為了評估這些CAR-T細胞的功能性記憶能力，在CAR-T細胞轉(zhuǎn)移后30天用LeY + 卵巢*細胞系OVCAR-3(Fig. 5D)處理小鼠，觀察到與未處理的CAR組相比，預(yù)處理的CAR-T細胞在小鼠血液中的擴增***增加(Fig. 5G)。意味著先前接受過CAR-T細胞***的小鼠的**控制***增強(Fig. 5H-I)。值得注意的是，第30天的**大小與**侵襲前血液中CD3+ T細胞的數(shù)量呈***負相關(guān)(Fig. 5J)，表明CDK4/6i處理的CAR-T細胞的持久性增強是驅(qū)動**控制的關(guān)鍵因素。事實上，**接種后40天，接受預(yù)處理的CAR-T細胞的小鼠浸潤CD4+和CD8+ CAR-T細胞的數(shù)量***增加(Fig. 5K)。接下來通過將未處理或預(yù)處理的抗LeY CAR-T細胞轉(zhuǎn)移到OVCAR-3荷瘤小鼠體內(nèi)，檢測了CDK4/6i預(yù)處理對CAR-T細胞急性療效的影響。用CDK4/6i預(yù)處理CAR-T細胞可***增強其抗**活性（Fig.5L-M)。與此一致，轉(zhuǎn)移后數(shù)周發(fā)現(xiàn)接受預(yù)處理細胞的小鼠血液中CD4 + 和CD8 + 細胞以及**中CD8 + 細胞數(shù)量***增高（Fig.5N-O)。總之，這些數(shù)據(jù)證明CDK4/6i體外***是增強CAR-T細胞表型和長期療效的穩(wěn)健策略。我們使用抗體陣列評估了表達PTEN- wt或PTEN- 398a的MCF10A細胞裂解液的應(yīng)激反應(yīng)和凋亡通路的活性。課題檢測服務(wù)
自噬“貨物”是有選擇性裝載的，其中主要依靠LIR基序與LC3互作，形成自噬體。隨后，自噬體進行運輸、溶解。研究表明，自噬異常會影響疾病進程。**中的自噬具有雙重作用：一方面自噬的發(fā)生會增強*細胞的生存能力；另一方面，抑制自噬會造成“廢物”的積累、基因突變等，誘發(fā)**。本研究旨在探索人類**中是否有某些突變通過影響LIR基序來改變自噬選擇性，進而影響疾病進程。
1.構(gòu)建LIR預(yù)測模型pLAM
收集人、釀酒酵母、其他物種LIR，并獲取相應(yīng)蛋白,確定了LIR的序列信息。
驗證算法的可靠性，然后用于泛*LIR基序預(yù)測，并對預(yù)測到的LIR基序?qū)?yīng)的基因進行GO、Pathway富集分析。
2.LIR基序突變預(yù)測
收集TCGA、ICGC和COSMIC數(shù)據(jù)庫突變數(shù)據(jù)并進行整合，獲得2,963,952個獨特的SNV。提取其中LIR基序的突變信息。分析發(fā)現(xiàn)STBD1蛋白，參與糖原代謝，在之前尚未報道過與**自噬有關(guān)。 鐵死亡課題整包服務(wù)有肝轉(zhuǎn)移的PDAC患者外泌體CD44v6和C1QBP的表達明顯高于無肝轉(zhuǎn)移的PDAC患者。
四、INPP4B促進pi3kα依賴的晚期核內(nèi)體形成
五、阻斷atm依賴的磷酸化會損害DNA損傷后PTEN的亞細胞再分配
對MCF-7細胞內(nèi)溶酶體室的檢查顯示，GFP-INPP4B不影響eea1陽性的早期內(nèi)溶體，但***增加了cd63陽性的晚期內(nèi)溶體(2.5倍)和lamp1陽性的溶酶體(1.7倍)(圖4a,b)。提示INPP4B促進晚期內(nèi)吞體/溶酶體的形成。使用bsa-gold標記MCF-7細胞內(nèi)溶酶體室，在電鏡下進行超微結(jié)構(gòu)分析。GFP-INPP4B增加了類似晚期核內(nèi)體的bsa陽性空泡結(jié)構(gòu)的數(shù)量(圖4c)。利用染料淬滅的BSA(BSA-dq)檢測了運往溶酶體的貨物運輸，BSA-dq通過液相內(nèi)吞進入內(nèi)吞體，溶酶體水解酶隨后促進去淬和***熒光信號。GFP-INPP4B***增加了bsa-dq陽性結(jié)構(gòu)的數(shù)量(2倍)(圖4d,e)，表明INPP4B增強了內(nèi)吞貨物通過晚期內(nèi)吞體到溶酶體的運輸。相比之下，使用泛I類PI3K抑制劑BKM120、PI3Kα特異性抑制劑BYL719(補充圖5f)或使用兩種不同的siRNAs耗盡PIK3CA抑制GFP-INPP4B細胞中晚期核內(nèi)體形成的增加(圖4f,g和補充圖5i,j)。通過在晚期核內(nèi)體上產(chǎn)生PI(3)P,INPP4B通過Hrs促進晚期核內(nèi)體的形成。
藥物基因組學(xué)（老年保護化合物）模塊
該老年保護化合物模塊專注于老年保護劑，允許用戶查詢與衰老相關(guān)的化合物，根據(jù)衰老表型、靶點、途徑和與年齡相關(guān)的疾病，提供應(yīng)用于模型生物的相關(guān)化合物的匯總數(shù)據(jù)。該模塊目前包含來自藥物治療分析（體內(nèi)和體外）的數(shù)百種化合物和組學(xué)數(shù)據(jù)集的列表，揭示由特定壽命/延長健康壽命的藥物引起的基因表達變化。在該模塊的首頁，用戶可以瀏覽“熱門小分子”功能，每周更新列出搜索**多的化合物；“臨床試驗”提供了老年保護劑的臨床試驗數(shù)據(jù)；“專題文章”展示了衰老領(lǐng)域的***研究。重要的是，用戶可以通過藥物名稱、目標基因或來源論文的 DOI 輕松搜索，以獲取有關(guān)老年保護化合物的詳細信息。該模塊不僅提供了延長壽命和延長健康期的化合物列表，還提供了有關(guān)藥物引起的基因調(diào)控和表達變化的信息。 進一步了解阻斷atm依賴的PTEN磷酸化如何影響細胞對基因毒性損傷的反應(yīng)。
snoRNAs的生物學(xué)功能
snoRNAs與核糖體RNA加工
在核糖體RNA的加工過程中，核糖體RNA的2′-O–甲基化由C/DboxsnoRNAs來負責(zé)。C/DboxsnoRNAs包含有兩個短的序列元件，即位于5"末端的boxC(RUGAUGAR**A或G)和3"末端的boxD(CUGA)。多數(shù)boxC/DsnoRNAs基因的5"和3"末端都有4-5nt的反向重復(fù)序列，可以形成較為穩(wěn)定的短莖結(jié)構(gòu)，這一結(jié)構(gòu)在snoRNAs的生物合成和核仁定位過程中起關(guān)鍵作用[7]。核糖體RNA的假尿嘧啶修飾主要是由H/ACAboxsnoRNAs來完成的。H/ACAboxsnoRNAs具有保守的“發(fā)夾-鉸鏈-發(fā)夾-尾”的二級結(jié)構(gòu)。boxH(ANANNA，N**任一核苷酸)位于單鏈形式的鉸鏈區(qū)，ACA則一般位于3"末端上游3個核苷酸處。H/ACAboxsnoRNAs的指導(dǎo)序列位于單個或者兩個發(fā)夾內(nèi)部的“假尿嘧啶化泡”內(nèi)，它們可以與靶RNA上的被修飾位點兩翼序列各形成4-8nt的互補配對。 了解客戶的研究方向以及所能提供的樣本類型和樣本量確定研究思路。NF-kB課題整體服務(wù)
將 CTD 暴露與 CTD 解剖學(xué)相結(jié)合使環(huán)境健康科學(xué)家能夠調(diào)查暴露研究和組織和系統(tǒng)暴露化學(xué)應(yīng)激誘導(dǎo)表型的細節(jié)。課題檢測服務(wù)
接下來，在低氧條件下，在HCCLM3和Hep3B細胞中敲低CFL1的表達（圖5A）。結(jié)果表明，CFL1敲除***逆轉(zhuǎn)了缺氧誘導(dǎo)的HCCLM3細胞增殖、細胞遷移和侵襲以及EMT（圖5A-D）。綜上所述，這些結(jié)果表明CFL1表達受HIF-1α的轉(zhuǎn)錄調(diào)控，介導(dǎo)缺氧誘導(dǎo)的HCC進展。
6、CFL1通過抑制泛素介導(dǎo)的PLD1降解來維持PLD1的表達為了進一步探索CFL1在HCC中致*作用的下游機制，利用KEGG數(shù)據(jù)庫篩選了受CFL1影響的通路。其中CFL1的高表達與細胞膜中細胞粘附分子和蛋白的定位密切相關(guān)（圖6A）。然后，基于蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)庫預(yù)測了CFL1和PLD1之間的潛在相互作用（圖6B）。CFL1敲低降低了HCCLM3細胞中PLD1的蛋白水平，而CFL1過表達增強了Hep3B細胞中PLD1蛋白表達（圖6C）。co-IP實驗表明，CFL1與PLD1相互作用，敲低CFL1可促進肝*細胞中PLD1的泛素化(圖6D-E)。用放線菌酮(CHX，2μg/mL)阻斷肝*細胞蛋白質(zhì)合成。繪制蛋白降解曲線，表明CFL1敲低時PLD1蛋白降解更快（圖6F）。此外，蛋白酶體抑制劑MG132(25μM)處理可阻斷CFL1敲低誘導(dǎo)的HCC細胞中PLD1降解（圖6F）。因此，這些結(jié)果表明CFL1抑制肝*細胞中泛素介導(dǎo)的PLD1蛋白水解。 課題檢測服務(wù)
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺，提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度，保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性，為您的標書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標書申請：提供標書課題設(shè)計、撰寫，標書部分基礎(chǔ)實驗的開展，設(shè)計的標書均符合科研前沿?zé)狳c，中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術(shù)支持，探討科研前沿?zé)狳c研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測序：轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學(xué)實驗