還檢測到β-肌動蛋白***升高,與免疫沉淀的HuR蛋白結合。接下來研究HuR-β-actin介導的調節(jié)機制是否參與OPC的遷移調節(jié)。β-actin的mRNA和蛋白表達以及細胞遷移能力在HuR基因過表達的細胞中***增加, HuR基因敲低細胞中降低。β-肌動蛋白的mRNA和蛋白表達在lnc-PMIF過表達細胞中***下調,但在lnc-PMIF基因敲除細胞中***上調,表明lnc-PMIF能抑制OPCs中β-actin的表達,基因過表達/敲除lnc-PMIF不改變HuR的蛋白表達。在前述lnc-PMIF敲低細胞中敲低HuR基因,細胞中β-actin的mRNA和蛋白表達***下調,細胞遷移能力也受到損害,這些數據表明lnc-PMIF可與HuR相互作用,抑制β-actin的表達來抑制OPC遷移。英拜生物對整體實驗實施的全局把控。過表達課題
5)DRD2通過阻斷TAK1的磷酸化來限制NF-κB信號的***NF-κB信號的***
對于觸發(fā)炎癥小體組裝和隨后的焦亡是必不可少的。IF染色顯示DRD2幾乎阻斷了p-p65的核易位(圖5A),但這種抑制被Mφ所抵消(圖5B)。核和細胞質提取物也顯示DRD2抑制了p-p65的核易位(圖5C)。如WB結果所示,在LPS刺激下,DRD2抑制IKKα/β、IκBα和p65的磷酸化(圖5D)。異位DRD2表達也***抑制了Mφ誘導的p65磷酸化和IKKα/β的上游***(圖5E)。WB結果顯示DRD2下調NF-κB的下游靶點ICAM-1。然而,這種下調被Mφ所抵消(圖5E)。抑制IKKα/β磷酸化提示DRD2負向介導IKK復合物上游。TAK1在催化IKKα和IKKβ中起關鍵作用。TAK1的磷酸化被異位DRD2表達***抑制(圖5D-E)。因此,DRD2通過阻斷上游激酶TAK1來抑制NF-κB信號通路的***。 醫(yī)學科研服務英拜生物致力于分子生物行業(yè)十余年。
表達MCF-10A腺泡的Myc-INPP4BWT而不是Myc-INPP4BC842A(PI(3,4)P24-磷酸酶死亡)的腺泡(補充圖2k)顯示增殖細胞的百分比明顯高于病媒控制的腺泡(1.5倍)(圖2i,j)。在第7天,腺泡的大小沒有明顯變化(圖2k)。第14天,Myc-INPP4BWT而不是MycINPP4BC842A表達MCF-10A的細胞形成了更大的腺泡(1.8倍),每個腺泡的細胞數量比載體對照增加了1.4倍(圖2ln)。過表達INPP4B促進MCF-10A細胞增殖,但不影響細胞的尖基底極性和細胞凋亡。與此一致的是,過表達Myc-INPP4BWT而不是Myc-INPP4BC842A在血清剝奪后的單層培養(yǎng)中增強了MCF-10A細胞的增殖(1.7倍)(圖2o,p)。
總之,這一數據與INPP4B以PI(3,4)P2-磷酸酶依賴的方式促進pik3a突變體ER+乳腺*和pik3a野生型乳腺上皮細胞增殖的解釋相一致。
利用高通量RNA-seq和m6A-seq鑒定WTAP靶基因
為了進一步驗證WTAP介導的m6A甲基化對DLBCL細胞的影響,對對照組和WTAP缺失的SU-DHL-8細胞進行m6A測序(m6A-seq)。結果發(fā)現,一致motifDRACH在免疫純化的RNA中富集(圖5A),m6A位點主要存在于外顯子和3’-UTR中,且m6A位點在終止密碼子附近富集程度比較高(圖5B),并通過篩選差異表達基因中出現的m6A低甲基化峰,鑒定出136個基因(圖5C)。HK2基因有助于**高糖酵解率,同時DLBCL在缺氧脅迫下促進生長需要HK2。GSEA分析表明,WTAP的潛在靶基因與缺氧信號***相關(圖5D),提示HK2是DLBCL中WTAP的關鍵靶基因。m6A-seq數據顯示,WTAP靶向HK2轉錄本的5’-UTR,WTAP的敲除導致5’-UTR的m6A水平***下降(圖5E)。***作者為了驗證HK2是否是WTAP靶基因,通過構建熒光素酶報告載體和CRISPR/CAS9敲除實驗,證明了HK2是WTAP在DLBCL中的直接下游靶點(圖5F,5G,5H,5I,5J)。 將 CTD 暴露與 CTD 解剖學相結合使環(huán)境健康科學家能夠調查暴露研究和組織和系統(tǒng)暴露化學應激誘導表型的細節(jié)。
4.Caspase-11缺失抑制MCD誘導的肝臟炎癥
接下來,我們評估了Caspase-11缺乏對MCD誘導炎癥的影響。首先,我們比較了野生型和Caspase-11缺陷小鼠肝臟白細胞浸潤情況。在正常情況下,野生型小鼠和caspase-11缺陷小鼠肝臟中CD45細胞的比例相似(圖4A和B)。MCD***導致野生型小鼠肝臟中CD45細胞的比例增加。相比之下,MCD****輕微增加了Caspase11缺陷小鼠肝臟中CD45細胞的比例。與MCD處理的野生型小鼠相比,MCD處理的Caspase-11缺陷小鼠肝臟中CD45細胞的比例明顯下降(圖4A和B),表明MCD處理后Caspase-11缺陷導致肝臟中白細胞浸潤減少。相應地,我們發(fā)現了MCD***促進肝臟F4/80的表達而Caspase-11缺乏則抑制MCD誘導的F4/80上調(圖4C)。我們進一步發(fā)現MCD***誘導野生型小鼠肝臟中TNF-α(圖4D)、IL-1β(圖4E)和CCL2(圖4F)的表達。相比之下,與MCD處理的野生型小鼠相比,MCD處理的Caspase-11缺陷小鼠肝臟中TNF-α(圖4D)、IL-1β(圖4E)和CCL2(圖4F)蛋白水平***降低。這些結果表明Caspase-11缺陷抑制了MCD誘導的肝臟炎癥。 了解客戶的研究方向以及所能提供的樣本類型和樣本量確定研究思路。細胞功能課題整包服務
外泌體CD44v6和C1QBP可能是預測PDAC患者預后的有前途的生物標志物。過表達課題
公共比較毒理基因組學數據庫(CTD,/)是一個創(chuàng)新的數字生態(tài)系統(tǒng),它將化學品、基因、表型、疾病和暴露的毒理學信息聯(lián)系起來,以促進對人類健康的了解。整合了基于文獻、人工策劃的交互,以創(chuàng)建一個知識庫,協(xié)調跨物種異質數據的化學暴露及其生物影響。在這兩年一次的更新中,報告CTD的含量增加了20%,現在提供了4500萬個毒性基因組關系,涉及600個比較物種的16300多種化學品、51300個基因、5500種表型、7200種疾病和163000次暴露事件。此外,通過CTD疾病頁面上的新數據選項卡(幫助填補環(huán)境健康方面的知識空白)和新的表型搜索參數(用于批量查詢和維恩分析工具),增加了化學表型內容的功能。此外,還介紹了新的CTD解剖學頁面,允許用戶從解剖學角度獨特地探索和分析化學-表型相互作用。 過表達課題
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術支持,探討科研前沿熱點研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關研究
4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗