進(jìn)一步檢測(cè)S100A4的功能，結(jié)果顯示敲除S100A4***降低高轉(zhuǎn)移性HCC細(xì)胞系的遷移和侵襲能力，過表達(dá)S100A4則***增強(qiáng)低轉(zhuǎn)移性HCC細(xì)胞系的遷移和侵襲能力（圖3d）。然后作者收集了S100A4敲除和S100A4過表達(dá)的HCC細(xì)胞的外泌體，結(jié)果得到了類似的結(jié)論，S100A4過表達(dá)外泌體***增強(qiáng)HCC細(xì)胞的遷移和侵襲，以及體內(nèi)肺部轉(zhuǎn)移的能力（圖3e-f）。這些結(jié)果證實(shí)了外泌體S100A4具有增強(qiáng)HCC細(xì)胞轉(zhuǎn)移潛力的功能。
4、外泌體S100A4通過STAT3磷酸化***OPN轉(zhuǎn)錄
接下來探究了S100A4的作用機(jī)制，首先選擇了21個(gè)**干性相關(guān)基因，然后下載了GEO數(shù)據(jù)進(jìn)行相關(guān)性分析，結(jié)果顯示S100A4主要和11個(gè)基因正相關(guān)（圖4a）。隨后檢測(cè)了不同HCC細(xì)胞系中敲除和過表達(dá)S100A4后11個(gè)基因的表達(dá)水平的改變，結(jié)果顯示只有OPN是S100A4的下游基因，其表達(dá)受到S100A4的調(diào)控（圖4b-f）。OPN是促進(jìn)HCC轉(zhuǎn)移和干性的關(guān)鍵因子，但外泌體S100A4調(diào)節(jié)OPN的機(jī)制仍不清楚。 提供***科研設(shè)計(jì)咨詢及輔助實(shí)驗(yàn)。凋亡課題實(shí)驗(yàn)外包
一、上傳數(shù)據(jù)
可以上傳原始的fast文件，也可以上傳時(shí)序count表達(dá)文件。按照數(shù)據(jù)情況填寫以下6個(gè)問題，然后點(diǎn)擊“Run”開始進(jìn)行質(zhì)控
二、初級(jí)分析
數(shù)據(jù)質(zhì)控合格后，進(jìn)行初級(jí)分析，包括：差異表達(dá)量計(jì)算、基因簇分析。差異計(jì)算方法包括ImpulseDE2、NextmaSigPro、DESeq2，可以根據(jù)實(shí)際情況自由選擇。
三、次級(jí)分析
次級(jí)分析用于評(píng)估豐富度、因子結(jié)合和時(shí)間關(guān)系。我們可以選擇不同類型的分析來分析初級(jí)分析中獲得的基因簇，即Enrichment，用于識(shí)別基因簇中高表達(dá)的基因；FactorBinding，使用motif和CHIP-seq預(yù)測(cè)影響基因簇表達(dá)的轉(zhuǎn)錄因子；TemporalRelations，識(shí)別轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)（GRN）。 TBI課題分子生物學(xué)促*分泌體通過外泌體傳遞和運(yùn)輸是轉(zhuǎn)移前微環(huán)境形成和轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵。
核型生物標(biāo)志物
MarkerDB共有154個(gè)核型標(biāo)記或核型圖，與47種不同的疾病/狀況相關(guān)。MarkerDB中的所有核型生物標(biāo)記物數(shù)據(jù)都是從原始文獻(xiàn)中提取的，包括**學(xué)和血液學(xué)中的遺傳學(xué)和細(xì)胞遺傳學(xué)圖譜，以及人類不平衡染色體畸變目錄。目前，MarkerDB中的所有核型標(biāo)記都有一個(gè)或多個(gè)疾病xiang關(guān)聯(lián)，以及MarkerDB ID、標(biāo)記的獨(dú)特圖譜或核型圖（顯示與疾病核型相鄰的正常核型）、核型的簡(jiǎn)短描述、疾病關(guān)聯(lián)、一個(gè)或多個(gè)相關(guān)基因的文獻(xiàn)參考和超鏈接。
作為一種典型的G蛋白偶聯(lián)受體， DRD2的內(nèi)化誘導(dǎo)其受體β-arrestin2在質(zhì)膜上的募集，并增加其與β-arrestin2的親和力。LPS和CM刺激了DRD2和β-arrestin2的蛋白-蛋白結(jié)合(圖5F-G)。同時(shí)，通過IF染色觀察到，經(jīng)過LPS處理后，DRD2似乎在細(xì)胞質(zhì)中與p-p65結(jié)合(圖5A)， Co-IP和IB進(jìn)一步證實(shí)了這種結(jié)合(圖5F)。據(jù)報(bào)道，β-arrestin2信號(hào)的***會(huì)破壞星形膠質(zhì)細(xì)胞中TAK1-Tab1的結(jié)合，而這種結(jié)合對(duì)于TAK1的***至關(guān)重要。本研究還證實(shí)，內(nèi)化的DRD2可以促進(jìn)TAB1與β-arrestin2的結(jié)合，削弱TAB1與TAK1的結(jié)合(圖5H)。綜上所述，DRD2***的β-arrestin2通過競(jìng)爭(zhēng)性地結(jié)合TAB1來拮抗TAK1的磷酸化。TIMEOR用于推斷基因調(diào)控事件之間的關(guān)系。
。CDKs的催化活性受細(xì)胞周期檢查點(diǎn)的調(diào)控，這些檢查點(diǎn)監(jiān)測(cè)細(xì)胞周期中主要事件的有序執(zhí)行。檢查點(diǎn)**了故障安全機(jī)制，它確保只有在滿足的比較好情況下才允許細(xì)胞分裂。所有生物體都需要通過細(xì)胞分裂周期進(jìn)行適當(dāng)?shù)幕蚪M維護(hù)，以確保正常生殖、發(fā)育和預(yù)防包括**在內(nèi)的各種疾病。DNA損傷可由內(nèi)源性過程引起，如DNA復(fù)制過程中偶爾引入的DNA不匹配，拓?fù)洚悩?gòu)酶I和拓?fù)洚悩?gòu)酶II活性失效導(dǎo)致的DNA鏈斷裂，或由正常代謝副產(chǎn)品產(chǎn)生的ROS攻擊DNA。外源性來源主要包括誘變化學(xué)品、紫外線和電離輻射(IR)。細(xì)胞周期檢查點(diǎn)能夠檢測(cè)DNA損傷，提示其存在，并***延緩細(xì)胞周期進(jìn)程的通路，修復(fù)DNA損傷，或通過誘導(dǎo)細(xì)胞死亡來消除基因不穩(wěn)定細(xì)胞。哺乳動(dòng)物細(xì)胞DNA損傷反應(yīng)(DDR)信號(hào)的**是共濟(jì)失調(diào)***擴(kuò)張癥突變(ATM)和ATM-和rad3相關(guān)(ATR)蛋白激酶。ATM和ATR磷酸化并***另外兩個(gè)激酶CHK1和CHK2,CHK1和CHK2與ATM和ATR一起，是細(xì)胞周期檢查點(diǎn)[24]的主調(diào)節(jié)器。通過調(diào)節(jié)CDKs的活性，這些分子在細(xì)胞周期G1S期、S內(nèi)期和G2M期減緩或阻止細(xì)胞周期進(jìn)程，使DNA損傷得以修復(fù)。ATM和ATR通過控制不同因子在DNA損傷位點(diǎn)的表達(dá)、活性或招募來促進(jìn)DNA修復(fù)高表達(dá)的外泌體CD44v6和C1QBP是預(yù)測(cè)PDAC患者預(yù)后和肝轉(zhuǎn)移的很有前途的生物標(biāo)志物。CRO課題整包服務(wù)
提供分子生物以及到后續(xù)動(dòng)物建模的一整套服務(wù)。凋亡課題實(shí)驗(yàn)外包
在野生型小鼠和Caspase-11缺陷小鼠中，MCD處理***降低了pro-caspase1的蛋白水平(圖5A和F)，而增加了活性Caspase-1的蛋白水平(圖5A和G)。此外，Caspase-11缺陷小鼠的活性caspase-1水平明顯低于野生型小鼠，說明MCD處理Caspase-11缺陷小鼠肝臟中Caspase-1的***較少。同樣，我們?cè)贛CD處理的Caspase-11缺陷小鼠的肝細(xì)胞中檢測(cè)到較少的Gsdmd-N表達(dá)(圖5H和I)。這些結(jié)果表明，Caspase-11缺失減弱了MCD誘導(dǎo)的Gsdmd和IL-1β的***。
6.Caspase-11缺乏抑制脂多糖誘導(dǎo)的肝細(xì)胞焦亡和體外損傷
我們?cè)隗w外評(píng)價(jià)Caspase-11缺乏對(duì)肝細(xì)胞焦亡的影響。我們用脂多糖(LPS)處理野生型小鼠原代肝細(xì)胞，發(fā)現(xiàn)LPS誘導(dǎo)了pro-caspase-11和caspase-11的表達(dá)(圖6A和B)，表明LPS誘導(dǎo)了原代肝細(xì)胞中caspase-11的***。我們進(jìn)一步處理來自野生型和Caspase-11缺陷小鼠的原代肝細(xì)胞，并監(jiān)測(cè)Gsdmd的表達(dá)和***。如圖6C和D所示，LPS處理未在野生型和Caspase-11缺陷的原代肝細(xì)胞中誘導(dǎo)pro-Gsdmd的表達(dá)。 凋亡課題實(shí)驗(yàn)外包
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀，客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性，為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請(qǐng)：提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫，標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開展，設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn)，中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持，探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測(cè)序：轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片：信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)