天津課題創(chuàng)新服務

來源: 發(fā)布時間:2021-11-06

藥物基因組學(老年保護化合物)模塊

該老年保護化合物模塊專注于老年保護劑,允許用戶查詢與衰老相關的化合物,根據(jù)衰老表型、靶點、途徑和與年齡相關的疾病,提供應用于模型生物的相關化合物的匯總數(shù)據(jù)。該模塊目前包含來自藥物治療分析(體內(nèi)和體外)的數(shù)百種化合物和組學數(shù)據(jù)集的列表,揭示由特定壽命/延長健康壽命的藥物引起的基因表達變化。在該模塊的首頁,用戶可以瀏覽“熱門小分子”功能,每周更新列出搜索**多的化合物;“臨床試驗”提供了老年保護劑的臨床試驗數(shù)據(jù);“專題文章”展示了衰老領域的***研究。重要的是,用戶可以通過藥物名稱、目標基因或來源論文的 DOI 輕松搜索,以獲取有關老年保護化合物的詳細信息。該模塊不僅提供了延長壽命和延長健康期的化合物列表,還提供了有關藥物引起的基因調(diào)控和表達變化的信息。 致力于醫(yī)學相關領域的實驗技術服務和相關生物醫(yī)學課題的研究。天津課題創(chuàng)新服務

然后使用單細胞RNA-seq來描述移植后30天脾臟中存留的T細胞的轉錄譜(Fig.4G)。使用pseudobulkRNA-seq分析和預轉移體外培養(yǎng)的基因比較,生成了持續(xù)細胞的基因標記,其標志是記憶相關基因(Sell,F(xiàn)oxp1,Tcf7,Cd7,Il7r,Klf2,Ccl5)的高表達和效應相關基因(Gzmd,Ifng,Prf1,Gzma,Gzmb)的低表達(Fig.4H-I)。對先前的體外單細胞數(shù)據(jù)(Fig.2H-J)的進一步分析顯示,CDK4/6i處理后,具有這種持續(xù)性特征的細胞頻率從7.5%增加至26.8%(Fig.4J-K)。這些數(shù)據(jù)表明,抑制CDK4/6促進T細胞向真實的記憶表型分化,其特征是功能的長期持久性。湖南課題細胞實驗完善的實驗平臺提供可視化的建模服務。

4)USP35過表達減少erastin/RSL3觸發(fā)的鐵紊亂和鐵死亡

erastin和RLS3誘導的ROS和MDA生成因USP35過表達而減少(圖4A,B)。此外,在erastin和RLS3處理的*細胞中,HETEs水平升高,但在除12-HETE外的USP35過表達的*細胞中,HETEs水平降低(圖4C,F(xiàn))。然而,USP35過表達對GSH含量和GPX4活性沒有影響(圖4G,H)。如圖4I,J所示,USP35的過表達***減弱了用erastin或RSL3刺激H460和H1299細胞誘導LIP和Fe2+的作用。與表型改變一致,在基礎條件下,USP35過表達對鐵代謝和鐵死亡也沒有影響(圖4A,J)。

該研究是基于生殖系拷貝數(shù)變異(CNV)的全基因組關聯(lián)分析(GWAS),通過對比1583例乙型肝炎病毒(HBV)相關的肝*患者與1540例乙型肝炎病毒(HBV)相關的非肝*患者,發(fā)現(xiàn)了一個低頻重復染色體15q13.3與乙型肝炎病毒相關的肝*患病風險密切相關(P=3.17×10–8;odds ratio, 12.02)。15q13.3的拷貝數(shù)與SNORA18L5在肝組織中的表達相關。過表達SNORA18L5的增加了小鼠肝*細胞的增殖和移植瘤的生長;干擾SNORA18L5降低了肝*的增殖和**的生長。SNORA18L5在HepG2和SMMC-7721細胞中的過表達可抑制p53依賴性細胞周期阻滯和凋亡。SNORA18L5的過表達導致核糖體生物合成活性增強,成熟的18S和28S rRNA水平升高,導致核糖體蛋白RPL5和RPL11停留在核仁中,從而阻止它們與MDM2結合。這導致了MDM2介導的p53泛素化和降解的增加。與非**肝組織相比,HCC組織中SNORA18L5水平升高,且患者生存時間縮短。該研究深入淺出的從中國人口全基因組的生殖拷貝數(shù)的突變?nèi)胧诌M一步揭示了CNV的突變通過snoRNA的差異表達來影響乙型肝炎病毒(HBV)相關的肝*。我們使用抗體陣列評估了表達PTEN- wt或PTEN- 398a的MCF10A細胞裂解液的應激反應和凋亡通路的活性。

4.YTHDC2抑制依賴于SLC7A11的胱氨酸攝取

Xc-系統(tǒng)是一個胱氨酸/谷氨酸逆向轉運蛋白,捕獲細胞外的胱氨酸,用于谷胱甘肽的合成,以交換谷氨酸的釋放。在圖3中,被抑制的Xc-系統(tǒng)功能與YTHDC2受損的胱氨酸攝取有關,然而YTHDC2如何調(diào)節(jié)Xc-系統(tǒng)依然未知。文獻報道催化亞基SLC7A11在維持Xc-系統(tǒng)活性方面起著重要作用。作者通過IB和RT-qPCR發(fā)現(xiàn),SLC7A11蛋白和mRNA水平均受YTHDC2負調(diào)控(圖4A、B)。在小鼠中,與KPE和KPYΔYTH小鼠相比,KPYWT小鼠的**中SLC7A11表達下調(diào)(圖4C、D)。這證明YTH結構域是YTHDC2抑制SLC7A11表達的前提。 公共比較毒理基因組學數(shù)據(jù)庫。黑龍江課題實驗可參觀

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2、白樺素下調(diào)SREBP靶基因,降低細胞脂質(zhì)水平

由于SREBP-2是其自身的直接靶標,因此白樺素將其表達下調(diào)40%(圖3A)。與SREBP-2是膽固醇生物合成的主要轉錄因子這一觀點一致,膽固醇合成途徑中的10個被測基因,例如HMGCR,HMG-CoA合酶(HMGCS)和角鯊烯環(huán)氧酶(SE),都被白樺素處理抑制了(圖3A)。類似地,與脂肪酸和甘油三酸酯合成有關的所有9個基因,例如SREBP-1c,脂肪酸合酶(FAS)和乙酰輔酶A羧化酶α(ACC),都被白樺素顯著下調(diào)(圖3B)。與早期觀察結果一致(圖1A),包括ABCG5和ABCG8在內(nèi)的LXR靶基因不受白樺素的影響(圖3C)。 天津課題創(chuàng)新服務

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5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片

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