還檢測到β-肌動蛋白***升高，與免疫沉淀的HuR蛋白結(jié)合。接下來研究HuR-β-actin介導(dǎo)的調(diào)節(jié)機制是否參與OPC的遷移調(diào)節(jié)。β-actin的mRNA和蛋白表達(dá)以及細(xì)胞遷移能力在HuR基因過表達(dá)的細(xì)胞中***增加， HuR基因敲低細(xì)胞中降低。β-肌動蛋白的mRNA和蛋白表達(dá)在lnc-PMIF過表達(dá)細(xì)胞中***下調(diào)，但在lnc-PMIF基因敲除細(xì)胞中***上調(diào)，表明lnc-PMIF能抑制OPCs中β-actin的表達(dá)，基因過表達(dá)/敲除lnc-PMIF不改變HuR的蛋白表達(dá)。在前述lnc-PMIF敲低細(xì)胞中敲低HuR基因，細(xì)胞中β-actin的mRNA和蛋白表達(dá)***下調(diào)，細(xì)胞遷移能力也受到...

Nup62 OE或?qū)φ展壌竽X的可溶性-不可溶性分選顯示，與對照相比，Nup62在運動神經(jīng)元中表達(dá)的上調(diào)***增加了不溶性，從而改變了Tbph的可溶性(圖4F和G)，表明Nup62水平是Tbph溶解度的重要決定因素。qPCR證實了Nup62的過表達(dá)(圖4H)。NUP62與內(nèi)源性TDP-43共聚合(圖4I)。與單獨mRuby相比，NUP62在HEK293T細(xì)胞中的表達(dá)導(dǎo)致TDP-43的溶解性***改變(圖4J和K）。檢測了nup62介導(dǎo)的TDP-43聚集物在HEK293T細(xì)胞中是否被磷酸化。內(nèi)源性與NUP62-mRuby共定位的TDP-43聚集體被磷酸化(圖4L)。外泌體CD44v6和C1QBP...

我們進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)，MCD處理的Caspase-11缺陷小鼠顯示更低的血清谷丙轉(zhuǎn)氨酶(ALT)水平(圖2D)、血清天冬氨酸轉(zhuǎn)氨酶(AST)水平(圖2E)和肝臟甘油三酯水平(圖2F)?？傊覀兊慕Y(jié)果表明Caspase-11缺陷減輕了MCD誘導(dǎo)的小鼠肝臟脂肪變性。 3.Caspase-11缺乏減弱NASH小鼠的肝纖維化 通過測量纖維化相關(guān)因子的表達(dá)我們評估Caspase-11缺失對MCD誘導(dǎo)的肝纖維化的影響。在正常條件下，野生型和Caspase-11缺陷小鼠的TGF-β(圖3A)、α-Sma(圖3B)和Col1a1(圖3C)表達(dá)相似。MCD處理的野生型小鼠中TGF-β、α-Sma和C...

2.TYRO3使**細(xì)胞對抗PD-1***耐藥 在同系BALB/c小鼠模型中比較了Tyro3過表達(dá)(Tyro3-OE)和4T1-P細(xì)胞對抗mPD-1***的反應(yīng)。在荷4T1-P**的小鼠中，抗mPD-1******減少**的生長，并延長了生存期。這些結(jié)果表明，盡管4T1-P**對抗mPD-1***有反應(yīng)，Tyro3的過表達(dá)促進(jìn)了這些**的耐藥性。為進(jìn)一步確定在4T1-R耐藥細(xì)胞中抗PD-1/PD-L1耐藥是否需要TYRO3，敲除4T1-R細(xì)胞(TYRO3–/–)中的TYRO3。荷瘤Tyro3敲低細(xì)胞的小鼠對抗mPD-1***敏感，**生長***減少，小鼠存活時間更長。這些結(jié)果證明TY...

三、pten - s38a突變誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡抵抗 為了進(jìn)一步了解阻斷atm依賴的PTEN磷酸化如何影響細(xì)胞對基因毒性損傷的反應(yīng)，我們使用抗體陣列評估了表達(dá)PTEN-wt或PTEN-398a的MCF10A細(xì)胞裂解液的應(yīng)激反應(yīng)和凋亡通路的活性。Pten+/+和Pten398A/398AMEF培養(yǎng)，表達(dá)Pten-wt的MCF10A細(xì)胞與表達(dá)Pten-398A的MCF10A細(xì)胞在正常培養(yǎng)條件下的生長速率均無差異(圖3A和補充圖5C)。對細(xì)胞進(jìn)行不同的基因毒性脅迫處理:IR、順鉑和柔紅霉素。在所有條件下，Pten398A/398AMEFs和PTEN-398A表達(dá)的MCF10A細(xì)胞對基因毒性脅迫的...

PTEN包含一個n端磷酸酶結(jié)構(gòu)域，它可以使脂質(zhì)細(xì)胞膜的一種成分——磷脂酰肌醇3,4,5-三磷酸(PI(3,4,5)P3或PIP3)去磷酸化。PTEN通過去磷酸化PIP3的D3位，拮抗磷脂酰肌苷3-激酶(PI3K)通路。PI3K通路調(diào)節(jié)多種細(xì)胞過程，包括細(xì)胞代謝、存活、增殖、凋亡、生長和遷移。這些基本的細(xì)胞過程，當(dāng)解除控制時，可以促進(jìn)或驅(qū)動惡性表型。PTEN功能突變的體細(xì)胞丟失在多種人類**中被發(fā)現(xiàn)，包括乳腺*、子宮內(nèi)膜*、多形性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤、皮膚*和前列腺*。PTEN缺失是乳腺*中常見的事件，與加速進(jìn)展和不良預(yù)后密切相關(guān)。特別是PTEN的表達(dá)已經(jīng)被提出在人表皮生長因子受體2(HER2)過表達(dá)乳...

來自4個不同腺泡性LUAD患者的PDX模型被給予XC-系統(tǒng)抑制劑erastin(PKE)和多激酶抑制劑索拉非尼(sorafenib)。與DMSO***的對照組相比，PKE和sorafenib給藥時觀察到***的**消退(圖7G-J)。此外，PKE和sorafenib給藥小鼠也導(dǎo)致**中MDA和4-HNE的***增加(圖7K和L)，提示誘導(dǎo)的脂質(zhì)過氧化可能是抑制腺泡LUADs**發(fā)生的結(jié)果。圖7M顯示，與*旁組織相比，**組織中MDA和YTHDC2表達(dá)量都降低，而SLC7A11mRNA和蛋白水平都升高，證明在LUAD中抑制YTHDC2可通過SLC7A11表達(dá)上調(diào)阻止脂質(zhì)過氧化。同樣地，MDA...

3）RIC8A與circPDE4B相互作用，參與OA 為了鑒別與circPDE4B相互作用的蛋白，我們采用RPD-MS(圖3A)，共鑒定出112個與circPDE4B相互作用的蛋白(圖3B)，確定RIC8A。HCs中的RNA-蛋白共定位證實了RIC8A和circPDE4B之間的相互作用(圖3C)。RPD實驗表明，體外線性轉(zhuǎn)錄的circPDE4B能拉下重組RIC8A(圖3D)。然后，我們使用catRAPID工具預(yù)測circPDE4B和RIC8A的相互作用區(qū)域(圖3E)。為了識別預(yù)測的結(jié)合位點，我們將FLcircPDE4B截短為3個片段。據(jù)預(yù)測，RIP結(jié)果顯示有FL和S3被RIC8A拉下...

QKI促進(jìn)NSCLC細(xì)胞中circNDUFB2的生物發(fā)生 circNDUFB2和NDUFB2均來自NDUFB2 pre-mRNA，而NDUFB2 mRNA在NSCLC中略有上調(diào)。因此，推測circNDUFB2的下調(diào)在轉(zhuǎn)錄后發(fā)生。我們在circNDUFB2中搜索與潛在QRE匹配的序列。接下來進(jìn)行了RIP分析，確認(rèn)QKI確實與NDUFB2 pre-mRNA中的假定QRE結(jié)合。在NSCLC細(xì)胞中QKI過表達(dá)可能會上調(diào)circNDUFB2。 這些數(shù)據(jù)表明，QKI與NDUFB2 pre-mRNA的circNDUFB2形成外顯子側(cè)翼的內(nèi)含子結(jié)合，從而促進(jìn)circNDUFB2的形成。 可以上傳原始...

1）circPDE4B在OA組織中表達(dá)較低 我們之前對3個臨床OA和3個對照樣本的軟骨細(xì)胞核糖體RNA缺失的總RNA進(jìn)行了RNA-seq分析。在數(shù)量**多的50個***調(diào)控異常的circRNA中，circPDE4B的表達(dá)水平排名***。我們評估了每個病例的OA嚴(yán)重程度(圖1A)。同時，我們進(jìn)行了組織形態(tài)學(xué)和熒光原位雜交實驗，結(jié)果顯示軟骨降解程度增加對應(yīng)軟骨細(xì)胞中circPDE4B的表達(dá)降低(圖1B)。RT-qPCR檢測到嚴(yán)重OA組織軟骨細(xì)胞中circPDE4BRNA水平下調(diào)，而mPDE4BmRNA水平保持相對一致(圖1C)。綜上所述，circPDE4B的表達(dá)與OA的嚴(yán)重程度呈負(fù)相關(guān)。...

4）circPDE4B促進(jìn)了RIC8A和MID1之間的三元配合物的形成，促進(jìn)了RIC8A的降解 我們試圖鑒定參與RIC8A蛋白酶體降解的E3連接酶。有趣的是，MS結(jié)果顯示circPDE4B也結(jié)合了兩個E3連接酶，包括RNF2和MID1。然而，由于RNF2定位于細(xì)胞核內(nèi)，我們選擇MID1進(jìn)行進(jìn)一步研究。實際上，通過免疫沉淀分析，MID1被發(fā)現(xiàn)與RIC8A結(jié)合(圖4A)。RIC8A和MID1的免疫熒光染色也證實了它們在HCs***定位(圖4B)。IP結(jié)果表明，MID1敲低有效地削弱了RIC8A和MID1過表達(dá)的泛素化作用，增加了RIC8A泛素化作用(圖4C)。Co-IP實驗也顯示，與對照...

為了探究MIR210HG是否參與了一個新的MIR210HG- miRNA -HMGA2調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，我們使用TargetScan、miRanda、CLIP-Seq和miRDB生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫來預(yù)測與HMGA2結(jié)合的mirna(圖3F)。選擇3個軟件程序分析交叉處的miRNAs作為候選miRNAs。通過將野生型雙熒光素酶載體介導(dǎo)的HMGA2構(gòu)建物共轉(zhuǎn)染HEK293T細(xì)胞，共鑒定和篩選了110個miRNAs。轉(zhuǎn)染后，23個miRNA轉(zhuǎn)染細(xì)胞的熒光素酶活性***降低(圖3G)。在上述23種miRNAs中，轉(zhuǎn)染miR-3373p、miR-137、let-7c-5p和miR-98-5p時，熒光素酶活性***...

此外，IF 分析還表明 FIR 過表達(dá)和敲低可以明顯逆轉(zhuǎn) circACTN4 上調(diào)和下調(diào)對 MYC 表達(dá)的影響。IF發(fā)現(xiàn)與*旁組織相比，在BC 組織中 MYC 高表達(dá)。WB分析表明，F(xiàn)IR的上調(diào)和下調(diào)可以通過過表達(dá)和沉默circACTN4來抵消對MYC及其下游蛋白CDK4和CCND2表達(dá)的增強和抑制作用。綜上所述，上述結(jié)果進(jìn)一步證明circACTN4可能與FUBP1競爭性結(jié)合，阻斷FIR對MYC的轉(zhuǎn)錄抑制作用，從而促進(jìn)BC的**發(fā)生和進(jìn)展。 CircACTN4促進(jìn)體內(nèi)異種移植**的發(fā)生和轉(zhuǎn)移 為了評估circACTN4在體內(nèi)的致*作用，通過皮下注射和尾靜脈注射在裸鼠中建立人BC...

一、人胎肝和骨髓造血室的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組 為獲取胚胎發(fā)育期間造血細(xì)胞的全部譜系，研究者從17 – 22 PCW的胚胎肝臟、股骨和髖骨中對表型確定的血液群體進(jìn)行單細(xì)胞分類，并對15個胚胎的單個細(xì)胞進(jìn)行scRNA-seq檢測（圖1）?；诓町惐磉_(dá)分析和標(biāo)準(zhǔn)化表達(dá)***性排名前20的標(biāo)記基因，標(biāo)注了23個不同的群體，發(fā)現(xiàn)在肝臟或股骨中檢測不到任何T細(xì)胞或先天淋巴細(xì)胞（ILCs），單細(xì)胞分析顯示在所有免疫表型定義的干細(xì)胞和祖細(xì)胞群體中存在大量的轉(zhuǎn)錄異質(zhì)性，其中一些表型祖細(xì)胞群體（如HSCs，MPPs，CMPs，GMPs，MEPs和CLPs）由10多個不同的轉(zhuǎn)錄表型定義群體組成，這進(jìn)一步證明人類臍...

circ_0072083 與 miR-1252-5p 相互作用以調(diào)節(jié) TMZ 抗性 神經(jīng)膠質(zhì)瘤細(xì)胞中的 ALKBH5/NANOG 軸和 TMZ 抗性為了分析circ_0072083如何調(diào)節(jié)ALKBH5/NANOG軸，探索了潛在的 miRNA作為串?dāng)_?；贑ircinteractome和starBase的數(shù)據(jù)庫，維恩圖顯示只有一種miRNA（miR-1252-5p）可以與circ_0072083、ALKBH5和NANOG結(jié)合。 miR-1252-5p 表達(dá)在 TMZ 抗性組織和細(xì)胞中顯著降低。為了驗證它們的相互作用，構(gòu)建了野生型和突變型熒光素酶報告載體。miR-1252-5p 過表達(dá)明...

為了檢測補充NAD + 是否可以糾正IFNα刺激的下游效應(yīng)，用1 mM β-煙酰胺單核苷酸(NMN)培養(yǎng)CD8 + T細(xì)胞以恢復(fù)NAD +/NADH比值（圖6e）。然后，評估了用抗CD3/CD28再刺激后的氧化反應(yīng)和細(xì)胞活力。補充NMN的NAD + 增加了OCR（圖6f），但未增加ECAR，表明線粒體能力增加。重要的是，通過NMN處理恢復(fù)NAD + 的可用性改善了IFNα延長和TCR刺激后的細(xì)胞活力（圖6 g），表明NAD途徑調(diào)節(jié)這些活化的人CD8 + T細(xì)胞中的線粒體適應(yīng)性和細(xì)胞存活率?？傊?，這些數(shù)據(jù)表明，在人TCR刺激的CD8 + T細(xì)胞中，延長IFNα暴露增加了NAD + 的消耗，并降低...

2、miR-138-5p介導(dǎo)*細(xì)胞誘導(dǎo)的巨噬細(xì)胞KDM6B表達(dá)抑制構(gòu)建了miR-138-5p過表達(dá)的乳腺*細(xì)胞系，取其培養(yǎng)基與巨噬細(xì)胞共培養(yǎng)，結(jié)果巨噬細(xì)胞中miR-138-5p表達(dá)***上調(diào)，同時KDM6B的表達(dá)***下降。證實miR-138-5p介導(dǎo)*細(xì)胞誘導(dǎo)的巨噬細(xì)胞KDM6B表達(dá)抑制。 3、*細(xì)胞來源的外泌體miR-138-5p下調(diào)KDM6B的表達(dá) 隨后為了判定上述巨噬細(xì)胞中miR-138-5p表達(dá)上調(diào)的原因，檢測了巨噬細(xì)胞中原代(pri-)和前體(pre-)miR-138的水平。結(jié)果顯示共培養(yǎng)和對照組間原代和前體miR-138的水平?jīng)]有差異，表明miR-138-5p是外...

然而，在單細(xì)胞方法中，尚未出現(xiàn)一種適用于所有三種模式的統(tǒng)一方法，這種方法可以應(yīng)用于高度特定的功能免疫細(xì)胞類型。我們系統(tǒng)地測試了PBMCs的全細(xì)胞和核純化和制備方法，以克服以往的分析只限于測量細(xì)胞表面的核成分(ATAC和核rna)或蛋白質(zhì)的局限性。我們發(fā)現(xiàn)完整的透性細(xì)胞的scATAC-seq表現(xiàn)非常好，在某些測量中超過了傳統(tǒng)的細(xì)胞核scATAC-seq(圖1b)。這一發(fā)現(xiàn)使得一種類似于轉(zhuǎn)錄組和表位的細(xì)胞索引(CITE-seq)的新方案能夠測量表面蛋白豐度和染色質(zhì)可及性:染色質(zhì)景觀和表位的整合細(xì)胞索引(ICICLE-seq，圖1a和3)。***，我們證明了我們優(yōu)化的可滲透細(xì)胞方法可以與基于液滴的多...

6.翻譯產(chǎn)物的序列組成 所有天然蛋白質(zhì)的氨基酸（aa）序列*占據(jù)可能序列空間的一小部分，主要是因為只有一小部分序列可以形成穩(wěn)定的蛋白質(zhì)。因此，具有“非天然”序列的蛋白質(zhì)傾向于快速降解，并且與所有天然蛋白質(zhì)的序列相似性可以作為強有力的預(yù)測指標(biāo)，以鑒定隨機氨基酸序列中的真實蛋白質(zhì)。使用機器學(xué)習(xí)方法來預(yù)測天然蛋白給定序列的可能性，并應(yīng)用該預(yù)測來對circRNA編碼的給定ORF可以用作功能蛋白模板的可能性進(jìn)行評分。 7.質(zhì)譜/蛋白質(zhì)組學(xué)證據(jù) 質(zhì)譜法是準(zhǔn)確鑒定和表征蛋白質(zhì)的重要方法。已經(jīng)進(jìn)行了數(shù)個大規(guī)模質(zhì)譜實驗來研究人類蛋白質(zhì)組，但是即使考慮蛋白質(zhì)的翻譯后修飾，也只能可靠地將約50...

自噬“貨物”是有選擇性裝載的，其中主要依靠LIR基序與LC3互作，形成自噬體。隨后，自噬體進(jìn)行運輸、溶解。研究表明，自噬異常會影響疾病進(jìn)程。**中的自噬具有雙重作用：一方面自噬的發(fā)生會增強*細(xì)胞的生存能力；另一方面，抑制自噬會造成“廢物”的積累、基因突變等，誘發(fā)**。 1、Meta-GWAS分析 收集三組GWAS數(shù)據(jù)用于meta分析，確定了35個基因區(qū)域中36個**的基因突變（p<5×10?8）。接下來，分析SNP200kb內(nèi)與AD***相關(guān)(p<10-5)的突變，篩選獲得PRKD3/NDUFAF7,SHARPIN,CHRNE,PLCG2,APP6個基因，這6個基因都存在于AD...

巨噬細(xì)胞在 AP 恢復(fù)不同階段的不同作用 鑒于 AP 恢復(fù)過程中巨噬細(xì)胞的表型變化，接下來試圖通過用脂質(zhì)體***巨噬細(xì)胞來檢查巨噬細(xì)胞在不同修復(fù)/再生階段的作用。首先，我們在急性炎癥反應(yīng)后（從第 1 天到第 2 天）立即消耗了胰腺巨噬細(xì)胞，并在第 3 天檢查了胰腺。如圖所示，第 3 天之前巨噬細(xì)胞的消耗可以在很大程度上減少導(dǎo)管樣結(jié)構(gòu)，這表明巨噬細(xì)胞在ADM的形成。AP 損傷后第 3天巨噬細(xì)胞的消耗顯著延遲了胰腺修復(fù)。Ki67 +細(xì)胞在第3天達(dá)到峰值，并隨著胰腺恢復(fù)逐漸下降。與組織學(xué)結(jié)果一致，發(fā)現(xiàn)CN處理組的Ki67 +細(xì)胞從第 5 天到第 7 天大幅下降，但在 CL 處理組中沒有，表...

miR-101-3p抑制**細(xì)胞通過靶向TBLR1 生物信息學(xué)預(yù)測分析顯示miR-101-3p在TBLR1的3’UTR區(qū)域存在3個結(jié)合位點（圖3A）。作者此前的研究結(jié)果表明TBLR1是一個肝*和宮頸*的原*基因，也有證據(jù)顯示其也是肺*中的原*基因。因此，探討了miR-101-3p和TBLR1的表達(dá)相關(guān)性，結(jié)果顯示在32例LC樣本中它們的表達(dá)負(fù)相關(guān)。熒光素酶實驗結(jié)果顯示miR-101-3pmimics和TBLR1野生型共轉(zhuǎn)染時熒光素酶活性***下降，而和TBLR1突變型共轉(zhuǎn)染時沒有***改變，表明miR-101-3p和TBLR1之間存在結(jié)合關(guān)系。進(jìn)一步地，WB結(jié)果顯示，過表達(dá)miR-1...

五、急性GvHD的嚴(yán)重程度可以在造血干細(xì)胞移植之前通過口腔微生物群的組成來預(yù)測 A.相對豐度:隨著時間的推移，在0級aGvHD患者的口腔中12個**豐富的家族。B.svmLinear模型識別出的前20名口腔預(yù)測ASV的重要性圖，重要性分?jǐn)?shù)表示剔除該ASV后，預(yù)測精度平均下降。**終的交叉驗證svmLinear模型從口服ASVspreHSCT的豐度中預(yù)測了aGvHD(0IvsIIIV)，準(zhǔn)確率為92%(95%CI:73~99%)。通過Boruta特征選擇確認(rèn)的asv用星號表示。C.條件推理樹(CTREE)顯示asv被非參數(shù)回歸識別為有意義的分裂節(jié)點用于aGvHD預(yù)測。沿分枝的數(shù)目表明變...

二、RIT1與MAD2和p31conmet的相互作用由CDK1磷酸化調(diào)控 在間期，RIT1 s c端尾部介導(dǎo)質(zhì)膜(PM)結(jié)合然而，在分析有絲分裂細(xì)胞時，我們觀察到RIT1在細(xì)胞進(jìn)入有絲分裂和進(jìn)入中期并在后期快速易位到PM時的彌漫性胞質(zhì)分布(圖2A和2B)。同樣，在有絲分裂細(xì)胞裂解物中檢測到內(nèi)源性RIT1的主要胞質(zhì)分布(圖2C)。(S209D/E)磷酸化，而非(S209A)缺磷，突變破壞了RIT1-MAD2/p31conmet結(jié)合(圖2D)。RIT1磷酸化在有絲分裂過程中**為豐富(圖2E)。抑制CDK1***降低了重組RIT1的磷酸化(圖2F)。免疫印跡檢測和質(zhì)譜證實CDK1/Cyc...

snoRNAs的生物合成 snoRNAs主要包含兩個家族：C/DboxsnoRNAs與H/ACAboxsnoRNAs[5](圖1)。大多數(shù)snoRNAs主要位于由RNA聚合酶II轉(zhuǎn)錄的基因的內(nèi)含子區(qū)域。但snoRNAs也可以來源于長鏈非編碼RNA（lncRNA）的內(nèi)含子區(qū)域。從內(nèi)含子上脫離后，pre-snoRNAs進(jìn)一步的被核酸外切酶處理去除兩端的多余序列，進(jìn)而形成成熟的snoRNAs。snoRNAs內(nèi)部的信號序列指導(dǎo)snoRNAs與相應(yīng)蛋白結(jié)合形成snoRNP復(fù)合物來避免被酶切，進(jìn)而發(fā)揮功能。snoRNP復(fù)合物能夠分為兩類C/DboxsnoRNP和H/ACAboxsnoRNP。C/...

藥物基因組學(xué)（老年保護(hù)化合物）模塊 該老年保護(hù)化合物模塊專注于老年保護(hù)劑，允許用戶查詢與衰老相關(guān)的化合物，根據(jù)衰老表型、靶點、途徑和與年齡相關(guān)的疾病，提供應(yīng)用于模型生物的相關(guān)化合物的匯總數(shù)據(jù)。該模塊目前包含來自藥物治療分析（體內(nèi)和體外）的數(shù)百種化合物和組學(xué)數(shù)據(jù)集的列表，揭示由特定壽命/延長健康壽命的藥物引起的基因表達(dá)變化。在該模塊的首頁，用戶可以瀏覽“熱門小分子”功能，每周更新列出搜索**多的化合物；“臨床試驗”提供了老年保護(hù)劑的臨床試驗數(shù)據(jù)；“專題文章”展示了衰老領(lǐng)域的***研究。重要的是，用戶可以通過藥物名稱、目標(biāo)基因或來源論文的 DOI 輕松搜索，以獲取有關(guān)老年保護(hù)化合物的詳細(xì)...

3）LINC00926通過抑制乳腺*細(xì)胞中PGK1的表達(dá)來抑制糖酵解 由于PGK1是一種關(guān)鍵的糖酵解酶，而LINC00926被鑒定為負(fù)調(diào)控PGK1的lncRNA，我們想知道需氧糖酵解是否在LINC00926介導(dǎo)的乳腺*細(xì)胞增殖抑制中發(fā)揮作用。我們測試了LINC00926對葡萄糖攝取、乳酸生成和ATP生成的調(diào)節(jié)作用。結(jié)果表明，LINC00926降低了葡萄糖攝取、乳酸生成和ATP生成(圖3A)。在LINC00926轉(zhuǎn)染的細(xì)胞中，PGK1的表達(dá)逆轉(zhuǎn)了這些作用。LINC00926還顯示出細(xì)胞外酸化率下降(圖3B和3C)。PGK1在LINC00926轉(zhuǎn)染的細(xì)胞中重新表達(dá)挽救了這些效果。在PGK...

IFNα和抗CD3/CD28磁珠長期刺激后CD8 + T細(xì)胞中SRC能力的降低表明生物能量適應(yīng)性受損。研究發(fā)現(xiàn)，IFNα刺激的CD8 + T細(xì)胞在初始爆發(fā)后，與*用CD3/CD28刺激的CD8 + T細(xì)胞相比，其氧化和糖酵解能力下降更快（圖4d）?？傊?，使用健康對照CD8 + T細(xì)胞的體外研究表明，雖然單獨延長IFNα處理能夠觸發(fā)可檢測的代謝改變，但只有IFNα暴露和T細(xì)胞活化的聯(lián)合才能表型復(fù)制IFN-High SLE患者CD8 + T細(xì)胞中觀察到的線粒體和代謝異常。 5、IFNα暴露誘導(dǎo)慢性***CD8+T細(xì)胞死亡 在建立重現(xiàn)SLECD8+T細(xì)胞代謝變化的實驗條件后，接下來研...

A.29名兒童在進(jìn)行異體造血干細(xì)胞移植前、移植時、移植后即刻以及后期隨訪時均進(jìn)行了監(jiān)測。監(jiān)測患者的基線特征、臨床結(jié)果、免疫細(xì)胞計數(shù)以及炎癥和***標(biāo)志物。表S1(附加文件1)詳細(xì)描述了患者特征。宿主免疫系統(tǒng)參數(shù)與腸道、口腔和鼻腔微生物群的縱向動力學(xué)相關(guān)，這些微生物群在指定的時間點進(jìn)行了評估。 B.每個身體部位HSCT前、移植時和移植后的細(xì)菌α多樣性以log10變換后的y軸顯示。星號表示時間點間的中值逆Simpson指數(shù)存在***差異。C.相對于HSCT的時間點LDA分析。對于糞便樣本，HSCT后立即采集的樣本LDA評分為陽性。對于口腔和鼻腔樣本，在HSCT前和后期隨訪時間點樣本的LD...

四、FZD7是YTHDF1中真正的m6A修飾靶標(biāo) 對于***腹肌Hippo或Wnt通路的13個轉(zhuǎn)錄本，我們采用了多步驟篩選策略(圖4A)。使用RIP結(jié)合qPCR驗證確定YTHDF1相互作用的轉(zhuǎn)錄本（4B）。Wnt途徑的FZD1、FZD7、CTBP2、MAPK9、MAP3K7等轉(zhuǎn)錄本，以及Hippo途徑的TP53BP1、PARD3、SMAD2、SMAD3等轉(zhuǎn)錄本均被YTHDF1抗體特異性免疫沉淀(4C)。YTHDF1基因敲除****降低了FZD7、MAPK9、SMAD2、SMAD3和PARD3的蛋白水平(圖4D)，但它們的mRNA未受影響。m6A免疫沉淀反應(yīng)(m6A-IP)和YTHDF1 e...