4）DRD2重編程的Mφ誘導(dǎo)**細(xì)胞的焦亡
如HE所示，來自小鼠模型的**承載DRD2顯示**細(xì)胞死亡增加(圖4A)。在免疫組化染色中，表達(dá)DRD2的4T1**樣本中pMLKL表達(dá)較高(圖4A)。根據(jù)TUNEL實(shí)驗(yàn)，DRD2也促進(jìn)了體內(nèi)細(xì)胞凋亡(圖4B)。DRD2上調(diào)GSDME而不是GSDMD(圖4C)。在crosstalk過程中，Mφ進(jìn)一步促進(jìn)了DRD2轉(zhuǎn)染的BrCa細(xì)胞中GSDME的表達(dá)(圖4C)。在表達(dá)DRD2的BrCa細(xì)胞中，Mφ也能上調(diào)IL-1β(圖4C)。WB結(jié)果表明，DRD2誘導(dǎo)了MLKL的磷酸化，而在共培養(yǎng)過程中，MLKL被Mφ抑制(圖4D)。此外，DRD2表達(dá)***了caspase-8，而***被Mφ抑制(圖4D)。假設(shè)，DRD2可能在與Mφcrosstalk時(shí)誘發(fā)焦亡。BrCa細(xì)胞中與Mφ共培養(yǎng)時(shí)，NLRP3在表達(dá)DRD2的BrCa細(xì)胞中被觸發(fā)。***的caspase-1蛋白水解也能誘導(dǎo)IL-1β和IL-18的成熟(圖4D)。在共培養(yǎng)過程中，Cleavedcaspase-3表達(dá)上調(diào)(圖4D)。此外，在共培養(yǎng)過程中發(fā)現(xiàn)表達(dá)DRD2的BrCa細(xì)胞中，GSDME的N端發(fā)生了剪切(圖4D)。為了確定是否由M1Mφ引起焦亡，我們使用了LPS誘導(dǎo)的M1Mφ培養(yǎng)基，結(jié)果表明，在表達(dá)DRD2的BrCa細(xì)胞中，M1Mφ*觸發(fā)NLRP3組裝并剪切GSDME(圖4E)。以上結(jié)果提示，M1Mφ以DRD2依賴的方式觸發(fā)BrCa細(xì)胞的焦亡。 與未接受FMT***的受傷小鼠相比接受FMT***的小鼠表現(xiàn)出相對更大的運(yùn)動(dòng)恢復(fù)。海南標(biāo)書歡迎咨詢
自噬“貨物”是有選擇性裝載的，其中主要依靠LIR基序與LC3互作，形成自噬體。隨后，自噬體進(jìn)行運(yùn)輸、溶解。研究表明，自噬異常會(huì)影響疾病進(jìn)程。**中的自噬具有雙重作用：一方面自噬的發(fā)生會(huì)增強(qiáng)*細(xì)胞的生存能力；另一方面，抑制自噬會(huì)造成“廢物”的積累、基因突變等，誘發(fā)**。本研究旨在探索人類**中是否有某些突變通過影響LIR基序來改變自噬選擇性，進(jìn)而影響疾病進(jìn)程。
1.構(gòu)建LIR預(yù)測模型pLAM
收集人、釀酒酵母、其他物種LIR，并獲取相應(yīng)蛋白,確定了LIR的序列信息。
驗(yàn)證算法的可靠性，然后用于泛*LIR基序預(yù)測，并對預(yù)測到的LIR基序?qū)?yīng)的基因進(jìn)行GO、Pathway富集分析。
2.LIR基序突變預(yù)測
收集TCGA、ICGC和COSMIC數(shù)據(jù)庫突變數(shù)據(jù)并進(jìn)行整合，獲得2,963,952個(gè)獨(dú)特的SNV。提取其中LIR基序的突變信息。分析發(fā)現(xiàn)STBD1蛋白，參與糖原代謝，在之前尚未報(bào)道過與**自噬有關(guān)。
3.分析突變的LIR基序（LAMs）在泛*中的作用
使用TCGA數(shù)據(jù)庫分析發(fā)現(xiàn)，STDB1在泛*中為抑制**；在膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中為促進(jìn)**。
蛋白組學(xué)標(biāo)書服務(wù)價(jià)格研究腸道微生物組和宿主循環(huán)代謝產(chǎn)物之間的關(guān)系。
2、HMH-exo增強(qiáng)低轉(zhuǎn)移性HCC細(xì)胞系的轉(zhuǎn)移潛力
為了探究HCC轉(zhuǎn)移時(shí)外泌體在細(xì)胞與細(xì)胞串?dāng)_中的可能作用，作者實(shí)驗(yàn)HMH-exo預(yù)處理低轉(zhuǎn)移性的HCC細(xì)胞系。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，與LMH-exo或者PBS預(yù)處理組相比，HMH-exo***增強(qiáng)了低轉(zhuǎn)移性HCC細(xì)胞系的轉(zhuǎn)移能力；隨后作者使用低轉(zhuǎn)移性HCC細(xì)胞系構(gòu)建了體內(nèi)原位異種移植瘤模型，成瘤后使用外泌體***6周，***檢測肝臟**和肺轉(zhuǎn)移，結(jié)果顯示與其它組相比，HMH-exo組的肝臟**更大，肺轉(zhuǎn)移結(jié)節(jié)更多。（圖2）。這些結(jié)果表明HMH-exo可以在體內(nèi)外增強(qiáng)低轉(zhuǎn)移性HCC細(xì)胞的轉(zhuǎn)移能力。
6）Pex衍生的CD44v6和C1QBP的高表達(dá)預(yù)示著PDAC患者的肝轉(zhuǎn)移和低生存率采用免疫組化和westernblot檢測肝轉(zhuǎn)移灶周圍肝組織和正常肝組織的纖維化ECM微環(huán)境。與體內(nèi)實(shí)驗(yàn)一致，纖維連接蛋白、I型膠原和α-SMA水平***升高，而玻連蛋白和固生蛋白C水平下調(diào)(圖7A，B)。接下來，我們研究了外泌體衍生CD44v6和C1QBP在PDAC患者中的預(yù)后價(jià)值。外泌體CD44v6和C1QBP在PDAC組織中的表達(dá)明顯高于正常胰腺組織(圖7C)。此外，有肝轉(zhuǎn)移的PDAC患者外泌體CD44v6和C1QBP的表達(dá)明顯高于無肝轉(zhuǎn)移的PDAC患者(圖7C)。免疫電鏡顯示，CD44v6和C1QBP在PDAC組織來源的EVs***表達(dá)(圖7D)。Pex中CD44v6和C1QBP高表達(dá)的患者比其他患者更容易發(fā)生肝轉(zhuǎn)移(圖7E)。PCOS大鼠大部分血清代謝物的豐度與對照組大鼠完全不同.
5.腸道微生物群和循環(huán)代謝產(chǎn)物之間的聯(lián)系
采用非靶向代謝組學(xué)方法測量三組血清代謝產(chǎn)物，并研究腸道微生物組和宿主循環(huán)代謝產(chǎn)物之間的關(guān)系。主成分分析(PCA)顯示，三組間主要代謝成分差異***(圖6A)。OP***A的監(jiān)督正交投影評分圖也顯示出PCOS大鼠與對照組、DHEA+PBS組與DHEA+tempol組之間的明顯區(qū)別(圖6B)。圖6C列出了三組52種血清代謝物(包括26種脂類及類脂分子)的相對豐度，說明PCOS大鼠大部分血清代謝物的豐度與對照組大鼠完全不同，說明DHEA***對血清代謝有深遠(yuǎn)的影響。PCOS大鼠服用Tempol后，血清代謝產(chǎn)物的豐度也發(fā)生了***變化，引起28種血清代謝物豐度的變化在tempol作用下部分減弱(圖6C)。 肺*是**常診斷的**之一也是大多數(shù)國家**死亡的主要原因。海南標(biāo)書歡迎咨詢
FMT可能通過***IL-1β/ NF-κB信號通路來緩解神經(jīng)炎癥。海南標(biāo)書歡迎咨詢
關(guān)聯(lián)研究已將血液來源的microRNA(miRNA)的改變與結(jié)直腸*(CRC)聯(lián)系起來。miRNA譜可能在CRC進(jìn)展過程中多樣化，并在血液中反映CRC進(jìn)展水平。但是，尚無研究評估不同CRC階段血液中miRNA的變化。本研究對來自不同階段的健康供體、結(jié)直腸腺瘤、結(jié)直腸憩室炎和CRC患者（UICCstagesI/II,III,andIV）的80份血液樣本中的2,549種miRNA的譜進(jìn)行了基于微陣列的比較。接下來通過RT-PCR進(jìn)行確認(rèn)，并對另外36份血液樣本中miRNA進(jìn)行驗(yàn)證。與健康對照相比，有179個(gè)CRC相關(guān)miRNA的豐度差異。只有三個(gè)（miR-1225-5p、miR-1207-5p和miR-4459）在所有CRC階段表現(xiàn)出增加的水平。對3個(gè)miRNA進(jìn)行通路分析，發(fā)現(xiàn)了miRNAs以各種方式對幾種**相關(guān)通路起作用。這項(xiàng)研究為改進(jìn)CRC篩查的生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)提供了線索，是***項(xiàng)提供CRC血液表達(dá)譜的研究，******評估了不同CRC不同階段血液中miRNA的變化。這也為其他疾病biomarker的研究提供了新的思路。海南標(biāo)書歡迎咨詢
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4.二代測序：轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)