四、atm依賴性PTEN磷酸化缺失的細(xì)胞中G1/S細(xì)胞周期檢查點受損
對表達(dá)PTEN-WT或PTEN-398A的MCF10A細(xì)胞進(jìn)行了cDNA微陣列分析，并用順鉑誘導(dǎo)基因毒性應(yīng)激。差異表達(dá)基因列表采用基因**富集分析[39]進(jìn)行分析。有趣的是，表達(dá)PTEN-398A的細(xì)胞中上調(diào)的基因與G1/S檢查點的***有關(guān)，如G1/S期特異性轉(zhuǎn)錄、E2F靶標(biāo)、Rb1通路控制的細(xì)胞周期調(diào)控基因等推測表達(dá)PTEN-398A的細(xì)胞對基因毒性脅迫的抗性可能是由于未能阻止細(xì)胞周期以應(yīng)對DNA損傷。為了測試這種可能性，測量了表達(dá)野生型或突變PTEN的同步細(xì)胞在細(xì)胞周期阻滯在G1/S檢查點的能力，以應(yīng)對DNA損傷。在表達(dá)PTEN-WT或PTEN-398A的正常周期細(xì)胞中，G1、S、G2/M期細(xì)胞比例沒有明顯差異(圖4A)。
IGF-1信號在Pex誘導(dǎo)的肝纖維化中起重要作用。壞死性小腸課題協(xié)同創(chuàng)作
2、MAO-A直接調(diào)節(jié)TAM極化并影響TAM相關(guān)的T細(xì)胞抗**活性
為了確定MAO-A是否直接調(diào)節(jié)免疫細(xì)胞，進(jìn)行一個骨髓（BM）轉(zhuǎn)移實驗，從MaoaWT或KO小鼠中獲得的BM細(xì)胞被連續(xù)轉(zhuǎn)移到BoyJ(CD45.1)WT受體小鼠中，然后該小鼠接受B16-OVA黑色素瘤細(xì)胞接種（圖2a）。在本實驗中，MAO-A缺乏的比較***于免疫細(xì)胞。結(jié)果顯示免疫細(xì)胞中MAO-A缺陷導(dǎo)致**生長抑制（圖2b-c），改變TAM極化（圖2d-f），增強(qiáng)**浸潤C(jī)D8+T細(xì)胞***，表明MAO-A直接調(diào)節(jié)免疫細(xì)胞抗**活性，特別是TAM極化和T細(xì)胞抗**反應(yīng)。 TRF課題實驗外包也是***PDAC肝轉(zhuǎn)移的潛在靶點。
二、npm1突變AML患者聚集的分子基礎(chǔ)
DH2是鈣粘蛋白家族的一員，被認(rèn)為是決定干細(xì)胞命運的調(diào)節(jié)因子15。類似地，G蛋白偶聯(lián)受體12(GPR12)在原始亞型中上調(diào)，已知在干細(xì)胞維持和**干細(xì)胞的體細(xì)胞重編程中發(fā)揮作用。MyoD家族抑制劑(MDFI)在原始亞型中表達(dá)增加，據(jù)報道它是WNT信號通路的調(diào)節(jié)因子，只在造血干細(xì)胞祖細(xì)胞中表達(dá)。鋅指蛋白521(ZNF521)是一種轉(zhuǎn)錄因子，其在人類白血病細(xì)胞系中被敲低可以減少增殖但在原始亞型中卻有***的高表達(dá)。CD163是一種免疫調(diào)節(jié)劑，是巨噬細(xì)胞清清體受體家族的成員，已知在單核細(xì)胞系的AML細(xì)胞中表達(dá)。在committedcluster中其他基因的高表達(dá)包括免疫相關(guān)基因，如C1QA,CD14和MARCO。msl1基因，一種已知的白血病干細(xì)胞增殖抑制因子，也在committedcluster中高表達(dá)。我們通過qPCR驗證了關(guān)鍵基因的差異表達(dá)(圖2B)。使用基因**富集分析(GSEA)，在committed亞型中，免疫反應(yīng)通路如干擾素-γ介導(dǎo)的信號通路、GPCR信號通路和toll樣受體(TLR)信號通路上調(diào)(圖2C,D,SupplementaryFigs.16,18，與FLT3-ITD和DNMT3A突變的弱相關(guān)性一致。
近日，美國圣路易斯華盛頓大學(xué)醫(yī)學(xué)院Yoshiharu Muto教授等在Nature communications發(fā)布了Single cell transcriptional and chromatin accessibility profiling redefine cellular heterogeneity in the adult human kidney的研究論文。文中，作者采用單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組snRNA-seq和單細(xì)胞核染色質(zhì)可及性snATAC-seq技術(shù)，對5個健康成人（50歲到62歲，男性(n = 3)和女性(n = 2)）腎臟樣本進(jìn)行檢測。此文揭示腎臟內(nèi)獨特的細(xì)胞狀態(tài)，并重新定義近端小管和粗升肢的細(xì)胞異質(zhì)性。完善的實驗平臺提供可視化的建模服務(wù)。
8、CXCL13/CXCR5/NFκB/p65/miR-934正反饋環(huán)路在CRLM期間介導(dǎo)M2巨噬細(xì)胞和CRC細(xì)胞之間的相互作用
如Fig.8a所示，WB顯示，與對照組相比，SW480和RKO細(xì)胞中，CXCL13促進(jìn)p65磷酸化，NFκB、MMP2和MMP9的表達(dá)上調(diào)而IκBα的表達(dá)下調(diào)。CXCR5表達(dá)下調(diào)可部分減弱CXCL13的增強(qiáng)作用。此外，PMA處理的THP-1細(xì)胞用miR-934mimics預(yù)處理，然后與SW480細(xì)胞或RKO細(xì)胞與anti-CXCL13抗體共培養(yǎng)，或與shCXCR5共培養(yǎng)。我們發(fā)現(xiàn)CRC細(xì)胞中的anti-CXCL13抗體或CXCR5敲低可以抑制miR-934過表達(dá)誘導(dǎo)的NFκB信號通路的活化（Fig.8b）。值得注意的是，helenalin抑制NFκB/p65信號后，SW480和RKO細(xì)胞中miR-934、MMP2和MMP9的表達(dá)***低于對照組（Fig.8c），這表明miR-934也可能通過正反饋回路被NFκB/p65信號正調(diào)控。 caspase-3抗體是一種***用于檢測凋亡細(xì)胞的標(biāo)志物。RNA甲基化課題一站式
ATM對PTEN的磷酸化驅(qū)動細(xì)胞周期進(jìn)程。壞死性小腸課題協(xié)同創(chuàng)作
我們之前的研究揭示了CD44v6參與調(diào)控PDAC細(xì)胞的IGF-1通路。因此，我們首先驗證了CD44v6在外泌體中的表達(dá)，發(fā)現(xiàn)CD44v6在Pex中的表達(dá)水平明顯高于Npex(圖5A)。為了研究CD44v6是否能夠被傳遞到受體細(xì)胞中，我們采用蛋白合成抑制劑環(huán)己酰亞胺檢測加入Pex后CD44v6的蛋白水平。western blot分析顯示，加入Pex后，HSCs中CD44v6的表達(dá)水平明顯增加(圖5B)。與Npex-孵育的細(xì)胞相比，CD44v6的表達(dá)水平保持不變(圖5B)。我們還進(jìn)行了免疫熒光分析，檢測出HSC膜中CD44v6與Pan-cadherin共定位(圖5C)。這些結(jié)果表明，Pex可將CD44v6輸送到HSC膜。此外，western blot檢測表明，敲除CD44v6或使用抗CD44v6抗體的Pex強(qiáng)烈減弱了Pex誘導(dǎo)的IGF-1信號通路的***(圖5D)。同時，在CD44v6- kd Pex或CD44v6抗體的作用下，Pex誘導(dǎo)的HSC活化(圖5E，F(xiàn))、ECM重塑(圖5G)的積極作用***減少。為了闡明CD44v6在Pex誘導(dǎo)的HSC***中的作用，我們進(jìn)一步研究了過表達(dá)CD44v6在HSC中是否與Pex具有同樣的***HSC的作用。然而，過表達(dá)CD44v6并沒有像預(yù)期的那樣提高α-SMA的表達(dá)(圖5H)。這些結(jié)果表明，CD44v6在Pex誘導(dǎo)的HSC***中發(fā)揮了重要作用。壞死性小腸課題協(xié)同創(chuàng)作
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