USF2促進(jìn)circACTN4在BC中的表達(dá)為了研究 circRNA 在 BC發(fā)展中的功能,利用芯片分析檢測(cè)了4對(duì)BC組織和*旁組織中circRNA表達(dá)特征。共發(fā)現(xiàn)85個(gè)***差異表達(dá)的circRNAs, 63 個(gè)上調(diào)和22個(gè)下調(diào)circRNAs。熱圖顯示了14個(gè)上調(diào)的circRNA,其中circACTN4是失調(diào)**嚴(yán)重的一個(gè),差異高達(dá)10倍。根據(jù)circBase數(shù)據(jù)庫(kù)發(fā)現(xiàn)circACTN4來(lái)自位于人類19號(hào)染色體上的ACTN4基因,產(chǎn)生于ACTN4外顯子2至外顯子7(共571bp),通過(guò) Sanger 測(cè)序驗(yàn)證了反向剪接連接點(diǎn)。為了驗(yàn)證circACTN4的環(huán)形結(jié)構(gòu),使用聚斂引物和發(fā)散引物擴(kuò)增...
人類**是由具有不同表型、基因型和表觀遺傳狀態(tài)的細(xì)胞組成的復(fù)雜生態(tài)系統(tǒng)。這種**內(nèi)異質(zhì)性是*****的主要障礙,也是大塊**分析中的重要混雜因素。單細(xì)胞RNA測(cè)序(scRNA-seq)技術(shù)是探索組織異質(zhì)性和細(xì)胞變異性的有力手段,并提供前所未有的機(jī)會(huì)來(lái)解決越來(lái)越具有挑戰(zhàn)性的生物學(xué)問(wèn)題并了解**發(fā)展中涉及的非典型功能機(jī)制。目前,已經(jīng)基于研究需求開發(fā)了許多單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)庫(kù)。目前的數(shù)據(jù)庫(kù)主要關(guān)注基因表達(dá),而在**內(nèi),細(xì)胞表現(xiàn)出由基因調(diào)控微調(diào)驅(qū)動(dòng)的不同行為。因此,需要探索**中單細(xì)胞水平的基因-基因關(guān)聯(lián)。越來(lái)越多的證據(jù)表明,LncRNA相關(guān)的競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA(ceRNA)調(diào)控與細(xì)胞命運(yùn)的確定和各種人類疾...
6.水蘇糖減輕DHEA誘導(dǎo)的多囊卵巢綜合征大鼠卵巢功能障礙 為了確定水蘇糖是否參與了Tempol對(duì)PCOS大鼠的有益作用,DHEA處理的大鼠給予200mg/kg水蘇糖12天。水蘇糖給藥對(duì)體重沒(méi)有明顯影響(圖8A),但改善了PCOS大鼠的動(dòng)情周期紊亂(圖8B)。H&E染色表明,水蘇糖可減少卵巢囊泡數(shù)量,增加黃體形成(圖8C-E)。水蘇糖還可***降低PCOS大鼠血清睪酮水平的升高(圖8F)。上述結(jié)果提示水蘇糖確實(shí)改善了PCOS大鼠卵巢功能障礙,改善了卵巢組織病理?yè)p傷。 綜上所述,Tempol通過(guò)降低腸道氧化應(yīng)激、恢復(fù)腸道失調(diào)、調(diào)節(jié)腸道微生物和宿主代謝產(chǎn)物之間的相互作用來(lái)保護(hù)DHE...
3)DRD2重新編碼MφM1表型,下調(diào)IL-6和IL-10 據(jù)報(bào)道,DRD2可調(diào)節(jié)M1的極化。結(jié)果顯示,在DRD2表達(dá)水平較高的BrCa組織中,M1Mφ的浸潤(rùn)增加,M2Mφ的浸潤(rùn)減少(圖3A)。為進(jìn)一步研究DRD2對(duì)TAMs的調(diào)控作用,構(gòu)建了BrCa與Mφ共培養(yǎng)體系。當(dāng)Mφ與表達(dá)DRD2的BrCa細(xì)胞共培養(yǎng)時(shí),qRT-PCR顯示M1表型標(biāo)記增加,M2Mφ標(biāo)記下調(diào)(圖3B-C)。qRT-PCR也證實(shí)了載體轉(zhuǎn)染的BrCa細(xì)胞將Mφ調(diào)節(jié)為M2型(圖3C)[12]。WB結(jié)果顯示,表達(dá)DRD2的BrCa細(xì)胞上調(diào)M1標(biāo)記iNOS,下調(diào)M2標(biāo)記CD206(圖3D)。IF染色顯示,與表達(dá)DRD2的*...
MELTF-AS1通過(guò)調(diào)節(jié)MMP14促進(jìn)骨肉瘤轉(zhuǎn)移transwell實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,過(guò)表達(dá)MELTF-AS1可提高骨肉瘤細(xì)胞的遷移和侵襲能力。過(guò)表達(dá)MELTF-AS1,而過(guò)表達(dá)miR-485-5p或抑制MMP14,削弱了MELTF-AS1過(guò)表達(dá)引起的轉(zhuǎn)移能力的增加。免疫熒光分析顯示,過(guò)表達(dá)MELTF-AS1增加了Vimentin的表達(dá),降低了E-cadherin的表達(dá),共轉(zhuǎn)染miR-485-5p或MMP14siRNA消除了MELTF-AS1引起的變化。westernblot顯示MELTF-AS1過(guò)表達(dá)促進(jìn)了MMP14下游靶點(diǎn)VEGF-A的表達(dá)。同樣,過(guò)表達(dá)miR-485-5p或抑制MMP14可減...
2.Lnc-PMIF抑制OPCs遷移到骨形成表面 在成骨細(xì)胞分化過(guò)程中,lnc-PMIF在早期增加,在礦化啟動(dòng)后減少,表明lnc-PMIF可能在成骨分化的早期階段發(fā)揮作用。過(guò)表達(dá)/敲低lnc-PMIF不影響OPCs的增殖和成骨分化。敲低lnc-PMIF的細(xì)胞遷移減弱,敲低組細(xì)胞處理的小鼠脛骨中Dil標(biāo)記細(xì)胞數(shù)量升高,小鼠中l(wèi)nc-PMIF表達(dá)更高。這些表明lnc-PMIF可抑制OPCs向骨形成表面的遷移,而不干擾其增殖和成骨潛能。 3.Lnc-PMIF與HuR相互作用抑制β-actin的表達(dá)以抑制OPC遷移 為探索Lnc-PMIF介導(dǎo)的OPC遷移的調(diào)節(jié)機(jī)制。RNApull...
TNF-α處理AS-MSC樣品后,METTL14表達(dá)下降進(jìn)而導(dǎo)致m6A水平降低,ELMO1RNA降解 已有研究發(fā)現(xiàn)m6A修飾可降低mRNA的穩(wěn)定性及表達(dá)。作者發(fā)現(xiàn)ELMO1的m6A修飾水平隨著TNF-α濃度而改變,經(jīng)過(guò)100ng/mlTNF-α處理后,AS-MSC中ELMO1m6A修飾水平遠(yuǎn)低于HC-MSC。此外,在100ng/mlTNF-α刺激下,AS-MSC的ELMO1mRNA半衰期比HC-MSC更長(zhǎng),說(shuō)明AS-MSC的mRNA穩(wěn)定性更好。然后檢測(cè)m6A相關(guān)甲基轉(zhuǎn)移酶和去甲基化酶的表達(dá)水平。結(jié)果表明,TNF-α處理后,METTL3,ALKBH5和FTO表達(dá)增加,METTL14和T...
CircRNAs調(diào)節(jié)基因表達(dá),參與多種生物學(xué)和病理過(guò)程。然而,關(guān)于特定circRNA對(duì)T輔助細(xì)胞17 (Th17)分化和相關(guān)自身免疫性疾病,如多發(fā)性硬化癥(MS)的影響知之甚少。本文使用轉(zhuǎn)錄組微陣列分析實(shí)驗(yàn)性自身免疫性腦脊髓炎(EAE)的不同階段,確定了與EAE進(jìn)展相關(guān)的circINPP4B,該circINPP4B在EAE小鼠Th17細(xì)胞和Th17體外分化過(guò)程中表達(dá)上調(diào)。該文于2021年8月發(fā)表于《Cellular Molecular Immunology》IF:11.53雜志上。 通過(guò)芯片分析鑒定與EAE相關(guān)的circRNA作者構(gòu)建了EAE小鼠模型,通過(guò)EAE的臨床特征得分分為4組...
還檢測(cè)到β-肌動(dòng)蛋白***升高,與免疫沉淀的HuR蛋白結(jié)合。接下來(lái)研究HuR-β-actin介導(dǎo)的調(diào)節(jié)機(jī)制是否參與OPC的遷移調(diào)節(jié)。β-actin的mRNA和蛋白表達(dá)以及細(xì)胞遷移能力在HuR基因過(guò)表達(dá)的細(xì)胞中***增加, HuR基因敲低細(xì)胞中降低。β-肌動(dòng)蛋白的mRNA和蛋白表達(dá)在lnc-PMIF過(guò)表達(dá)細(xì)胞中***下調(diào),但在lnc-PMIF基因敲除細(xì)胞中***上調(diào),表明lnc-PMIF能抑制OPCs中β-actin的表達(dá),基因過(guò)表達(dá)/敲除lnc-PMIF不改變HuR的蛋白表達(dá)。在前述lnc-PMIF敲低細(xì)胞中敲低HuR基因,細(xì)胞中β-actin的mRNA和蛋白表達(dá)***下調(diào),細(xì)胞遷移能力也受到...
網(wǎng)絡(luò)圖中代謝物的集富集分析 為了鑒定鏈接雞盲腸微生物群與脂質(zhì)生成之間的代謝物,進(jìn)行了代謝物富集分析。在門水平,有三個(gè)代謝物集***富集,包括obesity,myalgicencephalomyelitis/chronicfatiguesyndrome和unclassifiedIbd。有4個(gè)代謝物在屬水平***富集,包括unclassifiedIbd,encephalomyelitis/chronicfatiguesyndrome,gout和obesity。很顯然,肥胖代謝物集在門水平和屬水平均***富集。肥胖代謝物集涉及三種差異代謝物:L-glutamicacid,pantothen...
大約 1% 的人類基因組能夠折疊成 G 四鏈體 (G quadruplexes,G4s)——在富含 G 的基序上形成的非經(jīng)典鏈特異性 DNA 結(jié)構(gòu)。G4 的熱穩(wěn)定性不同,這可能會(huì)影響它們的功能。然而,G4s 也可能阻礙復(fù)制、轉(zhuǎn)錄和翻譯,并可能增加基因組的不穩(wěn)定性和突變率。因此,根據(jù)其基因組位置、熱穩(wěn)定性和功能性,G4 基因座可能會(huì)在不同的選擇壓力下進(jìn)化,而這一點(diǎn)從未被研究過(guò)。 一、基因組中G4基因座的密度不均勻 與全基因組平均值相比,CpG島、上游區(qū)域和轉(zhuǎn)錄鏈的G4密度的倍數(shù)差異特別**別為12.3、4.98和4.11。相比之下,內(nèi)含子的非轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)錄鏈、非轉(zhuǎn)錄外顯子鏈和3'UT...
這可能部分解釋了第3天巨噬細(xì)胞的增加。此外,流式細(xì)胞術(shù)數(shù)據(jù)顯示M2樣巨噬細(xì)胞(CD206+IL4RA+)的百分比在第1天(急性炎癥期)下降并從第3天開始增加(ADM階段),而這些M2樣巨噬細(xì)胞的數(shù)量在第3天達(dá)到峰值,然后迅速減少。此外,流式細(xì)胞術(shù)數(shù)據(jù)與免疫熒光分析一致,其中F4/80+CD206+細(xì)胞在第3天**豐富。 接下來(lái),我們想知道這些CCR2+單核細(xì)胞/巨噬細(xì)胞是否可以在胰腺損傷后重新編程為M2樣巨噬細(xì)胞。在植入和誘導(dǎo)AP8周后,我們發(fā)現(xiàn)第3天的增殖巨噬細(xì)胞(Ki67+)主要來(lái)自CCR2WT小鼠。與來(lái)自CCR2KO小鼠的巨噬細(xì)胞相比,來(lái)自CCR2WT小鼠的巨噬細(xì)胞表現(xiàn)出更高的...
MIR210HG與子宮內(nèi)膜*患者的低生存率相關(guān) 為了識(shí)別子宮內(nèi)膜*組中異常表達(dá)的lncRNA,我們分析了來(lái)自TCGA的數(shù)據(jù)。表達(dá)陣列分析顯示332個(gè)lncRNA的表達(dá)差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。7個(gè)lncRNA表達(dá)上調(diào)(圖1A和1B)。然后,我們分析了GEO數(shù)據(jù)集,發(fā)現(xiàn)在子宮內(nèi)膜*GSE17025隊(duì)列中MIR210HG的表達(dá)也上調(diào)(圖1C)。qPCR顯示MIR210HG在子宮內(nèi)膜*中的表達(dá)明顯高于正常子宮內(nèi)膜組織(圖1D)。此外,我們分析了MIR210HG的表達(dá)與子宮內(nèi)膜*患者臨床病理參數(shù)的關(guān)系,發(fā)現(xiàn)MIR210HG在從I、II期到III、IV期的進(jìn)展過(guò)程中增加。MIR210HG的表達(dá)與淋巴結(jié)...
2021年6月,***一篇發(fā)表在Curr Biol(IF=9.601)的文章(The RAS GTPase RIT1 compromises mitotic fidelity through spindle assembly checkpoint suppression.)從共生功能體視點(diǎn)的角度對(duì)29名接受同種異體造血干細(xì)胞移植的兒童的腸道、口腔和鼻腔微生物群進(jìn)行了綜合宿主微生物群分析。***揭示了RIT1直接與SAC**組件MAD2和p31conmet相互作用;CDK1在有絲分裂過(guò)程中磷酸化RIT1并抑制其與SAC的相互作用;RIT1是細(xì)胞有絲分裂及時(shí)進(jìn)展所必需的;RIT1致病水平促進(jìn)染色體...
**近的研究表明INPP4B可能在與化療耐藥性相關(guān)的急性髓系白血病(AML)中起致*作用,以及在黑素瘤和結(jié)腸*中起致*作用。而且可能與環(huán)境有關(guān)。例如,在乳腺*中,SGK3被擴(kuò)增,它的激酶活性依賴于致*的PI3K和INPP4B。**近,INPP4B被確定為與ER+乳腺*和**分級(jí)相關(guān)的前列基因。 2021年5月,在Naturecommunications雜志上發(fā)表了文章“INPP4BpromotesPI3Kα-dependentlateendosomeformationandWnt/β-cateninsignalinginbreastcancer”。此報(bào)道探討了INPP4B在ER+乳腺...
進(jìn)一步檢測(cè)S100A4的功能,結(jié)果顯示敲除S100A4***降低高轉(zhuǎn)移性HCC細(xì)胞系的遷移和侵襲能力,過(guò)表達(dá)S100A4則***增強(qiáng)低轉(zhuǎn)移性HCC細(xì)胞系的遷移和侵襲能力(圖3d)。然后作者收集了S100A4敲除和S100A4過(guò)表達(dá)的HCC細(xì)胞的外泌體,結(jié)果得到了類似的結(jié)論,S100A4過(guò)表達(dá)外泌體***增強(qiáng)HCC細(xì)胞的遷移和侵襲,以及體內(nèi)肺部轉(zhuǎn)移的能力(圖3e-f)。這些結(jié)果證實(shí)了外泌體S100A4具有增強(qiáng)HCC細(xì)胞轉(zhuǎn)移潛力的功能。 4、外泌體S100A4通過(guò)STAT3磷酸化***OPN轉(zhuǎn)錄 接下來(lái)探究了S100A4的作用機(jī)制,首先選擇了21個(gè)**干性相關(guān)基因,然后下載了GEO...
DNA生物標(biāo)志物 DNA生物標(biāo)記物是MarkerDB中比較大的一類標(biāo)記物。MarkerDB中的DNA生物標(biāo)記進(jìn)一步分為26021個(gè)與209種疾病相關(guān)的DNA突變標(biāo)記、353個(gè)與70種疾病相關(guān)的SNP標(biāo)記和23個(gè)與16種傳染病相關(guān)的微生物/病毒基因。DNA突變數(shù)據(jù)(和臨床批準(zhǔn)的突變?cè)囼?yàn))來(lái)自GeneticTestingRegistry,序列數(shù)據(jù)從GenBank中提取,DNASNP生物標(biāo)記物的主要來(lái)源是數(shù)據(jù)庫(kù)GWAS-ROCS,疾病信息從OMIM或GeneticsHomeReference中提取,關(guān)于微生物/病毒生物標(biāo)記基因的剩余數(shù)據(jù)通過(guò)原始文獻(xiàn)或?qū)@麢z索獲得。目前,MarkerDB中的...
circNDUFB2過(guò)表后IGF2BPs的mRNA無(wú)***變化,蛋白質(zhì)水平***降低。此外,circNDUFB2突變體不影響IGF2BPs的蛋白質(zhì)水平。因此推測(cè)circNDUFB2可能通過(guò)相互作用使IGF2BP蛋白失穩(wěn)。發(fā)現(xiàn)circNDUFB2的過(guò)度表達(dá)***降低了IGF2BP蛋白的水平,這可以通過(guò)MG132(蛋白酶抑制劑)恢復(fù)。circNDUFB2***增加了IGF2BPs的泛素化水平,但這種作用因其突變而受損。這些結(jié)果表明circNDUFB2通過(guò)促進(jìn)泛素/蛋白酶體依賴性降解降低IGF2BPs的穩(wěn)定性。 TRIM25是介導(dǎo)IGF2BP泛素化的E3連接酶 促*分泌體通過(guò)外泌體傳遞和運(yùn)...
QKI促進(jìn)NSCLC細(xì)胞中circNDUFB2的生物發(fā)生 circNDUFB2和NDUFB2均來(lái)自NDUFB2 pre-mRNA,而NDUFB2 mRNA在NSCLC中略有上調(diào)。因此,推測(cè)circNDUFB2的下調(diào)在轉(zhuǎn)錄后發(fā)生。我們?cè)赾ircNDUFB2中搜索與潛在QRE匹配的序列。接下來(lái)進(jìn)行了RIP分析,確認(rèn)QKI確實(shí)與NDUFB2 pre-mRNA中的假定QRE結(jié)合。在NSCLC細(xì)胞中QKI過(guò)表達(dá)可能會(huì)上調(diào)circNDUFB2。 這些數(shù)據(jù)表明,QKI與NDUFB2 pre-mRNA的circNDUFB2形成外顯子側(cè)翼的內(nèi)含子結(jié)合,從而促進(jìn)circNDUFB2的形成。 英拜生物對(duì)整...
2、敲除LncHrt損傷心臟內(nèi)穩(wěn)態(tài)為了探究LncHrt的功能,實(shí)驗(yàn)AAV9-shRNA敲除新生兒小鼠中的LncHrt,即AAV-LncHrtKD。結(jié)果表明敲除LncHrt后,導(dǎo)致心臟擴(kuò)大,心臟重量與體重之比提高(HW/BW),而不影響體重。心電圖顯示LncHrt敲除后小鼠左心室收縮功能受損,縮短分?jǐn)?shù)下降,明顯的左心室擴(kuò)張和左心室后壁厚度減少(2f-i)。并且這些變化得到了心臟組織學(xué)和組織纖維化的結(jié)果的支持。與此相反,過(guò)表達(dá)LncHrt后對(duì)小鼠的心臟的影響與上述結(jié)果完全相反??傊陨辖Y(jié)果表明敲除LncHrt損傷心臟內(nèi)穩(wěn)態(tài),過(guò)表達(dá)LncHrt可保護(hù)心臟免受心肌梗死。我們接下來(lái)研究了Pex對(duì)HSC...
6)DRD2通過(guò)下調(diào)DDX5和eEF1A2來(lái)抑制NF-κB通路的***和**的發(fā)生 DRD2異位表達(dá)***抑制了p65和NF-κB靶基因IL-10的mRNA表達(dá)(圖6A),表明在沒(méi)有配體***的情況下,DRD2是NF-κB通路的負(fù)調(diào)控因子。除了結(jié)合***β-arrestin2外,DRD2還可能通過(guò)其他方式抑制NF-κB信號(hào)通路。采用Co-IP法分離可能的結(jié)合蛋白,并采用質(zhì)譜法進(jìn)行蛋白鑒定。MDA-MB231和BT549細(xì)胞的所有結(jié)合蛋白中,DDX5、eEF1A2和ICAM-1均被異位表達(dá)的DRD2下調(diào)(圖6B-C)。根據(jù)以往的研究,DDX5和eEF1A2是幾種**中的兩種致*基因。W...
4.ELNAT1直接與hnRNPA1相互作用 由于lncRNA的分子功能與其亞細(xì)胞定位相關(guān),通過(guò)FISH和亞細(xì)胞定位實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)ELNAT1在UM-UC-3和T24細(xì)胞的細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核均有表達(dá)(SupplementalFigure7A,B)。并且通過(guò)RNA-pulldown實(shí)驗(yàn),發(fā)現(xiàn)在分子量35~40kDa上有明顯的條帶(Figure4A)。對(duì)此,通過(guò)質(zhì)譜(MS)和Westernblot分析顯示,hnRNPA1是**豐富的ELNAT1相互作用蛋白(Figure4B-D)。熒光染色和RNA免疫沉淀(RIP)證實(shí)了ELNAT1和hnRNPA1在UM-UC-3和T24細(xì)胞中的共定位,并且ELN...
在MAD1與未連接的動(dòng)點(diǎn)結(jié)合后,MAD2從開放的構(gòu)象狀態(tài)(O-MAD2)轉(zhuǎn)化為封閉的構(gòu)象狀態(tài)(C-MAD2), SAC信號(hào)被緊密調(diào)控和放大。MAD2的構(gòu)象變化啟動(dòng)了它與CDC20的結(jié)合。為了直接測(cè)試RIT1是否抑制了MAD2與CDC20或MAD1的關(guān)聯(lián),進(jìn)行了競(jìng)爭(zhēng)性pull-down實(shí)驗(yàn)來(lái)測(cè)試RIT1-MAD2和MAD2-CDC20/ MAD1結(jié)合之間的互斥性(圖4A和4B)。MAD2結(jié)合肽1 (MBP1)是一種模擬CDC20和MAD1相互作用基序(MIM)的高親和合成肽,它取消了MAD2- rit1的結(jié)合。評(píng)估了RIT1與O-或c -狀態(tài)穩(wěn)定的MAD2突變體的結(jié)合(圖4C)。用過(guò)量的RIT1...
5.ELNAT1與UBC9啟動(dòng)子形成DNA-RNA三聯(lián)體,通過(guò)招募hnRNPA1增強(qiáng)H3K4me3修飾 為了探索ELNAT1誘導(dǎo)BCa淋巴轉(zhuǎn)移的分子機(jī)制,我們使用NGS檢測(cè)過(guò)表達(dá)ELNAT1的BCa細(xì)胞和對(duì)照細(xì)胞(Figure5A),由于SUMOylation已經(jīng)被證明可以調(diào)節(jié)特異性RNA的識(shí)別,并參與RNA分選進(jìn)入EVs的過(guò)程,因此鑒定ELNAT1的SUMOylation相關(guān)靶基因。在受ELNAT1調(diào)控的925個(gè)基因中,作者發(fā)現(xiàn)UBC9是SUMOylation相關(guān)基因變化*****的(Figure5B-D)。接著通過(guò)RNA純化(ChIRP)檢驗(yàn)ELNAT1與UBC9中P1(153~...
7)USP35敲除增強(qiáng)肺*細(xì)胞的化療敏感性 鑒于USP35在肺*細(xì)胞中的高表達(dá)及其在調(diào)節(jié)鐵死亡中的作用,我們**終評(píng)估了USP35沉默是否能使肺*細(xì)胞對(duì)化療藥物敏感。如圖9A-C所示,USP35缺乏的H460和H1299細(xì)胞在體外對(duì)DDP和PTX的毒性作用更敏感,細(xì)胞活力和定殖的降低證明了這一點(diǎn)。相應(yīng)地,接種USP35缺陷*細(xì)胞的荷瘤小鼠經(jīng)DDP或PTX***后**體積和重量均減少(圖9D,E)。酪氨酸激酶抑制劑(TKI)已成為常規(guī)化療的替代藥物,并為肺*患者提供了***的生存益處。 英拜生物致力于分子生物行業(yè)十余年。斷鏈脂肪酸 總之,SLE患者純化T細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析根據(jù)ISG表...
雄***和雄***受體(AR)是******轉(zhuǎn)錄因子(TF),是驅(qū)動(dòng)前列腺*(PCa)發(fā)***展的關(guān)鍵因素。因此AR是晚期PCa******的主要分子靶點(diǎn)。雄***剝奪療法,特別是第二代抗雄***和雄***合成抑制劑**初是有效的。然而,由于患者仍然可以從晚期PCa進(jìn)展到致命性去勢(shì)抗性前列腺*(CRPC),需要新的***靶點(diǎn)和生物標(biāo)志物。靶蛋白的一個(gè)來(lái)源可能是ar相關(guān)的染色質(zhì)蛋白。 大多數(shù)目前已知的核受體(NR)相互作用蛋白,包括那些AR,已經(jīng)通過(guò)遺傳篩選,如雙雜交系統(tǒng),免疫共沉淀和基于肽段的體外方法。盡管親和純化-質(zhì)譜耦合(MS)已經(jīng)啟發(fā)了NRs的輔助調(diào)節(jié)器,但它很少在**NRs自...
m6A酶系統(tǒng) METTL3是早先被鑒定為結(jié)合SAM的組件,其缺失引起小鼠胚胎干細(xì)胞、Hela細(xì)胞和HepG2 細(xì)胞中m6Apeaks的減少。METTL3及其同源蛋白METTL14定位在富含剪切因子的細(xì)胞核內(nèi)亞細(xì)胞器-核小斑(Nuclear speckle)上,顯示m6A修飾可能和RNA的剪切加工相關(guān)。WTAP與METTL3–METTL14 二聚體相互作用,并共定位于核小斑,影響甲基化效率,參與mRNA剪。而KIAA1429作為候選的甲基轉(zhuǎn)移酶復(fù)合體的新亞基,是整體甲基化進(jìn)程所必須的[2]。FTO是ALKB家族的成員,作為***個(gè)被發(fā)現(xiàn)的去甲基酶,可影響剪切因子SRSF2的RN...
為了進(jìn)一步分析LncRNA-HGBC-miR-502-3p-SET-AKT之間的關(guān)聯(lián),作者在43對(duì)GBC組織中進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)LncRNA HGBC與miR-502-3p呈負(fù)相關(guān),與SET和HuR mRNA水平呈正相關(guān),與非**組織相比,HuR在GBC組織中表達(dá)上調(diào),通過(guò)IHC分析發(fā)現(xiàn),與非**組織相比,SET或p-AKT在GBC組織中表達(dá)上調(diào),此外,LncRNA -HGBC表達(dá)與SET和p-AKT表達(dá)呈正相關(guān)。綜上所述,LncRNA HGBC能通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合miR-502-3p發(fā)揮作用,然后***下游SET和AKT表達(dá),從而加強(qiáng)**細(xì)胞的**性。Pex衍生的CD44v6/C1QBP復(fù)合物介導(dǎo)了...
在基礎(chǔ)條件下,F(xiàn)th-KO小鼠皮層中鐵穩(wěn)態(tài)輕度受損 使用蛋白質(zhì)印跡分析,實(shí)時(shí)PCR和Fth免疫熒光證實(shí)了在基礎(chǔ)條件下神經(jīng)元Fth表達(dá)的喪失。Fth-KO小鼠的FTHmRNA和蛋白表達(dá)較低。我們還通過(guò)免疫熒光觀察了Fth的神經(jīng)元水平。從他莫昔芬處理的皮層神經(jīng)元Fth-KO小鼠具有減少的免疫原性FTH的。重要的是,在神經(jīng)元中觀察到幾乎罕見(jiàn)FTH陽(yáng)性細(xì)胞Fth-KO小鼠。有趣的是,神經(jīng)元中Fth的喪失并未導(dǎo)致Ftl表達(dá)的代償性增加。接下來(lái),檢查了神經(jīng)元Fth在鐵代謝和氧化還原穩(wěn)態(tài)中的假定作用。Fth-KO組與對(duì)照組相比,皮質(zhì)Fe2+,F(xiàn)e3+,總鐵水平***增加。Perls的藍(lán)色染色顯示在...
三、原始表型和染色質(zhì)可及性 雖然基因表達(dá)反映了細(xì)胞身份的活躍狀態(tài),但順式調(diào)節(jié)元件(cre),包括啟動(dòng)子和增強(qiáng)子,是決定細(xì)胞命運(yùn)的潛在因素。因此,我們研究了npm1突變的AML樣本是否也會(huì)根據(jù)其順式調(diào)控景觀分層為原始和committed的集群。使用轉(zhuǎn)座酶可達(dá)染色質(zhì)測(cè)序(ATAC-seq)可達(dá)染色質(zhì)區(qū)域,以CREAM方法鑒定的**為重點(diǎn),根據(jù)表達(dá)譜對(duì)AML樣本進(jìn)行聚類,但有一個(gè)例外(圖3A)。我們的研究結(jié)果表明,啟動(dòng)子區(qū)形成了**(啟動(dòng)子:FDR = 11%,基因間:FDR = 2%;圖3B、C及補(bǔ)充圖19)。RUNX和GATA家族成員HOXC9和CTCF的dna結(jié)合位點(diǎn)基模只富集在原始...