固醇調(diào)控元件結(jié)合蛋白(SREBPs)是***高脂血癥特征性膽固醇、脂肪酸和甘油三酯生物合成的主要轉(zhuǎn)錄因子。本研究中發(fā)現(xiàn)了一種小分子，白樺素，它通過誘導(dǎo)SREBP裂解***蛋白(SCAP) 與Insig相互作用特異性地抑制SREBP的成熟，進(jìn)而降低膽固醇和脂肪酸的生物合成，改善飲食誘導(dǎo)的肥胖，降低血清和組織中的脂質(zhì)含量，提高胰島素敏感性，減小***斑塊的大小。樺樹皮中含有豐富的白樺素，有望成為開發(fā)***高脂血癥藥物的先導(dǎo)化合物。本研究于2021年1月發(fā)表在《Cell Metabolism》IF:21.567期刊上。FMT***可能通過改變糞便短鏈脂肪酸介導(dǎo)宿主的病理生理變化。江蘇標(biāo)書創(chuàng)新服務(wù) ...

背景：RIT1突變已被確定為肺腺*的致*因素和努南綜合征的病因因素。RIT1有一組獨(dú)特的效應(yīng)蛋白，但與其他Ras GTPases共享MAPK通路的***。然而，由于缺乏確定的同源GTPase***蛋白或交換因子，RIT1 GTPase周期的調(diào)控仍不清楚。盡管如此，RIT1的豐度和活性是通過蛋白酶體降解在蛋白水平上調(diào)控的，這種機(jī)制是由適配器蛋白LZTR1和E3泛素連接酶Cullin 3 (CRL3LZTR1)介導(dǎo)的。RIT1在Noonan綜合征中的作用很可能是通過MAPK通路的過度***介導(dǎo)的，MAPK通路是該疾病的一種癥狀體征，但它在正常細(xì)胞和惡性**中的作用尚不清楚.單細(xì)胞核測序能夠獲得組織...

條件誘導(dǎo)的腸上皮通透性可促進(jìn)細(xì)菌易位和菌血癥，被認(rèn)為是急性移植物抗宿主病(aGvHD)發(fā)病機(jī)制的第一步。急性GvHD是同種異體造血干細(xì)胞移植的常見副作用，同種異體供體T細(xì)胞對宿主體內(nèi)健康組織(包括腸道上皮)表現(xiàn)出細(xì)胞毒性活性。根據(jù)受影響***的程度，急性GvHD的嚴(yán)重程度可分為四個等級:0級I表現(xiàn)為無或輕度，II級IV表現(xiàn)為中度至重度aGvHD。**近，研究表明較低的腸道微生物群多樣性與aGvHD和aGvHD死亡率相關(guān)，并且某些細(xì)菌類群在HSCT后可能參與促進(jìn)aGvHD。然而，在HSCT之前的微生物群組成是否在預(yù)測可能的aGvHD嚴(yán)重程度方面具有預(yù)測價值尚未被檢驗(yàn)，本研究對此進(jìn)行了探討。 ...

五、SIM2對ar介導(dǎo)的基因表達(dá)有***影響 利用RNAseq研究SIM2沉默后SIM2對基因表達(dá)的影響。沉默SIM2使dht調(diào)控的基因數(shù)量增加了一倍多，2394個基因受到雄***調(diào)控，而只有180個基因受到雄***調(diào)控(圖8a, b)。此外，沉默SIM2導(dǎo)致6867個deg，其中2937個deg受到雄***調(diào)控(圖8c, d, Supplementary Fig. S19f)。SIM2沉默也減輕了雄***對AR表達(dá)的抑制(補(bǔ)充圖S20)。根據(jù)RT-qPCR的評估，ARNT沉默實(shí)質(zhì)上再現(xiàn)了SIM2對選定AR靶基因和DEGs的影響(補(bǔ)充圖S21a, b)。對雄***調(diào)節(jié)基因集的meta...

4）DRD2重編程的Mφ誘導(dǎo)**細(xì)胞的焦亡 如HE所示，來自小鼠模型的**承載DRD2顯示**細(xì)胞死亡增加(圖4A)。在免疫組化染色中，表達(dá)DRD2的4T1**樣本中pMLKL表達(dá)較高(圖4A)。根據(jù)TUNEL實(shí)驗(yàn)，DRD2也促進(jìn)了體內(nèi)細(xì)胞凋亡(圖4B)。DRD2上調(diào)GSDME而不是GSDMD(圖4C)。在crosstalk過程中，Mφ進(jìn)一步促進(jìn)了DRD2轉(zhuǎn)染的BrCa細(xì)胞中GSDME的表達(dá)(圖4C)。在表達(dá)DRD2的BrCa細(xì)胞中，Mφ也能上調(diào)IL-1β(圖4C)。WB結(jié)果表明，DRD2誘導(dǎo)了MLKL的磷酸化，而在共培養(yǎng)過程中，MLKL被Mφ抑制(圖4D)。此外，DRD2表達(dá)***...

五、gata1調(diào)控靶基因的染色質(zhì)可及性及表達(dá)動態(tài) 檢測了pySCENIC鑒定的**頂層gata1調(diào)控靶基因的scRNA-seq和scATAC-seq數(shù)據(jù)(根據(jù)AUCell評分排序)(圖5)。 我們觀察了兩個基因啟動子(距轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)3kb[TSS])和遠(yuǎn)端調(diào)控區(qū)域(距TSS50kb)的可及性，以及沿MEMP分化軌跡所選靶基因的表達(dá)水平(圖5A)。我們觀察到，在造血干細(xì)胞/mpp中，gata1調(diào)控靶基因的啟動子在任何明顯的基因表達(dá)之前通常是開放的(圖5A)。因此，與我們之前的觀察一致，造血干細(xì)胞/mpp的染色質(zhì)可及性發(fā)生在*存在于分化程度更高的細(xì)胞中的轉(zhuǎn)錄變化之前。有趣的是，與第...

H460和H1299細(xì)胞是表皮生長因子受體(EGFR)野生型細(xì)胞，我們進(jìn)一步確定了在EGFR突變的H1650細(xì)胞中，USP35對細(xì)胞生長、鐵死亡誘導(dǎo)和**生長的作用。如圖5A-C所示，USP35沉默***減少了H1650細(xì)胞生長、集落形成和**進(jìn)展。因此，在USP 35缺陷型H1650細(xì)胞中，ROS生成、MDA生成、細(xì)胞內(nèi)LIP和Fe2+增加，而GSH水平和GPX4活性降低(圖5D-F)。相反，USP35過表達(dá)***阻止了erastin/RSL3誘導(dǎo)的體內(nèi)外對H1650細(xì)胞生長、集落形成和**進(jìn)展的抑制(圖5G-J)。在H1650細(xì)胞中過表達(dá)USP35也降低了ROS生成、MDA產(chǎn)生和鐵負(fù)荷的增...

5）USP35通過靶向FPN調(diào)節(jié)鐵下垂 我們接下來試圖闡明USP35對鐵死亡的可能機(jī)制。負(fù)責(zé)鐵輸入的蛋白質(zhì)(Tf和TfR)沒有改變；然而，哺乳動物中關(guān)鍵的鐵轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白FPN在USP35缺乏的細(xì)胞中減少，而在過表達(dá)的細(xì)胞中增加(圖6A-C)。在USP35過表達(dá)的*細(xì)胞中，細(xì)胞膜中的FPN蛋白豐度增加，但由于USP35的敲除而降低(圖6D)。與分子變化一致，在USP35沉默或過表達(dá)的細(xì)胞中，胱氨酸攝取也不受影響(圖6E)。為了進(jìn)一步證實(shí)FPN的參與，H460和H1299細(xì)胞分別預(yù)***shFPN以敲低內(nèi)源性FPN表達(dá)。USP35過表達(dá)在鐵刺激時降低了肺*細(xì)胞內(nèi)LIP和Fe2+，但在FPN缺...

我們鑒定出了幾個可能與LINC00926相互作用的蛋白，包括兩個E3連接酶，STUB1和E6AP(圖4F)。免疫印跡進(jìn)一步證實(shí)，只有STUB1與LINC00926相互作用，而E6AP則沒有(圖4G)。此外，RIP分析也表明，PGK1和STUB1免疫沉淀中，LINC00926***富集(圖4H)。此外，LINC00926增強(qiáng)了STUB1介導(dǎo)的PGK1泛素化(圖4I)。敲低STUB1**減弱了LINC00926對PGK1泛素化的影響(圖4J)。這些數(shù)據(jù)表明，STUB1在LINC00926調(diào)控PGK1泛素化過程中起著關(guān)鍵作用。與LINC00926對STUB1介導(dǎo)的PGK1泛素化的影響一致，LINC0...

caspase-3抗體是一種***用于檢測凋亡細(xì)胞的標(biāo)志物。確實(shí)，MMTVneu**的caspase-3陽性細(xì)胞比相應(yīng)的Pten+/+少;綜上所述，這些結(jié)果表明，PTEN不能被ATM磷酸化的細(xì)胞對基因毒性應(yīng)激誘導(dǎo)的細(xì)胞凋亡具有抗性。為了評估表達(dá)PTEN-398A且DNA損傷未解決的細(xì)胞在輻照(圖2B,C和補(bǔ)充圖4B,C)后的持續(xù)存在是否是誘導(dǎo)凋亡反應(yīng)失敗的結(jié)果，我們在IR之前先用泛caspase抑制劑z-VAD-FMK(zVAD)對細(xì)胞進(jìn)行預(yù)處理。與DMSO處理相比，zVAD增加了PTEN-WT細(xì)胞中未解決的DNA損傷灶的數(shù)量，其水平與DMSO處理的PTEN-398A細(xì)胞相當(dāng)(補(bǔ)充圖5F)。然...

5、hUC-MSCs調(diào)節(jié)MRL/lpr小鼠脾CD4+T細(xì)胞Sirt1/p53信號通過miR-199a-5p 文獻(xiàn)報道在**和自身免疫疾病中，hUC-MSCs能夠?qū)iRNAs轉(zhuǎn)移到周圍的細(xì)胞。因此，作者考慮miRNAs是否可能參與hUC-MSCs介導(dǎo)的對脾CD4+T細(xì)胞中Sirt1的表達(dá)調(diào)控。使用在線軟件Targetscan識別了10個miRNA，這些miRNA被預(yù)測靶向Sirt1。qPCR分析顯示，在這10個miRNAs中，只有miR-199a-5p的表達(dá)在MRL/lpr脾CD4+T細(xì)胞中***降低(圖5A)。此外，miR-199a-5p是hUC-MSCs處理后***表達(dá)增加的mi...

一、異種HSCT前后監(jiān)測腸道、口腔和鼻腔微生物群和宿主免疫系統(tǒng)。 在1年的時間里，從29名兒童的10個時間點(diǎn)收集糞便樣本、口腔拭子和前鼻孔拭子:在HSCT前2次，HSCT當(dāng)天，HSCT后1個月每周，以及HSCT后12個月的3個隨訪時間點(diǎn)(圖1)。通過16SrRNA基因譜測定這些樣本中的微生物群落動態(tài)。共對709份患者樣本(212份糞便樣本、248份口腔拭子和249份鼻拭子來自10個時間點(diǎn))進(jìn)行了鑒定。發(fā)現(xiàn)移植前患者的微生物群落組成與健康對照不同；三個身體部位性在HSCT后微生物α多樣性下降；在一年中，微生物群落動態(tài)呈現(xiàn)出三個階段：第一階段(在檢查前和適應(yīng)開始時的樣本)，第二階段(HS...

4、hnRNPA2B1在外泌體miR-934向巨噬細(xì)胞轉(zhuǎn)移中發(fā)揮作用 據(jù)報道，外泌體RNA的分泌需要一種特定的RNA結(jié)合蛋白來轉(zhuǎn)運(yùn)。通過RNApull-down分析和質(zhì)譜分析，鑒定了三種可能參與miR-934轉(zhuǎn)運(yùn)的RNA結(jié)合蛋白，并發(fā)現(xiàn)敲除hnRNPA2B1可以降低外泌體miR-934的表達(dá)（Fig.4a,b）。hnRNPA2B1是一種RNA結(jié)合蛋白，通過與特定基序GGAG/CCCU結(jié)合，參與miRNAs的運(yùn)輸和轉(zhuǎn)錄后調(diào)控。特別是，由于miR-934序列中有兩個GGAG基序，我們推測hnRNPA2B1可能通過與GGAG序列結(jié)合，介導(dǎo)miR-934包裝成外泌體的過程。此外，miRNAp...

與coaccessibilityscore較高的Cicero連接相比，coaccessibilityscore較低的Cicero連接在GeneHancerdoubleelite數(shù)據(jù)庫中的可能性較小(p<2.21016，卡的平方)。在近端曲小管內(nèi)，大部分Cicero連接要么在啟動子區(qū)域內(nèi)，要么在啟動子和另一個位置之間(圖3d)，這種分布在其他細(xì)胞類型中也類似(補(bǔ)充圖11)。轉(zhuǎn)錄因子活性與轉(zhuǎn)錄因子表達(dá)有適度的相關(guān)性(Pearsonr2=0.36,p值=4.21012，圖3e)。推測motif活性與轉(zhuǎn)錄因子表達(dá)呈正相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子可能在DAR中扮演轉(zhuǎn)錄***因子的角色，而負(fù)相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子則扮演轉(zhuǎn)...

LINC00926通過增強(qiáng)STUB1介導(dǎo)的泛素-蛋白酶體途徑調(diào)節(jié)PGK1蛋白的穩(wěn)定性亞細(xì)胞定位結(jié)果顯示，LINC00926主要定位于細(xì)胞質(zhì)，F(xiàn)ISH實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步證實(shí)了這一點(diǎn)(圖4A和4B)。結(jié)合LINC00926沒有改變PGK1mRNA水平的事實(shí)，我們推測LINC00926在轉(zhuǎn)錄后水平下調(diào)了PGK1的表達(dá)。事實(shí)上，蛋白酶體抑制劑MG132的加入阻斷了LINC00926過表達(dá)介導(dǎo)的PGK1降解，這表明泛素-蛋白酶體途徑參與了LINC00926對PGK1蛋白穩(wěn)定性的調(diào)節(jié)(圖4C)。LINC00926過表達(dá)增加PGK1泛素化(圖4D)。下調(diào)LINC00926基因后，PGK1蛋白水平升高，泛素化水平降低...

snoRNAs派生的小RNAs miRNA在一系列調(diào)控過程中起著重要作用，如細(xì)胞存活和細(xì)胞增殖的調(diào)控,由snoRNAs產(chǎn)生的sno-miRNAs產(chǎn)生的小RNA具有雙重功能,同樣的轉(zhuǎn)錄本可以作為snoRNA和miRNA的前體。ACA45是***個被報道能夠被降解成短片段snoRNAs，它是通過與Ago蛋白的相互作用被發(fā)現(xiàn)的，而Ago作為miRNARISC復(fù)合物的成員，這就表明ACA45的進(jìn)一步的加工處理是依賴于Dicer酶的。降解產(chǎn)生的20-22nt的短片段RNA的作用機(jī)制類似與miRNA抑制目的基因(CDC2L6)的表達(dá)[11]。很多研究揭示了snoRNAs可能參與抑*基因P53的調(diào)...

10.EVs介導(dǎo)的ELNAT1與BCa淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移相關(guān) 確定EVs介導(dǎo)的ELNAT1在BCa淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移中的臨床意義十分重要。首先，作者發(fā)現(xiàn)來自BCa患者的尿中EVs與配對BCa組織的ELNAT1表達(dá)呈正相關(guān)，這意味著EVs介導(dǎo)的ELNAT1是BCa中ELNAT1調(diào)控的重要參與者（Figure10A）。同時，BCa患者的尿中EV介導(dǎo)的ELNAT1過表達(dá)與BCa的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移呈正相關(guān)（Figure10B）。EV介導(dǎo)的ELNAT1表達(dá)較高的BCa患者總生存期（OS）和無病生存期（DFS）率較短（Figure10C-D）。ROC分析顯示尿液中EV介導(dǎo)的ELNAT1可有效區(qū)分BCa患者與健康志愿者...

2021年5月，***一篇發(fā)表在cancer research（IF=12.7000）的文章（YTHDF1 Promotes Gastric Carcinogenesis by Controlling Translation of FZD7）。此研究分析了cBioPortal (cBio cancer Genomics Portal)630例原發(fā)性胃腺*數(shù)據(jù)集，發(fā)現(xiàn)YTHDF1（m6A讀取蛋白）的突變主要是基因擴(kuò)增，導(dǎo)致其過表達(dá)。YTHDF1的高表達(dá)與更具侵襲性的**進(jìn)展和較差的總生存期相關(guān)。抑制YTHDF1在體內(nèi)外均可抑制胃*細(xì)胞增殖和**發(fā)生。在機(jī)制上，YTHDF1以m6依賴的方式促進(jìn)了W...

2）在體內(nèi)和體外，DRD2的表達(dá)抑制BrCa細(xì)胞的**發(fā)生 構(gòu)建過表達(dá)DRD2的MDA-MB231和BT549細(xì)胞，通過RT-PCR(Figure2A)和WB(Figure2B)驗(yàn)證。CCK8實(shí)驗(yàn)證明，DRD2異位表達(dá)抑制**細(xì)胞生長(圖2C)。在單層集落形成實(shí)驗(yàn)(圖2D)和軟瓊脂形成實(shí)驗(yàn)(圖2E)中，DRD2也損害了存活能力。并進(jìn)行細(xì)胞凋亡和細(xì)胞周期分布分析。DRD2的表達(dá)***促進(jìn)了BrCa細(xì)胞凋亡(圖2F)，并阻斷了MDA-MB231和BT549在G2/M期的凋亡(圖2G)。此外，過表達(dá)DRD2促進(jìn)了BrCa細(xì)胞對PTX的敏感性(圖2H)。在傷口愈合實(shí)驗(yàn)中，異位表達(dá)的DRD2比...

m6A酶系統(tǒng) METTL3是早先被鑒定為結(jié)合SAM的組件，其缺失引起小鼠胚胎干細(xì)胞、Hela細(xì)胞和HepG2 細(xì)胞中m6Apeaks的減少。METTL3及其同源蛋白METTL14定位在富含剪切因子的細(xì)胞核內(nèi)亞細(xì)胞器－核小斑（Nuclear speckle）上，顯示ｍ６Ａ修飾可能和ＲＮＡ的剪切加工相關(guān)。WTAP與METTL3–METTL14 二聚體相互作用，并共定位于核小斑，影響甲基化效率，參與mRNA剪。而KIAA1429作為候選的甲基轉(zhuǎn)移酶復(fù)合體的新亞基，是整體甲基化進(jìn)程所必須的[2]。FTO是ALKB家族的成員，作為***個被發(fā)現(xiàn)的去甲基酶，可影響剪切因子SRSF2的RN...

2021年6月，***一篇發(fā)表在Nat Immunol.（IF=25.600）的文章（Mitochondrial stress induced by continuous stimulation under hypoxia rapidly drives T cell exhaustion.）當(dāng)**內(nèi)衰竭T細(xì)胞經(jīng)歷嚴(yán)重缺氧時，他們假設(shè)代謝應(yīng)激會改變其對其他信號的反應(yīng)，特別是持續(xù)的抗原刺激。在體外，盡管單獨(dú)經(jīng)歷連續(xù)刺激或缺氧的CD8 + T細(xì)胞分化為功能性效應(yīng)物，但這種組合迅速驅(qū)動了與衰竭一致的T細(xì)胞功能障礙。連續(xù)刺激促進(jìn)了Blimp-1介導(dǎo)的PGC-1α依賴性線粒體重編程阻遏作用，使細(xì)胞對缺氧的...

JAK-Stat6信號通路在介導(dǎo)IL-4/IL-13誘導(dǎo)TME中TAMs免疫抑制極化過程中起關(guān)鍵作用。IL-4/IL-13刺激后，JAK磷酸化，隨后Stat6磷酸化，磷酸化后的Stat6二聚并遷移至細(xì)胞核，然后與IL-4/IL-13相應(yīng)基因，包括那些參與巨噬細(xì)胞免疫響應(yīng)功能的基因的啟動子結(jié)合。據(jù)報道ROS可以促進(jìn)JAK和Stat6磷酸化。因此，推測MAO-A可能通過上調(diào)ROS水平影響巨噬細(xì)胞極化，從而使JAK-Stat6信號通路敏感。事實(shí)上，直接分析從B16-OVA荷瘤MaoaWT和MaoaKO小鼠中分離的TAMs證實(shí)，與野生型TAMs相比，MAO-A缺陷的TAMs顯示Stat6***降低（圖...

PTEN是一種**抑制因子，調(diào)節(jié)多種細(xì)胞功能，包括***，PI3K/AKT信號通路是PTEN通過其磷酸酶活性靶向的**重要通路之一。因此，推測PI3K/AKT信號通路可能參與CRC細(xì)胞來源的外泌體miR-934誘導(dǎo)M2巨噬細(xì)胞極化。WB結(jié)果顯示過表達(dá)PTEN可以部分減弱miR-934和HCT-8細(xì)胞源外泌體對p-AKT和p-PI3K表達(dá)的增強(qiáng)作用，而沉默PTEN則相反（Fig. 5k）。更重要的是，當(dāng)與HCT-8細(xì)胞來源的外泌體和PI3K抑制劑(LY294002)共培養(yǎng)時，PMA處理的THP-1細(xì)胞中p-AKT和M2標(biāo)記物(CD206、arginase-1和CD163)的表達(dá)下調(diào)（Fig. 5...

二、INPP4B增強(qiáng)pik3a突變ER+乳腺*和乳腺上皮細(xì)胞增殖 GFP-INPP4B在MCF-7和T47D ER+乳腺*細(xì)胞中表達(dá)，這兩種細(xì)胞分別有PIK3CAE545K和PIK3CAH1047R高活化突變.*細(xì)胞進(jìn)行非錨定細(xì)胞生長的能力是細(xì)胞轉(zhuǎn)化的一個標(biāo)志。GFP-INPP4B***增加了軟瓊脂中MCF-7細(xì)胞集落大小(2.1倍)和T47D細(xì)胞集落大小(1.8倍)，但對集落數(shù)量沒有影響(圖2a-c)。與細(xì)胞增殖增加相一致。與載體對照相比，GFP-INPP4B在血清剝奪后增強(qiáng)了MCF-7細(xì)胞的增殖(1.7倍)(圖2d, e)，但不影響在含血清培養(yǎng)基中生長的MCF-7細(xì)胞的增殖。過表...

在缺氧條件下持續(xù)刺激的T細(xì)胞出現(xiàn)衰竭 為了確定缺氧是否會導(dǎo)致細(xì)胞衰竭，在體外建立暴露于缺氧應(yīng)激的模型。a，體外CD8+ T細(xì)胞d10的TNF和IFN-γ的產(chǎn)生，在缺氧或缺氧條件下，用抗cd3 /CD28珠急性或持續(xù)***d2- 5，然后在常氧或缺氧條件下額外培養(yǎng)5天。b，，圖2中使用的刺激方案生成的第3天CD8+ T細(xì)胞CTV稀釋液的代表性直方圖和division分析。c, CD8+ T細(xì)胞的擴(kuò)增(左)和累積倍增(右)。d，第3天或第4天產(chǎn)生的CD8+ T細(xì)胞的染色稀釋(增殖)與細(xì)胞死亡(活/死)染色。e, PD-1在cd4 + T細(xì)胞中的平均熒光強(qiáng)度。.f–h。第3天CD8+ T細(xì)...

4、CDK4/6預(yù)處理增強(qiáng)功能性記憶CD8+T細(xì)胞的持久性 長期生存能力是T細(xì)胞記憶的基本特征。為了確定CDK4/6i處理的細(xì)胞在體內(nèi)是否表現(xiàn)出優(yōu)越的存活率，將未處理和CDK4/6i預(yù)處理的體外活化CD45.1OT-iT細(xì)胞轉(zhuǎn)移至同源CD45.2小鼠中，并通過流式細(xì)胞術(shù)評價其隨時間的持續(xù)性和表型（Fig.4A）。在30天內(nèi)，在血液和脾臟中檢測到的預(yù)處理OT-I-T細(xì)胞的頻率明顯更高（Fig.4B）。30天后，未處理和預(yù)處理的OT-I-T細(xì)胞在血液和脾臟中的表型持久性相似，都具有記憶前體的特征(MPECs;KLRG1-CD127+)(Fig.4C)。為了評價CDK4/6i處理細(xì)胞的記憶...

4、CLF1敲除抑制小鼠HCC的生長和肺部轉(zhuǎn)移隨后，作者在體內(nèi)進(jìn)一步驗(yàn)證CLF1的功能。結(jié)果如圖3所以，敲除CFL1后***降低了HCC細(xì)胞的**體積和**，并減少了肺轉(zhuǎn)移結(jié)節(jié)數(shù)量。IHC表明CLF1的敲除也導(dǎo)致EMT相關(guān)蛋白的抑制?？傊?，CLF1敲除抑制小鼠HCC的生長和肺部轉(zhuǎn)移。 5、CFL1是HIF-1α在HCC細(xì)胞中的下游靶基因?yàn)榱岁U明低氧對HCC中CFL1表達(dá)的影響，將HCCLM3和Hep3B細(xì)胞在低氧培養(yǎng)箱中培養(yǎng)48h。結(jié)果發(fā)現(xiàn)低氧誘導(dǎo)導(dǎo)致CFL1的表達(dá)升高，但是當(dāng)HIF-1α敲除后，低氧誘導(dǎo)并不能提高CFL1的表達(dá)，并且使用HIF-1α的抑制劑處理HCCLM3和Hep3...

自4個不同腺泡性LUAD患者的PDX模型被給予XC-系統(tǒng)抑制劑erastin(PKE)和多激酶抑制劑索拉非尼(sorafenib)。與DMSO***的對照組相比，PKE和sorafenib給藥時觀察到***的**消退(圖7G-J)。此外，PKE和sorafenib給藥小鼠也導(dǎo)致**中MDA和4-HNE的***增加(圖7K和L)，提示誘導(dǎo)的脂質(zhì)過氧化可能是抑制腺泡LUADs**發(fā)生的結(jié)果。圖7M顯示，與*旁組織相比，**組織中MDA和YTHDC2表達(dá)量都降低，而SLC7A11mRNA和蛋白水平都升高，證明在LUAD中抑制YTHDC2可通過SLC7A11表達(dá)上調(diào)阻止脂質(zhì)過氧化。同樣地，MDA和...

單細(xì)胞RNA測序（scRNA-seq）技術(shù)可以在單細(xì)胞水平下研究復(fù)雜的多細(xì)胞生物的轉(zhuǎn)錄組譜。這為科學(xué)家提供了一種研究表達(dá)模式中細(xì)胞異質(zhì)性的新工具，尤其是疾病細(xì)胞的異質(zhì)性。更重要的是，scRNA-seq的快速發(fā)展帶來了在疾病微環(huán)境中探索細(xì)胞亞群的見識，這有助于研究疾病的發(fā)***展，耐藥性和免疫逃逸。scRNA-seq技術(shù)已被廣泛應(yīng)用于病例對照研究中差異表達(dá)基因的識別以及細(xì)胞亞群之間差異的識別。 ***我們來講一篇刊登在Nucleic Acids Research期刊（IF=11.502），題名為SC2disease: a manually curated database of sin...

二、改進(jìn)標(biāo)簽轉(zhuǎn)移和差異分析 研究了方法差異對下游生物學(xué)分析的影響 A.B.去除中性粒細(xì)胞**提高了在細(xì)胞核和細(xì)胞的均勻流形近似和投影(UMAP)投影中分離各種細(xì)胞類型的能力. C使用這些工具，中性粒細(xì)胞的去除提高了標(biāo)記轉(zhuǎn)移評分，與核基方法相比，滲透性細(xì)胞產(chǎn)生了更多具有高標(biāo)記轉(zhuǎn)移評分的細(xì)胞. D所有方法產(chǎn)生的CD16+單核細(xì)胞均少于流式細(xì)胞術(shù)觀察到的CD16+單核細(xì)胞，這表明無論是使用核或通透細(xì)胞的scATAC-seq過程中，CD16+單核細(xì)胞可能丟失，或者標(biāo)簽轉(zhuǎn)移方法不利于識別這種細(xì)胞類型. 采用非靶向代謝組學(xué)方法測量三組血清代謝產(chǎn)物?安徽標(biāo)書技術(shù)指導(dǎo)我們發(fā)現(xiàn)，在c...