轉(zhuǎn)錄組測序的研究對象為特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和,主要包括mRNA和非編碼RNA。轉(zhuǎn)錄組研究是基因功能及結(jié)構(gòu)研究的基礎(chǔ)和出發(fā)點,通過新一代高通量測序,能夠***快速地獲得某一物種特定組織或***在某一狀態(tài)下的幾乎所有轉(zhuǎn)錄本序列信息,已曠泛應(yīng)用于基礎(chǔ)研究、臨床診斷和藥物研發(fā)等領(lǐng)域。技術(shù)優(yōu)勢：任意物種的全轉(zhuǎn)錄組分析:無需預(yù)先設(shè)計特異性探針,因此無需了解物種基因或基因組信息,能夠直接對任何物種進(jìn)行*****的轉(zhuǎn)錄組分析。覆蓋度高:數(shù)字化信號,直接測定幾乎所有轉(zhuǎn)錄本片段的序列;。檢測閾值寬:跨越6個數(shù)量級的寬檢測閾值,從幾個到數(shù)十萬個拷貝精確計數(shù);●分辨率高:可以檢測基因家族中相似基因及可變剪接造成的單堿基差異;。檢測范圍廣:從幾個到數(shù)十萬個拷貝精確計數(shù)，可同時鑒定及定量正常和稀有的轉(zhuǎn)錄本。降低了測序過程中的GC偏向性,提高了測序覆蓋度和均一性,測序數(shù)據(jù)更加準(zhǔn)確、可靠。服務(wù)實驗服務(wù)實驗可參觀
lluminaHuman甲基化450K芯片服務(wù)每張芯片包含45萬個CpG位點,24846個基因來自于CCDS,2000多個**相關(guān)基因、400個miRNA基因啟動子區(qū),300個甲基化熱點區(qū)。***覆蓋基因的啟動子區(qū)域、5°UTR.***-個exon.基因內(nèi)部、3'UTR,***覆蓋CpGisland.CpGshores.CpGshelves;并且覆蓋了科學(xué)家們研究發(fā)現(xiàn)的一些其它重點區(qū)域,如:CpGisland以外的CpG位點在人類干細(xì)胞中觀察到的非CpG島甲基化位點多種**樣品與正常樣品以及不同組織之間有差異的甲基化位點miRNA啟動子區(qū)域以及GWAS項目發(fā)現(xiàn)的疾病相關(guān)區(qū)域位點、FANTOM4啟動子等。實驗流程:1基因組DNA;2.亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化;3.VCA方式擴(kuò)增、片股化;4.芯片雜交、洗脫、延伸、成像;5.數(shù)據(jù)分析.江西實驗服務(wù)推薦咨詢CpG甲基化焦磷酸測序檢測法通過將鏈合成過程中釋放出的焦磷酸(PPi)轉(zhuǎn)化成光信號來監(jiān)測鏈的合成過程。
佩土物多性性位測環(huán)境微生物多樣性檢測,是以樣品中的微生物群落作為整體進(jìn)行研究,通過對核糖體RNA高變區(qū)域(比如16S/18S/1TS等序列)或功能基因(如古菌的氨氧化基因等)進(jìn)行PCR擴(kuò)增和測序,然后分析相應(yīng)環(huán)境下微生物群落的多樣性和分布規(guī)律。生物信息分析1.原始數(shù)據(jù)整理、過濾及質(zhì)量評估2.OTU生成和注釋3.基于物種豐度分析:◆稀釋曲線◆豐度分布曲線+Alpha多樣性分析◆物種豐度差異分析4.基于群落結(jié)構(gòu)分析:◆單樣品物種分布餅圖多樣品物種分布柱圖+含進(jìn)化關(guān)系的物種豐度+Beta多樣性分析5.根據(jù)客戶需求進(jìn)行個性化分析
circRNA是通過特殊的選擇性剪切產(chǎn)生封閉環(huán)狀結(jié)構(gòu)的非編碼RNA。circRNA不受RNA外切酶的影響。比線性RNA表達(dá)更穩(wěn)定。研究表明,某些特殊的circRNA分子富含miRNA結(jié)合位點,在細(xì)胞中起到miRNAsponges的作用,進(jìn)而解除miRNA對其靶基因的抑制作用。ciRS-7(CDR1a)包含63個保守的miR-7結(jié)合位點,該circRNA在細(xì)胞中能夠有效吸附miR-7。而miR-7作為關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子***參與**途徑,如抑制在乳腺*、膠質(zhì)瘤等**中表達(dá)***上調(diào)的Pak1的表達(dá);miR-7也能通過結(jié)合a-synuclein抑制其表達(dá)。這些研究暗示ciRS-7通過ceRNA機(jī)制調(diào)節(jié)miR-7的功能,是神經(jīng)系統(tǒng)疾病和*****的潛在靶點。宏基因組測序是對特定環(huán)境樣品中的微生物群體基因組,進(jìn)行序列測定和功能基因的發(fā)掘。
piRNA的預(yù)測識別:通過高通量smallRNA測序數(shù)據(jù)預(yù)測piRNA;piRNA全基因組分布特征分析:解析piRNA在全基因組范圍內(nèi)的具體定位和簇分布特征piRNA臨近序列特征提取:采用motif短序列模式比配算法識別piRNA臨近調(diào)控區(qū)域加工區(qū)域特征，5"U端和10nt位置權(quán)重矩陣分析等計算調(diào)控序列的非隨機(jī)性概率,預(yù)測其序列調(diào)控功能。全基因組TE轉(zhuǎn)座子元件預(yù)測與重新注釋:針對物種基因組內(nèi)的轉(zhuǎn)座子序列,將轉(zhuǎn)座子識別為若干類別,包括longterminalrepeat(LTR),longinterspersednuclear(LINE),andinvertedrepeat(R)elements。并結(jié)合piRNA的生成來源進(jìn)行座位的富集度分析和聚類;全基因組特征區(qū)域的覆蓋度分析:針對rRNA,tRNA,miRNA,codinggene,repeat,transposon,Su(Ste),AT-ChX等特殊基因組功能區(qū)域進(jìn)行序列的覆蓋度分析;piRNA全基因組ORF與CDS注釋:結(jié)合piRNA定位進(jìn)行功能基因的分布分析;piRNA表達(dá)量計算與piRNA簇表達(dá)相關(guān)性分析:計算樣本之間的piRNA表達(dá)量,計算樣本之間piRNA簇之間的表達(dá)相關(guān)系數(shù)。統(tǒng)計重復(fù)序列內(nèi)piRNA表達(dá)量分布.基因區(qū)piRNA表達(dá)量分布。甲基化特異性的PCR是-種靈敏度高且操作相對簡單的甲基化研究方法。服務(wù)實驗服務(wù)實驗可參觀
英拜生物公司在多年miRNA表達(dá)譜芯片服務(wù)的基礎(chǔ)上,推出基于lluminaGAllx的smallRNA測序服務(wù)。服務(wù)實驗服務(wù)實驗可參觀
三、高分辨率熔解曲線(HRM)法高分辨率熔解曲線分析技術(shù)(HighResolutionMelting),簡稱HRM，是近年來興起的一種檢測基因突變、進(jìn)行基因分型而及甲基化檢測的新方法?；驹硎腔诤怂岱肿佑捎谄伍L短、GC含量、GC分布及單個堿基差異等物理性質(zhì)不同而造成DNA分子在加熱變性時都會有不同的熔解曲線的形狀和位置,并配合運用高濃度的飽和熒光染料,可以迅速的檢測出核酸片段中GC含量和單堿基的突變。近年來,公司引進(jìn)了RocheLightCycler@480I1和ABIVIIA7全自動熒光定量PCR系統(tǒng)，為客戶提供專業(yè)化個性化的甲基化HRM檢測服務(wù)。操作流程:.待測基因序列片段或位點甲基化引物設(shè)計(300p以內(nèi))。.利用甲基化轉(zhuǎn)移酶修飾的DNA和非甲基化修飾的DNA制備標(biāo)準(zhǔn)品(0%，1%，5%。10%,20%,50%,100%梯度HRM標(biāo)準(zhǔn)曲線)●亞硫酸氫鹽處理樣品DNA.上機(jī)檢測●數(shù)據(jù)處理,形成報告(包括實驗過程、試劑耗材、熒光PCR儀原始文件、測序文件等)。服務(wù)實驗服務(wù)實驗可參觀
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實驗平臺，提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進(jìn)度，保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性，為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請：提供標(biāo)書課題設(shè)計、撰寫，標(biāo)書部分基礎(chǔ)實驗的開展，設(shè)計的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c，中標(biāo)率很高。
3.提供熱點**文獻(xiàn)技術(shù)支持，探討科研前沿?zé)狳c研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測序：轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實驗