作者進行了PAR-CLIP實驗，以評估SLC7A11 mRNA-YTHDC2相互作用是否依賴于m6A甲基化。結果表明，在H1299細胞中，通過過表達METTL3來提高m6A的甲基化水平，促進YTHDC2與SLC7A11 mRNA的結合(圖6D)。無論METTL3是否過表達，YTH結構域的缺失都阻斷了SLC7A11 mRNA-YTHDC2的相互作用(圖6D)。作者通過SLC7A11 3’-UTR探針進行RNA-pull down實驗，發(fā)現(xiàn)YTHDC2WT，優(yōu)先結合于含有m6A的SLC7A11 mRNA的3'UTR，而不是含有未甲基化腺苷的mRNA(圖6E)。此外，YTHDC2傾向于結合m6A共識基元GGAC (圖6E)。通過在H1299和H1975細胞中進行METTL3的功能增加和丟失實驗，發(fā)現(xiàn)細胞內(nèi)SLC7A11 mRNA-YTHDC2的相互作用是由m6A水平?jīng)Q定的(圖6F和G)。這些數(shù)據(jù)表明YTHDC2優(yōu)先與m6A甲基化的SLC7A11 mRNA結合。circNDUFB2可能在NSCLC的進展中起***作用。細胞增殖標書江蘇
***我們來講一篇刊登在Nucleic Acids Research題名為MarkerDB: an online database of molecular biomarkers的文章。MarkerDB是一個整合已知臨床和選定的臨床前分子生物標志物的數(shù)據(jù)庫，包括四種主要類型的分子生物標記（化學，蛋白質，DNA [遺傳]和核型）和四種生物標記類別（診斷，預測，預后和暴露）。MarkerDB提供的信息包括：生物標志物名稱和同義詞，相關條件或病理，詳細的疾病描述，詳細的生物標志物描述，生物標志物特異性，敏感性和ROC曲線，標準參考值（對于蛋白質和化學標志物），變體（對于SNP或遺傳標志物） ），序列信息（用于遺傳和蛋白質標記），分子結構（用于蛋白質和化學標記），組織或生物流體來源（用于蛋白質和化學標記），染色**置和結構（用于遺傳和核型標記），臨床批準狀態(tài)和相關文獻參考。細胞增殖標書江蘇神經(jīng)絲(NF-200)是神經(jīng)元軸突中富含的細胞特異性蛋白。
有趣的是，我們發(fā)現(xiàn)內(nèi)源性PGK1蛋白水平和LINC00926水平在5種乳腺*細胞系(MCF-7、T47D、ZR75-1、MDA-MB-453、MDA-MB-231)中均呈負表達。在相對轉移性細胞系MDA-MB-231中PGK1表達量比較高，LINC00926表達量比較低；而惡性程度較低的細胞系MCF-7中PGK1表達量較低，LINC00926表達量較高(圖1G)。敲除LINC00926后，MCF-7細胞中PGK1的表達***增加，而過表達LINC00926后，MDA-MB-231細胞中PGK1的表達***降低(圖1H)。這些結果表明，LINC00926下調(diào)PGK1的表達，可能與PGK1介導的乳腺*發(fā)展呈負相關。
6）FOXO3A通過調(diào)控乳腺*細胞中LINC00926的表達抑制增殖、遷移和侵襲，抑制糖酵解
我們研究了FOXO3A是否通過LINC00926調(diào)節(jié)這些效應。細胞增殖和集落形成分析顯示FOXO3A過表達抑制了乳腺*細胞的生長，而LINC00926敲低則促進了細胞的生長(圖6A和6B)。重要的是，下調(diào)LINC00926***減弱了FOXO3A調(diào)控細胞增殖的能力，表明FOXO3A主要通過表達LINC00926來降低乳腺*細胞的增殖。接下來，我們通過LINC00926檢測FOXO3A是否抑制細胞遷移、侵襲和糖酵解。如預期，F(xiàn)OXO3A減少了乳腺*細胞的遷移和侵襲(圖6C和6D)。敲除LINC00926**削弱了FOXO3A抑制細胞遷移和侵襲的能力。FOXO3A過表達抑制葡萄糖攝取、乳酸生成和ATP生成，降低ECAR和增加OCR。然而，敲除LINC00926極大地減弱了FOXO3A調(diào)節(jié)細胞遷移、侵襲和糖酵解的能力(圖6C-6G)。綜上所述，F(xiàn)OXO3A抑制乳腺*細胞的遷移和侵襲，以及糖酵解主要依賴于LINC00926。 環(huán)狀RNA（circRNA）是一類共價閉合的單鏈RNA.
特色lncRNA基因
LncExpDB 表征了在特定細胞系/組織中特異性表達、在**或病毒***背景下差異表達、在特定細胞器中富集、在細胞分化或胚胎/***發(fā)育過程中動態(tài)表達或隨晝夜節(jié)律周期性表達的特征 lncRNA 基因韻律。基于大量RNA-seq數(shù)據(jù)，共鑒定出25191個特征lncRNA，其中***發(fā)育7922個，正常組織/細胞系7498個，亞細胞定位5292個，植入前胚胎4343個，*細胞系2907個，1740個晝夜節(jié)律，外泌體中為 1538，細胞分化中為 1232，病毒***中為 985。
LncRNA-mRNA相互作用
為了促進對特征 lncRNA 分子機制的深入研究，LncExpDB 通過共表達網(wǎng)絡預測 lncRNA-mRNA 相互作用。LncExpDB 總共包含 28 443 865 個預測的 lncRNA-mRNA 相互作用；這些相互作用中的大多數(shù) (96.4%) 存在于一種生物環(huán)境中，并且在五種環(huán)境中發(fā)現(xiàn)了 12 種相互作用。 circSDHC是一個很有前景的RCC患者潛在的預后生物標志物和***靶點。西安流式標書
FMT處理可以改善脊髓損傷小鼠的運動恢復。細胞增殖標書江蘇
在MAD1與未連接的動點結合后，MAD2從開放的構象狀態(tài)(O-MAD2)轉化為封閉的構象狀態(tài)(C-MAD2)，SAC信號被緊密調(diào)控和放大。MAD2的構象變化啟動了它與CDC20的結合。為了直接測試RIT1是否抑制了MAD2與CDC20或MAD1的關聯(lián)，進行了競爭性pull-down實驗來測試RIT1-MAD2和MAD2-CDC20/MAD1結合之間的互斥性(圖4A和4B)。MAD2結合肽1(MBP1)是一種模擬CDC20和MAD1相互作用基序(MIM)的高親和合成肽，它取消了MAD2-rit1的結合。評估了RIT1與O-或c-狀態(tài)穩(wěn)定的MAD2突變體的結合(圖4C)。用過量的RIT1c端尾肽孵育MAD2蛋白，并用凝膠過濾分離(圖4D)。RIT1M90I***降低了MAD2-CDC20和BubR1-CDC20的相互作用(圖4E和4F)；表明致病RIT1蛋白水平阻礙MCC的完整性，符合RIT1從CDC20中隔離MAD2并促進MCC拆卸的模型。用重組RIT1補充這些提取物增加了CyclinB1和Securin的泛素化和降解，表明APC/C活性增加，可能是由于MCC抑制緩解(圖4G)。RIT1缺失細胞顯示CyclinB1降解延遲(圖4H)。此外，RIT1M90I的表達加速了正常細胞生長下CyclinB1的降解(圖4I);然而，其對CyclinB1降解的影響在藥理學誘導的有絲分裂阻滯下被消除(圖S4M)，這表明致病性水平的RIT1不能抑制過度活躍的SAC反應。細胞增殖標書江蘇
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺，提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度，保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性，為您的標書奠定較好的基礎
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4.二代測序：轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗