五、SIM2對ar介導的基因表達有***影響
利用RNAseq研究SIM2沉默后SIM2對基因表達的影響。沉默SIM2使dht調控的基因數(shù)量增加了一倍多，2394個基因受到雄***調控，而只有180個基因受到雄***調控(圖8a, b)。此外，沉默SIM2導致6867個deg，其中2937個deg受到雄***調控(圖8c, d, Supplementary Fig. S19f)。SIM2沉默也減輕了雄***對AR表達的抑制(補充圖S20)。根據(jù)RT-qPCR的評估，ARNT沉默實質上再現(xiàn)了SIM2對選定AR靶基因和DEGs的影響(補充圖S21a, b)。對雄***調節(jié)基因集的meta分析顯示，通過SIM2沉默，幾種途徑***富集。A_up/ siSIM2_up基因組和A_up/siSIM2_dn基因組中富集的**上面的通路分別是膜運輸和細胞對外界刺激的反應(圖8e）。 WB結果顯示結腸中炎癥分子的相對表達似乎低于脊髓中的。糖尿病標書中標率高
核型生物標志物
MarkerDB共有154個核型標記或核型圖，與47種不同的疾病/狀況相關。MarkerDB中的所有核型生物標記物數(shù)據(jù)都是從原始文獻中提取的，包括**學和血液學中的遺傳學和細胞遺傳學圖譜，以及人類不平衡染色體畸變目錄。目前，MarkerDB中的所有核型標記都有一個或多個疾病xiang關聯(lián)，以及MarkerDB ID、標記的獨特圖譜或核型圖（顯示與疾病核型相鄰的正常核型）、核型的簡短描述、疾病關聯(lián)、一個或多個相關基因的文獻參考和超鏈接。
糖尿病標書中標率高促進了對定義腎臟細胞特性的基因和途徑的更深入的理解。
YTHDC2調節(jié)SLC7A11 mRNA的穩(wěn)定性(圖5A-D)，而控制RNA衰減是m6A甲基化的重要功能之一。作者先驗證METTL3刺激m6A的能力(圖5E、F)。在H1975細胞中敲降METTL3延長了SLC7A11 mRNA的半衰期，而在H1299細胞中過表達METTL3則加速了SLC7A11 mRNA的降解(圖5G)。此外，H1299細胞中降低METTL3表達阻斷了YTHDC2，從而減緩SLC7A11 mRNA的衰減，刺激胱氨酸攝取并減弱脂質活性氧(ROS)的生成(圖5H-J)，這表明YTHDC2在LUAD細胞中的作用是依賴m6A。
6.YTHDC2傾向于相互作用并使m6A甲基化的SLC7A11mRNA不穩(wěn)定
為了揭示SLC7A11mRNA中潛在的m6A甲基化位點，在H1975細胞中METTL3敲除前后分別進行了MeRIP-seq研究。在H1975細胞中，無論是否敲除METTL3,GGACmotif都高度富集于m6A位點(圖6A)。m6A峰在mRNA停止密碼子附近的3’非翻譯區(qū)(3’UTR)尤為豐富(圖6B)。為了進一步證實SLC7A11mRNA的m6A依賴性修飾，我們進行MeRIP-qPCR。在H1975細胞中，敲除METTL3后，SLC7A11mRNA中的m6A修飾明顯減少，特別是在假定的m6A位點周圍。相反，當METTL3在H1299細胞中過表達時，觀察到相反的結果(圖6C)。
8）SOCS6通過泛素化和降解p65抑制NF-κB信號通路
鑒于miR-155通過增強細胞質和細胞核中p65的表達負調控SOCS6的表達，并***NF-κB信號通路，我們下一步研究SOCS6與p65之間潛在的相互作用。首先，我們在bEnd.3細胞中過表達或下調SOCS6。發(fā)現(xiàn)p65表達與SOCS6水平呈負相關(圖8A)。DiscoveryStudio?分析的3D對接也表明SOCS6可能與p65相互作用(圖8B)。此外，熒光共定位實驗表明，SOCS6與p65在細胞質***定位(圖8C和D)，Co-IP實驗進一步揭示了SOCS6與p65的相互作用(圖8E)。值得注意的是蛋白酶體MG132可以部分逆轉SOCS6過表達對p65蛋白水平的抑制作用(圖8F)。同時，在環(huán)己酰亞胺的情況下，SOCS6的沉默***延緩了內源性p65的降解速率，而過表達SOCS6則***加速了p65的降解(圖8G)。***，通過泛素化實驗驗證SOCS6是否通過蛋白酶體降解誘導p65失穩(wěn)。我們發(fā)現(xiàn)過表達SOCS6增加了bEnd.3細胞中p65多聚泛素化。沉默SOCS6則相反(圖8H)。綜上所述，這些結果表明SOCS6可以與p65結合并誘導其多聚泛素化和蛋白酶體降解。 FMT處理促進神經元存活和突觸重建。
LINC00926通過***乳腺*細胞中PGK1的表達來***增殖、遷移和侵襲為了研究LINC00926在乳腺*細胞中的生物學功能，我們用LINC00926***細胞，對其進行細胞生長、遷移和侵襲分析。細胞增殖和集落形成實驗顯示，過表達LINC00926可降低MDA-MB-231和MCF-7細胞的增殖(圖2A和2B)。在LINC00926轉染的細胞系中，PGK1的表達可逆轉上述作用。過表達LINC00926也顯示出遷移和侵襲能力下降(圖2C和2D)。同樣，PGK1在LINC00926轉染的細胞中重新表達逆轉了這些作用。此外，敲除PGK1還可以***LINC00926調控乳腺*細胞增殖、遷移和侵襲的能力(圖2E-2H)，表示LINC00926通過***PGK1的表達來***乳腺*細胞的增殖、遷移和侵襲FMT處理***增加了SCI小鼠腸道菌群的豐富度。cancer免疫標書歡迎咨詢
為了確定水蘇糖是否參與了Tempol對PCOS大鼠的有益作用.糖尿病標書中標率高
在DMF誘導的HIF-2α介導的細胞死亡中，活性氧積累和鐵毒性是必不可少的
添加半胱氨酸前體n-乙酰半胱氨酸(NAC)的生長培養(yǎng)基挽救了含或不含F(xiàn)G4592DMF處理的HCT116和SW480細胞的死亡和活力。在DMF處理和維持缺氧的細胞中也觀察到類似的結果。FG4592或單獨的缺氧處理增加了ROS，這是通過細胞滲透的2,7-二氯二氫熒光素二醋酸酯(H2DCFDA)評估的，它被用作ROS的指標。與DMF的協(xié)同處理增強了ROS生成的增加，而NAC可以挽救ROS生成。為了證實對氧化細胞死亡的敏感性是由HIF-2α介導的，利用了shRNA介導的HIF-1α和HIF-2α敲低細胞。HIF-2α敲低細胞中的ROS水平***降低，表明DMF處理后HIF-2α在ROS產生中的作用。由于HIF***會導致線粒體代謝的變化和ROS的產生，作者分析了DMF或FG4592處理是否會引起線粒體代謝物池的變化。然而，線粒體代謝物水平未見***變化，表明HIF-2α通過其他機制影響細胞ROS。由DMF和FG4592介導的細胞死亡在低鐵和對照培養(yǎng)基中被挽救?？傊?，這些數(shù)據(jù)表明，鐵毒性通過HIF-2α和氧化應激脆弱性的機制。 糖尿病標書中標率高
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5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗