再次從老年和年輕小鼠中分離BMSCs，Dil染色劑標(biāo)記后體外增殖，脛骨內(nèi)注射到另一批年輕小鼠中，三天后收獲脛骨對成骨標(biāo)志物Runx2進(jìn)行熒光免疫染色。發(fā)現(xiàn)老年BMSCs處理的小鼠中Dil標(biāo)記細(xì)胞降低，表明老化過程中OPCs向骨形成表面的遷移能力降低。大部分遷移到骨形成表面的Dil標(biāo)記細(xì)胞表達(dá)Runx2，表明OPCs遷移到骨形成表面發(fā)生成骨分化，有助于體內(nèi)骨形成。與年輕BMSCs相比，老年BMSCs的體外遷移能力明顯受損，Macf1***下調(diào)，從Macf1基因位點轉(zhuǎn)錄而來的長鏈非編碼RNA PMIF（即lnc-PMIF）表達(dá)***增高。上述提示，衰老過程中小鼠骨形成的減少伴隨著OPCs向骨形成表面遷移的減少和OPCs中l(wèi)nc-PMIF表達(dá)的升高。阻斷atm依賴的磷酸化會損害DNA損傷后PTEN的亞細(xì)胞再分配。醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)實驗課題產(chǎn)學(xué)研合作
我們檢測到LPS處理的野生型小鼠原代肝細(xì)胞中Gsdmd-N明顯增加。相比之下，LPS處理不影響Caspase-11缺陷小鼠原代肝細(xì)胞的Gsdmd-N水平，且Gsdmd-N水平***低于野生型小鼠原代肝細(xì)胞。此外，LPS誘導(dǎo)野生型原代肝細(xì)胞中IL-1β(圖6E)、ALT(圖6F)和AST(圖6G)的表達(dá)。相反，在Caspase11缺陷的原發(fā)性肝細(xì)胞中，LPS誘導(dǎo)的IL-1β(圖6E)、ALT(圖6F)和AST(圖6G)的產(chǎn)生***減少。綜上所述，Caspase-11的缺失抑制了LPS誘導(dǎo)的Caspase-11和GSDMD的體外***。模型建造高通量測序的后續(xù)成文服務(wù)。
四、HSCT前通過腸道微生物組成預(yù)測急性GvHD 嚴(yán)重性
基于機器學(xué)習(xí)，hsct前腸道微生物群組成預(yù)測aGvHD嚴(yán)重程度。A.在0級aGvHD患者中，12個**豐富的家族隨著時間的推移在腸道中的相對豐度。B.svmLinear模型識別出的前20個預(yù)測腸道ASV的重要性圖，其重要性得分表明，如果將各自的ASV排除在模型之外，預(yù)測精度會平均下降。**終的交叉驗證svmLinear模型從腸ASVspreHSCT的豐度中預(yù)測了aGvHD(0IvsIIIV)，準(zhǔn)確率為86%(95%CI:65-97%)。通過Boruta特征選擇確認(rèn)的asv用星號表示。
進(jìn)一步使用E8聚類分析顯示，這些暴露于慢性d-flow的ec向免疫細(xì)胞樣類型(EndICLT)轉(zhuǎn)變，但沒有達(dá)到完全分化的免疫細(xì)胞狀態(tài)(圖3C和S3)。圖3D顯示了EC簇中EndMT、Tagln、Acta2、Cnn1和Snai1的四個標(biāo)記物，分別**了s流(E2)、急性d流(E6)和慢性d流(E8)染色質(zhì)可及性的變化。與s-流(E2)和急性d-流(E6)相比，慢性d-流在E8的啟動子區(qū)域(箭頭)增加了這些基因的可及性。從scRNA-seq數(shù)據(jù)的小提琴圖中可以看出，E8中相應(yīng)基因的表達(dá)量增加，進(jìn)一步證實了這一結(jié)果(圖3E)。阻斷atm依賴的磷酸化會損害DNA損傷后PTEN的亞細(xì)胞再分配
藥物篩選確定**類腸道中HIF-2α的合成易損性
作者構(gòu)建Apc缺失型（Cdx2-ERT2Cre；Apcfl/fl）和CRCHIF-2α過表達(dá)小鼠模型（Cdx2-ERT2Cre；Apcfl/flHIF-2αLSL/LSL），從這2個小鼠模型中分離腸類藥物，并用化療藥物培養(yǎng)，生長被監(jiān)測了5天。在Cdx2-ERT2Cre;在Apcfl/flHIF-2αLSL/LSL小鼠中，他莫昔芬可誘導(dǎo)HIF-2α，并特異性地破壞結(jié)腸上皮細(xì)胞中的Apc。來自Cdx2-ERT2Cre；Apcfl/fl**腸系膜的小鼠對doxorubicin,mitoxantrone,irinotecan,以及eribulin等藥物高度敏感，與來自Cdx2-ERT2Cre；Apcfl/flHIF2αLSL/LSL的不同。RSL3、sorafenib索拉菲尼、erastin和DMF被認(rèn)為是***的小分子，可以***降低Cdx2-ERT2Cre；Apcfl/flHIF2αLSL/LSL**腸道類物質(zhì)的生長。Erastin和RSL3是經(jīng)典的ferroptosis***劑，分別抑制xCT(由Slc7a11基因編碼，是xC系統(tǒng)的一個組成部分)和GPX4。DMF一種細(xì)胞可滲透的線粒體衍生物，在一些**細(xì)胞系中具有細(xì)胞毒性這些結(jié)果表明，HIF-2α表達(dá)的**可以被氧化應(yīng)激***劑選擇性靶向。 ***ATM對PTEN的磷酸化增加了DNA損傷后AKT和p27Kip1的***。武漢課題課題設(shè)計
高通量測序后續(xù)的機制實驗。醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)實驗課題產(chǎn)學(xué)研合作
特殊的Sno-lncRNA
在2012年由上海生化所陳玲玲課題組率先鑒定出來,Sno-lncRNA是一類新型的長非編碼RNA，它們的序列中包含完整的snoRNA序列，并且該序列對sno-lncRNA的穩(wěn)定性和亞細(xì)胞定位至關(guān)重要,研究表明sno-lncRNA長非編碼RNASLERT通過松弛DDX21的環(huán)形結(jié)構(gòu)，從而促進(jìn)PolI轉(zhuǎn)錄rRNA的重要作用[14]。
snoRNAs與**發(fā)***展
snoRNAs參與的**的分子病理學(xué)，在早年的研究中在非小細(xì)胞肺*中多種snoRNAs呈現(xiàn)出不同的表達(dá)狀態(tài)[15]。snoRNAsU502bp純合缺失突變與前列腺*的發(fā)***展有關(guān)[16]并且在乳腺*中U50具有雜合缺失以及轉(zhuǎn)錄下調(diào)的特點[11]。通過基因組芯片技術(shù)檢測到SNORD33,SNORD66,SNORD73B,SNORD76,SNORD78,andSNORA42六種snoRNAs在非小細(xì)胞肺*(NSCLC)是表達(dá)上調(diào)的他們通常位于肺*的頻繁擴(kuò)增的基因組區(qū)域[17]。snoRNAs與**的關(guān)系也能夠延伸到與它們相互作用的蛋白分子上。Fibrillarin是發(fā)育必須的，缺失Fibrillarin能夠?qū)е屡咛ブ滤馈Ｔ谌橄?的研究中當(dāng)高水平的Fibrillarin干擾應(yīng)激***p53，snoRNA通路被抑制時，**抑制因子p53可以作為snoRNP擾動的前哨，***其介導(dǎo)生長抑制作用[18]。Dyskerin、NOP10以及Nhp2p的突變與上皮*有關(guān)[19]。 醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)實驗課題產(chǎn)學(xué)研合作
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實驗平臺，提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進(jìn)度，保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性，為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請：提供標(biāo)書課題設(shè)計、撰寫，標(biāo)書部分基礎(chǔ)實驗的開展，設(shè)計的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c，中標(biāo)率很高。
3.提供熱點**文獻(xiàn)技術(shù)支持，探討科研前沿?zé)狳c研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測序：轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實驗