數(shù)據(jù)庫概況
目前，MarkerDB數(shù)據(jù)庫包含142個(gè)蛋白質(zhì)生物標(biāo)記，1089個(gè)化學(xué)生物標(biāo)記，154個(gè)核型生物標(biāo)記和26374個(gè)遺傳標(biāo)記。這些分類為25560個(gè)診斷生物標(biāo)志物，102個(gè)預(yù)后生物標(biāo)志物，265個(gè)暴露生物標(biāo)志物和6746個(gè)預(yù)測(cè)生物標(biāo)志物或生物標(biāo)志物組。這些標(biāo)記可共同用于檢測(cè)，監(jiān)視或預(yù)測(cè)670種特定人類疾病，這些疾病分為27大疾病類別。
MarkerDB中五個(gè)主要分子標(biāo)記類別
化學(xué)生物標(biāo)志物
MarkerDB中的化學(xué)生物標(biāo)記物包括各種先天性代謝或遺傳疾病、**、代謝紊亂、傳染病、藥物暴露、化學(xué)/污染物暴露和飲食攝入的標(biāo)記物。MarkerDB中的1089個(gè)化學(xué)標(biāo)記與448種疾病以及106種暴露有關(guān)。目前，MarkerDB中的每個(gè)化學(xué)標(biāo)記都有一個(gè)或多個(gè)疾病關(guān)聯(lián)，以及MarkerDB ID、結(jié)構(gòu)、化合物描述、名稱/同義詞、理化數(shù)據(jù)、疾病濃度、正常濃度、性別、年齡范圍（成人/兒童/新生兒）、生物流體（標(biāo)記物通常用于測(cè)量）、ROC曲線、敏感性、特異性、***性（P值）、一個(gè)或多個(gè)文獻(xiàn)參考和其他在線數(shù)據(jù)庫（OMIM、GenBank、UniProt、HMDB、PubMed、PDB等）的外部超鏈接。 這些數(shù)據(jù)表明大黃酸***可以消除尿酸引起的腸道通透性增強(qiáng)。上?？蒲蟹?wù)兩年
6、外泌體miR-138-5p促進(jìn)乳腺*肺轉(zhuǎn)移
極化的巨噬細(xì)胞在決定**細(xì)胞的表型中起著重要的作用。因此，探究M2巨噬細(xì)胞外泌體miR-138-5p處理是否有助于乳腺*小鼠異**模型的**轉(zhuǎn)移。使用氯膦酸鈉***小鼠巨噬細(xì)胞，然后轉(zhuǎn)移使用過表達(dá)miR-138-5p的T47D或T47D細(xì)胞來源的外泌體處理的Raw264.7細(xì)胞。小鼠模型通過尾靜脈注射4T1-熒光素酶細(xì)胞構(gòu)建（圖6A）。結(jié)果顯示，外泌體miR-138-5p處理組***促進(jìn)小鼠體內(nèi)乳腺*細(xì)胞的**體積和肺轉(zhuǎn)移，同時(shí)增加了CD206和Arg-1陽性細(xì)胞數(shù)（圖6B-E）。這些結(jié)果表明外泌體miR-138-5p誘導(dǎo)的M2巨噬細(xì)胞促進(jìn)乳腺*的肺轉(zhuǎn)移。 內(nèi)蒙古科研服務(wù)價(jià)格外泌體miR-934誘導(dǎo)巨噬細(xì)胞M2極化促進(jìn)CRC肝轉(zhuǎn)移。
VD以VDR依賴的方式調(diào)控AMPK
由于維生素D通過VDR發(fā)揮其比較大的生物學(xué)作用，我們使用HK-2VDRKO細(xì)胞研究VD是否通過VDR***AMPK。結(jié)果表明l，paricalcitol增加了PRKAA1和ULK1的磷酸化，而在高糖條件下則降低了PRKAA1和ULK1的磷酸化。而在HK-2VDRKO細(xì)胞中，這種作用完全消失。此外， 二甲雙胍在高糖條件下***了HK-2WT細(xì)胞中的PRKAA1和ULK1，但二甲雙胍的這種作用在HK-2VDRKO細(xì)胞中仍然可以觀察到。這些結(jié)果表明VD以VDR依賴的方式***AMPK。
10）M1-Exos在bEnd.3細(xì)胞中通過miR-155/SOCS6/p65軸上調(diào)ROS水平，損害線粒體功能
我們進(jìn)行了一系列功能喪失和功能獲得實(shí)驗(yàn)來研究miR-155/SOCS6/p65軸在調(diào)節(jié)線粒體功能中的作用。如圖10A-E所示，SOCS6過表達(dá)消除了miR-NCOE-Exos或miR-155OE-Exos誘導(dǎo)的ROS水平(圖10A和B)、線粒體超氧化物含量(圖10C和D)和線粒體電位(圖10E)的升高。此外，SOCS6過表達(dá)***緩解了miR-NCOE-Exos或miR-155OE-Exos處理后的線粒體腫脹，并降低了線粒體碎片細(xì)胞的比例(圖10F和G)。進(jìn)一步的結(jié)果表明，SOCS6過表達(dá)可挽救miR-NCOE-Exos或miR-155OE-Exos處理導(dǎo)致的OCR、基礎(chǔ)呼吸、ATP產(chǎn)生、呼吸能力和呼吸逆轉(zhuǎn)的下降(圖10H和I)。miR-NCKD-Exos或miR-155KD-Exos處理后沉默SOCS6則出現(xiàn)相反的結(jié)果(圖10J-R)。
結(jié)論：在本研究中，我們發(fā)現(xiàn)SCI后浸潤(rùn)的巨噬細(xì)胞可通過傳遞外泌體miR-155促進(jìn)EndoMT，損害線粒體功能，從而加重BSCB完整性，隨后通過抑制SOCS6誘導(dǎo)的p65降解，***NF-κB通路。我們的工作可能會(huì)加強(qiáng)對(duì)巨噬細(xì)胞和血管內(nèi)皮細(xì)胞之間相互干擾的理解，并揭示脊髓損傷后BSCB完整性的潛在調(diào)節(jié)機(jī)制。 上海英拜生物設(shè)有專業(yè)的武漢技術(shù)中心。
采用LEfSe方法分析經(jīng)DHEA和tempol處理后***改變的關(guān)鍵系統(tǒng)發(fā)育類型。Desulfovibrionaceae屬富集于oil+PBS組，而Muribaculaceae和Alloprevotella屬富集于DHEA+PBS和DHEA+tempol組(圖5A-B)，這表明tempol可以重塑微生物PCOS大鼠的腸道微生物群的結(jié)構(gòu)。通過分析細(xì)菌分類在門和屬水平上的相似性程度，進(jìn)一步比較三組腸道菌群的整體組成。在門水平上，厚壁菌門(Firmicutes)和擬桿菌門(Bacteroidetes)是3個(gè)類群的優(yōu)勢(shì)門(圖5)。DHEA處理增加了放線菌門(Actinobacteria)、擬桿菌門(Bacteroidetes)、Patescibacteria、軟毛桿菌門(Tenericutes)和Verrucomicrobia的豐度，減少了psilonbacteraeota和變形菌門(Proteobacteria)的數(shù)量。然而，在tempol干預(yù)下，放線菌門、Patescibacteria門、變形菌門和Tenericutes門的變化減弱了(圖5D)。在屬水平上，Lachnospiraceae_NK4A136_group和Multibaculaceae為優(yōu)勢(shì)屬(圖5E)。DHEA***提高了thaauera、葡萄球菌、Ideonella、棒狀桿菌和瘤胃球菌_2的豐度，降低了瘤胃球菌_1的豐度。這些變化被tempol處理抵消了(圖5F)。英拜生物是國(guó)內(nèi)承接各類高通量測(cè)序科研項(xiàng)目以及一站式的測(cè)序文章發(fā)表服務(wù)的公司之一。西藏科研服務(wù)價(jià)格
英拜提供春節(jié)回家探親車費(fèi)補(bǔ)貼。上?？蒲蟹?wù)兩年
DNA生物標(biāo)志物
DNA生物標(biāo)記物是MarkerDB中比較大的一類標(biāo)記物。MarkerDB中的DNA生物標(biāo)記進(jìn)一步分為26021個(gè)與209種疾病相關(guān)的DNA突變標(biāo)記、353個(gè)與70種疾病相關(guān)的SNP標(biāo)記和23個(gè)與16種傳染病相關(guān)的微生物/病毒基因。DNA突變數(shù)據(jù)（和臨床批準(zhǔn)的突變?cè)囼?yàn)）來自Genetic Testing Registry，序列數(shù)據(jù)從GenBank中提取，DNA SNP生物標(biāo)記物的主要來源是數(shù)據(jù)庫GWAS-ROCS，疾病信息從OMIM或Genetics Home Reference中提取，關(guān)于微生物/病毒生物標(biāo)記基因的剩余數(shù)據(jù)通過原始文獻(xiàn)或?qū)＠麢z索獲得。目前，MarkerDB中的所有DNA標(biāo)記都有一個(gè)或多個(gè)疾病關(guān)聯(lián)，以及MarkerDB ID、序列（標(biāo)記了疾病變體）、詳細(xì)的基因描述（編碼區(qū)范圍內(nèi)）、基因名稱/同義詞、一個(gè)或多個(gè)文獻(xiàn)參考和到其他在線數(shù)據(jù)庫的外部超鏈接。 上海科研服務(wù)兩年
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀，客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性，為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請(qǐng)：提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫，標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開展，設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn)，中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持，探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測(cè)序：轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片：信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)