10.EVs介導的ELNAT1與BCa淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移相關
確定EVs介導的ELNAT1在BCa淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移中的臨床意義十分重要。首先，作者發(fā)現(xiàn)來自BCa患者的尿中EVs與配對BCa組織的ELNAT1表達呈正相關，這意味著EVs介導的ELNAT1是BCa中ELNAT1調(diào)控的重要參與者（Figure10A）。同時，BCa患者的尿中EV介導的ELNAT1過表達與BCa的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移呈正相關（Figure10B）。EV介導的ELNAT1表達較高的BCa患者總生存期（OS）和無病生存期（DFS）率較短（Figure10C-D）。ROC分析顯示尿液中EV介導的ELNAT1可有效區(qū)分BCa患者與健康志愿者（Figure10E）。與尿液細胞學和FISH檢查結(jié)果相比，尿液中EVs介導的ELNAT1診斷BCa-LN轉(zhuǎn)移的準確性很高（Figure10F）。BCa患者血清中EVs介導的ELNAT1表達水平高于健康對照組（Figure10G）。與無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的BCa患者血清相比，伴有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的BCa患者血清中EVs介導的ELNAT1表達上調(diào)（Figure10H）。
結(jié)論：EVs介導的ELNAT1促進了BCa的淋巴管生成和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移。充分闡明EVs介導的ELNAT1***hnRNPA1/UBC9/ SOX18軸誘導BCa淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的精確機制，不僅將增加我們對EVs介導的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的認識，也將有助于開發(fā)一種***BCa的有效策略。 caspase-3抗體是一種***用于檢測凋亡細胞的標志物。醫(yī)學基礎實驗課題實驗檢測服務
為了進一步證實褪黑素對Tth小鼠在Fth-KO小鼠中的上述作用，將HT-22細胞系用siRNA轉(zhuǎn)染，然后在體外進行機械刮擦損傷。siRNA敲低Fth可以降低Fth的蛋白質(zhì)水平。鑒于脂質(zhì)過氧化是鐵死亡的標志，使用DCF和BODIRY581/591C11作為評估了溶質(zhì)ROS。與對照組+刮擦損傷組相比，siFth+刮擦損傷組細胞的熒光強度顯著增加，表明siFth增強了HT-22細胞中機械刮擦損傷引起的ROS產(chǎn)生的上調(diào)。重要的是，與未經(jīng)***的siFth組相比，用褪黑素處理siFth轉(zhuǎn)染的HT-22細胞未能顯著減少刮擦損傷后ROS的上調(diào)。另外，相對于對照組，在生理條件下，單獨使用siFth不能顯著增加ROS的產(chǎn)生。對鐵死亡的抗性與***BODIRY-C11氧化有關。與上述ROS結(jié)果一致。測量了鐵死亡的幾種推定生物標志物，包括xCT，Cox2和4HNE表達。如預期的那樣，與對照組+刮擦損傷組相比，在siFth轉(zhuǎn)染的HT-22細胞中，刮擦損傷的xCT表達顯著下降，而Cox-2和4HNE的表達顯著增加。重要的是，與未經(jīng)***的siFth組相比，用褪黑素處理siFth轉(zhuǎn)染的HT-22細胞在刮傷后未能顯著改變xCT，Cox2和4HNE的表達。另外，在生理條件下，單獨的siFth與對照組之間上述蛋白質(zhì)的表達沒有顯著差異。這些結(jié)果表明。廣州課題實驗外包阻斷atm依賴的磷酸化會損害DNA損傷后PTEN的亞細胞再分配。
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系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SLE)患者大多數(shù)存在I型IFN刺激基因(ISGs)的高表達。線粒體異常也有報道，但I型IFN暴露對這些變化的貢獻尚不清楚。此外，I型IFN通過上調(diào)脂肪酸氧化(FAO)和氧化磷酸化(OXPHOS)促進漿細胞樣樹突狀細胞（pDCs）的線粒體功能。本文數(shù)據(jù)表明，I型IFN暴露通過代謝重編程促進CD8 + T細胞死亡，有助于SLE發(fā)病。本文于2021年3月發(fā)表在《Nature Communications》IF:12.121。
1、ISGs高表達患者OXPHOS基因下調(diào)為了確定是否T細胞的轉(zhuǎn)錄組特征可以幫助鑒定SLE患者的疾病活動，作者對來源于***和未***女性的CD8+T和CD4+T細胞的mRNA進行測序。對DEGs進行聚類熱圖分析，發(fā)現(xiàn)SLE患者根據(jù)ISG表達水平被分為***的兩類：SLE-1和SLE-2（Fig.1a,b）。在兩種T細胞中，SLE-2類群的患者具有更強烈的I型IFN特征。在CD4+T細胞中，這種特征伴隨著參與JAK-STAT信號和T細胞共刺激的基因，而在CD8+T細胞中，ISG基因的高表達與基因參與細胞周期，響應DNA損傷和凋亡有關（Fig.1a,b）。比較SLE-1和SLE-2組的轉(zhuǎn)錄表達譜，結(jié)果顯示，除ISGs外，mtDNA編碼的OXPHOS基因的表達差異比較大（Fig.1c,d）。 醫(yī)學整體課題外包服務。
3、CRC細胞來源的外泌體miR-934誘導巨噬細胞M2極化
為了探索miR-934促進CRLM的分子和細胞基礎，通過Cytoscape軟件注釋了TCGAcohort中191個miR-934相關基因的細胞功能，發(fā)現(xiàn)miR-934***參與多種炎癥反應，提示miR-934可能參與了CRC免疫微環(huán)境（Fig.3a）。然后發(fā)現(xiàn)miR-934與巨噬細胞的基因信號特異性相關（Fig.3b）。為了研究在CRLM中TAM的浸潤與miR-934之間的相關性，我們在原發(fā)性結(jié)直腸*組織和CRLM組織樣本中采用免疫組化染色檢測TAM標記CD163。如圖3c所示，在CRLM組織中CD163+TAM浸潤豐富的區(qū)域觀察到miR-934表達升高。將THP-1細胞與PMA孵育，誘導分化為M0巨噬細胞，M0巨噬細胞具有適當?shù)馁N壁形態(tài)和巨噬細胞標志物CD68的高表達（Fig.3d）。接下來，研究了CRC細胞來源的外泌體對巨噬細胞M2極化的影響。如Fig.3e所示，當與巨噬細胞共培養(yǎng)時，標記有DiO(綠色)的CRC細胞來源的外泌體被未染色的巨噬細胞內(nèi)化。相比于低表達miR-934的細胞的外泌體孵育的巨噬細胞或PBS孵育的細胞，M2標記物(CD206,arginase-1,IL10和CD163)的表達在高表達miR-934的CRC細胞的外泌體孵育的巨噬細胞中***增加，而M1標記物(iNOS和IL-1β)幾乎無差異（Fig.3f,g）。 高表達的外泌體CD44v6和C1QBP是預測PDAC患者預后和肝轉(zhuǎn)移的很有前途的生物標志物。標志物課題實驗檢測服務
動物建模模型實驗的整體服務。醫(yī)學基礎實驗課題實驗檢測服務
同樣，Transwell實驗(圖5h)也證明了**細胞的遷移能力。綜上所述，circMAPK1在沒有其編碼蛋白MAPK1-109aa的情況下，不能抑制GC細胞的惡性表型。隨后，為了進一步驗證MAPK1-109aa的功能，我們在SGC7901和MGC803細胞中恢復了MAPK1-109aa的表達，無論是否穩(wěn)定敲除circMAPK1，Western blot驗證了這一點(圖6a)。將MAPK1-109aa質(zhì)粒轉(zhuǎn)染到SGC7901和MGC803細胞株后，細胞的增殖能力(圖6b-g)和遷移能力(圖6h)得到了有效的抑制。在轉(zhuǎn)染了shcirMAPK1的細胞系中，恢復了MAPK1-109aa的表達也逆轉(zhuǎn)了穩(wěn)定敲除circMAPK1所導致的惡性表型。綜上所述，上述結(jié)果表明circMAPK1對GC細胞惡性生物學行為的抑制作用依賴于其編碼蛋白MAPK1-109aa。醫(yī)學基礎實驗課題實驗檢測服務
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1.整體課題外包服務：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性，為您的標書奠定較好的基礎
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4.二代測序：轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗