piRNA的預(yù)測識別:通過高通量smallRNA測序數(shù)據(jù)預(yù)測piRNA;piRNA全基因組分布特征分析:解析piRNA在全基因組范圍內(nèi)的具體定位和簇分布特征piRNA臨近序列特征提取:采用motif短序列模式比配算法識別piRNA臨近調(diào)控區(qū)域加工區(qū)域特征，5"U端和10nt位置權(quán)重矩陣分析等計(jì)算調(diào)控序列的非隨機(jī)性概率,預(yù)測其序列調(diào)控功能。全基因組TE轉(zhuǎn)座子元件預(yù)測與重新注釋:針對物種基因組內(nèi)的轉(zhuǎn)座子序列,將轉(zhuǎn)座子識別為若干類別,包括longterminalrepeat(LTR),longinterspersednuclear(LINE),andinvertedrepeat(R)elements。并結(jié)合piRNA的生成來源進(jìn)行座位的富集度分析和聚類;全基因組特征區(qū)域的覆蓋度分析:針對rRNA,tRNA,miRNA,codinggene,repeat,transposon,Su(Ste),AT-ChX等特殊基因組功能區(qū)域進(jìn)行序列的覆蓋度分析;piRNA全基因組ORF與CDS注釋:結(jié)合piRNA定位進(jìn)行功能基因的分布分析;piRNA表達(dá)量計(jì)算與piRNA簇表達(dá)相關(guān)性分析:計(jì)算樣本之間的piRNA表達(dá)量,計(jì)算樣本之間piRNA簇之間的表達(dá)相關(guān)系數(shù)。統(tǒng)計(jì)重復(fù)序列內(nèi)piRNA表達(dá)量分布.基因區(qū)piRNA表達(dá)量分布。部分課題提供SCI成文服務(wù),-次收費(fèi)，服務(wù)到底周期:--年，費(fèi)用與IF以及接受時間有關(guān)。湖南實(shí)驗(yàn)服務(wù)實(shí)驗(yàn)可參觀
數(shù)據(jù)分析:原始數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)飽和度分析表達(dá)豐度分布統(tǒng)計(jì)重復(fù)性分析(需有2次以上**的重復(fù)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù))樣本間共有、特有及差異標(biāo)簽統(tǒng)計(jì)標(biāo)簽序列注釋基因表達(dá)圖譜分析基因表達(dá)模式聚類分析(不少于兩個樣品)基因差異表達(dá)分析GeneOntology顯菩性富集分析Pathway***性富集分析樣品要求●樣品類型:細(xì)胞、新鮮組織或RNA樣品?！駱悠妨?細(xì)胞樣品請?zhí)峁┲辽?x107個細(xì)胞,組織樣品請?zhí)峁┲辽?00mg的組織塊或切片,RNA樣品請?zhí)峁?0μg以上的總RNA。。樣品質(zhì)量:RNA無明顯降解,提取的總RNAOD260/280值在1.8~2.2之間,濃度z500ng/ul,28S:18S≥1.5,RIN≥●樣品保存:細(xì)胞樣品或新鮮組織塊(切成~50mg的小塊)可用TRIZOL或RNA保護(hù)劑處理或液氮凍存后,-80*C保存。RNA樣品可溶于乙醇或RNA-free的超純水中,-80°C保存。樣品保存期間避免反復(fù)凍融?！駱悠愤\(yùn)輸:樣品置于1.5ml管中,封口膜封好。干冰運(yùn)輸。風(fēng)險(xiǎn)提示:丁香通*作為第三方平臺,為商家信息發(fā)布提供平臺空間。用戶咨詢產(chǎn)品時請注意保護(hù)個人信息及財(cái)產(chǎn)安全,合理判斷,謹(jǐn)慎選購商品,商家和用戶對交易行為負(fù)責(zé)。對于醫(yī)療器械類產(chǎn)品,請先查證核實(shí)企業(yè)經(jīng)營資質(zhì)和醫(yī)療器械產(chǎn)品注冊證情況。重慶實(shí)驗(yàn)服務(wù)售后服務(wù)此外,芯片上還包括16個已經(jīng)被實(shí)驗(yàn)證實(shí)的線粒體能量代謝信號通路的生物標(biāo)識物基因。
佩土物多性性位測環(huán)境微生物多樣性檢測,是以樣品中的微生物群落作為整體進(jìn)行研究,通過對核糖體RNA高變區(qū)域(比如16S/18S/1TS等序列)或功能基因(如古菌的氨氧化基因等)進(jìn)行PCR擴(kuò)增和測序,然后分析相應(yīng)環(huán)境下微生物群落的多樣性和分布規(guī)律。生物信息分析1.原始數(shù)據(jù)整理、過濾及質(zhì)量評估2.OTU生成和注釋3.基于物種豐度分析:◆稀釋曲線◆豐度分布曲線+Alpha多樣性分析◆物種豐度差異分析4.基于群落結(jié)構(gòu)分析:◆單樣品物種分布餅圖多樣品物種分布柱圖+含進(jìn)化關(guān)系的物種豐度+Beta多樣性分析5.根據(jù)客戶需求進(jìn)行個性化分析
circRNA是通過特殊的選擇性剪切產(chǎn)生封閉環(huán)狀結(jié)構(gòu)的非編碼RNA。circRNA不受RNA外切酶的影響。比線性RNA表達(dá)更穩(wěn)定。研究表明,某些特殊的circRNA分子富含miRNA結(jié)合位點(diǎn),在細(xì)胞中起到miRNAsponges的作用,進(jìn)而解除miRNA對其靶基因的抑制作用。ciRS-7(CDR1a)包含63個保守的miR-7結(jié)合位點(diǎn),該circRNA在細(xì)胞中能夠有效吸附miR-7。而miR-7作為關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子***參與**途徑,如抑制在乳腺*、膠質(zhì)瘤等**中表達(dá)***上調(diào)的Pak1的表達(dá);miR-7也能通過結(jié)合a-synuclein抑制其表達(dá)。這些研究暗示ciRS-7通過ceRNA機(jī)制調(diào)節(jié)miR-7的功能,是神經(jīng)系統(tǒng)疾病和*****的潛在靶點(diǎn)?；饦?biāo)書的寫作與基金申請指導(dǎo):提供基金標(biāo)書的修改,潤色.專業(yè)內(nèi)容的提點(diǎn)。
技術(shù)優(yōu)勢●通量高:一次測序得到500萬條以上的序列;●分辨率高:可以檢測小RNA單個堿基的差異;●精細(xì)度高:從幾個到數(shù)十萬個拷貝精確計(jì)數(shù);.●不依賴已知信息:既能鑒定已知小RNA,又能發(fā)現(xiàn)新小RNA;.可重復(fù)性高:深度測序保證了抽樣隨機(jī)性,重復(fù)性非常好,無需重復(fù)實(shí)驗(yàn)。全基因組重測序隨著測序成本降低和已知基因組序列物種增多,全基因組重測序已經(jīng)成為動植物育種、群體進(jìn)化、藥物研發(fā)、疾病研究和臨床診斷中**為迅速而有效的方法之一。全基因組重測序是對基因組序列已知物種的個體進(jìn)行基因組測序,并在個體或群體水平進(jìn)行差異性分析的測序方法。相比芯片檢測或者外顯子測序,華大科技采用短序列(Short-Reads).雙末端(Paired-End)和不同長度的插入片段(Insert-Size)的測序策略?？梢?**的挖掘基因序列差異和結(jié)構(gòu)變異。在全基因組水平上掃描并檢測與生物體重要性狀相關(guān)的突變位點(diǎn),具有重大的科研價(jià)值和產(chǎn)業(yè)價(jià)值。技術(shù)優(yōu)勢:多種變異檢測:單核苷酸多態(tài)行(SNP).插入缺失(InDel)和結(jié)構(gòu)變異(SV);與芯片方法比較,可以檢測到新的變異序列;與人類全基因組從頭測序相比,耗時更短、成本更低。每一輪測序反應(yīng)體系中.只加入一種脫氧核苷酸三磷酸(dNTP)。湖南實(shí)驗(yàn)服務(wù)實(shí)驗(yàn)可參觀
NO是參與和抑制疾病發(fā)生的動態(tài)生物效應(yīng)分子。湖南實(shí)驗(yàn)服務(wù)實(shí)驗(yàn)可參觀
技術(shù)優(yōu)勢:多種變異檢測:單核苷酸多態(tài)行(SNP).插入缺失(InDel)和結(jié)構(gòu)變異(SV);與芯片方法比較，可以檢測到新的變異序列;與人類全基因組從頭測序相比，耗時更短、成本更低。研究內(nèi)容:一、數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計(jì)基因組單堿基深度分布及覆蓋度分析二、一致性序列組裝根據(jù)與參考基因組序列的比對結(jié)果,利用貝葉斯統(tǒng)計(jì)模型檢測出測序個體基因組中每個堿基位點(diǎn)比較大可能性的基因型,并組裝出該個體基因組的一致序列。三、SNP檢測及在基因組的分布在全基因組一致性序列的基礎(chǔ)上,從中提取全基因組中所有的潛在多態(tài)性位點(diǎn),再根據(jù)質(zhì)量值、深度、重復(fù)性等因素做進(jìn)一步的過濾篩選，**終得到高可信度的SNP數(shù)據(jù)集。根據(jù)已有的基因集對檢測到得變異進(jìn)行注釋。四、InDel檢測及在基因組的分布使用測序個體的短序列與參考基因組進(jìn)行Paired-End比對,將比對結(jié)果進(jìn)行聚類分析,并結(jié)合Paired-End關(guān)系檢測可信的shortInDel。在檢測過程中,gap的長度為1~3個堿基。對于每個InDel的檢測，至少需要3個雙末端序列的支持。湖南實(shí)驗(yàn)服務(wù)實(shí)驗(yàn)可參觀
公司特色是以各式高通量二代測序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性，為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請：提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫，標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開展，設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn)，中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持，探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測序：轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)