5）SsD可***抑制AML在體內的進展 為了研究SsD在體內對白血病的***效果，我們建立了C1498和FLT3+白血病小鼠模型(圖5A)。對照組小鼠的白細胞生長較快。0.1mg/kg或0.5mg/kg劑量的SsD***抑制WBC生長(圖5B)。與對WBC的抑制作用一致，SsD也有效地損害了骨髓(BM)克隆原性潛能(圖5C和5D)。此外，與對照組相比，接受SsD***組的小鼠的脾臟更輕，表明SsD處理***逆轉了脾腫大，抑制了脾臟轉移性**細胞(圖5C和5E)。與病理表型一致，SsD處理小鼠的生存時間也明顯延長(圖5F)。機制上，SsD在體內的抗白血病作用是通過其m6ARNA甲基化...

再次從老年和年輕小鼠中分離BMSCs，Dil染色劑標記后體外增殖，脛骨內注射到另一批年輕小鼠中，三天后收獲脛骨對成骨標志物Runx2進行熒光免疫染色。發(fā)現老年BMSCs處理的小鼠中Dil標記細胞降低，表明老化過程中OPCs向骨形成表面的遷移能力降低。大部分遷移到骨形成表面的Dil標記細胞表達Runx2，表明OPCs遷移到骨形成表面發(fā)生成骨分化，有助于體內骨形成。與年輕BMSCs相比，老年BMSCs的體外遷移能力明顯受損，Macf1***下調，從Macf1基因位點轉錄而來的長鏈非編碼RNA PMIF（即lnc-PMIF）表達***增高。上述提示，衰老過程中小鼠骨形成的減少伴隨著OPCs向骨形成表...

miR-101-3p或miR-423-5p過表達抑制體內**的發(fā)生 為了評價miR-101-3p和miR423-5p在體內的抗**作用，我們將轉染LV16-miR-101-3p、LV16-miR-423-5p或LV16-NC的Daoy細胞皮下注射Balb/c雄性裸鼠。RT-qPCR檢測miR-101-3p和miR-423-5p在慢病毒轉染的Daoy細胞中的相對表達水平。**在注射后2周被發(fā)現，小鼠在植入后7周被處死。與對照組相比，LV16-miR-101-3p-和LV16-miR-423-5p處理組的**生長明顯受到抑制。miR-101-3p或miR-423-5p***后，**重量也...

7）在體外，上調UCP1減少AKI期間的脂質積累可通過AMPK/ULK1途徑促進自噬 自噬已被證實在AKI中發(fā)揮重要作用。因此，自噬已經成為我們關注的重要途徑之一。在通過慢病毒轉染過表達UCP1或UCP1激動劑CL316243的AKI細胞模型中，自噬相關指標顯示AMPK/ULK1/自噬通路******(圖7A-B)。電子顯微鏡圖像也顯示，上調UCP1消除AKI中的脂質積累后，細胞自噬得到促進(圖7C)?；谶@些發(fā)現，為了驗證自噬在UCP1功能中的重要性，我們進行了功能恢復實驗。如圖7D-F所示，氯喹抑制自噬***逆轉了順鉑組UCP1引起的炎癥指標下降。同樣，TUNEL染色顯示，使用氯...

此外，有報道稱DRD2可在神經系統中與EGFR結合。在BrCa細胞中，293T和MDA-MB231中也證實了DRD2和EGFR的結合(圖6E)。DRD2的表達下調ERBB1 (EGFR)和ERBB2 (HER2)的表達(圖6F)。在異位表達DRD2的BrCa細胞中，DDX5可以促進p-IκBα的磷酸化，增加磷酸化p65的蛋白水平(圖6G)。eEF1A2可直接***上調p-p65的表達，而不影響IKKα/β或IκBα，甚至在沒有LPS的情況下，eEF1A2可上調表達DRD2的MDA-MB231的p-p65蛋白水平(圖6G)。以上結果表明，DDX5和eEF1A2對NF-κB信號通路的促進作用受...

2021年6月，***一篇發(fā)表在Microbiome（IF=11.607）的文章（Microbiota long-term dynamics and prediction of acute graft-versus-host disease in pediatric allogeneic stem cell transplantation.）從共生功能體視點的角度對29名接受同種異體造血干細胞移植的兒童的腸道、口腔和鼻腔微生物群進行了綜合宿主微生物群分析。***揭示了口腔和鼻子中的細菌可能預測急性移植物抗宿主病(aGvHD)。監(jiān)測HSCT患者不同身體部位的微生物群，特別是通過移植前樣本的參與，...

減輕ROS或缺氧可緩解T細胞衰竭 Pmel-1 T細胞被轉導Gpx1, Gpx1是一種谷胱甘肽過氧化物酶和已知的能作用于許多ROS物種的PGC1α靶點，然后轉移到攜帶b16的動物體內。與pgc1 α轉導的細胞一樣，gpx1過表達的T細胞對**中ROS的積累具有抗性(圖7a)。過表達gpx1的TIL T細胞保持功能，產生更多的ifn - γ(圖7b)。因此，通過細胞固有的方式減少ROS可以保護T細胞免受**誘導的衰竭。Ndufs4缺乏的**在體外沒有明顯的氧消耗，在體內產生較少的缺氧(圖7c,d)。在這些內源性的浸潤性CD8+ T細胞中，較小比例的細胞發(fā)展到**終衰竭(圖7e)。然而，...

在體內circRNF13抑制NPC的生長和轉移 和體外實驗類似，過表達circRNF13會抑制NPC的**生長和肺轉移，而干擾circRNF13則逆轉這些結果。表明circRNF13在體內也可發(fā)揮抑制NPC生長的作用。 CircRNF13可能通過抑制糖酵解抑制NPC的遷移和侵襲 為了探究circRNF13的作用機制，作者對si-circRNF13細胞系進行了LC-MS/MS檢測，結果鑒定到294個差異表達蛋白，他們的IPA分析結果顯示主要富集與糖酵解途徑。這些結果暗示circRNF13可能在NPC中參與調節(jié)糖酵解途徑。 深耕科研行業(yè)提高科研的高效。TBI課題 snoRN...

2、敲除LncHrt損傷心臟內穩(wěn)態(tài)為了探究LncHrt的功能，實驗AAV9-shRNA敲除新生兒小鼠中的LncHrt，即AAV-LncHrtKD。結果表明敲除LncHrt后，導致心臟擴大，心臟重量與體重之比提高（HW/BW），而不影響體重。心電圖顯示LncHrt敲除后小鼠左心室收縮功能受損，縮短分數下降，明顯的左心室擴張和左心室后壁厚度減少（2f-i）。并且這些變化得到了心臟組織學和組織纖維化的結果的支持。與此相反，過表達LncHrt后對小鼠的心臟的影響與上述結果完全相反?？傊?，以上結果表明敲除LncHrt損傷心臟內穩(wěn)態(tài)，過表達LncHrt可保護心臟免受心肌梗死。醫(yī)學整體課題外包服務。遷移體課...

四、atm依賴性PTEN磷酸化缺失的細胞中G1/S細胞周期檢查點受損 對表達PTEN-WT或PTEN-398A的MCF10A細胞進行了cDNA微陣列分析，并用順鉑誘導基因毒性應激。差異表達基因列表采用基因**富集分析[39]進行分析。有趣的是，表達PTEN-398A的細胞中上調的基因與G1/S檢查點的***有關，如G1/S期特異性轉錄、E2F靶標、Rb1通路控制的細胞周期調控基因等推測表達PTEN-398A的細胞對基因毒性脅迫的抗性可能是由于未能阻止細胞周期以應對DNA損傷。為了測試這種可能性，測量了表達野生型或突變PTEN的同步細胞在細胞周期阻滯在G1/S檢查點的能力，以應對DNA...

2021年6月，在Oncogene雜志上發(fā)表了文章“Chromatin-directed proteomics-identified network of endogenous androgen receptor in prostate cancer cells..”。此報道通過運用了一種強大的染色質導向蛋白質組學方法，稱為ChIP-SICAP，揭示去勢抗性前列腺*(CRPC)細胞中內源性AR周圍染色質蛋白網絡(染色質蛋白網絡)的組成。在CRPC細胞雄***信號通路的背景下，進一步研究了與AR相關蛋白作用的染色質重塑者SMARCA4和SIM2。通過整合ChIP-seq、RNA-seq、ATAC...

YTHDC2可促進靶基因的翻譯效率，并降低其mRNA的豐度，在精子發(fā)生過程中起關鍵作用。當減數分裂開始時YTHDC2表達上調，YTHDC2敲除小鼠的生殖細胞沒有經過偶線期的發(fā)育導致小鼠不育[20]。在DNA損傷反應中，METTL3可促進DNA聚合酶κ（Pol κ）與核酸剪切修復途徑快速定位到UV引起的DNA損傷位點，當缺失METTL3時，細胞無法迅速修復UV照射引起的突變，并且對UV照射更加敏感[25]。在淋巴細胞性小鼠過繼轉移模型中， Mettl3缺陷通過影響mRNA m6A修飾，降低SOCS家族mRNA衰減，增加mRNA和蛋白表達水平，從而抑制IL-7介導的 STAT5活性和T細胞內穩(wěn)態(tài)增...

10.EVs介導的ELNAT1與BCa淋巴結轉移相關 確定EVs介導的ELNAT1在BCa淋巴結轉移中的臨床意義十分重要。首先，作者發(fā)現來自BCa患者的尿中EVs與配對BCa組織的ELNAT1表達呈正相關，這意味著EVs介導的ELNAT1是BCa中ELNAT1調控的重要參與者（Figure10A）。同時，BCa患者的尿中EV介導的ELNAT1過表達與BCa的淋巴結轉移呈正相關（Figure10B）。EV介導的ELNAT1表達較高的BCa患者總生存期（OS）和無病生存期（DFS）率較短（Figure10C-D）。ROC分析顯示尿液中EV介導的ELNAT1可有效區(qū)分BCa患者與健康志愿者...

巨噬細胞在AP恢復不同階段的不同作用 鑒于AP恢復過程中巨噬細胞的表型變化，接下來試圖通過用脂質體***巨噬細胞來檢查巨噬細胞在不同修復/再生階段的作用。首先，我們在急性炎癥反應后（從第1天到第2天）立即消耗了胰腺巨噬細胞，并在第3天檢查了胰腺。如圖所示，第3天之前巨噬細胞的消耗可以在很大程度上減少導管樣結構，這表明巨噬細胞在ADM的形成。AP損傷后第3天巨噬細胞的消耗顯著延遲了胰腺修復。Ki67+細胞在第3天達到峰值，并隨著胰腺恢復逐漸下降。與組織學結果一致，發(fā)現CN處理組的Ki67+細胞從第5天到第7天大幅下降，但在CL處理組中沒有，表明CL處理小鼠的修復過程受損。 提供分子生物...

DREIMT整合了來自LINCS L1000 數據集的 4,694 個藥物概況和來自多種資源的 2,687 個免疫基因表達特征，以生成藥物——免疫特征關聯數據庫。除此以外，DREIMT 還可以根據用戶提供的免疫特征對藥物關聯進行優(yōu)先排序。 該模塊可以查詢特定的基因，也可以上傳數據進行分析。如果使用基因列表進行查詢，則需要輸入15-200個與DREIMdb藥物譜基因匹配的基因名。結果圖、表可以進行下載。tau＞90且FDR＜0.05的基因為比較好候選基因。 該模塊是通過測試用戶提供的基因表達特征和DREIMTdb特征之間是否存在顯著的基因重疊來探索**相似的藥物關聯。 在該...

為了評估這些CAR-T細胞的功能性記憶能力，在CAR-T細胞轉移后30天用LeY + 卵巢*細胞系OVCAR-3(Fig. 5D)處理小鼠，觀察到與未處理的CAR組相比，預處理的CAR-T細胞在小鼠血液中的擴增***增加(Fig. 5G)。意味著先前接受過CAR-T細胞***的小鼠的**控制***增強(Fig. 5H-I)。值得注意的是，第30天的**大小與**侵襲前血液中CD3+ T細胞的數量呈***負相關(Fig. 5J)，表明CDK4/6i處理的CAR-T細胞的持久性增強是驅動**控制的關鍵因素。事實上，**接種后40天，接受預處理的CAR-T細胞的小鼠浸潤CD4+和CD8+ CAR-T...

8.EVs介導的ELNAT1上調HLECs中SOX18的表達 qRT-PCR分析UM-UC-3-EV1載體或UM-UC-3-EVELNAT1處理的HLECs中淋巴管生成相關基因的表達，結果顯示SRY-box轉錄因子18（SOX18）是**明顯的與EVs介導的ELNAT1表達正相關的基因（Figure8A,B）。此外，ChIRP分析表明EVs介導的ELNAT1與HLECs中SOX18啟動子的771~786bp（p4）直接相互作用（Figure8C,D）。SOX18-p4區(qū)域的突變降低了EVs介導的ELNAT1誘導的熒光素酶活性（Figure8E,F），表明SOX18-p4對于EVs介導...

6）上調UCP1減輕AKI中的脂質積累，可***緩解體內炎癥和凋亡 以上研究證實，在體外，上調UCP1可以通過抑制炎癥和凋亡來抑制AKI的進展。為了探究其在體內的作用，我們在腎多點注射模型中檢測了相應的指標。如圖6A-E所示，炎癥指標CD68、IL-1β、IL-6、TNF-α均***降低，UCP1上調。在凋亡方面，凋亡指標Bax和C-caspase3也隨著UCP1的上調而降低，而Bcl-2隨著UCP1的上調而升高(圖6F)。TUNEL熒光染色也直接證明了UCP1上調導致的凋亡減少(圖6G-H)。同樣，我們也使用UCP1激動劑CL316243在動物模型中證實了同樣的炎癥和凋亡趨勢(圖6...

MAP4K4是絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶家族的成員，可以通過磷酸蛋白MEKK1***MAPK通路。構建pCMV-NM_4834.4和pCMV-NM_1242560.1質粒，分別轉染K1細胞，并通過qRT-PCR驗證了其轉染效率（圖6E）。這兩種變異***增強了K1細胞的增殖和遷移。而截斷型(NM_4834.4)比長型(NM_1242560.1)對增殖和遷移的影響更強（圖6F-G）。此外，MEKK1、MKK4、JNK、MEK、ERK的總磷酸化水平未發(fā)生改變，而NM_4834.4和NM_1242560.1兩種變體轉染組的磷酸化水平均高于對照組。更重要的是，與NM_1242560.1相比，NM_48...

在沒有RNA配體的情況下，RIG-I采用一種自動抑制的構象，CARDs發(fā)出信號。因此假設circNDUFB2可能通過促進其CARDs釋放***RIG-I。用Co-IP檢測RIG-I的CARDs（FLAG-CARD）和螺旋酶結構域（HA-ΔCARD）之間的相互作用。結果表明circNDUFB2抑制了RIG-I的CARDs和螺旋酶結構域之間的相互作用。此外，circNDUFB2增強了CARDs與線粒體抗病毒信號蛋白（MAVS）的相互作用。這些結果表明circNDUFB2可能通過破壞CARDs與其解旋酶結構域之間的分子內相互作用來***RIG-I，并使RIG-I保持活性，從而***RIG-I-MAV...

使用測量細胞一致性的活細胞成像作為細胞生長和擴散的代理，來測試SMARCA4消耗的影響是否轉化為VCaP細胞生長的改變。如圖5所示，在沒有雄***的情況下，SMARCA4刪除并不影響細胞的生長，而在有雄***的情況下，它降低了細胞的相對融合，盡管程度低于去除AR。SMARCA4刪除同樣會降低LNCaP細胞的相對融合。 四、SIM2沉默改變了arb亞群的染色質可及性 SIM2沉默降低了2434個arb染色質可及性，三分之二受siSIM2影響的arb在雄***暴露前可及(圖6a c中可獲得)，而其余在雄***暴露后可及(圖6a c中重新獲得)。根據ChIP-SICAP數據，siim...

結果1）AKI伴有明顯的脂質積累，并與腎損傷的嚴重程度高度正相關 根據脂質代謝組學分析結果，我們發(fā)現AKI組織中各類甘油三酯(TGs)含量***增加(圖1A)。考慮到AKI中的脂質積累，我們進行實驗來確定其臨床意義。我們對不同嚴重程度的AKI動物標本進行油紅O染色。結果顯示，隨著疾病進展的延長，小鼠腎組織脂質沉積逐漸增加(圖1B)。在體外也發(fā)現了類似的結果，即隨著細胞損傷的嚴重程度，脂質積累的程度增加(圖1C)。這些結果說明AKI中的脂質積累與疾病的嚴重程度呈正相關。 課題外包服務找英拜放心安心。代謝課題分子生物學實驗 異種移植的CRC**增加了小鼠血漿中5’-tRF-GlyGCC...

五、SIM2對ar介導的基因表達有***影響 利用RNAseq研究SIM2沉默后SIM2對基因表達的影響。沉默SIM2使dht調控的基因數量增加了一倍多，2394個基因受到雄***調控，而只有180個基因受到雄***調控(圖8a, b)。此外，沉默SIM2導致6867個deg，其中2937個deg受到雄***調控(圖8c, d, Supplementary Fig. S19f)。SIM2沉默也減輕了雄***對AR表達的抑制(補充圖S20)。根據RT-qPCR的評估，ARNT沉默實質上再現了SIM2對選定AR靶基因和DEGs的影響(補充圖S21a, b)。對雄***調節(jié)基因集的meta...

2）UCP1在AKI中***下調，且與腎損傷嚴重程度呈高度負相關 UCPs超家族與能量代謝密切相關，并在多種疾病中介導脂質消耗?；赨CPs的功能，我們通過westernblot和免疫組化方法對正常C57小鼠腎組織中UCP1、UCP2和UCP3的表達進行了表征。結果顯示，UCP1和UCP2表達較好，而UCP3幾乎未檢測到(圖2A-B)。在UCPs中，UCP1被認為是脂質降解**關鍵的基因，而UCP2與之沒有直接關系。因此，我們選擇UCP1進行進一步分析，證實其在皮質小管中高表達，在髓質中部分表達，C57小鼠、Sprague-Dawley大鼠、Wistar大鼠腎小球、**幾乎無表達(圖...

3.IRES序列由于circRNA是共價閉環(huán)分子，沒有游離末端，因此circRNA的翻譯必須使用一種非經典的啟動機制，即不依賴5’-帽子的翻譯啟動。這種起始途徑往往通過IRES（內部核糖體進入位點）驅動，IRES是具有特殊二級結構的短RN**段。在病毒中發(fā)現并證明了大量的IRES元件，在一些特殊情況下，哺乳動物內源性的IRES元件也可以起始翻譯。作者團隊也曾針對circRNA中IRES元件進行了系統性的篩選驗證。數據庫也使用了所有可用的IRES信息作為支持circRNA翻譯的證據。 4.m6A位點N-6-甲基腺苷（m6A）是**常見的RNA修飾，存在于許多類型的編碼和非編碼RNA中。...

1）AKI伴有明顯的脂質積累，并與腎損傷的嚴重程度高度正相關根據脂質代謝組學分析結果，我們發(fā)現AKI組織中各類甘油三酯(TGs)含量***增加(圖1A)?？紤]到AKI中的脂質積累，我們進行實驗來確定其臨床意義。我們對不同嚴重程度的AKI動物標本進行油紅O染色。結果顯示，隨著疾病進展的延長，小鼠腎組織脂質沉積逐漸增加(圖1B)。在體外也發(fā)現了類似的結果，即隨著細胞損傷的嚴重程度，脂質積累的程度增加(圖1C)。這些結果說明AKI中的脂質積累與疾病的嚴重程度呈正相關?？梢陨蟼髟嫉膄ast文件。cancer課題免費設計生物標志物是生物體中可測量的物質或特征，它指示某些現象，例如狀況，疾病，飲食，干預...

5）DRD2通過阻斷TAK1的磷酸化來限制NF-κB信號的***NF-κB信號的*** 對于觸發(fā)炎癥小體組裝和隨后的焦亡是必不可少的。IF染色顯示DRD2幾乎阻斷了p-p65的核易位(圖5A)，但這種抑制被Mφ所抵消(圖5B)。核和細胞質提取物也顯示DRD2抑制了p-p65的核易位(圖5C)。如WB結果所示，在LPS刺激下，DRD2抑制IKKα/β、IκBα和p65的磷酸化(圖5D)。異位DRD2表達也***抑制了Mφ誘導的p65磷酸化和IKKα/β的上游***(圖5E)。WB結果顯示DRD2下調NF-κB的下游靶點ICAM-1。然而，這種下調被Mφ所抵消(圖5E)。抑制IKKα/β...

HIF***可促進DMF誘導的CRC細胞死亡 作者的篩選鑒定出DMF是一種小分子，可以有效地減少低氧**腸道樣體的生長。一組CRC細胞系使用DMF單獨或聯合缺氧或模擬缺氧FG4592處理。通過MTT和長期克隆生存試驗評估，FG4592增強DMF誘導的CRC細胞死亡。此外，DMF處理和缺氧培養(yǎng)的細胞存活率較低。與erastin和RSL3數據一致，HIF-2α是促進DMF介導的CRC細胞生長的關鍵。 DMF**于鐵死亡誘導細胞死亡 由于DMF與其他細胞對鐵死亡***劑一起有效地降低了缺氧細胞的生長，我們評估了DMF是否介導了鐵死亡***劑的死亡。在DMF處理后，Fer-1和L...

6）FOXO3A通過調控乳腺*細胞中LINC00926的表達抑制增殖、遷移和侵襲，抑制糖酵解 我們研究了FOXO3A是否通過LINC00926調節(jié)這些效應。細胞增殖和集落形成分析顯示FOXO3A過表達抑制了乳腺*細胞的生長，而LINC00926敲低則促進了細胞的生長(圖6A和6B)。重要的是，下調LINC00926***減弱了FOXO3A調控細胞增殖的能力，表明FOXO3A主要通過表達LINC00926來降低乳腺*細胞的增殖。接下來，我們通過LINC00926檢測FOXO3A是否抑制細胞遷移、侵襲和糖酵解。如預期，FOXO3A減少了乳腺*細胞的遷移和侵襲(圖6C和6D)。敲除LINC...

非酒精性脂肪性肝炎(NASH)是一種結果嚴重的炎癥性疾病。肝細胞死亡，包括凋亡、壞死和焦亡，在NASH的病理生理學中已被證實。到目前為止，Caspase-11在NASH中的確切作用仍不清楚。本文詳細介紹了2021年4月發(fā)表于“Cell Mol Gastroenterol Hepatol”（IF=7.706）的文章“Caspase-11–Mediated Hepatocytic Pyroptosis Promotes the Progression of Nonalcoholic Steatohepatitis”。本研究探討了Caspase-11在NASH中的潛在作用。NASH小鼠肝臟中Casp...