所有生物體都需要通過細胞分裂周期進行適當的基因組維護，以確保正常生殖、發(fā)育和預防包括**在內的各種疾病。DNA損傷可由內源性過程引起，如DNA復制過程中偶爾引入的DNA不匹配，拓撲異構酶I和拓撲異構酶II活性失效導致的DNA鏈斷裂，或由正常代謝副產品產生的ROS攻擊DNA。外源性來源主要包括誘變化學品、紫外線和電離輻射(IR)。細胞周期檢查點能夠檢測DNA損傷，提示其存在，并***延緩細胞周期進程的通路，修復DNA損傷，或通過誘導細胞死亡來消除基因不穩(wěn)定細胞。 哺乳動物細胞DNA損傷反應(DDR)信號的**是共濟失調***擴張癥突變(ATM)和ATM-和rad3相關(ATR)蛋白激酶...

由于circMAPK1在GC細胞系中穩(wěn)定表達，我們推測circMAPK1可能是一種適合GC診斷或預后的標志物。qRT-PCR顯示circMAPK1在*組織中的表達低于匹配的非*組織(圖1m)。Kaplan-Meier生存分析顯示胃*組織中circMAPK1水平較高的患者總生存期***延長(圖1n)。綜上所述，circMAPK1是一種穩(wěn)定表達的circRNA，可作為有效的診斷和預后標志物，值得進一步研究。 2）CircMAPK1在體外抑制GC細胞的增殖和遷移 為了研究circMAPK1在GC中的生物學功能，我們進行了一系列細胞實驗。隨CCK8實驗(圖2a)、集落形成實驗(圖2b)...

這些基因的體細胞突變狀態(tài)如圖所示。平均突變頻率比較高的基因是TP53（31.4%）、PTEN（5.7%）、NOTCH1（3.6%）、CTNNB1（3.6%）、XIST（3.4%）和MALAT1（3.4%）。還觀察到在子宮內膜體*（UCEC）中有相對較高的突變頻率（7.6%）。 在泛*中構建 m6A 亞型和特征 我們使用K-means算法分別將患者分為不同的m6A亞型。Elbow法確定了三種亞型。對數秩檢驗發(fā)現，在排除死亡比例的**后，27種**中有24種**的定義亞型與總生存率***相關?

結果顯示，過表達miR-337-3p和miR-137抑制了HMGA2、TGF-bII、p-Smad3和Snail的表達(圖6E和6F)。agomir-3373p/137處理和sh-MIR210HG-或sh- HMGA2處理Ishikawa和HEC-1A細胞中，b-catenin在細胞核中的分布減少，E-cadherin的表達增加。然后，我們研究了MIR210HG是否通過改變miR-337-3p/137-HMGA2軸來影響EMT進展。Western blotting和免疫熒光結果顯示，MIR210HG的下調降低了Ishikawa和HEC1A細胞中HMGA2蛋白的表達，而加入miR-337-3p/...

此外，IF 分析還表明 FIR 過表達和敲低可以明顯逆轉 circACTN4 上調和下調對 MYC 表達的影響。IF發(fā)現與*旁組織相比，在BC 組織中 MYC 高表達。WB分析表明，FIR的上調和下調可以通過過表達和沉默circACTN4來抵消對MYC及其下游蛋白CDK4和CCND2表達的增強和抑制作用。綜上所述，上述結果進一步證明circACTN4可能與FUBP1競爭性結合，阻斷FIR對MYC的轉錄抑制作用，從而促進BC的**發(fā)生和進展。 CircACTN4促進體內異種移植**的發(fā)生和轉移 為了評估circACTN4在體內的致*作用，通過皮下注射和尾靜脈注射在裸鼠中建立人BC...

Nup62表達引起的Tbph的錯位和聚集也讓我們檢測了Nup62表達是否影響Tbph的溶解度。Nup62 OE或對照果蠅大腦的可溶性-不可溶性分選顯示，與對照相比，Nup62在運動神經元中表達的上調***增加了不溶性，從而改變了Tbph的可溶性(圖4F和G)，表明Nup62水平是Tbph溶解度的重要決定因素。qPCR證實了Nup62的過表達(圖4H)。NUP62與內源性TDP-43共聚合(圖4I)。與單獨mRuby相比，NUP62在HEK293T細胞中的表達導致TDP-43的溶解性***改變(圖4J和K）。檢測了nup62介導的TDP-43聚集物在HEK293T細胞中是否被磷酸化。內源性與NU...

C.為了評估這種差異對每種方法獲得的數據的影響，在TSS和CTCF轉錄因子結合位點附近覆蓋了Tn5足跡。在透性細胞中，TSS的信號被保留，但是與孤立的核相比，TSS的側翼位置(被鄰近的核小體占據)的信號減少了 D.用白細胞分離純化的pbmc比用Ficoll梯度離心純化的pbmc始終具有更高的FRIP評分和更少的非細胞條形碼。 E.F.FACS獲得的完整通透細胞具有比較高的frp和FRITSS評分，**少的非細胞條形碼和比較大的細胞捕獲效率，線粒體閱讀量*略有增加. circNDUFB2與IGF2BPs相互作用促進泛素/蛋白酶體介導的IGF2BPs降解.江蘇甘油三酯標書 ...

4）circPDE4B促進了RIC8A和MID1之間的三元配合物的形成，促進了RIC8A的降解 我們試圖鑒定參與RIC8A蛋白酶體降解的E3連接酶。有趣的是，MS結果顯示circPDE4B也結合了兩個E3連接酶，包括RNF2和MID1。然而，由于RNF2定位于細胞核內，我們選擇MID1進行進一步研究。實際上，通過免疫沉淀分析，MID1被發(fā)現與RIC8A結合(圖4A)。RIC8A和MID1的免疫熒光染色也證實了它們在HCs***定位(圖4B)。IP結果表明，MID1敲低有效地削弱了RIC8A和MID1過表達的泛素化作用，增加了RIC8A泛素化作用(圖4C)。Co-IP實驗也顯示，與對照...

作者進行了PAR-CLIP實驗，以評估SLC7A11 mRNA-YTHDC2相互作用是否依賴于m6A甲基化。結果表明，在H1299細胞中，通過過表達METTL3來提高m6A的甲基化水平，促進YTHDC2與SLC7A11 mRNA的結合(圖6D)。無論METTL3是否過表達，YTH結構域的缺失都阻斷了SLC7A11 mRNA-YTHDC2的相互作用(圖6D)。作者通過SLC7A11 3’-UTR探針進行RNA-pull down實驗，發(fā)現YTHDC2WT，優(yōu)先結合于含有m6A的SLC7A11 mRNA的3'UTR，而不是含有未甲基化腺苷的mRNA(圖6E)。此外，YTHDC2傾向于結合m6A共識...

CircCwc27通過與Pur-α結合來調控AD基因的轉錄以往研究發(fā)現，Pur-α有助于記憶保持和加強學習能力，并抑制APP的表達。結合組著的研究結果發(fā)現，CircCwc27可以與Pur-α結合，過表達Pur-α在很大程度上抑制了CircCwc27基因的表達，改善了Aβ負荷和認知功能下降的情況。作者推測，在AD患者中，Pur-α是CircCwc27下游的調節(jié)因子，可以調控aβ和記憶相關基因。為了驗證這一假設，作者對APP/PS1小鼠的海馬體進行了lv-sh-Circcon-和LV-shCircCwc27-注射，并進行RNA-seq，篩選出鑒定了339個差異表達基因。有意思的是，CircCwc2...

此外，抑制Warburg 效應（紫草素）顯著降低了外泌體濃度和外泌體 circ_0072083 水平，但促進 Warburg 效應（TNF-α）起到了相反的作用。此外，外泌體濃度與葡萄糖濃度和 Warburg 效應水平呈正相關。先前的報告表明，表皮生長因子 (EGF) 和齊墩果酸 (OA) 可以增強或抑制外泌體分泌。在這里，發(fā)現了EGF和OA促進或抑制U251 / TR和U87 / TR細胞Warburg效應。此外，EGF 介導的外泌體分泌促進通過抑制 Warburg 效應（紫草素）而減輕；和 OA 介導的外泌體分泌抑制通過促進 Warburg 效應（TNF-α）被逆轉。這些數據表明，在 TM...

此外，低氧誘導乳腺*細胞中依賴ZNF217的NANOG 和KLF4 的mRNA m6A甲基化抑制，且ALKBH5敲除***降低免疫缺陷小鼠乳腺*的肺轉移[24]。在肺*中，METTL3能夠促進肺腺*細胞的生長、生存和侵襲，但還不清楚它是否作為 m6A 調節(jié)器或效應器發(fā)揮作用[25]。在急性髓細胞白血病（AML）患者中，m (6) A 調控基因的突變或拷貝數變化與TP53 突變存在密切聯(lián)系，且m (6) A 調控基因的改變與AML不良預后相關[26]。此外，FTO在AML中高表達，它通過降低mRNA轉錄本中的m(6)水平，調節(jié)ASB2和RARA等靶點的表達，增強了白血病*基因介導的細胞轉化和白血...

5.沉默lnc-PMIF促進老年OPCs向骨形成表面遷移，促進老年小鼠骨形成 BMSCs中沉默lnc-PMIF，增殖無變化，OPCs成骨能力不改變，細胞遷移數量高，表明沉默lnc-PMIF可增強老年OPCs的遷移能力，而不干擾老年OPCs的體外增殖和成骨分化。接受si-PMIF處理的老年BMSCs的小鼠中骨形成表面Dil+細胞數***升高，提示沉默lnc-PMIF可促進老年OPCs在體內向骨形成表面遷移，大部分遷移的Dil+細胞中檢測到Runx2表達，表明si-PMIF處理的老年BMSCs遷移到骨形成表面發(fā)生正常的成骨分化，這將有助于小鼠的骨形成。接受si-PMIF處理的老年BMSC...

FOXP4在MB細胞中起致*基因的作用 我們首先通過qPCR檢測FOXP4在MB**組織中的表達水平。FOXP4在MB**組織中的表達水平高于相鄰腦組織樣本。為了進一步闡明靶向FOXP4是否可以介導MB**進展，我們在Daoy細胞中進行了一系列功能檢測。使用siRNA抑制FOXP4表達導致細胞增殖、遷移和侵襲減少，而細胞凋亡率增加。這些結果強烈表明沉默FOXP4表型復制了miR-101-3p和miR-423-5p過表達對**進展的抑制作用。綜上所述，這些結果表明FOXP4可能是MB**發(fā)生中的致*基因。 CircRNA在NSCLC發(fā)生、發(fā)展中誘導免疫反應的行為和機制尚未見報道.WNT...

氧化應激與阿爾茨海默病(AD)的發(fā)病機制有關。線粒體功能障礙與AD期間神經毒性中的氧化應激和活性氧(ROS)有關。線粒體代謝受損與AD腦損傷中的線粒體功能障礙有關。雖然已確定NOX4在腦損傷中的作用，但NOX4調控AD中星形膠質細胞鐵死亡的機制尚不清楚。因此，小編給大家介紹于2021年3月發(fā)表于影響因子為9.986的“Redox Biology”上的文章“NOX4 promotes ferroptosis of astrocytes by oxidative stress-induced lipid peroxidation via the impairment of mitochondria...

circRNA是一種新型的非編碼RNA，已被報道通過多種機制參與疾病的發(fā)生和發(fā)展。MAPK通路是一種常見的信號轉導通路，參與細胞增殖、炎癥和凋亡，在**中起著特別重要的作用。然而，與MAPK通路相關的circRNA在胃*中的作用尚未被探索。因此，小編為大家?guī)硪黄?021年4月發(fā)表于影響因子為15.302的雜志Molecular Cancer上的文章“A novel protein encoded by circMAPK1 inhibits progression of gastric cancer by suppressing activation of MAPK signaling”。在...

五、NF-κB調節(jié)表達VCAM1的近端小管亞群的分子特征 檢測了一組近端小管細胞，VCAM1的表達和染色質可及性增加，我們將其命名為PT_VCAM1(圖1)。免疫熒光研究表明，VCAM1在近端小管上皮中呈散在分布的表達(圖5a)。我們的單細胞研究估計PT_VCAM1占總細胞數的2%，近端小管上皮細胞數的6%。我們還證實，在LTL+ PT細胞中，VCAM1+小管細胞占4.19 1.58%，而在腎皮質的UMOD+ TAL細胞中，VCAM1+細胞未被檢測到(圖5b)。雖然之前的研究表明VCAM1在亨利氏襻(dTL)的降肢表達，但我們*通過AQP1對腎臟切片進行鏈紋檢測，觀察到VCAM1在d...

3、心肌LncHrt過表達挽救心肌梗死的轉錄組 為了探究LncHrt的分子機制，作者對LncHrt過表達的MI發(fā)生7天后的心臟組織和對照組進行了基因組RNA測序，鑒定差異表達基因（DEGs）。KEGG分析顯示這些上調的DEGs主要富集到代謝相關通路，如代謝通路、碳代謝、氧化磷酸化、TCA循環(huán)、糖酵解、脂肪酸代謝等，下調的DEGs則***富集于心臟病理通路，如ECM-受體相互作用和焦點粘連。GO分析也表明上調DEGs***富集于代謝過程和心臟肌肉組分，下調DEGs則富集在免疫系統(tǒng)過程和炎癥響應等，表明LncHrt過表達可能通過介導心臟代謝途徑改善MI發(fā)生后的心功能。為了驗證這一假設，對...

造血干細胞早期命運決定的機制在很大程度上尚不清楚。據推測，譜系特異性轉錄因子(TFs)在噪聲閾值以上的隨機表達可以鎖定一個細胞進入一個獨特的細胞命運。與此相一致的是，在多能造血細胞中觀察到與拮抗譜系相關的基因的共表達，包括關鍵的TFs，這表明在多能細胞室中存在一些細胞亞群，這些亞群允許細胞在譜系承諾之前的命運相反，這一現象被稱為啟動。**近，人類hspc的單細胞RNA測序(scRNA-seq)引入了一個不同的啟動概念。對成人骨髓和胎兒肝臟造血的研究已經確定了造血干細胞和多能祖細胞(MPPs)的亞群，這些亞群具有協(xié)調表達的標記基因，特異于不同的單胎分化程序，并沿著所有分化分支逐漸增加。有一些跡象...

并同年在同期刊中發(fā)表，遷移體在斑馬魚原腸胚形成中影響***形態(tài)發(fā)生，Tspan4a和Tspan7（遷移體生成相關基因）突變體斑馬魚的***形態(tài)發(fā)生受損，并闡明遷移體誘導胚胎細胞至正確的位置，從而影響***形態(tài)發(fā)生[5]。2019年俞立團隊還發(fā)表了關于遷移體標志物的文章[6]，該文章闡明了人血清中存在遷移體；與外泌體相比，遷移體中存在四種特異性蛋白：NDST1、EOGT、PIGK和CPQ。 2021年5月，俞立團隊在Cell期刊（IF=38.637）上發(fā)表文章，文章主要講述在外界刺激下，細胞中受損的線粒體外排至遷移體中[7]。同年6月，俞立團隊利用斷層成像技術研究不同物種的大規(guī)模細胞遷...

為了研究 PGE2 是否有助于 M2 活化，來自野生型 (WT) 和Il4ra -/-小鼠的BM 衍生巨噬細胞 (BMDM)在體外與 PGE2 一起經受 IL4/IL13。PGE2 單獨不影響 M2 ***，但**增強了 IL4/IL13 觸發(fā)的 M2 ***。更有趣的是，IL4/IL13 促進了巨噬細胞中ptgs2 的表達，在 PGE2 的存在下可以進一步升高。PGE2 通過與稱為 E-前列腺素 (EP) 1-4 受體的 4 種不同 G 偶聯(lián)受體結合而發(fā)揮作用。不同受體的亞型決定了不同細胞類型的特定生理反應。通過使用特定的 EP 抑制劑，我們確定 PGE2 促進 M2 極化主要由 EP2 受...

點擊該結構的圖像可以獲得放大的圖像。為了幫助用戶精細化搜索，PROTAC-DB還包含基于物理化學的過濾工具屬性(例如分子量、log P、log S、拓撲極性表面積)，包含了搜索結果中每個屬性的最小值和最大值。對于PROTAC，除了二維結構、化合物ID和靶蛋白外，數據表中還顯示了生物活性，包括降解能力、結合親和力和細胞活性。該數據表可以根據生物活動的值進行排序。對于彈頭和E3配體，搜索結果中只顯示了初始結構。修改后PROTAC中的結構匯總在其相應的詳細信息頁面中。此外，數據表中還顯示了初始結構的生物活性。同樣，也可以根據這些標準對數據表進行排序。對于Linker，數據表中只顯示了2D結構、化合物...

英拜生物提供婦科疾病風險評估8項檢測：妊娠糖尿病、子宮內膜異位、多囊卵巢綜合征等。 技術原理：基因芯片(genechip)是目前生物芯片家族中**完善、應用*****的芯片，將許多特定的寡聚核苷酸或DN**段(稱為探針)固定在芯片的每個預先設置的區(qū)域內，將待測樣本標記后同芯片進行雜交，利用堿基互補配對原理進行雜交，通過檢測雜交信號并進行計算機分析，從而檢測對應片段是否存在、存在量的多少，以用于疾病的臨床診斷和檢測等眾多方面。運用縮微技術，基因芯片能夠同時分析成千上萬個生物樣本，將許多不連續(xù)的分析過程集成于玻璃介質上，使這些分析過程連續(xù)化、微型化、集成化和自動化。 LAG抗體***富集...

1.FBW7促進胰腺*細胞脂質過氧化作者以分析在SW1990轉染pCMV-FBW7或空載體(GEO:accessionnumbersGSE76443)的高通量基因表達譜陣列研究FBW7在胰腺*中的作用。以谷胱甘肽代謝和脂肪酸代謝相關的氨基酸為重點，結果顯示，FBW7WT和FBW7T205A下調絲氨酸、蛋氨酸、甘氨酸和胱氨酸，而FBW7R465H對絲氨酸、蛋氨酸、甘氨酸和胱氨酸無影響。這些氨基酸可被催化生成谷胱甘肽。作者檢測了PANC-1和SW1990穩(wěn)定細胞系異位表達空載體FBW7WT或FBW7T205A的GSH/GSSG比值，結果發(fā)現FBW7WT和FBW7T205A導致GSH/GSSG比值增...

基序分析發(fā)現E2F TF基序在乙酰化降低相關區(qū)域***富集，在T細胞記憶驅動因子相關基序乙酰化增加，包括含叉頭框因子(Fig. 2F)。為了確定這些變化是否伴隨著對不同細胞狀態(tài)的長期表觀遺傳影響，在CDK4/6抑制后對體外活化的T細胞進行了ATAC-seq，觀察到染色質開放性的整體降低，T細胞記憶相關基因區(qū)域的開放性增加，包括Tcf7、Ccr7和Sell (Fig. 2G)。為了解開CDK4/6抑制后記憶和效應特征的明顯二分法，在暴露于CDK4/6i 24h后，對體外活化T細胞進行了單細胞RNA-seq。該分析顯示存在CDK4/6i處理后改變的不同T細胞亞群，簇2、4、5和8增加，簇0減少，以...

在MAD1與未連接的動點結合后，MAD2從開放的構象狀態(tài)(O-MAD2)轉化為封閉的構象狀態(tài)(C-MAD2)，SAC信號被緊密調控和放大。MAD2的構象變化啟動了它與CDC20的結合。為了直接測試RIT1是否抑制了MAD2與CDC20或MAD1的關聯(lián)，進行了競爭性pull-down實驗來測試RIT1-MAD2和MAD2-CDC20/MAD1結合之間的互斥性(圖4A和4B)。MAD2結合肽1(MBP1)是一種模擬CDC20和MAD1相互作用基序(MIM)的高親和合成肽，它取消了MAD2-rit1的結合。評估了RIT1與O-或c-狀態(tài)穩(wěn)定的MAD2突變體的結合(圖4C)。用過量的RIT1c端尾肽孵...

腸道菌群與結直腸*(CRC)之間的關聯(lián)已被***研究。然而，用于多個人群的早期診斷標記仍然難以捉摸。本研究對1056例糞便樣本進行了綜合分析，以確定與CRC相關的微生物作為早期檢測CRC的標志物。 1.meta-analysis 對來自4項研究的16srRNA測序進行分析，評估隨著CRC進展（無疾病-腺瘤-結直腸*）腸道微生物的變化，并鑒定出針對腺瘤的為微生物標志物。 2.構建腺瘤微生物模型 除了使用差異ASV作為關鍵指標，模型構建中還包括α多樣性指數（Shannon指數，Simpson指數和ObservedASV）以及三個患者臨床指標（年齡，性別和體重指數（BMI...

再次從老年和年輕小鼠中分離BMSCs，Dil染色劑標記后體外增殖，脛骨內注射到另一批年輕小鼠中，三天后收獲脛骨對成骨標志物Runx2進行熒光免疫染色。發(fā)現老年BMSCs處理的小鼠中Dil標記細胞降低，表明老化過程中OPCs向骨形成表面的遷移能力降低。大部分遷移到骨形成表面的Dil標記細胞表達Runx2，表明OPCs遷移到骨形成表面發(fā)生成骨分化，有助于體內骨形成。與年輕BMSCs相比，老年BMSCs的體外遷移能力明顯受損，Macf1***下調，從Macf1基因位點轉錄而來的長鏈非編碼RNA PMIF（即lnc-PMIF）表達***增高。上述提示，衰老過程中小鼠骨形成的減少伴隨著OPCs向骨形成表...

1）circPDE4B在OA組織中表達較低 我們之前對3個臨床OA和3個對照樣本的軟骨細胞核糖體RNA缺失的總RNA進行了RNA-seq分析。在數量**多的50個***調控異常的circRNA中，circPDE4B的表達水平排名***。我們評估了每個病例的OA嚴重程度(圖1A)。同時，我們進行了組織形態(tài)學和熒光原位雜交實驗，結果顯示軟骨降解程度增加對應軟骨細胞中circPDE4B的表達降低(圖1B)。RT-qPCR檢測到嚴重OA組織軟骨細胞中circPDE4BRNA水平下調，而mPDE4BmRNA水平保持相對一致(圖1C)。綜上所述，circPDE4B的表達與OA的嚴重程度呈負相關。...

編碼PI3Kαp110α亞基的PIK3CA在多達40%的乳腺*中發(fā)生突變，**常見的是雌***受體陽性(ER+)**。突變的PIK3CA在校正ER陽性等有利風險變量時并不是預后的**標記物，但它是改善晚期ER+乳腺*內分泌和PI3K聯(lián)合***應答的預測生物標記物。有趣的是，與PTEN等其他PI3K通路改變的**相比，pikca突變ER+乳腺*顯示出極少的AKT***和對AKT信號的依賴。 NPP4B抑制AKT信號，并在三陰性(ER/PR/HER2)和基底樣乳腺*中表現出**抑制活性。此外，INPP4B蛋白在黑色素瘤、卵巢*和前列腺*中表達減少。在小鼠模型中，Inpp4b消融與Tp53...