長鏈非編碼RNAs(longnon-codingRNAs,IncRNAs)是-類長度大于200nt且不編碼蛋白質(zhì)的RNAS(不含rRNA),***存在于各種生物體內(nèi)。IncRNAs參與表觀逮傳、轉(zhuǎn)錄以及轉(zhuǎn)錄后等多水平的調(diào)控過程,在生命活動中具有重要作用。本公司IncRNA測序服務使用高通量測序技術(shù)結(jié)合先進的生物信息學分析,-次性獲得樣本中幾乎全部的IncRNAs信息,為您***、深入地研究IncRNAs的功能提供了全新的工具。實驗流程:1.樣品提取總RNA后,去除rRNA。2.RN**斷化。3.以短片段為模板,用六堿基隨機弓|物反轉(zhuǎn)錄合成雙鏈cDNA。4.經(jīng)純化、末端修復、加堿基A、加測序接頭的步驟,根據(jù)測序長度和是否做對讀測序,確定瓊脂糖凝膠電泳回收片段的大小,并進行PCR擴增,完成測序文庫的制備。5.構(gòu)建好的文庫經(jīng)cBo擴增,用lluminaHiseq2500進行對讀測序。其中一些代表性的酶同時作用于鞘糖脂。上海實驗服務免費設計
TaqMan探針:該技術(shù)是由美國應用生物系統(tǒng)公司(ABI)研發(fā)的SNP分型技術(shù),其技術(shù)原理如下:PCR反應時,加入-對兩端有不同熒光標記的MGB特異探針來識別不同的等位基因(llel和llele2),5端為報告熒光基團(reporter),3端為淬滅熒光基團(quencher)。PCR過程中,兩個探針能與正向引物和反向引物之間的互補序列特異退火結(jié)合。當探針以完整形式存在時,由于能量共振轉(zhuǎn)移,熒光基團只發(fā)出微弱熒光。特異的探針與相應的等位基因結(jié)合后,DNA聚合酶發(fā)揮5到3'外切酶活性,把報告熒光基團切割下來,脫離3端淬滅熒光基團的淬滅作用(quench),從而發(fā)出熒光。兩個探針的5端標有不同的熒光(FAM或VIC),3端標有MGB淬滅基團結(jié)合體。根據(jù)檢測到的不同熒光,可以判斷相應的樣本的SNP等位基因型。醫(yī)學科研實驗服務地區(qū)科學基金宏基因組測序是對特定環(huán)境樣品中的微生物群體基因組,進行序列測定和功能基因的發(fā)掘。
數(shù)據(jù)分析:●數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計及質(zhì)量評估●Reads與參考基因組序列或轉(zhuǎn)錄組序列比對●Reads在基因組上的分布統(tǒng)計●轉(zhuǎn)錄組表達量的計算●基因差異表達分析●差異基因生物學通路分析●差異基因的GO分析●非編碼RNA(ncRNA)鑒定(轉(zhuǎn)綠本組裝、鑒定已知轉(zhuǎn)錄本及預測新轉(zhuǎn)錄本)●非編碼RNA(IncRNA)定量與差異表達分析●非編碼RNA(IncRNA)功能預測。長鏈非編碼RNAs(longnon-codingRNAS,IncRNAS)是一類長度大于200nt且不編碼蛋白質(zhì)的RNAs(不含rRNA)。***存在于各種生物體內(nèi)。IncRNAs參與表觀遺傳、轉(zhuǎn)錄以及轉(zhuǎn)錄后等多水平的調(diào)控過程,在生命活動中具有重要作用。本公司IncRNA測序服務使用高通量測序技術(shù)結(jié)合先進的生物信息學分析,一次性獲得樣本中幾乎全部的IncRNAs信息,為您***、深入地研究IncRNAs的功能提供了全新的工具。
circRNA是通過特殊的選擇性剪切產(chǎn)生封閉環(huán)狀結(jié)構(gòu)的非編碼RNA。circRNA不受RNA外切酶的影響。比線性RNA表達更穩(wěn)定。研究表明,某些特殊的circRNA分子富含miRNA結(jié)合位點,在細胞中起到miRNAsponges的作用,進而解除miRNA對其靶基因的抑制作用。ciRS-7(CDR1a)包含63個保守的miR-7結(jié)合位點,該circRNA在細胞中能夠有效吸附miR-7。而miR-7作為關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子***參與**途徑,如抑制在乳腺*、膠質(zhì)瘤等**中表達***上調(diào)的Pak1的表達;miR-7也能通過結(jié)合a-synuclein抑制其表達。這些研究暗示ciRS-7通過ceRNA機制調(diào)節(jié)miR-7的功能,是神經(jīng)系統(tǒng)疾病和*****的潛在靶點。甲基化特異性的PCR是-種靈敏度高且操作相對簡單的甲基化研究方法。
糖基化PCR芯片可用于研究編碼關(guān)鍵酶的84個基因的表達,這些酶在翻譯后,自蛋白多糖和糖蛋白添加和移除糖殘基。對蛋白多糖和糖蛋白功能必不可少的成熟的N-連接和O0-連接糖鏈的產(chǎn)“生和改變,不僅需要從頭穿糖合成的糖基轉(zhuǎn)移酶的活性,也需要重塑所需的糖苷酶和糖基轉(zhuǎn)移酶的活性。無論是通過刺激細胞分化或增生,還是外源性過度表達,導致細胞表面和分泌蛋白的表達增加,需要更多的糖基轉(zhuǎn)移酶和糖苷酶的活性,并且至少部分由其自身的基因表達上升造成的。芯片包含幾個重要的糖基轉(zhuǎn)移酶和糖苷酶基因,包括半乳糖,葡萄糖,甘露糖,N~-乙酰葡糖胺,N-乙酰基半乳糖胺,巖藻糖和唾液酸。其中一些代表性的酶同時作用于鞘糖脂。使用這一芯片試劑盒及配套試劑檢測RNA實驗標本,研究者可以簡單準確的檢測和分析蛋白糖基化相關(guān)的基因表達。通過實時定量PCR的方法,研究者即 能夠利用該芯片簡單可靠地同時檢測NO信號通路相關(guān)基因的表達。云南實驗服務地區(qū)科學基金
線粒體能量代謝PCR芯片可用于研究與線粒體呼吸相關(guān)的84個關(guān)鍵基因的表達。上海實驗服務免費設計
數(shù)據(jù)分析:原始數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計數(shù)據(jù)飽和度分析表達豐度分布統(tǒng)計重復性分析(需有2次以上**的重復實驗數(shù)據(jù))樣本間共有、特有及差異標簽統(tǒng)計標簽序列注釋基因表達圖譜分析基因表達模式聚類分析(不少于兩個樣品)基因差異表達分析GeneOntology顯菩性富集分析Pathway***性富集分析樣品要求●樣品類型:細胞、新鮮組織或RNA樣品?!駱悠妨?細胞樣品請?zhí)峁┲辽?x107個細胞,組織樣品請?zhí)峁┲辽?00mg的組織塊或切片,RNA樣品請?zhí)峁?0μg以上的總RNA。。樣品質(zhì)量:RNA無明顯降解,提取的總RNAOD260/280值在1.8~2.2之間,濃度z500ng/ul,28S:18S≥1.5,RIN≥●樣品保存:細胞樣品或新鮮組織塊(切成~50mg的小塊)可用TRIZOL或RNA保護劑處理或液氮凍存后,-80*C保存。RNA樣品可溶于乙醇或RNA-free的超純水中,-80°C保存。樣品保存期間避免反復凍融。●樣品運輸:樣品置于1.5ml管中,封口膜封好。干冰運輸。風險提示:丁香通*作為第三方平臺,為商家信息發(fā)布提供平臺空間。用戶咨詢產(chǎn)品時請注意保護個人信息及財產(chǎn)安全,合理判斷,謹慎選購商品,商家和用戶對交易行為負責。對于醫(yī)療器械類產(chǎn)品,請先查證核實企業(yè)經(jīng)營資質(zhì)和醫(yī)療器械產(chǎn)品注冊證情況。上海實驗服務免費設計
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎(chǔ)實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術(shù)支持,探討科研前沿熱點研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究
4.二代測序:轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗