QKI促進(jìn)NSCLC細(xì)胞中circNDUFB2的生物發(fā)生
circNDUFB2和NDUFB2均來自NDUFB2 pre-mRNA，而NDUFB2 mRNA在NSCLC中略有上調(diào)。因此，推測circNDUFB2的下調(diào)在轉(zhuǎn)錄后發(fā)生。我們在circNDUFB2中搜索與潛在QRE匹配的序列。接下來進(jìn)行了RIP分析，確認(rèn)QKI確實(shí)與NDUFB2 pre-mRNA中的假定QRE結(jié)合。在NSCLC細(xì)胞中QKI過表達(dá)可能會上調(diào)circNDUFB2。 這些數(shù)據(jù)表明，QKI與NDUFB2 pre-mRNA的circNDUFB2形成外顯子側(cè)翼的內(nèi)含子結(jié)合，從而促進(jìn)circNDUFB2的形成。 英拜生物對整體實(shí)驗(yàn)實(shí)施的全局把控。常規(guī)課題詢問報(bào)價(jià)
8）SOCS6通過泛素化和降解p65抑制NF-κB信號通路
鑒于miR-155通過增強(qiáng)細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核中p65的表達(dá)負(fù)調(diào)控SOCS6的表達(dá)，并***NF-κB信號通路，我們下一步研究SOCS6與p65之間潛在的相互作用。首先，我們在bEnd.3細(xì)胞中過表達(dá)或下調(diào)SOCS6。發(fā)現(xiàn)p65表達(dá)與SOCS6水平呈負(fù)相關(guān)(圖8A)。DiscoveryStudio?分析的3D對接也表明SOCS6可能與p65相互作用(圖8B)。此外，熒光共定位實(shí)驗(yàn)表明，SOCS6與p65在細(xì)胞質(zhì)***定位(圖8C和D)，Co-IP實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步揭示了SOCS6與p65的相互作用(圖8E)。值得注意的是蛋白酶體MG132可以部分逆轉(zhuǎn)SOCS6過表達(dá)對p65蛋白水平的抑制作用(圖8F)。同時(shí)，在環(huán)己酰亞胺的情況下，SOCS6的沉默***延緩了內(nèi)源性p65的降解速率，而過表達(dá)SOCS6則***加速了p65的降解(圖8G)。***，通過泛素化實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證SOCS6是否通過蛋白酶體降解誘導(dǎo)p65失穩(wěn)。我們發(fā)現(xiàn)過表達(dá)SOCS6增加了bEnd.3細(xì)胞中p65多聚泛素化。沉默SOCS6則相反(圖8H)。綜上所述，這些結(jié)果表明SOCS6可以與p65結(jié)合并誘導(dǎo)其多聚泛素化和蛋白酶體降解。 醫(yī)學(xué)相關(guān)課題實(shí)驗(yàn)外包zVAD預(yù)處理也略微增加了IR后PTEN-398A細(xì)胞中未解決的DNA損傷灶的數(shù)量。
胰腺*(PC)是**棘手的**之一，被認(rèn)為是預(yù)后**差的消化系統(tǒng)**。外泌體是微環(huán)境中**細(xì)胞和基質(zhì)細(xì)胞之間相互交流的重要介質(zhì)。**的發(fā)展不僅由*細(xì)胞決定，還受**微環(huán)境(Tumor microenvironment, TME)中缺氧、脂質(zhì)和間質(zhì)細(xì)胞這三個(gè)重要因素的調(diào)控。肥胖與包括PC在內(nèi)的幾種**的風(fēng)險(xiǎn)增加有關(guān)，并增加PC的發(fā)病率和死亡率。然而，PC衍生的外泌體在TME的進(jìn)展和與脂肪細(xì)胞的串?dāng)_中的潛在分子機(jī)制尚未闡明。因此，有作者對此進(jìn)行了研究，并把研究結(jié)果發(fā)表在《Molecular Therapy - Nucleic Acids》，IF：8.886。
5、外泌體miR-934通過下調(diào)PTEN表達(dá)和***PI3K/AKT信號通路誘導(dǎo)巨噬細(xì)胞M2極化
進(jìn)一步探索**來源的外泌體miR-934誘導(dǎo)M2巨噬細(xì)胞極化的機(jī)制。miR-934序列與PTEN的3'-UTR序列存在比對，提示miR-934可能靶向PTEN誘導(dǎo)M2巨噬細(xì)胞極化（Fig.5a）。如Fig.5b所示，將miR-934mimics或anti-miR-934及其控制載體轉(zhuǎn)染到PMA處理的THP-1細(xì)胞中，發(fā)現(xiàn)分別轉(zhuǎn)染miR-934mimics或anti-miR-934和PTEN野生型結(jié)合位點(diǎn)組中PTEN的3’-UTR熒光素酶活性***降低或升高（Fig.5b）。有趣的是，當(dāng)細(xì)胞與轉(zhuǎn)染了anti-miR-934、miR-934mimics或其對照載體的HCT-8或HT29細(xì)胞的外泌體共培養(yǎng)時(shí)，熒光素酶活性模式顯示出與上述趨勢相同（Fig.5c）。此外，PMA處理的THP-1細(xì)胞轉(zhuǎn)染miR-934mimics或anti-miR-934，與各自的對照細(xì)胞相比，分別在mRNA和蛋白水平下調(diào)或上調(diào)了PTEN的表達(dá)（Fig.5d）。類似的，分別用轉(zhuǎn)染anti-miR-934或miR-934mimics的CRC細(xì)胞的外泌體孵育PMA處理的THP-1細(xì)胞，結(jié)果發(fā)現(xiàn)PTEN，PI3K/AKT的表達(dá)明顯高于或低于各自的對照組（Fig.5e,f）。這些表明在PMA處理的THP-1細(xì)胞中，外泌體來源的miR-934可以通過靶向其3'-UTR和***PI3K/AKT通路來下調(diào)PTEN的表達(dá)。 也是***PDAC肝轉(zhuǎn)移的潛在靶點(diǎn)。
在基礎(chǔ)條件下，F(xiàn)th-KO小鼠皮層中鐵穩(wěn)態(tài)輕度受損
使用蛋白質(zhì)印跡分析，實(shí)時(shí)PCR和Fth免疫熒光證實(shí)了在基礎(chǔ)條件下神經(jīng)元Fth表達(dá)的喪失。Fth-KO小鼠的FTHmRNA和蛋白表達(dá)較低。我們還通過免疫熒光觀察了Fth的神經(jīng)元水平。從他莫昔芬處理的皮層神經(jīng)元Fth-KO小鼠具有減少的免疫原性FTH的。重要的是，在神經(jīng)元中觀察到幾乎罕見FTH陽性細(xì)胞Fth-KO小鼠。有趣的是，神經(jīng)元中Fth的喪失并未導(dǎo)致Ftl表達(dá)的代償性增加。接下來，檢查了神經(jīng)元Fth在鐵代謝和氧化還原穩(wěn)態(tài)中的假定作用。Fth-KO組與對照組相比，皮質(zhì)Fe2+，F(xiàn)e3+，總鐵水平***增加。Perls的藍(lán)色染色顯示在生理?xiàng)l件下，在Fth-KO中觀察到的鐵陽性細(xì)胞相對較少。這些結(jié)果表明，F(xiàn)th-KO小鼠具有活力和繁殖力，但鐵代謝發(fā)生了改變，這提供了神經(jīng)元鐵蛋白的鐵存儲功能在維持皮質(zhì)鐵穩(wěn)態(tài)基礎(chǔ)條件中起重要作用的證據(jù)。 TIMEOR用于推斷基因調(diào)控事件之間的關(guān)系。推廣課題國家自然科學(xué)基金
表達(dá)PTEN- 398A的細(xì)胞中上調(diào)的基因與G1/S檢查點(diǎn)的***有關(guān)。常規(guī)課題詢問報(bào)價(jià)
1、在響應(yīng)CDK4/6抑制中瘤內(nèi)記憶類CD8+T細(xì)胞的表現(xiàn)
為了***評價(jià)CDK4/6抑制對抗**T細(xì)胞免疫的影響，使用多模式單細(xì)胞測序(CITE-seq)分析了CDK4/6抑制劑palbociclib或?qū)φ仗幚淼腗C38-OVA**小鼠的瘤內(nèi)T細(xì)胞群體(Fig.1A)。維度分析顯示MC38-OVA**中有10個(gè)不同的T細(xì)胞群(Fig.1B)。用CDK4/6i處理的**有較低頻率的CD4+調(diào)節(jié)性T細(xì)胞(Foxp3+Tregs)，而CD8+記憶類T細(xì)胞頻率更高，以Tcf7、Sell、Bcl2和Cd7高表達(dá)為特征(Fig.1B-D)。CD8+T細(xì)胞池的基因動態(tài)表達(dá)揭示來源于CDK4/6i處理的小鼠的CD8+**免疫浸潤（TILs）向更早、更像干細(xì)胞的分化狀態(tài)傾斜(Fig.1E-F)。與此一致，較早出現(xiàn)假時(shí)間軌跡的細(xì)胞表達(dá)更高水平的記憶相關(guān)基因(Tcf7,Sell,Il7r)，和更低水平的效應(yīng)相關(guān)基因(Prf1,Gzmb)和耗損標(biāo)志物(PD-1,TIM3)(Fig.1G)。 常規(guī)課題詢問報(bào)價(jià)
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