巨噬細(xì)胞在 AP 恢復(fù)不同階段的不同作用
鑒于 AP 恢復(fù)過程中巨噬細(xì)胞的表型變化,接下來試圖通過用脂質(zhì)體***巨噬細(xì)胞來檢查巨噬細(xì)胞在不同修復(fù)/再生階段的作用。首先,我們在急性炎癥反應(yīng)后(從第 1 天到第 2 天)立即消耗了胰腺巨噬細(xì)胞,并在第 3 天檢查了胰腺。如圖所示,第 3 天之前巨噬細(xì)胞的消耗可以在很大程度上減少導(dǎo)管樣結(jié)構(gòu),這表明巨噬細(xì)胞在ADM的形成。AP 損傷后第 3天巨噬細(xì)胞的消耗顯著延遲了胰腺修復(fù)。Ki67 +細(xì)胞在第3天達(dá)到峰值,并隨著胰腺恢復(fù)逐漸下降。與組織學(xué)結(jié)果一致,發(fā)現(xiàn)CN處理組的Ki67 +細(xì)胞從第 5 天到第 7 天大幅下降,但在 CL 處理組中沒有,表明 CL 處理小鼠的修復(fù)過程受損。 IGF-1信號在Pex誘導(dǎo)的肝纖維化中起重要作用。單細(xì)胞相關(guān)課題課題細(xì)胞實(shí)驗(yàn)
二、npm1突變AML患者聚集的分子基礎(chǔ)
CDH2是鈣粘蛋白家族的一員,被認(rèn)為是決定干細(xì)胞命運(yùn)的調(diào)節(jié)因子15。類似地,G蛋白偶聯(lián)受體12(GPR12)在原始亞型中上調(diào),已知在干細(xì)胞維持和**干細(xì)胞的體細(xì)胞重編程中發(fā)揮作用。MyoD家族抑制劑(MDFI)在原始亞型中表達(dá)增加,據(jù)報道它是WNT信號通路的調(diào)節(jié)因子,只在造血干細(xì)胞祖細(xì)胞中表達(dá)。鋅指蛋白521(ZNF521)是一種轉(zhuǎn)錄因子,其在人類白血病細(xì)胞系中被敲低可以減少增殖但在原始亞型中卻有***的高表達(dá)。CD163是一種免疫調(diào)節(jié)劑,是巨噬細(xì)胞清清體受體家族的成員,已知在單核細(xì)胞系的AML細(xì)胞中表達(dá)。在committedcluster中其他基因的高表達(dá)包括免疫相關(guān)基因,如C1QA,CD14和MARCO。msl1基因,一種已知的白血病干細(xì)胞增殖抑制因子,也在committedcluster中高表達(dá)。我們通過qPCR驗(yàn)證了關(guān)鍵基因的差異表達(dá)(圖2B)。使用基因**富集分析(GSEA),在committed亞型中,免疫反應(yīng)通路如干擾素-γ介導(dǎo)的信號通路、GPCR信號通路和toll樣受體(TLR)信號通路上調(diào)(圖2C,D,SupplementaryFigs.16,18,與FLT3-ITD和DNMT3A突變的弱相關(guān)性一致。 蛋白組學(xué)課題技術(shù)指導(dǎo)生命科學(xué)領(lǐng)域內(nèi)的精細(xì)研究。
五、阻斷atm依賴的磷酸化會損害DNA損傷后PTEN的亞細(xì)胞再分配
研究了磷脂酰肌醇3,4,5磷酸(PIP3)在DNA損傷后的細(xì)胞定位。將MCF10A細(xì)胞按上述方法同步輻照,免疫熒光法分析PTEN的亞細(xì)胞分布。PTEN-WT和PTEN-398A蛋白在細(xì)胞核和質(zhì)膜穩(wěn)定定位(圖6A, B)。經(jīng)過IR處理后,PTEN-WT在質(zhì)膜上積累(圖6A, B)。相比之下,在這些條件下,沒有檢測到PTEN-398A蛋白的重新定位(圖6A, B)。B).我們通過細(xì)胞分離和膜相關(guān)PTEN的免疫印跡分析進(jìn)一步證實(shí)了這些結(jié)果(圖6C, D)。這些結(jié)果表明,ATM對PTEN的磷酸化導(dǎo)致PTEN在質(zhì)膜上重新分布,這與AKT通路***減少有關(guān)
**調(diào)節(jié)因子通常作為蛋白質(zhì)復(fù)合物中的亞基存在,并以多種方式參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控,例如通過調(diào)節(jié)組蛋白修飾和染色質(zhì)結(jié)構(gòu)。哺乳動物BRG1-或brm相關(guān)的染色質(zhì)重塑復(fù)合物(BAF, SWI/SNF)改變了*細(xì)胞染色質(zhì)可及性景觀。該復(fù)合物是細(xì)胞周期和增殖的關(guān)鍵調(diào)控因子,也是前列腺*的驅(qū)動因子,具有多種**特異性作用。此外,頻繁發(fā)生的TMPRSS2-ERG融合基因易位可使BAF復(fù)合物重新靶向于染色質(zhì),促進(jìn)前列腺*的發(fā)生?;コ獾腁TPase亞基BRG1 (SMARCA4)和BRM (SMARCA2)是復(fù)雜功能的關(guān)鍵組件。此外,AR與DNA序列特異性轉(zhuǎn)錄因子(如FOXA1、GATA2、ERG和HOXB13)之間的合作已經(jīng)建立。TF FOXA1可以結(jié)合到封閉的染色質(zhì)區(qū)域,調(diào)節(jié)其染色質(zhì)可及性,從而促進(jìn)AR結(jié)合染色質(zhì)引發(fā)PCa。高通量測序后續(xù)的機(jī)制實(shí)驗(yàn)。
2021年,來自加拿大多倫多大學(xué)和加拿大溫哥華英屬哥倫比亞大學(xué)等團(tuán)隊(duì)合作在Nature communication雜志上發(fā)表了文章“Biological and therapeutic implications of a unique subtype of NPM1 mutated AML.”。此報道描述了npm1突變AML患者的分子異質(zhì)性?;趓na-seq的基因表達(dá)譜分析,確定了兩種新亞型,稱為原始型和committed型?;诨虮磉_(dá)、表觀基因組(ATAC-seq)和免疫表型(CyToF)的差異,在**的AML隊(duì)列中將亞型與特定的分子特征、疾病分化狀態(tài)和患者生存聯(lián)系起來。此外,表明了在缺乏FLT3-ITD的原始特征病例的***中添加激酶抑制劑對AML可能有***益處。課題外包服務(wù)找英拜放心安心。甘肅課題推薦咨詢
TRF測序課題整體服務(wù)。單細(xì)胞相關(guān)課題課題細(xì)胞實(shí)驗(yàn)
在體外,上調(diào)UCP1減少AKI期間的脂質(zhì)積累可通過AMPK/ULK1途徑促進(jìn)自噬
自噬已被證實(shí)在AKI中發(fā)揮重要作用。因此,自噬已經(jīng)成為我們關(guān)注的重要途徑之一。在通過慢病毒轉(zhuǎn)染過表達(dá)UCP1或UCP1激動劑CL316243的AKI細(xì)胞模型中,自噬相關(guān)指標(biāo)顯示AMPK/ULK1/自噬通路******(圖7A-B)。電子顯微鏡圖像也顯示,上調(diào)UCP1消除AKI中的脂質(zhì)積累后,細(xì)胞自噬得到促進(jìn)(圖7C)?;谶@些發(fā)現(xiàn),為了驗(yàn)證自噬在UCP1功能中的重要性,我們進(jìn)行了功能恢復(fù)實(shí)驗(yàn)。如圖7D-F所示,氯喹抑制自噬***逆轉(zhuǎn)了順鉑組UCP1引起的炎癥指標(biāo)下降。同樣,TUNEL染色顯示,使用氯喹抑制自噬,可以明顯逆轉(zhuǎn)UCP1促進(jìn)的凋亡抑制作用(圖7G)。這些結(jié)果表明,脂質(zhì)積累通過作用于AKI細(xì)胞自噬,在調(diào)節(jié)細(xì)胞功能方面發(fā)揮著重要作用。 單細(xì)胞相關(guān)課題課題細(xì)胞實(shí)驗(yàn)
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7.實(shí)時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證,過表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)