circNDUFB2過表后IGF2BPs的mRNA無***變化,蛋白質(zhì)水平***降低。此外,circNDUFB2突變體不影響IGF2BPs的蛋白質(zhì)水平。因此推測(cè)circNDUFB2可能通過相互作用使IGF2BP蛋白失穩(wěn)。發(fā)現(xiàn)circNDUFB2的過度表達(dá)***降低了IGF2BP蛋白的水平,這可以通過MG132(蛋白酶抑制劑)恢復(fù)。circNDUFB2***增加了IGF2BPs的泛素化水平,但這種作用因其突變而受損。這些結(jié)果表明circNDUFB2通過促進(jìn)泛素/蛋白酶體依賴性降解降低IGF2BPs的穩(wěn)定性。
TRIM25是介導(dǎo)IGF2BP泛素化的E3連接酶 促*分泌體通過外泌體傳遞和運(yùn)輸是轉(zhuǎn)移前微環(huán)境形成和轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵。FISH課題產(chǎn)學(xué)研合作
自噬“貨物”是有選擇性裝載的,其中主要依靠LIR基序與LC3互作,形成自噬體。隨后,自噬體進(jìn)行運(yùn)輸、溶解。研究表明,自噬異常會(huì)影響疾病進(jìn)程。**中的自噬具有雙重作用:一方面自噬的發(fā)生會(huì)增強(qiáng)*細(xì)胞的生存能力;另一方面,抑制自噬會(huì)造成“廢物”的積累、基因突變等,誘發(fā)**。
1、Meta-GWAS分析
收集三組GWAS數(shù)據(jù)用于meta分析,確定了35個(gè)基因區(qū)域中36個(gè)**的基因突變(p<5×10?8)。接下來,分析SNP200kb內(nèi)與AD***相關(guān)(p<10-5)的突變,篩選獲得PRKD3/NDUFAF7,SHARPIN,CHRNE,PLCG2,APP6個(gè)基因,這6個(gè)基因都存在于AD發(fā)病***相關(guān)的突變。
2、多基因風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分(PRS)
為了評(píng)估AD遺傳景觀的穩(wěn)健性和綜合效應(yīng),基于39個(gè)遺傳變異(不包括APOE基因型)構(gòu)建了一個(gè)加權(quán)PRS。
接下來測(cè)試了RPS與臨床診斷的關(guān)聯(lián)。PRS與臨床診斷的AD病例的關(guān)聯(lián)與病理證實(shí)的AD的關(guān)聯(lián)相似;在伴隨的腦部病變(除AD之外)存在的情況下PRS與AD相關(guān);在不同性別中,RPS與AD的相關(guān)性無差異,并且在早發(fā)型、晚發(fā)型中效果一致。
3、PRS有可能及早識(shí)別有風(fēng)險(xiǎn)的受試者
使用12,386例樣本分析RPS能否識(shí)別早發(fā)型AD(AAO),結(jié)果表明,PRS與APOE基因型相結(jié)合,可能對(duì)AAO進(jìn)行有效的預(yù)測(cè)。 江蘇課題實(shí)驗(yàn)外包我們使用抗體陣列評(píng)估了表達(dá)PTEN- wt或PTEN- 398a的MCF10A細(xì)胞裂解液的應(yīng)激反應(yīng)和凋亡通路的活性。
接下來,作者確定了PARP1基因消融對(duì)SLC7A11和p53表達(dá)的影響。PARP1敲除明顯降低HEY細(xì)胞中SLC7A11蛋白水平,誘導(dǎo)p53表達(dá)。在對(duì)PARP1進(jìn)行遺傳消融的HEY細(xì)胞中并未發(fā)現(xiàn)GPX4上調(diào),這表明奧拉帕尼處理后HEY細(xì)胞中GPX4的誘導(dǎo)可能是對(duì)氧化應(yīng)激的適應(yīng)性反應(yīng),因?yàn)樵摷?xì)胞系中GPX4的基礎(chǔ)水平較低。另外,作者觀察到奧拉帕尼在SKOV3細(xì)胞中降低PARP1蛋白水平而不影響SLC7A11蛋白水平。同樣,PARP1的缺失也無法抑制SKOV3細(xì)胞中SLC7A11的表達(dá)。為了進(jìn)一步確定PARP抑制是否以p53依賴的方式抑制SLC7A11的表達(dá),通過CRISPR/Cas9在野生型p53表達(dá)的HEY細(xì)胞中敲除p53。我們發(fā)現(xiàn),與p53缺陷的SKOV3細(xì)胞一致,奧拉帕尼在對(duì)照組細(xì)胞中下調(diào)SLC7A11的mRNA和蛋白表達(dá),而在p53 敲除細(xì)胞中沒有下調(diào)。綜上所述,結(jié)果表明,PARP抑制主要通過上調(diào)卵巢*細(xì)胞中的p53來抑制SLC7A11的轉(zhuǎn)錄。
為了驗(yàn)證在體內(nèi)使用FINs增強(qiáng)ferroptosis是否能使BRCA卵巢*對(duì)奧拉帕尼敏感,我們將HEY細(xì)胞接種到裸鼠中,并同時(shí)給小鼠使用奧拉帕尼、磺胺吡啶或兩種藥物。雖然單獨(dú)使用磺胺吡啶并沒有***降低**生長(zhǎng)或延長(zhǎng)小鼠存活率,但它確實(shí)***提高了這些HEY源性**對(duì)奧拉帕尼的敏感性,導(dǎo)致了有效的**抑制和生存益處。值得注意的是,與其他***相比,奧拉帕尼聯(lián)合磺胺吡啶的小鼠體重并沒有明顯下降,提示奧拉帕尼聯(lián)合磺胺吡啶的毒性在體內(nèi)是耐受的??偟膩碚f,奧拉帕尼和磺胺吡啶聯(lián)合***BRCA野生型卵巢*是一種有前景的***策略。動(dòng)物建模模型實(shí)驗(yàn)的整體服務(wù)。
WTAP介導(dǎo)的HK2調(diào)控依賴于其m6A甲基化酶活性
m6A閱讀器IGF2BP2識(shí)別WTAP轉(zhuǎn)錄本中的m6A位點(diǎn),以促進(jìn)其穩(wěn)定性。qPCR結(jié)果顯示,IGF2BP2缺陷細(xì)胞中HK2的轉(zhuǎn)錄水平***降低(圖6A),mRNA穩(wěn)定性實(shí)驗(yàn)顯示HK2在IGF2BP2缺陷細(xì)胞中趨于不穩(wěn)定(圖6B)。pGL3-HK2-WT載體的熒光素酶活性通過抑制IGF2BP2而降低,而pGL3-HK2-MUT載體的熒光素酶活性則消失(圖6C)。因此,IGF2BP2與WTAP共同作用,影響DLBCL細(xì)胞中HK2mRNA的穩(wěn)定性和表達(dá)。此外,考慮到piRNA-30473在**發(fā)生和疾病進(jìn)展中的功能重要性,利用選擇性抑制劑靶向piRNA-30473/WTAP/HK2軸可能是***DLBCL的一種有前景的***策略(圖6D)。
結(jié)論:作者證明了piRNA-30473通過調(diào)節(jié)m6ARNA甲基化,從而觸發(fā)下游信號(hào)級(jí)聯(lián)而促進(jìn)DLBCL的**發(fā)生和不良預(yù)后。該研究強(qiáng)調(diào)了m6A修飾機(jī)制在DLBCL中的功能重要性,并通過揭示一個(gè)之前未被發(fā)現(xiàn)的DLBCL基因調(diào)控機(jī)制,為**發(fā)生的表觀遺傳機(jī)制提供了深刻的見解。 使用motif和CHIP-seq預(yù)測(cè)影響基因簇表達(dá)的轉(zhuǎn)錄因子。巨噬細(xì)胞課題檢測(cè)服務(wù)
解決了對(duì)確定因果調(diào)節(jié)機(jī)制網(wǎng)絡(luò)的方法的關(guān)鍵需求。FISH課題產(chǎn)學(xué)研合作
4、Sirt1是在MRL/lpr小鼠中hUC-MSCs介導(dǎo)的CD4+T細(xì)胞衰老所必須的
接下來,檢測(cè)了Sirt1是否是hUC-MSCs促進(jìn)MRL/lpr脾CD4+T細(xì)胞衰老所足夠和必要的。研究發(fā)現(xiàn),使用Sirt1抑制劑-EX527預(yù)處理MRL/lpr小鼠的CD4+T細(xì)胞后,Sirt1的表達(dá)減弱,p21和p16的表達(dá)和p53的乙酰化水平均增加了(圖4A)。相反地,用Sirt1的選擇性***劑SRT1720預(yù)處理MRL/lpr小鼠的CD4+T細(xì)胞后,可以抑制hUC-MSCs誘導(dǎo)的衰老(圖4B)。綜上所述,這些數(shù)據(jù)表明Sirt1是hUC-MSCs增加MRL/lpr小鼠脾CD4+T細(xì)胞衰老的關(guān)鍵介質(zhì)。 FISH課題產(chǎn)學(xué)研合作
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái),提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀,客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度,保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請(qǐng):提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫,標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開展,設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn),中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究
4.二代測(cè)序:轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片:信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn):DNA甲基化實(shí)驗(yàn)(BSP,MSP,焦磷酸測(cè)序),RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證,過表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測(cè),F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)