核仁小RNA(snoRNAs)是一類存在于真核生物細胞核仁的小分子非編碼RNA,長度60-300nt，能與核仁核糖**白結(jié)臺形成snoRNPs復(fù)合物。在脊椎動物中編碼核仁小RNA的基因主要存在于蛋白編碼基因或非蛋白編碼基因的內(nèi)含子區(qū)域，并且經(jīng)過進一步的轉(zhuǎn)錄后加工處理形成成熟的核仁小RNA。snoRNAS參與的生物學(xué)過程主要有rRNA的加工處理,RNA剪接和翻譯過程的調(diào)控以及氧化應(yīng)激反應(yīng)。由于snoRNA被認為主要存在于核仁**能單一,之后的很長-段時間,snoRNA的研究陷入低潮。然而，近幾年,隨著測序技術(shù)的發(fā)展,越來越多的數(shù)據(jù)表明snoRNA在**中被異常調(diào)控,還參與到遺傳性疾病、造血、代謝以及**的過程中。新-代測序技術(shù)的高通量、高靈敏性、高精確性、低樣品需求量、操作簡便等特點，為在基因組范圍內(nèi)快速研究任-物種已知的snoRNA的表達情況和預(yù)測挖掘新的snoRNA調(diào)控分子提供了強有力的技術(shù)工具。本公司snoRNA測序基于llumina測序平臺,能夠準確檢測樣本snoRNA表達情況。結(jié)合Bisulfite的測序法是一種靈敏的能直接檢測分析基因組DNA甲基化模式的方法。。黑龍江實驗服務(wù)贈送提供技術(shù)路線
snoRNA測序核仁小RNA(snoRNAs)是一類存在于真核生物細胞核仁的小分子非編碼RNA,長度60-300nt,能與核仁核糖**白結(jié)合形成snoRNPs復(fù)合物。在脊椎動物中編碼核仁小RNA的基因主要存在于蛋白編碼基因或非蛋白編碼基因的內(nèi)含子區(qū)域，并且經(jīng)過進一步的轉(zhuǎn)錄后加工處理形成成熟的核仁小RNA。snoRNAS參與的生物學(xué)過程主要有rRNA的加工處理,RNA剪接和翻譯過程的調(diào)控以及氧化應(yīng)激反應(yīng)。由于snoRNA被認為主要存在于核仁**能單一,之后的很長-段時間,snoRNA的研究陷入低潮。然而，近幾年,隨著測序技術(shù)的發(fā)展,越來越多的數(shù)據(jù)表明snoRNA在**中被異常調(diào)控,還參與到選傳性疾病、造血、代謝以及**的過程中。新-代測序技術(shù)的高通量、高靈敏性、高精確性、低樣品需求量、操作簡便等特點,為在基因組范圍內(nèi)快速研究任一物種已知的snoRNA的表達情況和預(yù)測挖掘新的snoRNA調(diào)控分子提供了強有力的技術(shù)工具。本公司snoRNA測序基于llumina測序平臺,能夠準確檢測樣本snoRNA表達情況。陜西實驗服務(wù)國家自然科學(xué)基金結(jié)合您的實驗要求分析課題中所需要的技術(shù)方法和檢測指標,幫助您設(shè)計出經(jīng)濟合理的實驗方案。
利用序列捕獲技術(shù)將全基因組外顯子區(qū)域DNA捕捉并富集后進行高通量測序的基因組分析方法。是-種選擇基因組的編碼序列的高效策略,外顯子測序相對于基因組重測序成本較低,對研究已知基因的SNP.IndelI等具有較大的優(yōu)勢。簡介:全外顯子組(Exome)是指基因組中全部外顯子區(qū)域的總和，人類的外顯子組約占基因組的1%~2%,包含了蛋白質(zhì)合成，的重要信息,是基因行使功能**直接的體現(xiàn)。絕大部分疾病或性狀相關(guān)的變異位于外顯子區(qū)域,與全基因組重測序相比,全外顯子組測序*針對外顯子區(qū)域內(nèi)部和邊界區(qū)域的DNA進行測序,覆蓋度更深,數(shù)據(jù)準確性更高,可更加經(jīng)濟.高效地發(fā)現(xiàn)與疾病或表型相關(guān)的個體速傳變異及罕見突變。人全外顯子組測序技術(shù)已逐步應(yīng)用到單基因致病基因和復(fù)雜疾病易感基因研究中。
轉(zhuǎn)錄組測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和,主要包括mRNA和非編碼RNA。轉(zhuǎn)錄組研究是基因功能及結(jié)構(gòu)研究的基礎(chǔ)和出發(fā)點,通過新一代高通量測序,能夠***快速地獲得某一物種特定組織或***在某一狀態(tài)下的幾乎所有轉(zhuǎn)錄本序列信息,已曠泛應(yīng)用于基礎(chǔ)研究、臨床診斷和藥物研發(fā)等領(lǐng)域。技術(shù)優(yōu)勢：任意物種的全轉(zhuǎn)錄組分析:無需預(yù)先設(shè)計特異性探針,因此無需了解物種基因或基因組信息,能夠直接對任何物種進行*****的轉(zhuǎn)錄組分析。覆蓋度高:數(shù)字化信號,直接測定幾乎所有轉(zhuǎn)錄本片段的序列;。檢測閾值寬:跨越6個數(shù)量級的寬檢測閾值,從幾個到數(shù)十萬個拷貝精確計數(shù);●分辨率高:可以檢測基因家族中相似基因及可變剪接造成的單堿基差異;。檢測范圍廣:從幾個到數(shù)十萬個拷貝精確計數(shù)，可同時鑒定及定量正常和稀有的轉(zhuǎn)錄本。SmallRNA參與細胞生長、發(fā)育、代謝、基因轉(zhuǎn)錄和翻譯等諸多生物學(xué)過程。
基因表達譜測序為對組織或細胞在特定狀態(tài)下產(chǎn)生的mRNA進行高通量測序分析,得到基因差異表達的情況。測序法進行基因表達分析具有定量準確,重復(fù)性、特異性、靈敏性高的特點。與全轉(zhuǎn)錄組測序研究相比,表達譜測序采用單端或雙端讀長的策略,測序通量較小,成本較低;與芯片法相比,測序法具有無需樣本序列信息即可實現(xiàn)任一物種已知和未知轉(zhuǎn)錄本差異研究的開放性特點,對低豐度轉(zhuǎn)錄本的檢測具有靈敏性和特異性高的優(yōu)點?？蛻艨筛鶕?jù)實驗?zāi)康?靈活選擇合適的測序深度,以達到對不同豐度轉(zhuǎn)錄本的檢測要求。-般10M~20Mreads數(shù)的測序量即可檢測到比芯片更多的差異基因。如果對低豐度表達基因的關(guān)注度高,建議至少測30M以上的reads.宏基因組測序分析微生物群體基因組成及功能,解讀微生物群體的多樣性與豐度,研究新的、具有特定功能的基因。焦亡生物相關(guān)實驗服務(wù)
高通量測序(轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、miRNA測序、IncRNA測序、circRNA測序、tRF測序、甲基化測序)。黑龍江實驗服務(wù)贈送提供技術(shù)路線
三、數(shù)據(jù)分析.原始數(shù)據(jù)產(chǎn)“出統(tǒng)計已知smallRNA注釋:miRNA,siRNA,piRNA,rRNA,tRNA,snRNA,snoRNA,repeatasscociatedsRNA等降解片段鑒定:mRNA,exon,intron等預(yù)測新的miRNAmiRNA同源性結(jié)構(gòu)分析miRNA表達譜聚類分析miRNA差異表達分析miRNA靶基因預(yù)測靶基因功能注釋、Pathway和GeneOnlotogy富集分析與mRNA進行關(guān)聯(lián)分析(需要有mRNA數(shù)據(jù))四、樣品要求樣品類型:細胞、新鮮組織或RNA樣品。樣品量:細胞樣品請?zhí)峁┲辽?x106個細胞,組織樣品請?zhí)峁┲辽?00mg的組織塊或切片,RNA樣品請?zhí)峁?0μg以上的總RNA。樣品質(zhì)量:RNA無明顯降解,提取的總RNAOD260/280值在1.8~2.2之間,濃度z500ng/ul,28S:18S≥1.5,RIN≥8。樣品保存:細胞樣品或新鮮組織塊(切成~50mg的小塊)可用TRIZOL或RNA保護劑處理或液氮凍存后,-80°C保存。RNA樣品可溶于乙醇或RNA-free的超純水中,-80°C保存。樣品保存期間避免反復(fù)凍融。樣品運輸:樣品置于1.5ml管中,封口膜封好,干冰運輸。黑龍江實驗服務(wù)贈送提供技術(shù)路線
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺，提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度，保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性，為您的標書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標書申請：提供標書課題設(shè)計、撰寫，標書部分基礎(chǔ)實驗的開展，設(shè)計的標書均符合科研前沿熱點，中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術(shù)支持，探討科研前沿熱點研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測序：轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學(xué)實驗