一、PBMC單核、單細(xì)胞ATAC序列優(yōu)化 A.snATAC、scATAC和ICICLE-seq方法的主要步驟概要。ficoll純化的PBMCs和白細(xì)胞分離純化的PBMCs之間的一個(gè)主要區(qū)別是ficoll純化樣品中存在殘留的中性粒細(xì)胞。我們使用熒光***細(xì)胞分選(FACS)從高中性粒細(xì)胞含量的PBMC樣本中檢測(cè)去除死細(xì)胞和碎片的方法，包括去除中性粒細(xì)胞和不去除中性粒細(xì)胞。 B.這種單核分析利用低滲裂解、洗滌劑和皂苷的組合來(lái)分離細(xì)胞核，而不保留線粒體DNA。使用這種方法進(jìn)行snATAC-seq，測(cè)序，并將數(shù)據(jù)質(zhì)量指標(biāo)(材料和方法)制成表格后，鑒定了兩個(gè)主要的細(xì)胞條碼群體。細(xì)胞核制備...

OARSI分級(jí)(圖6E)進(jìn)一步提示小鼠SHAM+載體和DMM+circPde4b組軟骨降解較少，而DMM+載體和DMM+circPde4b+RIC8A組軟骨降解情況相反。熱板試驗(yàn)、膝關(guān)節(jié)伸展試驗(yàn)和電擊刺激跑步機(jī)試驗(yàn)顯示，DMM+載體組和DMM+circPde4b+RIC8A組的不適和膝關(guān)節(jié)疼痛多于SHAM+載體組和DMM+circPde4b組(圖6F)。小鼠膝關(guān)節(jié)的三維微CT重建顯示，DMM+NC組和DMM+circPde4b+RIC8A組比SHAM+載體和DMM+circPde4b組有更多的骨贅(圖6G)。此外，四組中RIC8A和p-p38標(biāo)記的免疫組化染色顯示過(guò)表達(dá)circPde4b下...

越來(lái)越多的證據(jù)表明**相關(guān)巨噬細(xì)胞（TAMs）和外泌體在轉(zhuǎn)移前niche（生態(tài)位）形成中發(fā)揮重要作用。TAMs是轉(zhuǎn)移前生態(tài)位形成和結(jié)直腸*肝轉(zhuǎn)移(CRLM)的基礎(chǔ)。然而，**來(lái)源的外泌體miRNAs與TAMs相互作用的分子機(jī)制仍然很大程度上未知。本研究發(fā)現(xiàn)**來(lái)源外泌體miR-934可以誘導(dǎo)巨噬細(xì)胞M2極化，進(jìn)而促進(jìn)CRC的肝轉(zhuǎn)移。該文于2020年11月發(fā)表在《Journal of Hematology and Oncology》IF：11.059期刊上。 總之，如Fig. 9，CRC來(lái)源的外泌體miR-934可通過(guò)下調(diào)PTEN表達(dá)和***PI3K/AKT信號(hào)通路...

接著，我們利用NMR進(jìn)一步研究了FTO和SsD之間的相互作用，在滴定過(guò)程中觀察到信號(hào)的劑量依賴(lài)性衰減(圖3E)。這些結(jié)果表明，F(xiàn)TO干擾了SsD的狀態(tài)。接下來(lái)，我們使用LC-MS/MS定量分析了細(xì)胞對(duì)SsD的攝取(圖3F)。在NB4和Kas-1細(xì)胞中，SsD在0.05-0.14 nmol/百萬(wàn)細(xì)胞中檢測(cè)到。HPLC顯示SsD對(duì)體外FTO去甲基化的抑制活性(圖3G)。此外，在無(wú)細(xì)胞系統(tǒng)中，斑點(diǎn)印跡試驗(yàn)證實(shí)了SsD介導(dǎo)的FTO活性競(jìng)爭(zhēng)性抑制(圖3H)。綜上所述， FTO是SsD的直接靶點(diǎn)，可能是SsD誘導(dǎo)的白血病細(xì)胞生長(zhǎng)抑制作用的主要介質(zhì)。英拜生物致力于分子生物行業(yè)十余年。RNA甲基化課題一站式 ...

六、改進(jìn)分選策略以分離胚胎HSCs/MPPs 研究者基于細(xì)胞表面標(biāo)記設(shè)計(jì)了一種針對(duì)HSCs / MPP的新的熒光***細(xì)胞分選策略（簡(jiǎn)稱(chēng)CD-REF），使用CD-REF分選板對(duì)股骨BM細(xì)胞進(jìn)行分選，結(jié)果顯示標(biāo)記為HSCs / MPP和HSCs / MPPs-Cycle簇的CD-REF細(xì)胞約占88％。為了評(píng)估CD-REF細(xì)胞譜系輸出的分化潛力和穩(wěn)健性，研究人員在小鼠MS5飼養(yǎng)層或更具生理相關(guān)性的人類(lèi)胎兒間充質(zhì)干細(xì)胞（fMSCs）上對(duì)三個(gè)胎兒的單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行了分選，結(jié)果顯示MS5和fMSCs上分別存在著四系、三系、雙系、單系和未分化的譜系集落。接下來(lái)，又對(duì)單個(gè)CD-REF和免疫表型HSCs...

為了完全理解HoxBlinc過(guò)表達(dá)調(diào)控HSPC造血轉(zhuǎn)錄程序的機(jī)制，進(jìn)行了ChIRP-seq在WT和HoxBlincTg Lin - c-Kit+細(xì)胞中繪制基因組HoxBlinc結(jié)合位點(diǎn)。HoxBlinc的過(guò)表達(dá)***增加了其與HoxB前基因啟動(dòng)子區(qū)域和其他反式靶點(diǎn)的結(jié)合，如Stat1、Cdr2、Wnt5a、Runx1和后HoxA基因（圖5d）。Lin-c-Kit+細(xì)胞基因組中HoxBlinc結(jié)合位點(diǎn)的整體分布表明，HoxBlinc主要與非編碼區(qū)相互作用，包括基因間區(qū)、內(nèi)含子和啟動(dòng)子。值得強(qiáng)調(diào)的是，HoxBlinc的過(guò)表達(dá)***增加了其與啟動(dòng)子和UTR的占用（圖5e）。整合來(lái)自WT和HoxBli...

五、敲除核孔蛋白來(lái)挽救核孔蛋白的表達(dá)導(dǎo)致果蠅的運(yùn)動(dòng)功能障礙和壽命縮短 Nup62、Nup214、Nup43在運(yùn)動(dòng)神經(jīng)元中過(guò)表達(dá)***降低了運(yùn)動(dòng)功能和攀爬速度(圖5A和B)。與各自的Nup對(duì)照或?qū)φ战M動(dòng)物相比，過(guò)表達(dá)Nup62和Nup214或Nup62和Nup43的動(dòng)物的壽命明顯縮短——Nup62/ Nup214 OE和Nup62/Nup43 OE的中位存活時(shí)間分別為23天和21天(圖5C)。用RNAi成蟲(chóng)(Nup62或Nup214)多次暴露于創(chuàng)傷后，檢測(cè)其運(yùn)動(dòng)功能和壽命。Nup62 mRNA (p <0.01)和Nup214 mRNA (p <0.001)與對(duì)照組相比，N...

4）miR-337-3p/miR-137在子宮內(nèi)膜*組織中表達(dá)較低，miR-337-3p/miR-137是MIR210HG的靶點(diǎn) qPCR結(jié)果顯示，**組織中miR-337-3p和miR-137的表達(dá)明顯下調(diào)(圖4A)。此外，采用Pearson等級(jí)相關(guān)法分析miR-337-3p、miR-137與MIR210HG表達(dá)的相關(guān)性(圖4B)。隨后，我們分析了HMGA2與miR-337-3p/137表達(dá)的關(guān)系(圖4C)。我們進(jìn)行了熒光素酶實(shí)驗(yàn)，以確定MIR210HG是否可以直接靶向miR-337-3p和miR-137在預(yù)測(cè)的結(jié)合位點(diǎn)(圖4D)。為了確定MIR210HG是否與miRNA核糖**白...

5.沉默lnc-PMIF促進(jìn)老年OPCs向骨形成表面遷移，促進(jìn)老年小鼠骨形成 BMSCs中沉默lnc-PMIF，增殖無(wú)變化，OPCs成骨能力不改變，細(xì)胞遷移數(shù)量高，表明沉默lnc-PMIF可增強(qiáng)老年OPCs的遷移能力，而不干擾老年OPCs的體外增殖和成骨分化。接受si-PMIF處理的老年BMSCs的小鼠中骨形成表面Dil+細(xì)胞數(shù)***升高，提示沉默lnc-PMIF可促進(jìn)老年OPCs在體內(nèi)向骨形成表面遷移，大部分遷移的Dil+細(xì)胞中檢測(cè)到Runx2表達(dá)，表明si-PMIF處理的老年BMSCs遷移到骨形成表面發(fā)生正常的成骨分化，這將有助于小鼠的骨形成。接受si-PMIF處理的老年BMSC...

此外，GFP-INPP4B的表達(dá)在基礎(chǔ)和wnt刺激條件下降低了GSK3β蛋白水平，與GSK3β的增強(qiáng)破壞一致(圖6d)。通過(guò)HrsshRNA消耗抑制晚期核內(nèi)體形成后，降低的GSK3β蛋白水平得以恢復(fù)(圖6f,g)。GFP-INPP4B而不是gfp載體細(xì)胞表現(xiàn)出明顯的GSK3β蛋白酶保護(hù)，這與GSK3β向晚期核內(nèi)體轉(zhuǎn)運(yùn)的增強(qiáng)相一致(圖6h)。免疫熒光證實(shí)了這一點(diǎn)，在GFP-INPP4B中觀察到RFP-GSK3與LysoTracker共定位，這是一種積累在晚期核內(nèi)體/溶酶體中的染料，而不是gfp載體細(xì)胞(圖6i)。醫(yī)學(xué)整體課題外包服務(wù)。帕金森小鼠模型課題產(chǎn)學(xué)研合作 表觀基因組學(xué) (ChIP-Se...

再次從老年和年輕小鼠中分離BMSCs，Dil染色劑標(biāo)記后體外增殖，脛骨內(nèi)注射到另一批年輕小鼠中，三天后收獲脛骨對(duì)成骨標(biāo)志物Runx2進(jìn)行熒光免疫染色。發(fā)現(xiàn)老年BMSCs處理的小鼠中Dil標(biāo)記細(xì)胞降低，表明老化過(guò)程中OPCs向骨形成表面的遷移能力降低。大部分遷移到骨形成表面的Dil標(biāo)記細(xì)胞表達(dá)Runx2，表明OPCs遷移到骨形成表面發(fā)生成骨分化，有助于體內(nèi)骨形成。與年輕BMSCs相比，老年BMSCs的體外遷移能力明顯受損，Macf1***下調(diào)，從Macf1基因位點(diǎn)轉(zhuǎn)錄而來(lái)的長(zhǎng)鏈非編碼RNA PMIF（即lnc-PMIF）表達(dá)***增高。上述提示，衰老過(guò)程中小鼠骨形成的減少伴隨著OPCs向骨形成表...

轉(zhuǎn)座酶染色質(zhì)可及性單核測(cè)序(snATAC-seq)也是一種單細(xì)胞表觀遺傳組測(cè)序技術(shù)。單細(xì)胞核測(cè)序，能夠獲得組織的細(xì)胞圖譜，解決細(xì)胞異質(zhì)性的問(wèn)題。單細(xì)胞或細(xì)胞核RNA測(cè)序(scRNA-seq或snRNAseq)促進(jìn)了對(duì)定義腎臟細(xì)胞特性的基因和途徑的更深入的理解。成熟的人類(lèi)和小鼠腎臟的多個(gè)scRNAseq圖譜已經(jīng)確定了轉(zhuǎn)錄如何有助于細(xì)胞類(lèi)型的特異性。**近的方法已經(jīng)將這種方法擴(kuò)展到單細(xì)胞染色質(zhì)可及性分析。單核染色質(zhì)轉(zhuǎn)置可及性測(cè)序試驗(yàn)(snATACseq)是ATAC-seq的擴(kuò)展，該試劑盒利用Tn5轉(zhuǎn)置酶在數(shù)千個(gè)單個(gè)細(xì)胞中測(cè)量染色質(zhì)可及性。Pex調(diào)節(jié)HSC的ECM分泌。高通量測(cè)序課題 1）circ...

轉(zhuǎn)錄組學(xué) (RNA-Seq) 模塊 RNA-seq 模塊對(duì)與衰老相關(guān)的全基因組轉(zhuǎn)錄組變化進(jìn)行編目。RNA-seq 模塊中收集的數(shù)據(jù)集來(lái)自與衰老研究相關(guān)的已發(fā)表文章。該模塊收集在特定基因干預(yù)（過(guò)表達(dá)、敲除等）時(shí)觀察到的轉(zhuǎn)錄組變化，該模塊還收集特定組織和***在生理和病理衰老過(guò)程中基因表達(dá)譜的變化。RNA-seq 模塊目前包含 > 18 000 個(gè)可能與衰老有關(guān)的差異表達(dá)基因 (DEG)。在 RNA-seq 模塊中，可以通過(guò)基因名稱(chēng)輕松搜索 DEG，并且每個(gè) DEG 條目都包含潛在的實(shí)驗(yàn)條件和基因表達(dá)的倍數(shù)變化及其發(fā)布的來(lái)源?？梢韵螺d每篇文章中的所有搜索結(jié)果和相應(yīng)的DEG數(shù)據(jù)庫(kù)。 生命科...

大約 1% 的人類(lèi)基因組能夠折疊成 G 四鏈體 (G quadruplexes，G4s)——在富含 G 的基序上形成的非經(jīng)典鏈特異性 DNA 結(jié)構(gòu)。G4 的熱穩(wěn)定性不同，這可能會(huì)影響它們的功能。然而，G4s 也可能阻礙復(fù)制、轉(zhuǎn)錄和翻譯，并可能增加基因組的不穩(wěn)定性和突變率。因此，根據(jù)其基因組位置、熱穩(wěn)定性和功能性，G4 基因座可能會(huì)在不同的選擇壓力下進(jìn)化，而這一點(diǎn)從未被研究過(guò)。 一、基因組中G4基因座的密度不均勻 與全基因組平均值相比，CpG島、上游區(qū)域和轉(zhuǎn)錄鏈的G4密度的倍數(shù)差異特別**別為12.3、4.98和4.11。相比之下，內(nèi)含子的非轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)錄鏈、非轉(zhuǎn)錄外顯子鏈和3'UT...

MIR210HG與子宮內(nèi)膜*患者的低生存率相關(guān)為了識(shí)別子宮內(nèi)膜*組中異常表達(dá)的lncRNA，我們分析了來(lái)自TCGA的數(shù)據(jù)。表達(dá)陣列分析顯示332個(gè)lncRNA的表達(dá)差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。7個(gè)lncRNA表達(dá)上調(diào)(圖1A和1B)。然后，我們分析了GEO數(shù)據(jù)集，發(fā)現(xiàn)在子宮內(nèi)膜*GSE17025隊(duì)列中MIR210HG的表達(dá)也上調(diào)(圖1C)。qPCR顯示MIR210HG在子宮內(nèi)膜*中的表達(dá)明顯高于正常子宮內(nèi)膜組織(圖1D)。此外，我們分析了MIR210HG的表達(dá)與子宮內(nèi)膜*患者臨床病理參數(shù)的關(guān)系，發(fā)現(xiàn)MIR210HG在從I、II期到III、IV期的進(jìn)展過(guò)程中增加。MIR210HG的表達(dá)與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移***相...

還檢測(cè)到β-肌動(dòng)蛋白***升高，與免疫沉淀的HuR蛋白結(jié)合。接下來(lái)研究HuR-β-actin介導(dǎo)的調(diào)節(jié)機(jī)制是否參與OPC的遷移調(diào)節(jié)。β-actin的mRNA和蛋白表達(dá)以及細(xì)胞遷移能力在HuR基因過(guò)表達(dá)的細(xì)胞中***增加， HuR基因敲低細(xì)胞中降低。β-肌動(dòng)蛋白的mRNA和蛋白表達(dá)在lnc-PMIF過(guò)表達(dá)細(xì)胞中***下調(diào)，但在lnc-PMIF基因敲除細(xì)胞中***上調(diào)，表明lnc-PMIF能抑制OPCs中β-actin的表達(dá)，基因過(guò)表達(dá)/敲除lnc-PMIF不改變HuR的蛋白表達(dá)。在前述lnc-PMIF敲低細(xì)胞中敲低HuR基因，細(xì)胞中β-actin的mRNA和蛋白表達(dá)***下調(diào)，細(xì)胞遷移能力也受到...

然后利用SCENIC通過(guò)分化軌跡識(shí)別出HSPCs和成熟血細(xì)胞中162個(gè)調(diào)節(jié)子，其中HLF和HOXA9是HSCs/MPPs中的主要調(diào)節(jié)子，且HSC/MPPs簇在轉(zhuǎn)錄上為高度未成熟的細(xì)胞群(圖2D)。鑒定了一個(gè)增殖的MEMPs- cycle群體，92%的MEMPs處于G2M/S期，而65%的MEMPs處于G2M/S期(圖2E)。此外，研究者對(duì)HSCs/MPPs- cycle和HSCs/MPPs進(jìn)行DE分析，結(jié)果顯示HSCs/MPPs- cycle增加了糖酵解相關(guān)基因的表達(dá)，除了HSCs/MPPS-Cycle簇中存在轉(zhuǎn)錄啟動(dòng)外，HSCs/MPPs和HSCs/MPPs-Cycle之間沒(méi)有其它轉(zhuǎn)錄差異。...

三、pten-s38a突變誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡抵抗 為了進(jìn)一步了解阻斷atm依賴(lài)的PTEN磷酸化如何影響細(xì)胞對(duì)基因毒性損傷的反應(yīng)，我們使用抗體陣列評(píng)估了表達(dá)PTEN-wt或PTEN-398a的MCF10A細(xì)胞裂解液的應(yīng)激反應(yīng)和凋亡通路的活性。Pten+/+和Pten398A/398AMEF培養(yǎng)，表達(dá)Pten-wt的MCF10A細(xì)胞與表達(dá)Pten-398A的MCF10A細(xì)胞在正常培養(yǎng)條件下的生長(zhǎng)速率均無(wú)差異(圖3A和補(bǔ)充圖5C)。對(duì)細(xì)胞進(jìn)行不同的基因毒性脅迫處理:IR、順鉑和柔紅霉素。在所有條件下，Pten398A/398AMEFs和PTEN-398A表達(dá)的MCF10A細(xì)胞對(duì)基因毒性脅迫的抗性...

為了進(jìn)一步研究MAO-A是否作為巨噬細(xì)胞自主因子直接調(diào)控TAM極化從而影響抗**免疫，進(jìn)行了巨噬細(xì)胞過(guò)繼轉(zhuǎn)移**實(shí)驗(yàn)。從Maoa WT和KO小鼠中獲取BM細(xì)胞，然后培養(yǎng)成骨髓源性巨噬細(xì)胞(bone marrow macrophages, BMDMs)。然后將這些Maoa WT或KO BMDMs與B16-OVA黑色素瘤細(xì)胞混合，皮下注射到BoyJ WT受體小鼠中建立實(shí)體**（圖2g）。在本實(shí)驗(yàn)中，MAO-A缺乏的比較***于TAM細(xì)胞。在接受Maoa KO BMDMs小鼠中觀察到**生長(zhǎng)抑制（圖2h-i），TAM免疫抑制markers下調(diào)（圖2j），免疫刺激markers上調(diào)（圖2k-l），以及...

CD8+T細(xì)胞是**重要的**適應(yīng)性免疫調(diào)節(jié)細(xì)胞，通過(guò)直接殺死*細(xì)胞來(lái)介導(dǎo)抗**免疫。PD-1抑制***CD8+T細(xì)胞以增加T細(xì)胞***，從而導(dǎo)致**消退。因此，CD8+T細(xì)胞的***可能是通過(guò)免疫療法***LSCC的關(guān)鍵。這篇文章以生信分析開(kāi)篇，篩選出關(guān)鍵基因后在動(dòng)物模型與臨床樣本中進(jìn)行了簡(jiǎn)單的驗(yàn)證。實(shí)驗(yàn)思路如下： 1.下載GEO數(shù)據(jù)并進(jìn)行數(shù)據(jù)篩選下載數(shù)據(jù)集GSE17710，選擇變異系數(shù)＞0.1的5000個(gè)基因進(jìn)行后續(xù)WGCNA分析2.CIBERSORT分析免疫浸潤(rùn)分析獲得每個(gè)樣本中22種免疫細(xì)胞的豐度，選擇T細(xì)胞作為WGCNA分析的性狀**（其中，T細(xì)胞包括7中亞型）3.WGCN...

3.YTHDC2抑制LUAD的胱氨酸攝取和下游抗氧化程序 為了研究YTHDC2對(duì)代謝物的影響，作者對(duì)YTHDC2低表達(dá)和高表達(dá)的LUAD標(biāo)本(分別稱(chēng)為YTHDC2low和YTHDC2high)進(jìn)行代謝組學(xué)分析(n=20/組)。如圖3A顯示，GSH代謝在KEGG通路中排名前20。在***改變的代謝產(chǎn)物中，與YTHDC2high的**相比，YTHDC2low的**中胱氨酸含量增加了3.975倍(圖3B)。此外，在cohort#1(n=100)中，YTHDC2和胞內(nèi)胱氨酸呈負(fù)相關(guān)(圖3C)。這些數(shù)據(jù)表明YTHDC2減少了細(xì)胞內(nèi)的胱氨酸。 提供整體課題外包實(shí)驗(yàn)構(gòu)思。褪黑素課題一站式為了確定C...

染色質(zhì)可及性是驅(qū)動(dòng)腎元發(fā)育的動(dòng)態(tài)過(guò)程，而腎元祖細(xì)胞具有不同的染色質(zhì)可及性譜，且隨其分化而變化。染色質(zhì)可及性在促進(jìn)或抑制腎臟修復(fù)和再生中的作用對(duì)于設(shè)計(jì)急性和慢性腎臟疾病的治療方案具有重要意義，并可能有助于改善腎臟類(lèi)***的定向分化。scRNA-seq和snATAC-seq在成年小鼠腎臟中的聯(lián)合分析為理解染色質(zhì)可及性如何調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄提供了一個(gè)框架。然而，人類(lèi)腎臟的單細(xì)胞表觀基因組還沒(méi)有被描述。 生物信息學(xué)工具可以從snATAC-seq數(shù)據(jù)集中提取出scRNA-seq無(wú)法獲取的***信息。預(yù)測(cè)細(xì)胞類(lèi)型特異性順式調(diào)控DNA相互作用和轉(zhuǎn)錄因子活性是補(bǔ)充scRNA-seq獲得的轉(zhuǎn)錄信息的兩種方法。長(zhǎng)...

6）FPN蛋白在肺*細(xì)胞中的穩(wěn)定性需要USP35 USP35屬于DUBs家族，在控制各種蛋白質(zhì)的Ub依賴(lài)性降解中起關(guān)鍵作用。此外，F(xiàn)PN泛素化和隨后的內(nèi)吞作用導(dǎo)致鐵超載和鐵死亡。因此，我們研究了USP35是否通過(guò)影響其蛋白質(zhì)穩(wěn)定性來(lái)調(diào)節(jié)FPN表達(dá)。如圖8A所示，USP35敲除增加，而USP35過(guò)表達(dá)降低泛素化FPN水平。用MG132蛋白酶體抑制劑***后，shUSP35***細(xì)胞的全部或膜裂解物中FPN水平的降低被阻止(圖8B)。隨后，我們檢查了USP35是否是FPN的直接結(jié)合伙伴。IP分析的數(shù)據(jù)揭示了內(nèi)源性USP35和FPN之間的聯(lián)系(圖8C)?？傊@些數(shù)據(jù)表明USP35可以直接...

6.水蘇糖減輕DHEA誘導(dǎo)的多囊卵巢綜合征大鼠卵巢功能障礙 為了確定水蘇糖是否參與了Tempol對(duì)PCOS大鼠的有益作用，DHEA處理的大鼠給予200mg/kg水蘇糖12天。水蘇糖給藥對(duì)體重沒(méi)有明顯影響(圖8A)，但改善了PCOS大鼠的動(dòng)情周期紊亂(圖8B)。H&E染色表明，水蘇糖可減少卵巢囊泡數(shù)量，增加黃體形成(圖8C-E)。水蘇糖還可***降低PCOS大鼠血清睪酮水平的升高(圖8F)。上述結(jié)果提示水蘇糖確實(shí)改善了PCOS大鼠卵巢功能障礙，改善了卵巢組織病理?yè)p傷。 綜上所述，Tempol通過(guò)降低腸道氧化應(yīng)激、恢復(fù)腸道失調(diào)、調(diào)節(jié)腸道微生物和宿主代謝產(chǎn)物之間的相互作用來(lái)保護(hù)DHE...

胰管腺*(PDAC)有明顯的肝轉(zhuǎn)移傾向。促*分泌體通過(guò)外泌體傳遞和運(yùn)輸是轉(zhuǎn)移前微環(huán)境形成和轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵。2021年4月發(fā)表于Gut（IF=19.819）的文章“Exosome-delivered CD44v6/C1QBP complex drives pancreatic cancer liver metastasis by promoting fibrotic liver microenvironment”對(duì)此進(jìn)行了探究。本研究旨在探討PDAC來(lái)源的外泌體(Pex)調(diào)控肝臟微環(huán)境、促進(jìn)轉(zhuǎn)移的潛在機(jī)制。Pex衍生的CD44v6/C1QBP復(fù)合物對(duì)于肝纖維化微環(huán)境和PDAC肝轉(zhuǎn)移的形成是必不可少的...

一、YTHDF1在胃*中的過(guò)表達(dá) 通過(guò)評(píng)估YTHDF1突變的分布，我們發(fā)現(xiàn)65%的突變是基因擴(kuò)增，這通常會(huì)導(dǎo)致基因產(chǎn)物的過(guò)表達(dá)(圖1A).通過(guò)對(duì)TCGA數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)YTHDF1在胃*患者中的表達(dá)確實(shí)明顯高于正常組織(圖1B)。YTHDF1的高表達(dá)與胃*進(jìn)展(圖1C)和較差的總生存期(圖1D)相關(guān)。對(duì)正常胃組織和胃*標(biāo)本進(jìn)行免疫組化分析，證實(shí)**組織中YTHDF1蛋白表達(dá)上調(diào)(圖1F)。此外，YTHDF1在胃*患者中的異常高表達(dá)與更嚴(yán)重的臨床病理特征(如神經(jīng)周?chē)址?、侵襲性**分期(III/IV期vs.I/II期)、靜脈侵犯等***相關(guān)(圖1G）。KaplanMeier生存分析...

SIM2是否也影響AR與染色質(zhì)的結(jié)合，我們?cè)赟IM2沉默后進(jìn)行AR ChIP-seq。如圖7所示，受體與大多數(shù)arb的結(jié)合沒(méi)有改變。然而,SIM2沉默影響2265 ARBs藥物通過(guò)降低和增加染色質(zhì)占用大約相同數(shù)量的地點(diǎn)(圖7 a、b)。當(dāng)反映這些siSIM2-affected染色質(zhì)易訪問(wèn)性的變化,有趣的是,減少可訪問(wèn)性是在690年siSIM2-DN ARBs藥物(圖7 c、e、f),而在siSIM2-UP arb中，染色質(zhì)可及性的變化不明顯(圖7c)。其余的(1744)siSIM2位點(diǎn)在AR結(jié)合方面沒(méi)有變化。大多數(shù)由SIM2沉默改變的arb并不與FOXA1缺失改變的arb重疊，這得到了基元分析...

系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SLE)患者大多數(shù)存在I型IFN刺激基因(ISGs)的高表達(dá)。線粒體異常也有報(bào)道，但I(xiàn)型IFN暴露對(duì)這些變化的貢獻(xiàn)尚不清楚。此外，I型IFN通過(guò)上調(diào)脂肪酸氧化(FAO)和氧化磷酸化(OXPHOS)促進(jìn)漿細(xì)胞樣樹(shù)突狀細(xì)胞（pDCs）的線粒體功能。本文數(shù)據(jù)表明，I型IFN暴露通過(guò)代謝重編程促進(jìn)CD8 + T細(xì)胞死亡，有助于SLE發(fā)病。本文于2021年3月發(fā)表在《Nature Communications》IF:12.121。 1、ISGs高表達(dá)患者OXPHOS基因下調(diào) 為了確定是否T細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組特征可以幫助鑒定SLE患者的疾病活動(dòng)，作者對(duì)來(lái)源于***和未***女性的...

3、MAO-A促進(jìn)巨噬細(xì)胞免疫抑制極化 為了研究MAO-A對(duì)巨噬細(xì)胞極化的調(diào)控，體外培養(yǎng)MaoaWT和KOBMDMs，并通過(guò)添加***刺激（IL4和IL-13）使這些巨噬細(xì)胞向免疫抑制表型極化（圖3a）。觀察到，在M-CSF誘導(dǎo)的巨噬細(xì)胞分化過(guò)程中，MaoamRNA的表達(dá)在Maoa野生型BMDMs中有明顯的誘導(dǎo)作用，Maoa在成熟的BMDMs中表達(dá)趨于穩(wěn)定，并維持IL-4/IL-13誘導(dǎo)的免疫抑制極化（圖3b-c）。MaoaKOBMDMs中MAO-A表達(dá)未檢測(cè)到，證實(shí)了其MAO-A缺失基因型（圖3b,d）。與野生型巨噬細(xì)胞相比，在IL-4/IL-13刺激下，MaoaKO巨噬細(xì)胞表現(xiàn)出...

因?yàn)镃XCL13是一種趨化劑，可以促進(jìn)表達(dá)CXCR5的細(xì)胞趨化，使用IHC染色評(píng)估其在CRC中的表達(dá)，結(jié)果顯示CXCR-5在結(jié)直腸*組織中的染色強(qiáng)于正常組織，說(shuō)明M2極化巨噬細(xì)胞分泌的CXCL13主要作用于CRC細(xì)胞（Fig. 7d）。PMA預(yù)處理后的THP-1細(xì)胞轉(zhuǎn)染miR-934 mimics，并與加入anti-CXCL13抗體或IgG的SW480細(xì)胞或RKO細(xì)胞共培養(yǎng)。此外，上述TPH-1細(xì)胞液與敲除CXCR5的細(xì)胞共培養(yǎng)。體外transwell實(shí)驗(yàn)顯示，在與miR-934過(guò)表達(dá)PMA處理的THP-1細(xì)胞的CM共培養(yǎng)組中，anti-CXCL13抗體抑制了CRC細(xì)胞的遷移和侵襲；轉(zhuǎn)染了sh...