SIM2是否也影響AR與染色質(zhì)的結(jié)合，我們?cè)赟IM2沉默后進(jìn)行AR ChIP-seq。如圖7所示，受體與大多數(shù)arb的結(jié)合沒(méi)有改變。然而,SIM2沉默影響2265 ARBs藥物通過(guò)降低和增加染色質(zhì)占用大約相同數(shù)量的地點(diǎn)(圖7 a、b)。當(dāng)反映這些siSIM2-affected染色質(zhì)易訪(fǎng)問(wèn)性的變化,有趣的是,減少可訪(fǎng)問(wèn)性是在690年siSIM2-DN ARBs藥物(圖7 c、e、f),而在siSIM2-UP arb中，染色質(zhì)可及性的變化不明顯(圖7c)。其余的(1744)siSIM2位點(diǎn)在A(yíng)R結(jié)合方面沒(méi)有變化。大多數(shù)由SIM2沉默改變的arb并不與FOXA1缺失改變的arb重疊，這得到了基元分析的支持，表明FOXA1基元在siSIM2-DN arb上的富集少于在A(yíng)R結(jié)合沒(méi)有變化的位點(diǎn)上的富集(圖7d）。高通量分子實(shí)驗(yàn)的后續(xù)標(biāo)書(shū)申請(qǐng)指導(dǎo)服務(wù)。推廣課題售后服務(wù)
此外，westernblot檢測(cè)表明，敲除CD44v6或使用抗CD44v6抗體的Pex強(qiáng)烈減弱了Pex誘導(dǎo)的IGF-1信號(hào)通路的***(圖5D)。同時(shí)，在CD44v6-kdPex或CD44v6抗體的作用下，Pex誘導(dǎo)的HSC活化(圖5E，F(xiàn))、ECM重塑(圖5G)的積極作用***減少。為了闡明CD44v6在Pex誘導(dǎo)的HSC***中的作用，我們進(jìn)一步研究了過(guò)表達(dá)CD44v6在HSC中是否與Pex具有同樣的***HSC的作用。然而，過(guò)表達(dá)CD44v6并沒(méi)有像預(yù)期的那樣提高α-SMA的表達(dá)(圖5H)。這些結(jié)果表明，CD44v6在Pex誘導(dǎo)的HSC***中發(fā)揮了重要作用。服務(wù)課題免費(fèi)設(shè)計(jì)動(dòng)物建模模型實(shí)驗(yàn)的整體服務(wù)。
一、腦損傷改變了果蠅的大腦蛋白質(zhì)組，擾亂了NCT蛋白和Nup蛋白水平
為了研究創(chuàng)傷性腦損傷的機(jī)制，我們使用了一個(gè)具有良好特征的創(chuàng)傷性腦損傷果蠅模型，該模型顯示了強(qiáng)大的表型，如TDP-43同源物(Tbph)、p62、應(yīng)激顆粒和泛素病理，以識(shí)別和研究創(chuàng)傷性腦損傷后大腦蛋白質(zhì)組的變化(圖1A)。對(duì)暴露于重復(fù)TBI的三齡果蠅幼蟲(chóng)大腦中的2000個(gè)蛋白質(zhì)進(jìn)行了無(wú)偏性蛋白質(zhì)組學(xué)分析(w1118)，發(fā)現(xiàn)361個(gè)蛋白質(zhì)在創(chuàng)傷損傷后發(fā)生了***變化(p 0.05，學(xué)生t檢驗(yàn))?；诨虮倔w論(GO)的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)分析在BiNGO (Cytoscape 3)中對(duì)tbi相關(guān)腦蛋白質(zhì)組與非tbi對(duì)照進(jìn)行了關(guān)聯(lián)分析，確定了不同類(lèi)別的改變蛋白，其中大多數(shù)上調(diào)(圖1B和C;圖1圖補(bǔ)充1A-E;補(bǔ)充文件1和3)。TBI后上調(diào)的比較高類(lèi)別是微管細(xì)胞骨架、蛋白質(zhì)折疊和蛋白酶體。
2021年6月，在Oncogene雜志上發(fā)表了文章“Chromatin-directed proteomics-identified network of endogenous androgen receptor in prostate cancer cells..”。此報(bào)道通過(guò)運(yùn)用了一種強(qiáng)大的染色質(zhì)導(dǎo)向蛋白質(zhì)組學(xué)方法，稱(chēng)為ChIP-SICAP，揭示去勢(shì)抗性前列腺*(CRPC)細(xì)胞中內(nèi)源性AR周?chē)旧|(zhì)蛋白網(wǎng)絡(luò)(染色質(zhì)蛋白網(wǎng)絡(luò))的組成。在CRPC細(xì)胞雄***信號(hào)通路的背景下，進(jìn)一步研究了與AR相關(guān)蛋白作用的染色質(zhì)重塑者SMARCA4和SIM2。通過(guò)整合ChIP-seq、RNA-seq、ATAC-seq和功能實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù)，揭示SMARCA4和AR在染色質(zhì)上***共存，SMARCA4缺失影響了一組AR靶基因的染色質(zhì)可及性和表達(dá)，也抑制了CRPC細(xì)胞的生長(zhǎng)，驗(yàn)證了SMARCA4在CRPC細(xì)胞中的功能。雖然SIM2的沉默同樣降低了染色質(zhì)的可及性，但它影響了更多的雄***調(diào)節(jié)基因的表達(dá)。在雞胚絨膜尿囊膜實(shí)驗(yàn)中，SIM2沉默也降低了CRPC細(xì)胞的增殖和**的大小?？傊搜芯胯b定的AR染色體是研究這一重要藥物靶點(diǎn)的重要資源。ATM對(duì)PTEN的磷酸化驅(qū)動(dòng)細(xì)胞周期進(jìn)程。
二、npm1突變AML患者聚集的分子基礎(chǔ)
CDH2是鈣粘蛋白家族的一員，被認(rèn)為是決定干細(xì)胞命運(yùn)的調(diào)節(jié)因子15。類(lèi)似地，G蛋白偶聯(lián)受體12 (GPR12)在原始亞型中上調(diào)，已知在干細(xì)胞維持和**干細(xì)胞的體細(xì)胞重編程中發(fā)揮作用。MyoD家族抑制劑(MDFI)在原始亞型中表達(dá)增加，據(jù)報(bào)道它是WNT信號(hào)通路的調(diào)節(jié)因子，只在造血干細(xì)胞祖細(xì)胞中表達(dá)。鋅指蛋白521 (ZNF521)是一種轉(zhuǎn)錄因子，其在人類(lèi)白血病細(xì)胞系中被敲低可以減少增殖但在原始亞型中卻有***的高表達(dá)。 促*分泌體通過(guò)外泌體傳遞和運(yùn)輸是轉(zhuǎn)移前微環(huán)境形成和轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵。臨床醫(yī)學(xué)課題地區(qū)科學(xué)基金
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隨著全球老齡化人口的逐步增長(zhǎng)，研究和制定健康老齡化戰(zhàn)略的需求變得越來(lái)越重要，并呈現(xiàn)出新的緊迫性。衰老是一個(gè)復(fù)雜的過(guò)程，受遺傳和表觀(guān)遺傳調(diào)控、翻譯后調(diào)控、代謝調(diào)控、宿主-微生物組相互作用、生活方式和許多其他因素的影響。近年來(lái)，高通量組學(xué)技術(shù)（包括基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、表觀(guān)基因組學(xué)、代謝組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、藥物基因組學(xué)和宏基因組學(xué)）已廣泛應(yīng)用于衰老研究，從而對(duì)衰老相關(guān)的分子變化進(jìn)行大規(guī)模分析。因此，與衰老相關(guān)的有價(jià)值的數(shù)據(jù)量越來(lái)越大，需要一個(gè)開(kāi)放和集成的數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)支持新的衰老研究領(lǐng)域。推廣課題售后服務(wù)
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5.芯片：信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀(guān)遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過(guò)表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)