HIF***可促進(jìn)DMF誘導(dǎo)的CRC細(xì)胞死亡
作者的篩選鑒定出DMF是一種小分子，可以有效地減少低氧**腸道樣體的生長(zhǎng)。一組CRC細(xì)胞系使用DMF單獨(dú)或聯(lián)合缺氧或模擬缺氧FG4592處理。通過(guò)MTT和長(zhǎng)期克隆生存試驗(yàn)評(píng)估，F(xiàn)G4592增強(qiáng)DMF誘導(dǎo)的CRC細(xì)胞死亡。此外，DMF處理和缺氧培養(yǎng)的細(xì)胞存活率較低。與erastin和RSL3數(shù)據(jù)一致，HIF-2α是促進(jìn)DMF介導(dǎo)的CRC細(xì)胞生長(zhǎng)的關(guān)鍵。
DMF**于鐵死亡誘導(dǎo)細(xì)胞死亡
由于DMF與其他細(xì)胞對(duì)鐵死亡***劑一起有效地降低了缺氧細(xì)胞的生長(zhǎng)，我們?cè)u(píng)估了DMF是否介導(dǎo)了鐵死亡***劑的死亡。在DMF處理后，F(xiàn)er-1和Lip-1不能挽救細(xì)胞的死亡和活力，而rsl3介導(dǎo)的細(xì)胞死亡被Fer-1和Lip-1挽救。在DMF處理后，F(xiàn)er-1和Lip-1不能挽救細(xì)胞的死亡和活力，而RSL3介導(dǎo)的細(xì)胞死亡被Fer-1和Lip-1挽救。DMF可與抗氧化劑GSH直接反應(yīng)，導(dǎo)致NADPH降低，ROS增強(qiáng)。然而，F(xiàn)G4592和糖酵解抑制劑的共同作用并沒(méi)有降低細(xì)胞活力。這些結(jié)果表明，在DMF介導(dǎo)的缺氧**細(xì)胞死亡中有其他機(jī)制參與。 高通量測(cè)序后續(xù)的機(jī)制實(shí)驗(yàn)。項(xiàng)目課題技術(shù)指導(dǎo)
1、循環(huán)miR-208b是CRC中FOLFOX化療敏感性的一種很有前途的生物標(biāo)志物如圖1所示，作者設(shè)計(jì)了一項(xiàng)多期研究，以確定新的血清miRNAs作為預(yù)測(cè)和監(jiān)測(cè)奧沙利鉑聯(lián)合亞葉酸和5-FU（FOLFOX）化療反應(yīng)的替代標(biāo)志物。
作者檢測(cè)了69個(gè)化療敏感和47個(gè)化療不敏感患者的血漿中miR-208b表達(dá)，結(jié)果顯示與未響應(yīng)組相比，miR-208b的表達(dá)水平在響應(yīng)組***下調(diào)（圖2A-B）。同時(shí)檢測(cè)了血清*胚抗原(CEA)水平，血清miR-208b的曲線下面積(AUC)與血清CEA的AUC相比，優(yōu)于血清CEA水平。在化療響應(yīng)組，在化療前miR-208b的表達(dá)高于化療后，而在未響應(yīng)組，化療前低于化療后水平（圖2C）。生存分析顯示，無(wú)進(jìn)展生存期化療響應(yīng)組***高于未響應(yīng)組，miR-208b低表達(dá)組***高于高表達(dá)組（圖2D）。這些結(jié)果表明miR-208b可作為預(yù)測(cè)CRC中FOLFOX化療敏感性的非侵襲性標(biāo)志物。 鐵死亡課題協(xié)同創(chuàng)作小鼠正常胰腺(Npex)和小鼠PDAC細(xì)胞分離的外泌體呈現(xiàn)典型的外泌體結(jié)構(gòu)。
IFNα和抗CD3/CD28磁珠長(zhǎng)期刺激后CD8 + T細(xì)胞中SRC能力的降低表明生物能量適應(yīng)性受損。研究發(fā)現(xiàn)，IFNα刺激的CD8 + T細(xì)胞在初始爆發(fā)后，與*用CD3/CD28刺激的CD8 + T細(xì)胞相比，其氧化和糖酵解能力下降更快（圖4d）?？傊?，使用健康對(duì)照CD8 + T細(xì)胞的體外研究表明，雖然單獨(dú)延長(zhǎng)IFNα處理能夠觸發(fā)可檢測(cè)的代謝改變，但只有IFNα暴露和T細(xì)胞活化的聯(lián)合才能表型復(fù)制IFN-High SLE患者CD8 + T細(xì)胞中觀察到的線粒體和代謝異常。
5、IFNα暴露誘導(dǎo)慢性***CD8+T細(xì)胞死亡
在建立重現(xiàn)SLECD8+T細(xì)胞代謝變化的實(shí)驗(yàn)條件后，接下來(lái)研究了下游效應(yīng)。與SLE患者的離體數(shù)據(jù)一致，發(fā)現(xiàn)IFNα暴露延長(zhǎng)聯(lián)合T細(xì)胞活化可促進(jìn)CD8+T細(xì)胞的自發(fā)死亡（圖5a）。與自發(fā)性細(xì)胞死亡數(shù)據(jù)一致，作者發(fā)現(xiàn)再激發(fā)后，暴露于IFNα的細(xì)胞中表達(dá)AnnexinV的增殖性CD8+T細(xì)胞百分比***增加（圖5b）。此外，在IFN刺激的細(xì)胞中檢測(cè)到較少的脫顆粒（CD107a陽(yáng)性）和活化的（CD69和CD25陽(yáng)性）CD8+T細(xì)胞（圖5c）。總之，數(shù)據(jù)表明，I型IFN改變了SLE患者CD8+T細(xì)胞的代謝，導(dǎo)致TCR再激發(fā)后細(xì)胞存活率降低。
2021年6月，***一篇發(fā)表在Microbiome（IF=11.607）的文章（Microbiotalong-termdynamicsandpredictionofacutegraft-versus-hostdiseaseinpediatricallogeneicstemcelltransplantation.）從共生功能體視點(diǎn)的角度對(duì)29名接受同種異體造血干細(xì)胞移植的兒童的腸道、口腔和鼻腔微生物群進(jìn)行了綜合宿主微生物群分析。***揭示了口腔和鼻子中的細(xì)菌可能預(yù)測(cè)急性移植物抗宿主病(aGvHD)。監(jiān)測(cè)HSCT患者不同身體部位的微生物群，特別是通過(guò)移植前樣本的參與，可能具有預(yù)后價(jià)值，并有助于指導(dǎo)個(gè)性化***策略。識(shí)別具有預(yù)測(cè)移植后aGvHD潛力的獨(dú)特細(xì)菌，可能為改進(jìn)預(yù)防性臨床管理提供機(jī)會(huì)，包括對(duì)微生物群的調(diào)節(jié)。背景：在異種造血干細(xì)胞移植(allogeneichematopoieticstemcelltransplantation,allo-HSCT)中，供者來(lái)源的干細(xì)胞輸注被用于***各種類型的血液病和非血液病。在異種造血干細(xì)胞移植患者中，移植后人體腸道菌群發(fā)生變化，這可能部分歸因于******和調(diào)理方案。我們接下來(lái)研究了Pex對(duì)HSCs生物學(xué)行為的影響。
磷酸甘油酸激酶1 (PGK1)是糖酵解途徑的重要組成部分，與多種**的發(fā)***展有關(guān)。然而，PGK1抑制劑在*細(xì)胞中的抑制機(jī)制和生理意義尚不清楚。因此，***給大家介紹于2021年4月發(fā)表于“Molecular Therapy”（IF=8.986）的文章“FOXO3A-induced LINC00926 suppresses breast tumor growth and metastasis through inhibition of PGK1-mediated Warburg effect”。在這里，我們鑒定了一個(gè)負(fù)調(diào)控PGK1表達(dá)的lncRNA LINC00926，并預(yù)測(cè)乳腺*良好的臨床預(yù)后。我們的研究建立了FOXO3A/LINC00926/PGK1作為調(diào)節(jié)乳腺*生長(zhǎng)和進(jìn)展的關(guān)鍵軸。靶向PGK1或補(bǔ)充LINC00926或FOXO3A可能是乳腺*的潛在***策略。促*分泌體通過(guò)外泌體傳遞和運(yùn)輸是轉(zhuǎn)移前微環(huán)境形成和轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵。課題地區(qū)科學(xué)基金
了解客戶的研究方向以及所能提供的樣本類型和樣本量確定研究思路。項(xiàng)目課題技術(shù)指導(dǎo)
circACTN4 和 FIR 與 FUBP1 競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合
推測(cè)circACTN4可以與FUBP1競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合并阻止FIR與FUBP1結(jié)合以促進(jìn) MYC的轉(zhuǎn)錄和表達(dá)。為了進(jìn)一步驗(yàn)證提出的假設(shè)，qRT-PCR檢測(cè)了BC和匹配組織中FIR的表達(dá)，與正常相鄰組織相比，BC組織中FIR的表達(dá)顯著下調(diào)。Pearson相關(guān)分析表明，F(xiàn)IR的表達(dá)與BC組織中circACTN4、FUBP1和MYC的水平呈負(fù)相關(guān)。免疫共沉淀試驗(yàn)結(jié)果表明，在過(guò)表達(dá)circACTN4的BC細(xì)胞的FUBP1-共免疫共沉淀物中未發(fā)現(xiàn)明顯的FIR蛋白帶，而在circACTN4被敲低后，通過(guò)蛋白質(zhì)印跡在共免疫共沉淀物中明顯檢測(cè)到FIR，這表明上調(diào)的circACTN4顯著削弱FIR與 FUBP1的結(jié)合，同時(shí)下調(diào) circACTN4 顯著加強(qiáng)了 FUBP1 和 FIR 之間的相互作用。ChIP分析結(jié)果表明，高濃度si-circ#2轉(zhuǎn)染后FIR和FUSE的結(jié)合水平高于低濃度si-circ#2轉(zhuǎn)染后FIR和FUSE的結(jié)合水平。 項(xiàng)目課題技術(shù)指導(dǎo)
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過(guò)英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫(xiě)SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開(kāi)發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開(kāi)放參觀，客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
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