長(zhǎng)鏈非編碼RNAs(longnon-codingRNAs,IncRNAs)是-類長(zhǎng)度大于200nt且不編碼蛋白質(zhì)的RNAS(不含rRNA),***存在于各種生物體內(nèi)。IncRNAs參與表觀逮傳、轉(zhuǎn)錄以及轉(zhuǎn)錄后等多水平的調(diào)控過(guò)程,在生命活動(dòng)中具有重要作用。本公司IncRNA測(cè)序服務(wù)使用高通量測(cè)序技術(shù)結(jié)合先進(jìn)的生物信息學(xué)分析,-次性獲得樣本中幾乎全部的IncRNAs信息,為您***、深入地研究IncRNAs的功能提供了全新的工具。實(shí)驗(yàn)流程：1.樣品提取總RNA后,去除rRNA。2.RN**斷化。3.以短片段為模板,用六堿基隨機(jī)弓|物反轉(zhuǎn)錄合成雙鏈cDNA。4.經(jīng)純化、末端修復(fù)、加堿基A、加測(cè)序接頭...

佩土物多性性位測(cè)環(huán)境微生物多樣性檢測(cè),是以樣品中的微生物群落作為整體進(jìn)行研究,通過(guò)對(duì)核糖體RNA高變區(qū)域(比如16S/18S/1TS等序列)或功能基因(如古菌的氨氧化基因等)進(jìn)行PCR擴(kuò)增和測(cè)序,然后分析相應(yīng)環(huán)境下微生物群落的多樣性和分布規(guī)律。生物信息分析1.原始數(shù)據(jù)整理、過(guò)濾及質(zhì)量評(píng)估2.OTU生成和注釋3.基于物種豐度分析:◆稀釋曲線◆豐度分布曲線+Alpha多樣性分析◆物種豐度差異分析4.基于群落結(jié)構(gòu)分析:◆單樣品物種分布餅圖多樣品物種分布柱圖+含進(jìn)化關(guān)系的物種豐度+Beta多樣性分析5.根據(jù)客戶需求進(jìn)行個(gè)性化分析課題外包服務(wù):承接課題全部外包服務(wù),包含分子生物學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)...

糖基化PCR芯片可用于研究編碼關(guān)鍵酶的84個(gè)基因的表達(dá),這些酶在翻譯后,自蛋白多糖和糖蛋白添加和移除糖殘基。對(duì)蛋白多糖和糖蛋白功能必不可少的成熟的N-連接和O0-連接糖鏈的產(chǎn)“生和改變,不僅需要從頭穿糖合成的糖基轉(zhuǎn)移酶的活性，也需要重塑所需的糖苷酶和糖基轉(zhuǎn)移酶的活性。無(wú)論是通過(guò)刺激細(xì)胞分化或增生,還是外源性過(guò)度表達(dá),導(dǎo)致細(xì)胞表面和分泌蛋白的表達(dá)增加,需要更多的糖基轉(zhuǎn)移酶和糖苷酶的活性,并且至少部分由其自身的基因表達(dá)上升造成的。芯片包含幾個(gè)重要的糖基轉(zhuǎn)移酶和糖苷酶基因，包括半乳糖,葡萄糖，甘露糖，N~-乙酰葡糖胺,N-乙?；肴樘前?巖藻糖和唾液酸。其中一些代表性的酶同時(shí)作用于鞘糖脂。使用這一芯...

-氧化氮A(NO)信號(hào)通路RT2ProfilerTMPCRArray包含了表達(dá)受第I二信使NO控制及參與NO信號(hào)通路的84個(gè)基因。NO是參與和抑制疾病發(fā)生的動(dòng)態(tài)生物效應(yīng)分子。NO分子能夠可逆地改變特異基因的表達(dá),和許多蛋白的活性以及可逆影響信號(hào)通路，從而能夠影響許多生理活動(dòng)。本芯片包括參與NO生物合成、過(guò)氧化物代謝的基因和參與氧化應(yīng)激反應(yīng)的基因。還包括被NO誘導(dǎo)或抑制的基因,這些基因能夠作為細(xì)胞體系中NO信號(hào)通路***的指標(biāo)。通過(guò)實(shí)時(shí)定量PCR的方法,研究者即能夠利用該芯片簡(jiǎn)單可靠地同時(shí)檢測(cè)NO信號(hào)通路相關(guān)基因的表達(dá)。焦磷酸測(cè)序技術(shù)是由4種酶催化的同一反應(yīng)體系中的酶級(jí)聯(lián)化學(xué)發(fā)光反應(yīng)。鐵死亡臨床...

轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的研究對(duì)象為特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來(lái)的所有RNA的總和,主要包括mRNA和非編碼RNA。轉(zhuǎn)錄組研究是基因功能及結(jié)構(gòu)研究的基礎(chǔ)和出發(fā)點(diǎn),通過(guò)新一代高通量測(cè)序,能夠***快速地獲得某一物種特定組織或***在某一狀態(tài)下的幾乎所有轉(zhuǎn)錄本序列信息,已曠泛應(yīng)用于基礎(chǔ)研究、臨床診斷和藥物研發(fā)等領(lǐng)域。技術(shù)優(yōu)勢(shì)：任意物種的全轉(zhuǎn)錄組分析:無(wú)需預(yù)先設(shè)計(jì)特異性探針,因此無(wú)需了解物種基因或基因組信息,能夠直接對(duì)任何物種進(jìn)行*****的轉(zhuǎn)錄組分析。覆蓋度高:數(shù)字化信號(hào),直接測(cè)定幾乎所有轉(zhuǎn)錄本片段的序列;。檢測(cè)閾值寬:跨越6個(gè)數(shù)量級(jí)的寬檢測(cè)閾值,從幾個(gè)到數(shù)十萬(wàn)個(gè)拷貝精確計(jì)數(shù);●分辨率高:可以檢測(cè)基因家...

長(zhǎng)鏈非編碼RNAs(longnon-codingRNAs,IncRNAs)是-類長(zhǎng)度大于200nt且不編碼蛋白質(zhì)的RNAS(不含rRNA),***存在于各種生物體內(nèi)。IncRNAs參與表觀逮傳、轉(zhuǎn)錄以及轉(zhuǎn)錄后等多水平的調(diào)控過(guò)程,在生命活動(dòng)中具有重要作用。本公司IncRNA測(cè)序服務(wù)使用高通量測(cè)序技術(shù)結(jié)合先進(jìn)的生物信息學(xué)分析,-次性獲得樣本中幾乎全部的IncRNAs信息,為您***、深入地研究IncRNAs的功能提供了全新的工具。實(shí)驗(yàn)流程：1.樣品提取總RNA后,去除rRNA。2.RN**斷化。3.以短片段為模板,用六堿基隨機(jī)弓|物反轉(zhuǎn)錄合成雙鏈cDNA。4.經(jīng)純化、末端修復(fù)、加堿基A、加測(cè)序接頭...

原理:結(jié)合重亞確酸鹽的測(cè)序法是-種靈敏的能直接檢測(cè)分析基因組DNA甲基化模式的方法。重亞硫酸鹽處理后.用針對(duì)改變后的DNA序列設(shè)計(jì)特異性引物井進(jìn)行聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)。PCR產(chǎn)物中原先非甲基化的胞嘧啶位點(diǎn)被胸腺嘧啶所替代.而甲基化的胞嘧啶位點(diǎn)保持不變。PCR產(chǎn)物克隆后進(jìn)行測(cè)序。通過(guò)這個(gè)方法能得到特定位點(diǎn)在各個(gè)基因組DNA分子中的甲基化狀態(tài)。該方法特點(diǎn)是:1.特異性高,它能夠提供特異性很高的分析結(jié)果,這是所有其他研究甲基化的分析方法所不能比擬的;2.靈敏度高,可以用于分析少于100個(gè)細(xì)胞的檢測(cè)樣品。用微量的基因組DNA進(jìn)行分析就能得到各個(gè)DNA分子精確的甲基化位點(diǎn)分布圖。子實(shí)驗(yàn)平臺(tái)包含的實(shí)驗(yàn)...

心臟毒性PCR芯片可用于研究由藥物或化合物誘導(dǎo)而發(fā)生心臟損傷的84個(gè)關(guān)鍵基因的表達(dá)。毒性反應(yīng)是藥物上市的檢測(cè)指標(biāo)之一,其中就包括心臟毒性反應(yīng)的檢測(cè)。出于安全考慮,在過(guò)去40年,約有10%的藥品因?yàn)閷?duì)心血管有影響而撤出臨床市場(chǎng)。傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)研究昂貴又耗時(shí),且很難分辨是否為藥物或化合物引發(fā)的心臟毒性反應(yīng)。這一芯片包含了多個(gè)模型中由于藥物或化合物引起的心臟損傷的生物標(biāo)志物基因,既減少了實(shí)驗(yàn)周期和成本,也能在研究**初階段就發(fā)現(xiàn)和剔除會(huì)引起心臟毒性反應(yīng)的藥物。通過(guò)實(shí)時(shí)定量PCR的方法,研究者即能夠利用該芯片簡(jiǎn)單可靠地同時(shí)檢測(cè)心臟毒性相關(guān)基因的表達(dá)?；饦?biāo)書的寫作與基金申請(qǐng)指導(dǎo):提供基金標(biāo)書的修改,潤(rùn)色...

數(shù)據(jù)分析:原始數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)飽和度分析表達(dá)豐度分布統(tǒng)計(jì)重復(fù)性分析(需有2次以上**的重復(fù)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù))樣本間共有、特有及差異標(biāo)簽統(tǒng)計(jì)標(biāo)簽序列注釋基因表達(dá)圖譜分析基因表達(dá)模式聚類分析(不少于兩個(gè)樣品)基因差異表達(dá)分析GeneOntology顯菩性富集分析Pathway***性富集分析樣品要求●樣品類型:細(xì)胞、新鮮組織或RNA樣品。●樣品量:細(xì)胞樣品請(qǐng)?zhí)峁┲辽?x107個(gè)細(xì)胞,組織樣品請(qǐng)?zhí)峁┲辽?00mg的組織塊或切片,RNA樣品請(qǐng)?zhí)峁?0μg以上的總RNA。。樣品質(zhì)量:RNA無(wú)明顯降解,提取的總RNAOD260/280值在1.8~2.2之間,濃度z500ng/ul,28S:18S≥1.5,RIN≥...

核仁小RNA(snoRNAs)是一類存在于真核生物細(xì)胞核仁的小分子非編碼RNA,長(zhǎng)度60-300nt，能與核仁核糖**白結(jié)臺(tái)形成snoRNPs復(fù)合物。在脊椎動(dòng)物中編碼核仁小RNA的基因主要存在于蛋白編碼基因或非蛋白編碼基因的內(nèi)含子區(qū)域，并且經(jīng)過(guò)進(jìn)一步的轉(zhuǎn)錄后加工處理形成成熟的核仁小RNA。snoRNAS參與的生物學(xué)過(guò)程主要有rRNA的加工處理,RNA剪接和翻譯過(guò)程的調(diào)控以及氧化應(yīng)激反應(yīng)。由于snoRNA被認(rèn)為主要存在于核仁**能單一,之后的很長(zhǎng)-段時(shí)間,snoRNA的研究陷入低潮。然而，近幾年,隨著測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,越來(lái)越多的數(shù)據(jù)表明snoRNA在**中被異常調(diào)控,還參與到遺傳性疾病、造血、代謝...

基因表達(dá)譜測(cè)序?yàn)閷?duì)組織或細(xì)胞在特定狀態(tài)下產(chǎn)生的mRNA進(jìn)行高通量測(cè)序分析,得到基因差異表達(dá)的情況。測(cè)序法進(jìn)行基因表達(dá)分析具有定量準(zhǔn)確,重復(fù)性、特異性、靈敏性高的特點(diǎn)。與全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序研究相比,表達(dá)譜測(cè)序采用單端或雙端讀長(zhǎng)的策略,測(cè)序通量較小,成本較低;與芯片法相比,測(cè)序法具有無(wú)需樣本序列信息即可實(shí)現(xiàn)任一物種已知和未知轉(zhuǎn)錄本差異研究的開(kāi)放性特點(diǎn),對(duì)低豐度轉(zhuǎn)錄本的檢測(cè)具有靈敏性和特異性高的優(yōu)點(diǎn)?？蛻艨筛鶕?jù)實(shí)驗(yàn)?zāi)康?靈活選擇合適的測(cè)序深度,以達(dá)到對(duì)不同豐度轉(zhuǎn)錄本的檢測(cè)要求。-般10M~20Mreads數(shù)的測(cè)序量即可檢測(cè)到比芯片更多的差異基因。如果對(duì)低豐度表達(dá)基因的關(guān)注度高,建議至少測(cè)30M以上的rea...

piRNA的預(yù)測(cè)識(shí)別:通過(guò)高通量smallRNA測(cè)序數(shù)據(jù)預(yù)測(cè)piRNA;piRNA全基因組分布特征分析:解析piRNA在全基因組范圍內(nèi)的具體定位和簇分布特征piRNA臨近序列特征提取:采用motif短序列模式比配算法識(shí)別piRNA臨近調(diào)控區(qū)域加工區(qū)域特征，5"U端和10nt位置權(quán)重矩陣分析等計(jì)算調(diào)控序列的非隨機(jī)性概率,預(yù)測(cè)其序列調(diào)控功能。全基因組TE轉(zhuǎn)座子元件預(yù)測(cè)與重新注釋:針對(duì)物種基因組內(nèi)的轉(zhuǎn)座子序列,將轉(zhuǎn)座子識(shí)別為若干類別,包括longterminalrepeat(LTR),longinterspersednuclear(LINE),andinvertedrepeat(R)elements...

microRNA:測(cè)序小RNA是一類重要的體內(nèi)調(diào)節(jié)分子,主要包括miRNA.piRNA和siRNA。它的功能主要是誘導(dǎo)基因沉默,參與基因轉(zhuǎn)錄后調(diào)控，從而調(diào)節(jié)細(xì)胞生長(zhǎng)、分化，以及個(gè)體發(fā)育、生殖等重要生物學(xué)過(guò)程。小RNA測(cè)序技術(shù)采用膠分離技術(shù),收集樣品中18-30nt的RN**段,利用高通量測(cè)序技術(shù)。--次性獲得單堿基分辨率的數(shù)百萬(wàn)條小RNA序列信息，依托強(qiáng)大的生物信息分析平臺(tái)，鑒定已知小RNA,并預(yù)測(cè)新的小RNA及其靶標(biāo)基因。IncRNA:測(cè)序長(zhǎng)鏈非編碼RNAs(longnon-cdingRNAs,IncRNAS)是一類長(zhǎng)度大于200nt且不編碼蛋白質(zhì)的RNAS(不含rRNA),***存在于各種...

lluminaHuman甲基化450K芯片服務(wù)每張芯片包含45萬(wàn)個(gè)CpG位點(diǎn),24846個(gè)基因來(lái)自于CCDS,2000多個(gè)**相關(guān)基因、400個(gè)miRNA基因啟動(dòng)子區(qū),300個(gè)甲基化熱點(diǎn)區(qū)。***覆蓋基因的啟動(dòng)子區(qū)域、5°UTR.***-個(gè)exon.基因內(nèi)部、3'UTR,***覆蓋CpGisland.CpGshores.CpGshelves;并且覆蓋了科學(xué)家們研究發(fā)現(xiàn)的一些其它重點(diǎn)區(qū)域,如:CpGisland以外的CpG位點(diǎn)在人類干細(xì)胞中觀察到的非CpG島甲基化位點(diǎn)多種**樣品與正常樣品以及不同組織之間有差異的甲基化位點(diǎn)miRNA啟動(dòng)子區(qū)域以及GWAS項(xiàng)目發(fā)現(xiàn)的疾病相關(guān)區(qū)域位點(diǎn)、FANTOM4...

piRNA的預(yù)測(cè)識(shí)別:通過(guò)高通量smallRNA測(cè)序數(shù)據(jù)預(yù)測(cè)piRNA;piRNA全基因組分布特征分析:解析piRNA在全基因組范圍內(nèi)的具體定位和簇分布特征piRNA臨近序列特征提取:采用motif短序列模式比配算法識(shí)別piRNA臨近調(diào)控區(qū)域加工區(qū)域特征，5"U端和10nt位置權(quán)重矩陣分析等計(jì)算調(diào)控序列的非隨機(jī)性概率,預(yù)測(cè)其序列調(diào)控功能。全基因組TE轉(zhuǎn)座子元件預(yù)測(cè)與重新注釋:針對(duì)物種基因組內(nèi)的轉(zhuǎn)座子序列,將轉(zhuǎn)座子識(shí)別為若干類別,包括longterminalrepeat(LTR),longinterspersednuclear(LINE),andinvertedrepeat(R)elements...

三、高分辨率熔解曲線(HRM)法高分辨率熔解曲線分析技術(shù)(HighResolutionMelting),簡(jiǎn)稱HRM，是近年來(lái)興起的一種檢測(cè)基因突變、進(jìn)行基因分型而及甲基化檢測(cè)的新方法?；驹硎腔诤怂岱肿佑捎谄伍L(zhǎng)短、GC含量、GC分布及單個(gè)堿基差異等物理性質(zhì)不同而造成DNA分子在加熱變性時(shí)都會(huì)有不同的熔解曲線的形狀和位置,并配合運(yùn)用高濃度的飽和熒光染料,可以迅速的檢測(cè)出核酸片段中GC含量和單堿基的突變。近年來(lái),公司引進(jìn)了RocheLightCycler@480I1和ABIVIIA7全自動(dòng)熒光定量PCR系統(tǒng)，為客戶提供專業(yè)化個(gè)性化的甲基化HRM檢測(cè)服務(wù)。操作流程:.待測(cè)基因序列片段或位點(diǎn)甲基...

長(zhǎng)鏈非編碼RNAs(longnon-codingRNAs,IncRNAs)是-類長(zhǎng)度大于200nt且不編碼蛋白質(zhì)的RNAS(不含rRNA),***存在于各種生物體內(nèi)。IncRNAs參與表觀逮傳、轉(zhuǎn)錄以及轉(zhuǎn)錄后等多水平的調(diào)控過(guò)程,在生命活動(dòng)中具有重要作用。本公司IncRNA測(cè)序服務(wù)使用高通量測(cè)序技術(shù)結(jié)合先進(jìn)的生物信息學(xué)分析,-次性獲得樣本中幾乎全部的IncRNAs信息,為您***、深入地研究IncRNAs的功能提供了全新的工具。實(shí)驗(yàn)流程：1.樣品提取總RNA后,去除rRNA。2.RN**斷化。3.以短片段為模板,用六堿基隨機(jī)弓|物反轉(zhuǎn)錄合成雙鏈cDNA。4.經(jīng)純化、末端修復(fù)、加堿基A、加測(cè)序接頭...