使用測量細(xì)胞一致性的活細(xì)胞成像作為細(xì)胞生長和擴散的代理,來測試SMARCA4消耗的影響是否轉(zhuǎn)化為VCaP細(xì)胞生長的改變。如圖5所示,在沒有雄***的情況下,SMARCA4刪除并不影響細(xì)胞的生長,而在有雄***的情況下,它降低了細(xì)胞的相對融合,盡管程度低于去除AR。SMARCA4刪除同樣會降低LNCaP細(xì)胞的相對融合。
四、SIM2沉默改變了arb亞群的染色質(zhì)可及性
SIM2沉默降低了2434個arb染色質(zhì)可及性,三分之二受siSIM2影響的arb在雄***暴露前可及(圖6a c中可獲得),而其余在雄***暴露后可及(圖6a c中重新獲得)。根據(jù)ChIP-SICAP數(shù)據(jù),siim2受影響的位點中**富集的motif是ARE,盡管其在這些位點的富集程度低于未受siim2影響的位點(NC位點,圖6d)。AR、FOXA1、ERG和HOXB13在sisim2影響的位點的標(biāo)簽密度與NC位點相比均呈上升趨勢(圖6e),表明SIM2是一種與AR協(xié)同的TF。 soRNA測序的 整套服務(wù)。lncRNA課題檢測服務(wù)
創(chuàng)傷性腦損傷(TBI)是重要的健康問題,每年有超過5000萬新發(fā)TBI病例。在TBI的病理生理過程中,會發(fā)生各種形式的細(xì)胞死亡,包括細(xì)胞凋亡,壞死,程序性壞死,自噬,焦亡和鐵死亡。目前尚未充分挖掘TBI中鐵死亡的發(fā)病機理。***我們講一篇蘇州大學(xué)團隊在JOURNALOFPINEALRESEARCH(IF=)期刊發(fā)表的題名為DeletionofferritinHinneuronscounteractstheprotectiveeffectofmelatoninagainsttraumaticbraininjury-inducedferroptosis的文獻(xiàn)。該文獻(xiàn)主要講述褪黑素通過FTH調(diào)節(jié)TBI中鐵死亡。褪黑素可減輕TBI引起的鐵死亡為了確定褪黑素是否可以挽救TBI引起的鐵死亡,在相應(yīng)的高峰表達(dá)(例如1天和3天)進行了與鐵死亡相關(guān)蛋白的蛋白質(zhì)印跡分析。發(fā)現(xiàn)褪黑素給藥在TBI后1天***了TBI誘導(dǎo)的xCT,Cox2,Tfr1,F(xiàn)pn和Nox2蛋白表達(dá)的上調(diào)。同樣,褪黑素***在TBI后3天阻止了Fth,F(xiàn)tl和4HNE蛋白的表達(dá)。用促鐵蛋白抑制劑liproxstatin-1(Lip-1)也獲得了相似的結(jié)果。此外,免疫組化染色顯示,與對照組相比在TBI后第7天,褪黑素和Lip-1的處理減少了神經(jīng)元中4HNE陽性細(xì)胞的數(shù)量,表明褪黑素對TBI誘導(dǎo)的脂質(zhì)具有神經(jīng)保護作用過氧化。褪黑素和Lip-1均***TBI誘導(dǎo)的皮質(zhì)GSH水平降低。 帕金森小鼠模型課題產(chǎn)學(xué)研合作高表達(dá)的外泌體CD44v6和C1QBP是預(yù)測PDAC患者預(yù)后和肝轉(zhuǎn)移的很有前途的生物標(biāo)志物。
這可能部分解釋了第3天巨噬細(xì)胞的增加。此外,流式細(xì)胞術(shù)數(shù)據(jù)顯示M2樣巨噬細(xì)胞(CD206+IL4RA+)的百分比在第1天(急性炎癥期)下降并從第3天開始增加(ADM階段),而這些M2樣巨噬細(xì)胞的數(shù)量在第3天達(dá)到峰值,然后迅速減少。此外,流式細(xì)胞術(shù)數(shù)據(jù)與免疫熒光分析一致,其中F4/80+CD206+細(xì)胞在第3天**豐富。
接下來,我們想知道這些CCR2+單核細(xì)胞/巨噬細(xì)胞是否可以在胰腺損傷后重新編程為M2樣巨噬細(xì)胞。在植入和誘導(dǎo)AP8周后,我們發(fā)現(xiàn)第3天的增殖巨噬細(xì)胞(Ki67+)主要來自CCR2WT小鼠。與來自CCR2KO小鼠的巨噬細(xì)胞相比,來自CCR2WT小鼠的巨噬細(xì)胞表現(xiàn)出更高的CD206和IL4RA表達(dá)水平。綜上所述,結(jié)果表明,ADM階段的M2樣巨噬細(xì)胞主要來源于CCR2+單核細(xì)胞/巨噬細(xì)胞,這些細(xì)胞在AP早期募集。
2)circPDE4B調(diào)節(jié)軟骨細(xì)胞活力和ECM代謝
為了評估circPDE4B在ECM代謝中的作用,我們分別用三種circPDE4BsiRNA轉(zhuǎn)染HCs(圖2A)。我們使用CCK-8方法評估了circPDE4B對軟骨細(xì)胞活力的影響。結(jié)果顯示,敲低circPDE4B的表達(dá)降低了軟骨細(xì)胞的活力(圖2B)。此外,shRNA腺病毒抑制circPDE4B***提高了MMP3、MMP13和ADAMTS4的表達(dá),而SOX9、COL2A1(或COL2蛋白)和aggrecan在HCs/MCs中的表達(dá)下調(diào)(圖2C和圖2D)。免疫熒光進一步證實,circPDE4B敲除影響了HCs/MCs的MMP3、MMP13、COL2和aggrecan水平(圖2E、F)。同時,HCs的阿爾新藍(lán)染色顯示,circPDE4B抑制導(dǎo)致軟骨細(xì)胞功能障礙,蛋白多糖藍(lán)染較少(圖2G)。然后通過CCK-8實驗(圖2H)發(fā)現(xiàn),過表達(dá)circPDE4B增加了軟骨細(xì)胞的活力。在過表達(dá)circPDE4B-HCs中,MMP3、MMP13和ADAMTS4的mRNA和蛋白水平下調(diào),SOX9、COL2A1(或COL2蛋白)和aggrecan的mRNA和蛋白水平上調(diào)(圖2I-L)。此外,HCs的阿爾新藍(lán)染色表明,與單獨IL-1β***相比,circPDE4B過表達(dá)和IL-1β共處理減少了軟骨破壞(圖2M)。這些數(shù)據(jù)表明,circPDE4B/circPde4b在HCs中可以促進細(xì)胞活力,抑制分解代謝作用。 提供生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域內(nèi)的課題思路設(shè)計。
1、循環(huán)miR-208b是CRC中FOLFOX化療敏感性的一種很有前途的生物標(biāo)志物如圖1所示,作者設(shè)計了一項多期研究,以確定新的血清miRNAs作為預(yù)測和監(jiān)測奧沙利鉑聯(lián)合亞葉酸和5-FU(FOLFOX)化療反應(yīng)的替代標(biāo)志物。
作者檢測了69個化療敏感和47個化療不敏感患者的血漿中miR-208b表達(dá),結(jié)果顯示與未響應(yīng)組相比,miR-208b的表達(dá)水平在響應(yīng)組***下調(diào)(圖2A-B)。同時檢測了血清*胚抗原(CEA)水平,血清miR-208b的曲線下面積(AUC)與血清CEA的AUC相比,優(yōu)于血清CEA水平。在化療響應(yīng)組,在化療前miR-208b的表達(dá)高于化療后,而在未響應(yīng)組,化療前低于化療后水平(圖2C)。生存分析顯示,無進展生存期化療響應(yīng)組***高于未響應(yīng)組,miR-208b低表達(dá)組***高于高表達(dá)組(圖2D)。這些結(jié)果表明miR-208b可作為預(yù)測CRC中FOLFOX化療敏感性的非侵襲性標(biāo)志物。 提供分子生物以及到后續(xù)動物建模的一整套服務(wù)。課題整包課題
英拜生物對整體實驗實施的全局把控。lncRNA課題檢測服務(wù)
以上數(shù)據(jù)提示,miR-934異常高表達(dá)與結(jié)直腸***進展及肝轉(zhuǎn)移***相關(guān)。生存分析顯示,與miR-934表達(dá)較低的患者相比,miR-934表達(dá)較高的患者總生存期(OS)和無病生存期(DFS)較低(Fig.1f,g)。因此,在CRLM患者中,miR-934高表達(dá)與CRLM進展和預(yù)后不良呈正相關(guān)。
2、miR-934存在于CRC細(xì)胞衍生的外泌體中
miR-934在HCT-8和LoVo的CM中的表達(dá)***高于其它細(xì)胞(Fig.2a)。隨后,研究發(fā)現(xiàn)HCT-8和LoVo的CM中miR-934的表達(dá)***高于細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)(Fig.2b,c)。并且,miR-934在CM中的表達(dá)不隨RNaseA的處理而改變,而隨RNaseA+TritonX-100的處理***下降(Fig.2d),這表明細(xì)胞外的miR-934被膜包裹,而不是直接分泌。因此,推測miR-934可能是被外泌體傳輸。電鏡和納米顆粒追蹤分析表明,miR-934表達(dá)水平較高的CRC細(xì)胞分泌的外泌體比miR-934表達(dá)水平較低的CRC細(xì)胞分泌的外泌體更多(Fig.2e,f)。各組外泌體標(biāo)志物CD9,ALIX,TSG101均被WB檢測到(Fig.2g)。 lncRNA課題檢測服務(wù)
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實驗平臺,提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請:提供標(biāo)書課題設(shè)計、撰寫,標(biāo)書部分基礎(chǔ)實驗的開展,設(shè)計的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c,中標(biāo)率很高。
3.提供熱點**文獻(xiàn)技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究
4.二代測序:轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實驗