4.ELNAT1直接與hnRNPA1相互作用
由于lncRNA的分子功能與其亞細(xì)胞定位相關(guān),通過FISH和亞細(xì)胞定位實驗發(fā)現(xiàn)ELNAT1在UM-UC-3和T24細(xì)胞的細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核均有表達(SupplementalFigure7A,B)。并且通過RNA-pulldown實驗,發(fā)現(xiàn)在分子量35~40kDa上有明顯的條帶(Figure4A)。對此,通過質(zhì)譜(MS)和Westernblot分析顯示,hnRNPA1是**豐富的ELNAT1相互作用蛋白(Figure4B-D)。熒光染色和RNA免疫沉淀(RIP)證實了ELNAT1和hnRNPA1在UM-UC-3和T24細(xì)胞中的共定位,并且ELNAT1通過內(nèi)源性hnRNPA1富集(Figure4E,F),進一步驗證了ELNAT1和hnRNPA1之間的相互作用。 英拜生物對實驗可行性分析。項目課題分子生物學(xué)實驗
急性髓系白血病(AML)的靶向***的實施一直具有挑戰(zhàn)性。FTO是一種m6A去甲基酶,作為一種致*基因,促進白血病*基因介導(dǎo)的細(xì)胞轉(zhuǎn)化和白血病發(fā)生。因此為大家介紹于2021年3月發(fā)表于影響因子為8.579的Theranostics上文章“Saikosaponin D exhibits anti-leukemic activity by targeting FTO/m6A signaling”。在這里,我們研究了Saikosaponin-d (SsD)在AML中***的抗增殖作用中的作用,并通過靶向SsD的FTO來評估m(xù)6A去甲基化活性。SsD在體外和體內(nèi)均能***抑制AML細(xì)胞增殖,促進細(xì)胞凋亡和細(xì)胞周期阻滯。機制上,SsD直接靶向FTO,從而增加了m6A RNA的甲基化,降低了下游基因轉(zhuǎn)錄本的穩(wěn)定性,導(dǎo)致相關(guān)通路的抑制。重要的是,SsD還克服了FTO/m6A介導(dǎo)的白血病對酪氨酸激酶抑制劑的耐藥性。總之,F(xiàn)TO依賴的m6A RNA甲基化介導(dǎo)了SsD的抗白血病作用,使SsD成為一種***白血病的藥物。cancer課題售后服務(wù)按照實驗設(shè)計路線和實驗結(jié)果進行文章的構(gòu)思與潤色。
circPDE3B的致*作用部分依賴于LAMA1
為了研究LAMA1在ESCC侵襲表型中的作用,我們進行了qRT-PCR,結(jié)果表明LAMA1在ESCC細(xì)胞系和組織中過表達。TCGAESCC數(shù)據(jù)集也得到了類似的結(jié)果。同樣,對10對匹配的ESCC組織和相鄰的非*組織進行westernblotting,發(fā)現(xiàn)在ESCC組織中LAMA1表達***上調(diào)。通過免疫組化研究LAMA1在組織中的表達,發(fā)現(xiàn)ESCC組織比相鄰的非*組織具有更強的LAMA1染色。與LAMA1低表達的患者相比,LAMA1高表達的患者平均OS和DFS天數(shù)減少。這些結(jié)果均提示LAMA1可能在ESCC進展中發(fā)揮致*作用。接著,我們驗證了circPDE3B在ESCC中的致*活性是否依賴于LAMA1。CCK-8和集落形成實驗表明,抑制LAMA1表達可損害細(xì)胞增殖。然而,共轉(zhuǎn)染circPDE3B載體***逆轉(zhuǎn)了這種抑制作用。同樣,與circPDE3B載體共轉(zhuǎn)染后,LAMA1沉默誘導(dǎo)的受損細(xì)胞遷移和侵襲能力被消除。
CircRNF13通過SUMO2促進SLUT1的泛素化
接下來探究circRNF13是否是通過SUMO2來促進SLUT1的泛素化的。利用anti-Flag-GLUT1抗體進行共免疫沉淀(Co-IP)實驗,驗證GLUT1與SUMO2蛋白之間的相互作用。在SUMOylation期間,UBC9是***可以直接識別底物并催化SUMO蛋白c端羧基與底物蛋白結(jié)合進行修飾的連接酶。Co-IP實驗揭示了GLUT1和UBC9之間的相互作用。免疫熒光也顯示SUMO2和GLUT1蛋白有共定位。WB顯示過表達circRNF13促進GLUT1的SUMOylation,敲低circRNF13抑制GLUT1的SUMOylation。此外,泛素化實驗表明,過表達SUMO2可加速GLUT1的泛素化,而當(dāng)共轉(zhuǎn)染si-circRNF13和SUMO2過表達載體時,si-circRNF13可減弱SUMO2誘導(dǎo)的GLUT1泛素化水平。這些結(jié)果提示,circRNF13通過與SUMO2結(jié)合調(diào)控GLUT1泛素化??傊?,circRNF13促進GLUT1的泛素化,抑制GLUT1的表達,從而抑制NPC細(xì)胞的糖酵解過程。 高通量測序的后續(xù)成文服務(wù)。
為了驗證circMYH9 是否通過 p53 途徑調(diào)節(jié)SG的合成。qRT-PCR和WB 證明了circMYH9 對p53的負(fù)調(diào)節(jié)。Nutlin-3可*** p53。Nutlin-3處理過表達 circMYH9的 LoVo 細(xì)胞逆轉(zhuǎn)了p53和MDM2的下調(diào),并抑制了SG生物合成途徑基因表達和細(xì)胞增殖。而circMYH9耗盡的HCT116細(xì)胞中的p53沉默則顯示出相反的效果。還在過度表達 circMYH9 的 LoVo 細(xì)胞中用 shRNA 敲低了 PHGDH。PHGDH 抑制顯示出與 Nutlin-3 處理類似的效果,但不影響 p53 表達。此外,與對照細(xì)胞相比,具有 circMYH9 敲除的體內(nèi)異種移植物的 IHC 顯示出更高的 p53 表達和更低的 PHGDH 和 PSPH 表達。相比之下,circMYH9 過表達異種移植物的 IHC 顯示 p53 的表達較低,而 PHGDH 和 PSPH 的表達高于載體細(xì)胞的表達。這些結(jié)果證實了 circMYH9 在 p53 通路和從頭 SG 代謝的調(diào)節(jié)中的主要作用。醫(yī)學(xué)整體課題外包服務(wù)。內(nèi)分泌課題服務(wù)兩年
Pex調(diào)節(jié)HSC的ECM分泌。項目課題分子生物學(xué)實驗
LCAT3招募FUBP1***MYC轉(zhuǎn)錄
芯片分析表明,F(xiàn)UBP1在肺*細(xì)胞中與c-MYC啟動子結(jié)合。FUBP1在LCAT3敲低后***降低。因此,LCAT3似乎是FUBP1與c-MYC啟動子結(jié)合所必需的。然后,然后,我們測試了LCAT3是否通過將FUBP1招募到c-MYC啟動子上的FUSE序列中來***c-MYC表達。使用c-MYC啟動子驅(qū)動的熒光素酶報告基因,在有或沒有FUSE序列的情況下,我們發(fā)現(xiàn)LCAT3或FUBP1基因敲低后,c-MYC啟動子活性受到抑制,這種抑制方式依賴于FUSE序列。因此,LCAT3將FUBP1招募到MYCFUSE序列中來***其轉(zhuǎn)錄。 項目課題分子生物學(xué)實驗
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實驗平臺,提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請:提供標(biāo)書課題設(shè)計、撰寫,標(biāo)書部分基礎(chǔ)實驗的開展,設(shè)計的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c,中標(biāo)率很高。
3.提供熱點**文獻技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究
4.二代測序:轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實驗