CircCwc27通過與Pur-α結(jié)合來調(diào)控AD基因的轉(zhuǎn)錄以往研究發(fā)現(xiàn),Pur-α有助于記憶保持和加強(qiáng)學(xué)習(xí)能力,并抑制APP的表達(dá)。結(jié)合組著的研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),CircCwc27可以與Pur-α結(jié)合,過表達(dá)Pur-α在很大程度上抑制了CircCwc27基因的表達(dá),改善了Aβ負(fù)荷和認(rèn)知功能下降的情況。作者推測,在AD患者中,Pur-α是CircCwc27下游的調(diào)節(jié)因子,可以調(diào)控aβ和記憶相關(guān)基因。為了驗(yàn)證這一假設(shè),作者對APP/PS1小鼠的海馬體進(jìn)行了lv-sh-Circcon-和LV-shCircCwc27-注射,并進(jìn)行RNA-seq,篩選出鑒定了339個(gè)差異表達(dá)基因。有意思的是,CircCwc27敲低后,APP和膜金屬內(nèi)肽酶(Mme)這兩個(gè)負(fù)責(zé)Aβ代謝的基因也受到調(diào)節(jié)。不僅如此,學(xué)習(xí)和記憶方面的基因表達(dá)量***上調(diào)。而結(jié)果進(jìn)一步發(fā)現(xiàn),在APP/PS1小鼠和AD患者中,大部分CircCwc27調(diào)控基因的表達(dá)都發(fā)生了改變。DHEA和tempol處理可影響腸道微生物的β-多樣性。Caspase-11標(biāo)書廣州
作者構(gòu)建了 (WT) SLC7A113’-UTR和突變型(Mut) 3’-UTR兩種質(zhì)粒(圖6H)。結(jié)果表明,只有過表達(dá)YTHDC2WT降低SLC7A11 mRNA在H1299細(xì)胞中的穩(wěn)定性,敲除YTHDC2可以提高SLC7A11 mRNA在H1975細(xì)胞中的穩(wěn)定性。然而,與WT 3’-UTR相比,Mut報(bào)告基因的這些作用減弱(圖6I和J)。在檢測外源性F-Luc-SLC7A11融合mRNA的RNA穩(wěn)定性后,得到了類似的結(jié)果(圖6K-M)??偟膩碚f,3’-UTR上的m6A位點(diǎn)對于YTHDC2使SLC7A11 mRNA不穩(wěn)定至關(guān)重要。
7.抑制YTHDC2對XC-系統(tǒng)靶向***敏感,并與LUAD進(jìn)展相關(guān)
為了評估YTHDC2抑制在LUAD中的重要性,從cohort#1隨機(jī)抽取20例YTHDC2lowLUAD,其中50%屬于腺泡型(圖7A)。在cohort#2中,與相鄰組織相比,**中YTHDC2表達(dá)下調(diào),62%(62/100)的腺泡組織被歸類為YTHDC2low(圖7B、C)。與無這種表達(dá)模式的腺泡性LUAD患者相比,YTHDC2low的患者總生存期要短得多(圖7D),進(jìn)一步表明YTHDC2抑制可能對腺泡性LUAD的**進(jìn)展尤為重要。另外,相對于*旁組織,**中腺泡LUAD組織中SLC7A11mRNA和蛋白水平表達(dá)量都比較高(圖7E、F)。 武漢電鏡標(biāo)書PCOS大鼠血清水蘇糖水平升高。
奧沙利鉑耐藥是結(jié)直腸*(CRC)患者***中的一個(gè)挑戰(zhàn)。調(diào)節(jié)性T細(xì)胞(Treg)以其免疫抑制作用而聞名,靶向Treg是提高化療敏感性的有效途徑。Treg是一種提高化學(xué)敏感性的有效方法。外泌體遞送的miRNA被用作預(yù)測化療敏感性的潛在生物標(biāo)志物。然而,Treg和外泌體miRNAs之間的關(guān)系仍然很大程度上是未知的。本研究結(jié)果表明,**分泌的miR-208b通過靶向PDCD4促進(jìn)Treg擴(kuò)增,這可能與CRC中奧沙利鉑化療敏感性的降低有關(guān)本。這些發(fā)現(xiàn)突出了外泌體miR-208b作為奧沙利鉑***反應(yīng)的預(yù)測生物標(biāo)志物的潛在作用,并且它們是免疫***的新靶點(diǎn)。本研究于2021年4月發(fā)表于《Molecular Therapy》IF: 8.986期刊上。
為了確認(rèn)ACTN4在BC中的生物學(xué)功能,構(gòu)建了ACTN4過表達(dá)和干擾質(zhì)粒,為了探究 circACTN4 的作用與 ACTN4 無關(guān),進(jìn)行了共轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn),結(jié)果表明 ACTN4 敲低不影響促進(jìn)作用circACTN4 對 MYC 轉(zhuǎn)錄的過度表達(dá),ACTN4 的上調(diào)并沒有逆轉(zhuǎn) qRT-PCR 和蛋白質(zhì)印跡對 circACTN4 敲低對 MYC 表達(dá)的抑制作用。WB結(jié)果表明circACTN4可以促進(jìn)MYC及其下游蛋白CDK4和CCND2的表達(dá)。這些數(shù)據(jù)表明 circACTN4 可以與 FUBP1 結(jié)合并促進(jìn) MYC 的表達(dá)。
circACTN4 和 FIR 與 FUBP1
競爭結(jié)合推測circACTN4可以與FUBP1競爭性結(jié)合并阻止FIR與FUBP1結(jié)合以促進(jìn) MYC的轉(zhuǎn)錄和表達(dá)。為了進(jìn)一步驗(yàn)證提出的假設(shè),qRT-PCR檢測了BC和匹配組織中FIR的表達(dá),與正常相鄰組織相比,BC組織中FIR的表達(dá)顯著下調(diào)。Pearson相關(guān)分析表明,F(xiàn)IR的表達(dá)與BC組織中circACTN4、FUBP1和MYC的水平呈負(fù)相關(guān)。免疫共沉淀試驗(yàn)結(jié)果表明,在過表達(dá)circACTN4的BC細(xì)胞的FUBP1-共免疫共沉淀物中未發(fā)現(xiàn)明顯的FIR蛋白帶,而在circACTN4被敲低后,通過蛋白質(zhì)印跡在共免疫共沉淀物中明顯檢測到FIR,這表明上調(diào)的circACTN4顯著削弱FIR與 FUBP1的結(jié)合,同時(shí)下調(diào) circACTN4 顯著加強(qiáng)了 FUBP1 和 FIR 之間的相互作用。 circNDUFB2作為一個(gè)支架增強(qiáng)IGF2BP蛋白與TRIM25的結(jié)合。
**近的研究表明INPP4B可能在與化療耐藥性相關(guān)的急性髓系白血病(AML)中起致*作用,以及在黑素瘤和結(jié)腸*中起致*作用。而且可能與環(huán)境有關(guān)。例如,在乳腺*中,SGK3被擴(kuò)增,它的激酶活性依賴于致*的PI3K和INPP4B。**近,INPP4B被確定為與ER+乳腺*和**分級相關(guān)的前列基因。
2021年5月,在Naturecommunications雜志上發(fā)表了文章“INPP4BpromotesPI3Kα-dependentlateendosomeformationandWnt/β-cateninsignalinginbreastcancer”。此報(bào)道探討了INPP4B在ER+乳腺*中的作用,揭示了一組pik3c突變ER+乳腺*表現(xiàn)出INPP4B表達(dá)增加。盡管同時(shí)抑制AKT信號,但過表達(dá)INPP4B可以促進(jìn)pik3a突變ER+乳腺*細(xì)胞系的增殖和**生長。為了研究這一明顯的悖論,使用了蛋白質(zhì)組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)和先進(jìn)的細(xì)胞成像的綜合方法來闡明INPP4B促進(jìn)pik3a突變ER+乳腺*發(fā)生的分子機(jī)制。結(jié)果顯示INPP4B刺激晚期核內(nèi)體上pi3kα依賴的信號樞紐,指導(dǎo)Wnt/β-catenin的***。這些研究揭示了促進(jìn)細(xì)胞增殖和**生長的兩種致*信號通路之間的串?dāng)_機(jī)制。 注射circSDHC敲低*細(xì)胞的小鼠比對照組表現(xiàn)出更少的惡病質(zhì).西安FISH標(biāo)書
DHEA處理的大鼠給予200 mg/kg水蘇糖12天.Caspase-11標(biāo)書廣州
細(xì)胞間的相互作用在**進(jìn)展和轉(zhuǎn)移中發(fā)揮關(guān)鍵作用。目前關(guān)于這些**細(xì)胞是如何與其他細(xì)胞相互交流的仍有很多是未知的。**釋放的外泌體被認(rèn)為是**進(jìn)行細(xì)胞間溝通的有效介質(zhì)。Dong等探索了肝細(xì)胞*(HCC)外泌體在其轉(zhuǎn)移和預(yù)后價(jià)值中的功能。本文于2021年6月發(fā)表在《Signal Transduction and Targeted Therapy》期刊上,IF:13.493。
1、外泌體的分離與鑒定以及HCC細(xì)胞的釋放和吸收
使用投射電子顯微鏡觀察了外泌體的形態(tài)和形狀;納米粒子**分析發(fā)現(xiàn)外泌體直徑在40-200nm之間,并且在6個(gè)HCC細(xì)胞系外泌體中都檢測到了外泌體標(biāo)志物CD63,CD9,和Alix的表達(dá);然后使用DIO標(biāo)記高轉(zhuǎn)移性HCC細(xì)胞的外泌體(HMH-exo)和低轉(zhuǎn)移性HCC細(xì)胞外泌體(LMH-exo),在激光掃描共焦顯微鏡下觀察到綠色標(biāo)記的HMH-exo和LMH-exo都可以被低轉(zhuǎn)移性HCC細(xì)胞細(xì)胞系有效吸收(圖1)。這些結(jié)果表明已經(jīng)成功分離和純化HCC來源的外泌體并且他們可以被其它HCC細(xì)胞吸收。 Caspase-11標(biāo)書廣州
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4.二代測序:轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn):DNA甲基化實(shí)驗(yàn)(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證,過表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)