細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶4和6(CDK4/6)的藥理學(xué)抑制劑是***受體陽性乳腺*的獲批***藥物，目前正在其他**類型的數(shù)百項(xiàng)臨床試驗(yàn)中進(jìn)行評(píng)價(jià)。這些抑制劑的臨床成功在很大程度上歸因于定義明確的**內(nèi)在細(xì)胞抑制機(jī)制，而其作為免疫調(diào)節(jié)劑的新作用知之甚少。本研究利用整合的表觀基因組、轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)分析，證明了CDK4/6抑制劑在促進(jìn)免疫T細(xì)胞記憶的表型和功能獲得中的新作用。本文的機(jī)制見解拓寬了CDK4/6抑制劑作為增強(qiáng)抗**T細(xì)胞免疫的臨床工具的前瞻性效用。本研究于2021年5月14日發(fā)表在《Cancer Discovery》IF:29.497期刊上。評(píng)估了丙酸丁酸和異丁酸的含量是否與運(yùn)動(dòng)恢...

6、MiR-199a-5p改善MRL/lpr小鼠疾病 接下來，在體內(nèi)評(píng)估了miR-199a-5p對(duì)MRL/lpr小鼠的影響。17周齡MRL/lpr小鼠每4天注射20nmolmiR-199a-5pagomir或?qū)φ?agomirnc)，共4周(圖6A)。末次注射后48h處死小鼠，分離脾臟CD4+T細(xì)胞。與對(duì)照組相比，miR-199a-5pagomir處理組顯示miR-199a-5p水平升高(圖6B)，Sirt1表達(dá)降低(圖6C)，衰老標(biāo)志物p21和p16的表達(dá)***上調(diào)(圖6D)。這些數(shù)據(jù)表明hUC-MSCs通過miR-199a-5p增加MRL/lpr脾CD4+T細(xì)胞衰老。 接下...

2021年6月，***一篇發(fā)表在Curr Biol（IF=9.601）的文章（The RAS GTPase RIT1 compromises mitotic fidelity through spindle assembly checkpoint suppression.）從共生功能體視點(diǎn)的角度對(duì)29名接受同種異體造血干細(xì)胞移植的兒童的腸道、口腔和鼻腔微生物群進(jìn)行了綜合宿主微生物群分析。***揭示了RIT1直接與SAC**組件MAD2和p31conmet相互作用；CDK1在有絲分裂過程中磷酸化RIT1并抑制其與SAC的相互作用；RIT1是細(xì)胞有絲分裂及時(shí)進(jìn)展所必需的；RIT1致病水平促進(jìn)染色體...

有趣的是，研究報(bào)道S100A4可以增強(qiáng)STAT3的磷酸化，而STAT3的磷酸化與OPN的表達(dá)是相關(guān)的，并且STAT3被預(yù)測(cè)是OPN的潛在轉(zhuǎn)錄因子。因此，檢測(cè)了S100A4敲除和過表達(dá)后OPN表達(dá)，STAT3表達(dá)和STAT3磷酸化，結(jié)果顯示OPN表達(dá)和STAT3磷酸化水平與S100A4的變化趨勢(shì)一致；并且敲除STAT3后HCC細(xì)胞系中OPN表達(dá)和STAT3磷酸化被***抑制（圖5a-c）。這些結(jié)果表明S100A4可以***STAT3磷酸化并增加OPN表達(dá)。 為了進(jìn)一步探究S100A4過表達(dá)外泌體對(duì)STAT3磷酸化和OPN表達(dá)的影響，使用該外泌體預(yù)處理HCC細(xì)胞，結(jié)果顯示它可以***促進(jìn)...

H&E染色顯示oil+ PBS組卵巢在不同發(fā)育階段均出現(xiàn)卵泡和少量新鮮黃體(圖1C)。與對(duì)照組相比，DHEA + PBS組的囊泡數(shù)量較多，黃體數(shù)量較少。另一方面，tempol處理減少了囊泡的數(shù)量，增加了黃體的形成(圖1C-E)。檢測(cè)了血清睪酮、eE2、LH、PRGE、FSH 5種性類固醇***水平。DHEA + PBS組血清睪酮水平明顯高于oil+ PBS組。Tempol***降低PCOS大鼠血清睪酮和eE2水平，但對(duì)血清LH、PRGE、FSH水平無明顯影響(圖1F)。DHEA處理的大鼠血清膽汁酸水平***降低，但這種減弱在DHEA + tempol組消失了(圖1G)。在DHEA + PBS組...

6）MAPK1-109aa通過競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合MEK1來抑制MAPK1的磷酸化 為了研究MAPK1-109aa抑制GC的分子機(jī)制，我們將標(biāo)記的MAPK1-109aa質(zhì)粒轉(zhuǎn)染HEK293T細(xì)胞。在flag標(biāo)記的MAPK1-109aa免疫沉淀復(fù)合物中，潛在的相互作用蛋白被拉下(圖7a)。采用蛋白MS分析對(duì)差異表達(dá)蛋白進(jìn)行鑒定。在被識(shí)別的蛋白質(zhì)列表中，豐度比較高的蛋白質(zhì)是MEK1，表明MEK1是MAPK1-109aa潛在的相互作用蛋白(圖7b，c)。此外，flag標(biāo)記的MAPK1-109aa可以與MEK1相互作用，證實(shí)了MAPK1-109aa與MEK1之間的直接相互作用(圖7d)。免疫熒光染色顯...

3、外泌體S100A4是HCC細(xì)胞轉(zhuǎn)移潛力的關(guān)鍵增強(qiáng)子 為了探究通過HMH-exo增強(qiáng)HCC轉(zhuǎn)移能力的關(guān)鍵，作者對(duì)LMH-exo和HMH-exo進(jìn)行了iTRAQ質(zhì)譜篩選。結(jié)果從HMH-exo中鑒定到116個(gè)***上調(diào)和43***下調(diào)的蛋白質(zhì)；結(jié)果發(fā)現(xiàn)了4個(gè)蛋白家族的聚類：Apo、PSM、EEF/EIF和S100鈣結(jié)合蛋白家族（圖3a-b）。經(jīng)過文獻(xiàn)分析，作者主要關(guān)注了S100鈣結(jié)合蛋白家族，并以其中*****差異表達(dá)的4個(gè)蛋白為主：依次是S100A4，S100A6，S100A10，和S100A11。作者檢測(cè)了這4個(gè)蛋白在5個(gè)HCC細(xì)胞系外泌體中的表達(dá)豐度，結(jié)果發(fā)現(xiàn)依然是S100A4的...

為了進(jìn)一步確定過表達(dá)的Caspase-11是否足以加重MCD誘導(dǎo)的NASH，我們給小鼠使用了Caspase-1抑制劑belnacasan。belnacasan******降低MCD***對(duì)照組小鼠的脂肪變性評(píng)分(圖8H)。相比之下，belnacasan***不影響MCD處理的Caspase-11過表達(dá)小鼠的脂肪變性評(píng)分。同樣，belnacasan處理***降低了MCD處理對(duì)照組小鼠的腫脹評(píng)分(圖8I)、血清ALT(圖8J)、AST(圖8K)和肝臟甘油三酯(圖8L)，而MCD處理過表達(dá)Caspase-11小鼠的這些指標(biāo)沒有明顯影響。綜上所述，過表達(dá)Caspase-11足以促進(jìn)MCD誘導(dǎo)的小鼠...

APCmRNA上的METTL3依賴性m6A上調(diào)抑制APC表達(dá) 為了確定METTL3依賴的m6A調(diào)控對(duì)APC表達(dá)的影響，構(gòu)建了一個(gè)熒光素酶報(bào)告基因，熒光素酶分析顯示，METTL3缺失**增加了WTAPC的熒光素酶活性，而突變的APC提高了熒光素酶活性并使該活性抵抗METTL3缺失的調(diào)節(jié)。相反，METTL3過表達(dá)抑制了WT-APC的熒光素酶活性，但沒有突變的APC。這些結(jié)果表明METTL3介導(dǎo)的m6A水平的APCmRNA上調(diào)抑制了APC的表達(dá)。 與這一發(fā)現(xiàn)一致，METTL3缺失增加了APCmRNA和蛋白質(zhì)表達(dá)（，并且這些增加被KYSE450細(xì)胞中rMETTL3的重組表達(dá)所消除。此外...

MiR-101-3p和MiR-423-5p在體外MB細(xì)胞中作為**抑制因子發(fā)揮作用 我們使用CCK-8分析了miR-101-3p和miR-423-5p對(duì)MB細(xì)胞增殖能力的影響。與對(duì)照組相比，Daoy和D283Med細(xì)胞中miR-101-3p或miR-423-5p的過表達(dá)導(dǎo)致**細(xì)胞增殖率降低。通過CCK-8分析，我們進(jìn)一步評(píng)估了添加來自MB患者血漿的外泌體對(duì)Daoy和D283Med細(xì)胞增殖的影響，結(jié)果表明，兩種細(xì)胞系的**細(xì)胞的增殖能力均受到***抑制。接下來，我們研究了miR-101-3p和miR-423-5p對(duì)細(xì)胞凋亡的影響。與陰性對(duì)照組相比，任一miRNA的過表達(dá)都導(dǎo)致Daoy...

四、TEA-seq轉(zhuǎn)錄本、表位和可及性的三峰測(cè)量 A.隨著從單個(gè)核中同時(shí)捕獲RNA-seq和ATAC-seq的商業(yè)平臺(tái)的發(fā)布，我們推斷通透細(xì)胞可以用于同時(shí)捕獲三個(gè)主要的分子隔間:DNA可以用scATAC-seq捕獲，RNA可以用scRNA-seq捕獲，蛋白質(zhì)表位豐度可以用聚腺苷化抗體條形碼捕獲，我們根據(jù)轉(zhuǎn)錄本、表位表位和可及性將其稱為TEA-seq。經(jīng)過試驗(yàn)和關(guān)鍵步驟的優(yōu)化后，我們能夠在10倍基因組MultiomeATAC+基因表達(dá)平臺(tái)上獲得文庫，該平臺(tái)使用46個(gè)低聚標(biāo)記抗體組合了數(shù)千個(gè)單細(xì)胞的所有三種測(cè)量結(jié)果. B.D.在對(duì)裝入4孔的細(xì)胞進(jìn)行初始數(shù)據(jù)處理后，我們鑒定出2926...

AP損傷后胰腺巨噬細(xì)胞的表型變化A動(dòng)物模型使用雨蛙素誘導(dǎo)，。為了研究AP后的修復(fù)/再生過程，用更高劑量的雨蛙素（100μg/kg，每小時(shí)10次）誘導(dǎo)AP，并在一周內(nèi)的不同時(shí)間點(diǎn)收集胰腺。接受雨蛙素誘導(dǎo)***的AP小鼠在24小時(shí)后顯示出腺泡壞死和白細(xì)胞浸潤(rùn)的組織學(xué)跡象以及血清淀粉酶升高。第3天出現(xiàn)典型的腺泡-導(dǎo)管化生(ADM)結(jié)構(gòu)，第7天左右迅速恢復(fù)正常腺泡。為了檢測(cè)免疫細(xì)胞的比例，分離并分析了AP誘導(dǎo)后的胰腺白細(xì)胞。發(fā)炎的胰腺內(nèi)**豐富的免疫細(xì)胞是巨噬細(xì)胞（CD11b+F4/80+CD11c-）。流式細(xì)胞術(shù)分析的胰腺巨噬細(xì)胞數(shù)量在第1天和第3天顯著增加。根據(jù)F4/80水平，胰腺巨噬細(xì)胞從第1天...

病理上，脊髓損傷(SCI)后血脊髓屏障(BSCB)破裂導(dǎo)致大量周圍巨噬細(xì)胞浸潤(rùn)到損傷區(qū)域，并在新生血管周圍聚集。M1極化的巨噬細(xì)胞在SCI過程中起著至關(guān)重要的作用。***小編給大家介紹于2020年3月發(fā)表在影響因子為9.986的“Redox Biology”上的文章“Exosomal miR-155 from M1-polarized macrophages promotes EndoMT and impairs mitochondrial function via activating NF-κB signaling pathway in vascular endothelial cells...

此外，Ago2 RIP 分析表明 miR-1252-5p、circ_0072083、ALKBH5 和 NANOG 可以在同一復(fù)合物上富集。此外，在U251/TR和U87/TR 細(xì)胞中，通過circ_0072083 沉默，miR-1252-5p 水平明顯增強(qiáng)。miR-1252-5p 過表達(dá)顯著降低了 U251/TR 和 U87/TR 細(xì)胞中的 ALKBH5 和 NANOG 水平。此外，在用 sh-NC + anti-NC、sh-circ_0072083 + anti-NC 或 sh-circ_0072083 + anti-miR-1252-轉(zhuǎn)染的細(xì)胞中研究了 circ_0072083/miR-1...

接著作者為了進(jìn)一步證明YTHDC2與LUAD的關(guān)系，與相鄰的*旁組織相比，在LUAD**中觀察到Y(jié)THDC2 mRNA和蛋白的***下調(diào)(圖1E-G)，組織芯片檢測(cè)(TMA)評(píng)估cohort #1中YTHDC2的表達(dá)，結(jié)果顯示51% (98/192) LUAD患者的YTHDC2表達(dá)下調(diào)(圖1H、I)。值得注意的是，YTHDC2表達(dá)下調(diào)與更大的**直徑和更晚期的分期相關(guān)(圖1J、K)。表明抑制YTHDC2可促進(jìn)LUAD的**進(jìn)展。 2.過表達(dá)YTHDC2抑制細(xì)胞活力和**發(fā)生 為了探索YTHDC2在體內(nèi)的m6A解讀器功能，作者構(gòu)建AAV5表達(dá)系統(tǒng)(KPYWT、KPYΔYTH和對(duì)照...

五、npm1突變的AML亞型可預(yù)測(cè)總生存率 評(píng)估了原始亞型和committed亞型是否與患者總生存期相關(guān)(圖5A;補(bǔ)充圖22)。與committed亞型相比，原始亞型與明顯更差的生存率相關(guān)(Log-rank檢驗(yàn)p=0.002)。為了確定我們的聚類是否超出了已建立的預(yù)測(cè)因素，我們還擬合了一個(gè)多變量Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型，調(diào)整了臨床病理參數(shù)，如性別、白細(xì)胞計(jì)數(shù)、年齡、核型和突變，包括FLT3-itd、FLT3-TKD、DNMT3A、NRAS和KRAS。多變量分析顯示，原始亞型和committed亞型具有***的互補(bǔ)預(yù)后價(jià)值(p-值=0.01，圖5B)。 circNDUFB2通過增強(qiáng)泛素/蛋白...

前，PROTAC-DB包括1662個(gè)PROTAC，202個(gè)彈頭（靶向目標(biāo)蛋白質(zhì)的小分子），65個(gè)E3配體（能夠募集E3連接酶的小分子）和806個(gè)接頭，以及它們的化學(xué)結(jié)構(gòu)，生物學(xué)活性和理化性質(zhì)。除了彈頭和E3配體的生物活性外，PROTAC-DB還提供PROTAC的降解能力，結(jié)合親和力和細(xì)胞活性。 數(shù)據(jù)庫的查詢和瀏覽為了方便對(duì)PROTAC-DB中的數(shù)據(jù)進(jìn)行檢索，作者提供了檢索和瀏覽工具。在檢索工具上，PROTAC-DB可以進(jìn)行基于文本的檢索和基于結(jié)構(gòu)的檢索。基于文本的搜索是在整個(gè)PROTAC-DB中進(jìn)行搜索的一種簡(jiǎn)單方式，只需輸入單個(gè)術(shù)語，如目標(biāo)名稱、化合物名稱或ID。對(duì)于基于結(jié)構(gòu)的搜索...

tiRNA-Gly通過RBM17調(diào)節(jié)增殖或遷移相關(guān)基因的選擇性剪接 由于RBM17是一種參與mRNA選擇性剪接的剪接體蛋白，研究tiRNA-Gly在與RBM17結(jié)合時(shí)是否調(diào)節(jié)下游基因的選擇性剪接將是一項(xiàng)有趣的研究。對(duì)過表達(dá)tiRNA-Gly后的K1細(xì)胞系進(jìn)行RNA測(cè)序，所有的選擇性剪切事件如6A所示，外顯子跳躍（cassette外顯子）占37.67%，A5SSs剪接占6.78%，A3SSs剪接占4.99%，備選***外顯子(AltStart)剪接占18.19%，備選末端外顯子（AltEnd）剪接占18.74%，互斥事件（MEXs）占5.12%，內(nèi)含子保留剪接（IR）占8.51%。外顯...

雄***和雄***受體(AR)是******轉(zhuǎn)錄因子(TF)，是驅(qū)動(dòng)前列腺*(PCa)發(fā)***展的關(guān)鍵因素。因此AR是晚期PCa******的主要分子靶點(diǎn)。雄***剝奪療法，特別是第二代抗雄***和雄***合成抑制劑**初是有效的。然而，由于患者仍然可以從晚期PCa進(jìn)展到致命性去勢(shì)抗性前列腺*(CRPC)，需要新的***靶點(diǎn)和生物標(biāo)志物。靶蛋白的一個(gè)來源可能是ar相關(guān)的染色質(zhì)蛋白。 大多數(shù)目前已知的核受體(NR)相互作用蛋白，包括那些AR，已經(jīng)通過遺傳篩選，如雙雜交系統(tǒng)，免疫共沉淀和基于肽段的體外方法。盡管親和純化-質(zhì)譜耦合(MS)已經(jīng)啟發(fā)了NRs的輔助調(diào)節(jié)器，但它很少在**NRs自...

5）Pex衍生的CD44v6/C1QBP復(fù)合物介導(dǎo)了Pex對(duì)肝纖維化和PDAC肝轉(zhuǎn)移的積極作用 此前，我們發(fā)現(xiàn)IGF-1可以通過誘導(dǎo)補(bǔ)體C1q結(jié)合蛋白(C1QBP)從細(xì)胞質(zhì)轉(zhuǎn)位到膜上，驅(qū)動(dòng)CD44v6/C1QBP復(fù)合物的形成，從而***IGF-1下游通路。因此，我們很想知道C1QBP是否通過CD44v6相互作用參與Pex誘導(dǎo)的HSC活化。我們的結(jié)果表明C1QBP在Pex中的表達(dá)明顯高于Npex(圖6A)。如圖6B所示，C1QBP在Pex孵育的HSCs中表達(dá)高于Npex組。同時(shí)，與Pex處理的細(xì)胞相比，C1QBP-kdPex處理HSCs后C1QBP蛋白水平***降低(圖6B)。與Pex...

IGF2BP結(jié)合區(qū)域包含“ GGAC” N6-甲基腺苷（m6A）**基序。IGF2BPs是m6A結(jié)合蛋白。為了探索circRNA和IGF2BP之間的相互作用是否通過m6A依賴性的方式進(jìn)行調(diào)節(jié)，對(duì)circNDUFB2進(jìn)行了MeRIP，并觀察到circNDUFB2中m6A的顯著富集。敲低METTL3和METTL14顯著降低了circNDUFB2中m6A修飾的水平，并且沒有改變circNDUFB2的水平。METTL3 / 14敲低顯著削弱了circNDUFB2和IGF2BP之間的相互作用。 這些數(shù)據(jù)表明，circNDUFB2以依賴于m6A的方式與三個(gè)IGF2BP物理相互作用。FMT處理可能促進(jìn)了創(chuàng)傷...

在沒有RNA配體的情況下，RIG-I采用一種自動(dòng)抑制的構(gòu)象，CARDs發(fā)出信號(hào)。因此假設(shè)circNDUFB2可能通過促進(jìn)其CARDs釋放***RIG-I。用Co-IP檢測(cè)RIG-I的CARDs（FLAG-CARD）和螺旋酶結(jié)構(gòu)域（HA-ΔCARD）之間的相互作用。結(jié)果表明circNDUFB2抑制了RIG-I的CARDs和螺旋酶結(jié)構(gòu)域之間的相互作用。此外，circNDUFB2增強(qiáng)了CARDs與線粒體抗病毒信號(hào)蛋白（MAVS）的相互作用。這些結(jié)果表明circNDUFB2可能通過破壞CARDs與其解旋酶結(jié)構(gòu)域之間的分子內(nèi)相互作用來***RIG-I，并使RIG-I保持活性，從而***RIG-I-MAV...

CircRNF13直接結(jié)合SUMO2mRNA的3’UTR穩(wěn)定SUMO2 為了探究circRNF13調(diào)節(jié)GLUT1泛素化的機(jī)制，作者進(jìn)行了LC-MS/MS，其中SUMO2引起了作者的注意。SUMO2類泛素化修飾（SUMOylation）是泛素化樣蛋白修飾成員可以調(diào)節(jié)蛋白降解通過泛素化途徑。并且研究表明SUMO2在NOC中是抑制糖酵解的。于是探究circRNF13與SUMO2的結(jié)合關(guān)系。與預(yù)期一致，過表達(dá)circRNF13會(huì)在mRNA和蛋白水平誘導(dǎo)SUMO2的表達(dá)上調(diào)，干擾circRNF13則效果相反。生信分析揭示circRNF13和SUMO2的非編碼區(qū)存在結(jié)合位點(diǎn)。RNApull-do...

三、在體內(nèi)，tbi介導(dǎo)的NCT缺陷和致死率被核輸出抑制劑抑制 為了確定TBI是否會(huì)損害體內(nèi)的核質(zhì)運(yùn)輸，我們?cè)诠夁\(yùn)動(dòng)神經(jīng)元中過表達(dá)了一個(gè)帶有核定位序列(NLS)和核輸出序列(NES)標(biāo)記的GFP蛋白(OK371-gal4)。在表達(dá)nlsnes -GFP的大腦中，GFP信號(hào)分布在細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)中(圖3A)。然而，定量分析顯示，在nls - nes -GFP表達(dá)的vnc暴露于TBI中，核GFP信號(hào)減少的細(xì)胞百分比***增加，而核GFP強(qiáng)度***降低(圖3B和C)，說明GFP核進(jìn)口受到抑制和/或GFP核出口增加。接下來，我們?cè)谶\(yùn)動(dòng)神經(jīng)元中表達(dá)了一種用NLS和突變的NES (ΔNES)標(biāo)記的...

5、白樺素可以改善小鼠的胰島素抵抗 由于白樺素可降低血清和組織中的脂質(zhì)水平，因此接下來研究了白樺素是否可改善體內(nèi)胰島素抵抗。與進(jìn)食chow糧的小鼠相比，由WD喂養(yǎng)的小鼠表現(xiàn)出葡萄糖受損和胰島素耐受性。WD喂養(yǎng)的小鼠的白樺素或洛伐他汀***可顯著改善葡萄糖耐量和胰島素抵抗（圖6A-6D）。此外，WD喂養(yǎng)的小鼠的空腹血糖和胰島素升高通過白樺素的施用而被顯著降低，但洛伐他汀卻沒有（圖6E和6F）?？傮w而言，這些數(shù)據(jù)表明，白樺素可改善小鼠的胰島素抵抗。 異丁酸含量與BMS評(píng)分/ FITC -葡聚糖滲透性之間的相關(guān)性無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。焦亡活化標(biāo)書 由于MLL1在HoxBlinc過表達(dá)介導(dǎo)的異常造...

作者構(gòu)建了 (WT) SLC7A113’-UTR和突變型(Mut) 3’-UTR兩種質(zhì)粒(圖6H)。結(jié)果表明，只有過表達(dá)YTHDC2WT降低SLC7A11 mRNA在H1299細(xì)胞中的穩(wěn)定性，敲除YTHDC2可以提高SLC7A11 mRNA在H1975細(xì)胞中的穩(wěn)定性。然而，與WT 3’-UTR相比，Mut報(bào)告基因的這些作用減弱(圖6I和J)。在檢測(cè)外源性F-Luc-SLC7A11融合mRNA的RNA穩(wěn)定性后，得到了類似的結(jié)果(圖6K-M)?？偟膩碚f，3’-UTR上的m6A位點(diǎn)對(duì)于YTHDC2使SLC7A11 mRNA不穩(wěn)定至關(guān)重要。 7.抑制YTHDC2對(duì)XC-系統(tǒng)靶向***敏感，并...

隨著全球老齡化人口的逐步增長(zhǎng)，研究和制定健康老齡化戰(zhàn)略的需求變得越來越重要，并呈現(xiàn)出新的緊迫性。衰老是一個(gè)復(fù)雜的過程，受遺傳和表觀遺傳調(diào)控、翻譯后調(diào)控、代謝調(diào)控、宿主-微生物組相互作用、生活方式和許多其他因素的影響。近年來，高通量組學(xué)技術(shù)（包括基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、表觀基因組學(xué)、代謝組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、藥物基因組學(xué)和宏基因組學(xué)）已廣泛應(yīng)用于衰老研究，從而對(duì)衰老相關(guān)的分子變化進(jìn)行大規(guī)模分析。因此，與衰老相關(guān)的有價(jià)值的數(shù)據(jù)量越來越大，需要一個(gè)開放和集成的數(shù)據(jù)庫來支持新的衰老研究領(lǐng)域。體外實(shí)驗(yàn)證實(shí)circNDUFB2過表達(dá)******NSCLC細(xì)胞的增殖遷移和侵襲.TRF標(biāo)書深圳表達(dá)PTENWT的細(xì)胞，...

L-14c-胱氨酸攝取試驗(yàn)結(jié)果顯示，YTHDC2通過其YTH域抑制了H1299細(xì)胞產(chǎn)生的異種移植物、小鼠形成的LUAD和患者來源的LUAD細(xì)胞的胱氨酸攝取(圖3D-F)。圖3H證明了系統(tǒng)Xc功能受損與GSH水平降低相關(guān)。NAC和GSH給藥后發(fā)現(xiàn)，KPYWT小鼠的**負(fù)荷明顯高于給藥對(duì)照小鼠，且水平與KPE小鼠相似(圖3H、I)。與KPE小鼠相比，GSH和NAC給藥*導(dǎo)致KPYWT小鼠**中GSH/GSSG比值***增加。NAC和GSH的補(bǔ)充降低了KPYWT小鼠的脂質(zhì)過氧化并縮短了存活時(shí)間(圖3K、L)。NSCLC中circNDUFB2下調(diào).成都?jí)乃罉?biāo)書 5）DRD2通過阻斷TAK1的磷酸化來...

作者檢測(cè)了69個(gè)化療敏感和47個(gè)化療不敏感患者的血漿中miR-208b表達(dá)，結(jié)果顯示與未響應(yīng)組相比，miR-208b的表達(dá)水平在響應(yīng)組***下調(diào)（圖2A-B）。同時(shí)檢測(cè)了血清*胚抗原(CEA)水平，血清miR-208b的曲線下面積(AUC)與血清CEA的AUC相比，優(yōu)于血清CEA水平。在化療響應(yīng)組，在化療前miR-208b的表達(dá)高于化療后，而在未響應(yīng)組，化療前低于化療后水平（圖2C）。生存分析顯示，無進(jìn)展生存期化療響應(yīng)組***高于未響應(yīng)組，miR-208b低表達(dá)組***高于高表達(dá)組（圖2D）。這些結(jié)果表明miR-208b可作為預(yù)測(cè)CRC中FOLFOX化療敏感性的非侵襲性標(biāo)志物。FMT處理可以改...

染色質(zhì)可及性是驅(qū)動(dòng)腎元發(fā)育的動(dòng)態(tài)過程，而腎元祖細(xì)胞具有不同的染色質(zhì)可及性譜，且隨其分化而變化。染色質(zhì)可及性在促進(jìn)或抑制腎臟修復(fù)和再生中的作用對(duì)于設(shè)計(jì)急性和慢性腎臟疾病的治療方案具有重要意義，并可能有助于改善腎臟類***的定向分化。scRNA-seq和snATAC-seq在成年小鼠腎臟中的聯(lián)合分析為理解染色質(zhì)可及性如何調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄提供了一個(gè)框架。然而，人類腎臟的單細(xì)胞表觀基因組還沒有被描述。 生物信息學(xué)工具可以從snATAC-seq數(shù)據(jù)集中提取出scRNA-seq無法獲取的***信息。預(yù)測(cè)細(xì)胞類型特異性順式調(diào)控DNA相互作用和轉(zhuǎn)錄因子活性是補(bǔ)充scRNA-seq獲得的轉(zhuǎn)錄信息的兩種方法。長(zhǎng)...