snoRNAs的生物合成
snoRNAs主要包含兩個家族:C/DboxsnoRNAs與H/ACAboxsnoRNAs[5](圖1)。大多數snoRNAs主要位于由RNA聚合酶II轉錄的基因的內含子區(qū)域。但snoRNAs也可以來源于長鏈非編碼RNA(lncRNA)的內含子區(qū)域。從內含子上脫離后,pre-snoRNAs進一步的被核酸外切酶處理去除兩端的多余序列,進而形成成熟的snoRNAs。snoRNAs內部的信號序列指導snoRNAs與相應蛋白結合形成snoRNP復合物來避免被酶切,進而發(fā)揮功能。snoRNP復合物能夠分為兩類C/DboxsnoRNP和H/ACAboxsnoRNP。C/DboxsnoRNP包含四種進化上保守的,必需的蛋白質,即纖維蛋白(fibrillarin)/Nop1p、Nop56、Nop58/Nop5p和p15.5KD/Snu13p,而H/ACAboxsnoRNP的結合蛋白包括進化保守的Cbf5p(dyskerin)、Gar1p、Nhp2p和Nop10p。 英拜提供生物醫(yī)學課題外包服務。西藏課題動物模型構建
HIF***可促進DMF誘導的CRC細胞死亡
作者的篩選鑒定出DMF是一種小分子,可以有效地減少低氧**腸道樣體的生長。一組CRC細胞系使用DMF單獨或聯合缺氧或模擬缺氧FG4592處理。通過MTT和長期克隆生存試驗評估,FG4592增強DMF誘導的CRC細胞死亡。此外,DMF處理和缺氧培養(yǎng)的細胞存活率較低。與erastin和RSL3數據一致,HIF-2α是促進DMF介導的CRC細胞生長的關鍵。
DMF**于鐵死亡誘導細胞死亡
由于DMF與其他細胞對鐵死亡***劑一起有效地降低了缺氧細胞的生長,我們評估了DMF是否介導了鐵死亡***劑的死亡。在DMF處理后,Fer-1和Lip-1不能挽救細胞的死亡和活力,而rsl3介導的細胞死亡被Fer-1和Lip-1挽救。在DMF處理后,Fer-1和Lip-1不能挽救細胞的死亡和活力,而RSL3介導的細胞死亡被Fer-1和Lip-1挽救。DMF可與抗氧化劑GSH直接反應,導致NADPH降低,ROS增強。然而,FG4592和糖酵解抑制劑的共同作用并沒有降低細胞活力。這些結果表明,在DMF介導的缺氧**細胞死亡中有其他機制參與。 西藏課題動物模型構建深耕科研行業(yè)提高科研的高效。
為了證明ELNAT1與BCa分泌的EV的關系,作者從BCa細胞培養(yǎng)基中分離出EVs,采用透射電子顯微鏡(TEM)、納米粒子**分析(NTA)及對EVs的蛋白標志物檢測,證明了作者準確分離出BCa分泌的EV(Figure 2 J-L)。并且從BCa患者和健康志愿者尿液樣本中分離的EVs中檢測ELNAT1的表達,發(fā)現ELNAT1在BCa分泌的EV中過表達(Figure 2 I)。以上數據表明,EVs介導的ELNAT1過表達與淋巴結轉移相關。
3.EVs介導的ELNAT1促進BCa體內外淋巴管生成和淋巴轉移
為了確定EV介導的ELNAT1是否促進體外淋巴管生成,作者用HLECs孵育BCa細胞分泌的EVs的檢測管形成和遷移。研究發(fā)現,干擾ELNAT1基因會破壞UM-UC-3和T24細胞分泌EVs誘導HLECs管形成和遷移的能力(Figure3A-C),這些結果表明EVs介導的ELNAT1誘導了體外淋巴管生成。為
以上數據提示,miR-934異常高表達與結直腸***進展及肝轉移***相關。生存分析顯示,與miR-934表達較低的患者相比,miR-934表達較高的患者總生存期(OS)和無病生存期(DFS)較低(Fig.1f,g)。因此,在CRLM患者中,miR-934高表達與CRLM進展和預后不良呈正相關。
2、miR-934存在于CRC細胞衍生的外泌體中
miR-934在HCT-8和LoVo的CM中的表達***高于其它細胞(Fig.2a)。隨后,研究發(fā)現HCT-8和LoVo的CM中miR-934的表達***高于細胞核和細胞質(Fig.2b,c)。并且,miR-934在CM中的表達不隨RNaseA的處理而改變,而隨RNaseA+TritonX-100的處理***下降(Fig.2d),這表明細胞外的miR-934被膜包裹,而不是直接分泌。因此,推測miR-934可能是被外泌體傳輸。電鏡和納米顆粒追蹤分析表明,miR-934表達水平較高的CRC細胞分泌的外泌體比miR-934表達水平較低的CRC細胞分泌的外泌體更多(Fig.2e,f)。各組外泌體標志物CD9,ALIX,TSG101均被WB檢測到(Fig.2g)。為了闡明miR-934是否主要來源于CRC細胞的外泌體,使用GW4869抑制CRC細胞的外泌體分泌,發(fā)現miR-934在CRC細胞來源的外泌體中的表達水平明顯高于外泌體耗盡的CRC細胞(Fig.2h)。
Pex衍生的CD44v6/C1QBP復合物介導了Pex對肝纖維化和PDAC肝轉移的積極作用。
從各組小鼠中分離出外周血CD4+T細胞,結果顯示miR-208b-OE組中PDCD4的***下調,miR-208-KD組的結果則相反(圖7E和7F)。然而,在PDCD4mRNA水平上沒有觀察到差異(圖7G)。從血清中分離出外泌體,檢測miR-208b水平(圖7H)。如預期的,miR-208b在miR-208b-OE組中***升高,而miR-208b-KD組中miR-208b水平下降(圖7I)。這些結果表明,**分泌的miR-208b在體內可以充分地傳遞到CD4+T細胞中,抑制PDCD4的表達。此外,這種現象在奧沙利鉑***組更加***(miR-208b-OE+OXA和miR-208b-KD+OXA)。致力于醫(yī)學相關領域的實驗技術服務和相關生物醫(yī)學課題的研究。蛋白組學課題推薦咨詢
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關聯研究已將血液來源的microRNA(miRNA)的改變與結直腸*(CRC)聯系起來。miRNA譜可能在CRC進展過程中多樣化,并在血液中反映CRC進展水平。但是,尚無研究評估不同CRC階段血液中miRNA的變化。本研究對來自不同階段的健康供體、結直腸腺瘤、結直腸憩室炎和CRC患者(UICCstagesI/II,III,andIV)的80份血液樣本中的2,549種miRNA的譜進行了基于微陣列的比較。
接下來通過RT-PCR進行確認,并對另外 36 份血液樣本中miRNA進行驗證。與健康對照相比,有 179 個 CRC 相關 miRNA 的豐度差異。只有三個(miR-1225-5p、miR-1207-5p 和 miR-4459)在所有 CRC 階段表現出增加的水平。
對3個miRNA進行通路分析,發(fā)現了miRNAs 以各種方式對幾種**相關通路起作用。
這項研究為改進 CRC 篩查的生物標志物發(fā)現提供了線索,是***項提供 CRC 血液表達譜的研究,******評估了不同 CRC不同階段血液中 miRNA 的變化。 這也為其他疾病biomarker的研究提供了新的思路。 西藏課題動物模型構建
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1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術支持,探討科研前沿熱點研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關研究
4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗