二、胎兒造血過(guò)程中分化軌跡的推斷 接下來(lái)，研究者使用力導(dǎo)向圖繪制算法推斷了人類(lèi)胚胎發(fā)育期間造血細(xì)胞的分化軌跡。結(jié)果顯示HSCs/MPPs位于軌跡頂端，并且在HSCs/MPPs下游，研究者鑒定了三個(gè)高度增殖的寡能祖細(xì)胞群，即MEMPs（紅系細(xì)胞、MKs和肥大細(xì)胞）；GPs（粒細(xì)胞）；LMPs（淋巴樣細(xì)胞、單核細(xì)胞和樹(shù)突狀細(xì)胞）(圖2A和2B）。并使用Scanpy的paga_path函數(shù)顯示了沿三條分化途徑（MEMPs、GPs和LMPs）的譜系特異性基因動(dòng)態(tài)表達(dá)(圖2C）。MEMPs將hsc / mpp與MKs、紅細(xì)胞和肥大細(xì)胞連接起來(lái)。與此一致的是，HSC/MPP向MEMPs轉(zhuǎn)化的差異...

caspase-3抗體是一種***用于檢測(cè)凋亡細(xì)胞的標(biāo)志物。確實(shí)，MMTVneu**的caspase-3陽(yáng)性細(xì)胞比相應(yīng)的Pten+/+少;綜上所述，這些結(jié)果表明，PTEN不能被ATM磷酸化的細(xì)胞對(duì)基因毒性應(yīng)激誘導(dǎo)的細(xì)胞凋亡具有抗性。為了評(píng)估表達(dá)PTEN-398A且DNA損傷未解決的細(xì)胞在輻照(圖2B,C和補(bǔ)充圖4B,C)后的持續(xù)存在是否是誘導(dǎo)凋亡反應(yīng)失敗的結(jié)果，我們?cè)贗R之前先用泛caspase抑制劑z-VAD-FMK(zVAD)對(duì)細(xì)胞進(jìn)行預(yù)處理。與DMSO處理相比，zVAD增加了PTEN-WT細(xì)胞中未解決的DNA損傷灶的數(shù)量，其水平與DMSO處理的PTEN-398A細(xì)胞相當(dāng)(補(bǔ)充圖5F)。然...

熒光原位雜交和核胞質(zhì)RNA分?jǐn)?shù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示，MIR210HG在Ishikawa細(xì)胞和HEC-1A細(xì)胞中均位于核和細(xì)胞質(zhì)內(nèi)(圖3D和3E)。我們假設(shè)MIR210HG對(duì)miRNAs起海綿作用。為了探究MIR210HG是否參與了一個(gè)新的MIR210HG- miRNA -HMGA2調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，我們使用TargetScan、miRanda、CLIP-Seq和miRDB生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)預(yù)測(cè)與HMGA2結(jié)合的mirna(圖3F)。選擇3個(gè)軟件程序分析交叉處的miRNAs作為候選miRNAs。通過(guò)將野生型雙熒光素酶載體介導(dǎo)的HMGA2構(gòu)建物共轉(zhuǎn)染HEK293T細(xì)胞，共鑒定和篩選了110個(gè)miRNAs。轉(zhuǎn)染后，...

LINC00926通過(guò)***乳腺*細(xì)胞中PGK1的表達(dá)來(lái)***增殖、遷移和侵襲為了研究LINC00926在乳腺*細(xì)胞中的生物學(xué)功能，我們用LINC00926***細(xì)胞，對(duì)其進(jìn)行細(xì)胞生長(zhǎng)、遷移和侵襲分析。細(xì)胞增殖和集落形成實(shí)驗(yàn)顯示，過(guò)表達(dá)LINC00926可降低MDA-MB-231和MCF-7細(xì)胞的增殖(圖2A和2B)。在LINC00926轉(zhuǎn)染的細(xì)胞系中，PGK1的表達(dá)可逆轉(zhuǎn)上述作用。過(guò)表達(dá)LINC00926也顯示出遷移和侵襲能力下降(圖2C和2D)。同樣，PGK1在LINC00926轉(zhuǎn)染的細(xì)胞中重新表達(dá)逆轉(zhuǎn)了這些作用。此外，敲除PGK1還可以***LINC00926調(diào)控乳腺*細(xì)胞增殖、遷移和侵...

5）缺氧主要通過(guò)FOXO3A轉(zhuǎn)錄抑制LINC00926的表達(dá)，***PGK1的表達(dá) 由于缺氧是**的一個(gè)關(guān)鍵現(xiàn)象，我們確定了LINC00926/PGK1軸是否在缺氧下糖酵解的調(diào)節(jié)中發(fā)揮作用。缺氧刺激了PGK1在mRNA和蛋白水平上的表達(dá)，并降低了LINC00926的表達(dá)(圖5A)。為了確定缺氧如何抑制乳腺*細(xì)胞中LINC00926的表達(dá)，我們研究了缺氧后對(duì)LINC00926啟動(dòng)子的抑制。對(duì)不同的LINC00926啟動(dòng)子缺失報(bào)告基因的分析顯示，啟動(dòng)子區(qū)域在300-200bp之間包含一個(gè)缺氧抑制元件(圖5B)。該區(qū)域假定的FOXO3A結(jié)合位點(diǎn)的突變會(huì)導(dǎo)致抑制的喪失。在常氧或缺氧條件下，F(xiàn)...

6、MAO-A阻斷**免疫***-人類(lèi)TAM和臨床數(shù)據(jù)相關(guān)性研究 為了探索MAO-A阻斷***的翻譯潛力，首先研究了MAO-A對(duì)人巨噬細(xì)胞極化的調(diào)控。分析體外培養(yǎng)的免疫刺激M1樣和免疫抑制M2樣人單核細(xì)胞源性巨噬細(xì)胞的基因表達(dá)特征。有趣的是，在所有檢測(cè)的免疫檢查點(diǎn)、免疫刺激和免疫抑制基因中，MAOA是M2樣單核來(lái)源巨噬細(xì)胞（MDMs）中表達(dá)水平比較高的基因（圖6a），提示MAO-A可能在促進(jìn)人巨噬細(xì)胞免疫抑制極化中發(fā)揮作用。MDM培養(yǎng)的時(shí)間過(guò)程分析證實(shí)了巨噬細(xì)胞分化過(guò)程中MAO-A基因和蛋白表達(dá)上調(diào)，并在IL-4/IL-13誘導(dǎo)的免疫抑制極化后進(jìn)一步上調(diào)（圖6b-d）。用苯乙肼阻斷M...

PGE2增強(qiáng)IL4Rα信號(hào)以增強(qiáng)巨噬細(xì)胞的M2*** 巨噬細(xì)胞能夠響應(yīng)可變的局部微環(huán)境信號(hào)從一種功能表型切換到另一種功能表型。除了經(jīng)典的信號(hào)級(jí)聯(lián)（例如，IL4/IL4Rα），巨噬細(xì)胞還可以整合由細(xì)胞外刺激觸發(fā)的代謝線索，以***它們的M2表型。在這里，我們想知道PGE2是否也參與了AP損傷后胰腺巨噬細(xì)胞的M2極化。為此，我們首先檢查了AP損傷后PGE2的動(dòng)態(tài)表達(dá)。COX1和COX2是產(chǎn)生前列腺素的兩種關(guān)鍵酶。在這里我們發(fā)現(xiàn)Ptgs2(COX2)的表達(dá)在第3天達(dá)到峰值，而Ptgs1(COX1)的表達(dá)在第1天下降并在第3天回到基礎(chǔ)水平。一致地，免疫熒光分析顯示PGE2在第3天升高，并在第...

采用LEfSe方法分析經(jīng)DHEA和tempol處理后***改變的關(guān)鍵系統(tǒng)發(fā)育類(lèi)型。Desulfovibrionaceae屬富集于oil+ PBS組，而Muribaculaceae 和Alloprevotella屬富集于DHEA+ PBS和DHEA+ tempol組 (圖5A-B)，這表明tempol可以重塑微生物PCOS大鼠的腸道微生物群的結(jié)構(gòu)。 通過(guò)分析細(xì)菌分類(lèi)在門(mén)和屬水平上的相似性程度，進(jìn)一步比較三組腸道菌群的整體組成。在門(mén)水平上，厚壁菌門(mén)(Firmicutes)和擬桿菌門(mén)(Bacteroidetes)是3個(gè)類(lèi)群的優(yōu)勢(shì)門(mén)(圖5)。DHEA處理增加了放線菌門(mén)(Actinobacte...

A.29名兒童在進(jìn)行異體造血干細(xì)胞移植前、移植時(shí)、移植后即刻以及后期隨訪時(shí)均進(jìn)行了監(jiān)測(cè)。監(jiān)測(cè)患者的基線特征、臨床結(jié)果、免疫細(xì)胞計(jì)數(shù)以及炎癥和***標(biāo)志物。表S1(附加文件1)詳細(xì)描述了患者特征。宿主免疫系統(tǒng)參數(shù)與腸道、口腔和鼻腔微生物群的縱向動(dòng)力學(xué)相關(guān)，這些微生物群在指定的時(shí)間點(diǎn)進(jìn)行了評(píng)估。B.每個(gè)身體部位HSCT前、移植時(shí)和移植后的細(xì)菌α多樣性以log10變換后的y軸顯示。星號(hào)表示時(shí)間點(diǎn)間的中值逆Simpson指數(shù)存在***差異。C.相對(duì)于HSCT的時(shí)間點(diǎn)LDA分析。對(duì)于糞便樣本，HSCT后立即采集的樣本LDA評(píng)分為陽(yáng)性。對(duì)于口腔和鼻腔樣本，在HSCT前和后期隨訪時(shí)間點(diǎn)樣本的LDA評(píng)分均為陽(yáng)...

用戶(hù)界面SC2disease提供瀏覽器和搜索引擎，以查詢(xún)有關(guān)不同疾病中特定于細(xì)胞類(lèi)型的基因的詳細(xì)信息，具體流程如圖。 “疾病”和“單元格類(lèi)型”是SC2disease瀏覽器的根類(lèi)別?！凹膊　备?lèi)別中總共包括25種疾病，通過(guò)單擊疾病名稱(chēng)可以顯示與所關(guān)注疾病相關(guān)的特定于細(xì)胞類(lèi)型的基因的詳細(xì)信息。**初將所有細(xì)胞類(lèi)型分為16組，以幫助想要瀏覽特定細(xì)胞類(lèi)型中標(biāo)記基因的研究人員。還可以使用“搜索”功能搜索他們感興趣的疾病，基因或細(xì)胞類(lèi)型。每個(gè)基因的信息將在表格中以一行顯示，其中包括疾病名稱(chēng)，實(shí)驗(yàn)組織，細(xì)胞類(lèi)型，基因名稱(chēng)，用于描述基因表達(dá)的變量名稱(chēng)（log 2 FC或均值），變量的值，DEG比較，...

紡錘體裝配檢查點(diǎn)(SAC)作為一個(gè)傳感器的**的著絲點(diǎn)延遲有絲分裂進(jìn)入后期，直到適當(dāng)?shù)娜旧w分離得到保證。這一安全機(jī)制的破壞導(dǎo)致基因組不穩(wěn)定和非整倍體，這是胚胎死亡、先天性出生缺陷、智力殘疾和**的遺傳原因。然而，盡管了解了控制SAC的基本機(jī)制，但信號(hào)通路如何直接與有絲分裂檢查點(diǎn)活動(dòng)相互作用和調(diào)節(jié)仍是未知的。在對(duì)細(xì)胞外刺激的反應(yīng)中，參與細(xì)胞生長(zhǎng)、生存和分化的多種信號(hào)通路網(wǎng)絡(luò)被***，這一過(guò)程***受到Ras家族小鳥(niǎo)苷三磷酸酶(GTPases)的調(diào)控。RIT1是一種ras相關(guān)的GTPase，調(diào)節(jié)細(xì)胞存活和應(yīng)激反應(yīng)，是通過(guò)有絲分裂和適當(dāng)?shù)娜旧w分離及時(shí)進(jìn)展的必要條件。RIT1在有絲分裂期間從質(zhì)膜(...

3）DRD2重新編碼MφM1表型，下調(diào)IL-6和IL-10 據(jù)報(bào)道，DRD2可調(diào)節(jié)M1的極化。結(jié)果顯示，在DRD2表達(dá)水平較高的BrCa組織中，M1Mφ的浸潤(rùn)增加，M2Mφ的浸潤(rùn)減少(圖3A)。為進(jìn)一步研究DRD2對(duì)TAMs的調(diào)控作用，構(gòu)建了BrCa與Mφ共培養(yǎng)體系。當(dāng)Mφ與表達(dá)DRD2的BrCa細(xì)胞共培養(yǎng)時(shí)，qRT-PCR顯示M1表型標(biāo)記增加，M2Mφ標(biāo)記下調(diào)(圖3B-C)。qRT-PCR也證實(shí)了載體轉(zhuǎn)染的BrCa細(xì)胞將Mφ調(diào)節(jié)為M2型(圖3C)[12]。WB結(jié)果顯示，表達(dá)DRD2的BrCa細(xì)胞上調(diào)M1標(biāo)記iNOS，下調(diào)M2標(biāo)記CD206(圖3D)。IF染色顯示，與表達(dá)DRD2的*...

在Jurkat和小鼠T細(xì)胞中檢測(cè)到多個(gè)肽上特異性磷酸化位點(diǎn)的***缺失，包括典型的CDK4/6靶標(biāo)RB和RBL 1/2 (Fig. 3D-F)。值得注意的是，RB在兩種細(xì)胞蛋白組學(xué)中重疊，并且是全基因組CRISPR/Cas9篩選*****的（Fig. 3B，3G），表明CDK4/6i介導(dǎo)的記憶形成是由RB介導(dǎo)。因此，靶向敲除RB1，可以消除CD62L的表達(dá)上調(diào)(Fig. 3H)。3’RNA-seq分析顯示RB缺失廢除了轉(zhuǎn)錄對(duì)CDK4/6i的響應(yīng)，包括SELL，其被CDK4/6i誘導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄改變被RB缺失所大幅度減弱了(Fig. 3I)。與此一致，靶向敲除RB1也廢除了***的初級(jí)小鼠CD8+T細(xì)...

YTHDF1水平的降低導(dǎo)致MGC-803移植**的**進(jìn)展延遲(補(bǔ)充圖S2D和S2E)；與對(duì)照組相比，YTHDF1缺陷**的重量和體積***減少(圖2D)。因此，在YTHDF1缺陷**中，增殖標(biāo)記物Ki-67下調(diào)，凋亡標(biāo)記物cleavedcaspase-3上調(diào)(圖2E)。通過(guò)兩種轉(zhuǎn)移模型探討YTHDF1是否參與了胃*的體內(nèi)轉(zhuǎn)移。尾靜脈注射MGC-803-sicontrol細(xì)胞導(dǎo)致肺轉(zhuǎn)移，而注射MGC-803-siYTHDF1l細(xì)胞幾乎完全消除轉(zhuǎn)移淋巴結(jié)的形成。***建立了PDX模型，發(fā)現(xiàn)敲除YTHDF1抑制了**的生長(zhǎng)和重量。上述結(jié)果表明YTHDF1在胃*發(fā)生中起重要作用。circNDUFB2...

在確定了UCP1與AKI中的脂質(zhì)積累負(fù)相關(guān)后，我們?cè)噲D闡明其潛在的關(guān)系。首先，我們使用UCP1特異性過(guò)表達(dá)慢病毒載體和UCP1激動(dòng)劑CL316243構(gòu)建UCP1上調(diào)的細(xì)胞模型(圖3A)。如圖3B所示，UCP1過(guò)表達(dá)***降低了順鉑暴露HK2的脂質(zhì)積累。UCP1激動(dòng)劑CL316243也得到了類(lèi)似的結(jié)果。這些結(jié)果表明，UCP1參與了AKI中脂質(zhì)積累的調(diào)節(jié)。為了進(jìn)一步驗(yàn)證這一調(diào)控關(guān)系，提高證據(jù)的可靠性，我們采用腎多點(diǎn)注射UCP1特異性過(guò)表達(dá)腺病毒的方法建立AKI過(guò)表達(dá)UCP1的動(dòng)物模型(圖3C-D)。油紅O染色顯示，過(guò)表達(dá)UCP1可***緩解AKI動(dòng)物模型中的脂質(zhì)積累(圖3E)。***，使用UCP1...

這些基因的體細(xì)胞突變狀態(tài)如圖所示。平均突變頻率比較高的基因是TP53（31.4%）、PTEN（5.7%）、NOTCH1（3.6%）、CTNNB1（3.6%）、XIST（3.4%）和MALAT1（3.4%）。還觀察到在子宮內(nèi)膜體*（UCEC）中有相對(duì)較高的突變頻率（7.6%）。 在泛*中構(gòu)建 m6A 亞型和特征 我們使用K-means算法分別將患者分為不同的m6A亞型。Elbow法確定了三種亞型。對(duì)數(shù)秩檢驗(yàn)發(fā)現(xiàn)，在排除死亡比例的**后，27種**中有24種**的定義亞型與總生存率***相關(guān)?

9.阻斷SUMOylation抑制EVs介導(dǎo)的ELNAT1誘導(dǎo)的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移 用si-NC或si-UBC9#1轉(zhuǎn)染的對(duì)照或ELNAT1過(guò)表達(dá)UM-UC-3細(xì)胞分泌的EVs處理HLECs，結(jié)果顯示過(guò)表達(dá)ELNAT1***促進(jìn)了體外BCa細(xì)胞分泌的EVs誘導(dǎo)淋巴血管生成，而沉默UBC9逆轉(zhuǎn)了這一作用（Figure9A-C）。IVIS證明UM-UC-3-EVELNAT1增強(qiáng)了體內(nèi)腘窩淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移，而沉默UBC9抑制了這種作用（Figure9D,E）。UM-UC-3-EVELNAT1+siUBC9#1組的腘窩LNs體積比UM-UC-3-EVELNAT1組?。‵igure9F）。與UM-UC-3-...

七、急性腎損傷和慢性腎臟疾病患者PT_VCAM1的比例升高 對(duì)小鼠缺血再灌注損傷(IRI)實(shí)驗(yàn)中獲得的大量RNA-seq進(jìn)行反卷積，以確定PT_VCAM1的比例是否與急性腎損傷有關(guān)。BisqueRNA使用基于scRNA-seq參考的反褶積方法從整體RNA-seq中估算細(xì)胞類(lèi)型的豐度。PT_VCAM1估計(jì)比例在iri后24h***增加，并持續(xù)至少7天;與正常近端小管細(xì)胞比例下降相對(duì)應(yīng)(圖7a)。有趣的是，未手術(shù)控制小鼠腎臟中PT_VCAM1的估計(jì)比例在老齡小鼠中增加(圖7b)。用BisqueRNA對(duì)非**腎樣本進(jìn)行反卷積，估計(jì)PT_VCAM1細(xì)胞的比例為2.6%(圖7d)，這與我們的s...

USP35敲除增加了脂質(zhì)活性氧的產(chǎn)生和丙二醛的產(chǎn)生(圖2D)。過(guò)量的活性氧導(dǎo)致多不飽和脂肪酸氧化損傷并分裂成各種產(chǎn)物，包括HETEs。我們觀察到，USP35沉默促進(jìn)了H460和H1299細(xì)胞中5-HETE、11-HETE和15-HETE的釋放，而不影響12-HETE的釋放(圖2F)。GSH/GPX4為基礎(chǔ)的ROS***機(jī)制在防止鐵缺乏期間的脂質(zhì)過(guò)氧化中起著不可或缺的作用。研究表明在USP35缺乏的細(xì)胞中GSH水平降低并伴隨著對(duì)GPX4活性的抑制(圖2G，H)。此外，shUSP35***細(xì)胞中的鐵和Fe2+水平***高于對(duì)照組。相比之下，補(bǔ)充GSH或鐵螯合劑***減少了shUSP35***細(xì)胞的...

H&E染色顯示oil+ PBS組卵巢在不同發(fā)育階段均出現(xiàn)卵泡和少量新鮮黃體(圖1C)。與對(duì)照組相比，DHEA + PBS組的囊泡數(shù)量較多，黃體數(shù)量較少。另一方面，tempol處理減少了囊泡的數(shù)量，增加了黃體的形成(圖1C-E)。檢測(cè)了血清睪酮、eE2、LH、PRGE、FSH 5種性類(lèi)固醇***水平。DHEA + PBS組血清睪酮水平明顯高于oil+ PBS組。Tempol***降低PCOS大鼠血清睪酮和eE2水平，但對(duì)血清LH、PRGE、FSH水平無(wú)明顯影響(圖1F)。DHEA處理的大鼠血清膽汁酸水平***降低，但這種減弱在DHEA + tempol組消失了(圖1G)。在DHEA + PBS組...

遷移體（migrasome）是清華大學(xué)生命科學(xué)院俞立團(tuán)隊(duì)新發(fā)現(xiàn)的胞外分泌囊泡，該研究成果已于2015年發(fā)表在Cell Research期刊（IF=20.509）[1]。遷移體是在遷移細(xì)胞后部回縮纖維的前列或交叉處生長(zhǎng)的大囊泡，直徑約為0.5μm到3μm，并且包含許多較小的囊泡（**多300余個(gè)，**少不足10個(gè)），掃描電子顯微鏡觀察下呈石榴狀結(jié)構(gòu)。細(xì)胞遷移后，回縮纖維**終斷裂，遷移體分離。遷移體及其內(nèi)容物，包括細(xì)胞溶質(zhì)成分和來(lái)源不明的囊泡，被釋放到細(xì)胞外空間——這一過(guò)程稱(chēng)為遷移。俞立團(tuán)隊(duì)推測(cè)遷移體可能在細(xì)胞間通訊中發(fā)揮重要作用。 2017年俞立團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)，整合素與 ECM ...

***的shrna介導(dǎo)的Hrs耗散(補(bǔ)充圖6a, b)導(dǎo)致gfp載體細(xì)胞中cd63陽(yáng)性晚期核內(nèi)體減少，并將GFPINPP4B細(xì)胞中晚期核內(nèi)體形成增加的水平逆轉(zhuǎn)為gfp載體控制水平(圖5a, b)。在非錨定細(xì)胞生長(zhǎng)試驗(yàn)中，耗用Hrs shRNA對(duì)gfp載體軟瓊脂集落的大小沒(méi)有影響，但減少了GFP-INPP4B細(xì)胞集落的大小，這與Hrs依賴(lài)的細(xì)胞增殖一致(圖5c, d)。將MCF-7細(xì)胞注射到雌性BALB/c裸小鼠腹股溝第四乳腺脂肪墊中，在體內(nèi)檢測(cè)**生長(zhǎng)的hrs依賴(lài)性。與GFPvector相比，GFP-INPP4B在體內(nèi)**體積和體外**重量***增加(3倍)(圖5e g)。雖然敲除Hrs沒(méi)有影...

值得注意的是，與對(duì)照組相比，NOX4的升高增加了鐵的積累，這是鐵死亡的特異性標(biāo)志(圖7D)。接下來(lái)，我們使用3D分析儀分析NOX4上調(diào)后人星形膠質(zhì)細(xì)胞細(xì)胞毒性的形態(tài)學(xué)變化(圖7E)。相對(duì)于對(duì)照，NOX4的升高誘導(dǎo)了細(xì)胞毒性的形態(tài)學(xué)特征，包括細(xì)胞質(zhì)面積縮小和起泡(圖7E)。此外，與對(duì)照組相比，NOX4升高后，形態(tài)死亡細(xì)胞數(shù)量***增加(圖7F)。與形態(tài)學(xué)分析結(jié)果一致，相對(duì)于對(duì)照，NOX4的升高***增加了細(xì)胞毒性水平(圖7G)。這些結(jié)果表明，NOX4通過(guò)氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的人星形膠質(zhì)細(xì)胞脂質(zhì)過(guò)氧化促進(jìn)了鐵死亡。 結(jié)論：NOX4通過(guò)線粒體代謝損傷，氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的脂質(zhì)過(guò)氧化作用促進(jìn)星形膠質(zhì)細(xì)胞的...

在確定了UCP1與AKI中的脂質(zhì)積累負(fù)相關(guān)后，我們?cè)噲D闡明其潛在的關(guān)系。首先，我們使用UCP1特異性過(guò)表達(dá)慢病毒載體和UCP1激動(dòng)劑CL316243構(gòu)建UCP1上調(diào)的細(xì)胞模型(圖3A)。如圖3B所示，UCP1過(guò)表達(dá)***降低了順鉑暴露HK2的脂質(zhì)積累。UCP1激動(dòng)劑CL316243也得到了類(lèi)似的結(jié)果。這些結(jié)果表明，UCP1參與了AKI中脂質(zhì)積累的調(diào)節(jié)。為了進(jìn)一步驗(yàn)證這一調(diào)控關(guān)系，提高證據(jù)的可靠性，我們采用腎多點(diǎn)注射UCP1特異性過(guò)表達(dá)腺病毒的方法建立AKI過(guò)表達(dá)UCP1的動(dòng)物模型(圖3C-D)。油紅O染色顯示，過(guò)表達(dá)UCP1可***緩解AKI動(dòng)物模型中的脂質(zhì)積累(圖3E)。***，使用UCP1...

鑒于以上結(jié)果，作者想進(jìn)一步探究tiRNA-Gly與RBM17作用的分子結(jié)果。結(jié)果顯示，tiRNA-Gly可提高總RBM17蛋白的水平，但是不影響RBM17的mRNA水平（圖3H-I）。隨后，用蛋白質(zhì)合成抑制劑環(huán)己胺(CHX)處理細(xì)胞，tiRNA-Gly轉(zhuǎn)染后增加了K1細(xì)胞內(nèi)源性RBM17蛋白的半衰期，而β-actin作為對(duì)照（圖3J）。此外，蛋白酶體抑制劑MG132處理后，內(nèi)源性RBM17在轉(zhuǎn)染tiRNA-Gly的K1細(xì)胞中的積累量**高于轉(zhuǎn)染siRNA-NC的K1細(xì)胞，表明tiRNA-Gly抑制了蛋白酶體依賴(lài)性的PTC細(xì)胞中RBM17的降解（圖3K）。此外，tiRNA-Gly的過(guò)表達(dá)***抑...

2、miR-138-5p介導(dǎo)*細(xì)胞誘導(dǎo)的巨噬細(xì)胞KDM6B表達(dá)抑制構(gòu)建了miR-138-5p過(guò)表達(dá)的乳腺*細(xì)胞系，取其培養(yǎng)基與巨噬細(xì)胞共培養(yǎng)，結(jié)果巨噬細(xì)胞中miR-138-5p表達(dá)***上調(diào)，同時(shí)KDM6B的表達(dá)***下降。證實(shí)miR-138-5p介導(dǎo)*細(xì)胞誘導(dǎo)的巨噬細(xì)胞KDM6B表達(dá)抑制。 3、*細(xì)胞來(lái)源的外泌體miR-138-5p下調(diào)KDM6B的表達(dá) 隨后為了判定上述巨噬細(xì)胞中miR-138-5p表達(dá)上調(diào)的原因，檢測(cè)了巨噬細(xì)胞中原代(pri-)和前體(pre-)miR-138的水平。結(jié)果顯示共培養(yǎng)和對(duì)照組間原代和前體miR-138的水平?jīng)]有差異，表明miR-138-5p是外...

核磷蛋白(Nucleophosmin，NPM1)是急性髓系白血病(AML)中**常見(jiàn)的突變基因，會(huì)導(dǎo)致編碼的核仁蛋白(NPM1c+)發(fā)生異常胞漿易位。NPM1c +維持一個(gè)獨(dú)特的白血病基因表達(dá)程序，以***HOXA/B簇和MEIS1*基因?yàn)樘卣鳎龠M(jìn)白血病發(fā)生。然而，NPM1c+控制這種基因表達(dá)模式促進(jìn)白血病發(fā)生的機(jī)制仍在很大程度上未知。本文揭示了HOXBLINC lncRNA***在NPM1c +白血病中扮演促*作用。HOXBLINC和其合作者M(jìn)LL1是NPM1c+ AML的潛在***靶點(diǎn)。本文于2021年3月發(fā)表在《Nature Communications》IF:14.919。脊髓損傷（...

MAP4K4是絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶家族的成員，可以通過(guò)磷酸蛋白MEKK1***MAPK通路。構(gòu)建pCMV-NM_4834.4和pCMV-NM_1242560.1質(zhì)粒，分別轉(zhuǎn)染K1細(xì)胞，并通過(guò)qRT-PCR驗(yàn)證了其轉(zhuǎn)染效率（圖6E）。這兩種變異***增強(qiáng)了K1細(xì)胞的增殖和遷移。而截?cái)嘈?NM_4834.4)比長(zhǎng)型(NM_1242560.1)對(duì)增殖和遷移的影響更強(qiáng)（圖6F-G）。此外，MEKK1、MKK4、JNK、MEK、ERK的總磷酸化水平未發(fā)生改變，而NM_4834.4和NM_1242560.1兩種變體轉(zhuǎn)染組的磷酸化水平均高于對(duì)照組。更重要的是，與NM_1242560.1相比，NM_48...

CRC中circPLCE1的特征及臨床意義 為了識(shí)別CRC中差異表達(dá)的circRNA，我們使用正常的人類(lèi)腸道上皮細(xì)胞系和CRC細(xì)胞系進(jìn)行了總RNA測(cè)序。我們確定研究對(duì)象為circPLCE1(hsa_circ_0019223，命名為circPLCE1)。我們分析了85對(duì)CRC樣本中的circPLCE1表達(dá)，證實(shí)了88.2%(75/85)的CRC患者中circPLCE1表達(dá)下調(diào)。進(jìn)一步分析顯示，circPLCE1在晚期臨床期或T期患者中表達(dá)下調(diào)。使用qRT-PCR分析circPLCE1在正常人腸上皮細(xì)胞株和CRC細(xì)胞株中的表達(dá)水平差異，得到了相似的結(jié)果。circPLCE1由PLCE1外顯...

確定關(guān)鍵驅(qū)動(dòng)突變?cè)谠己蚦ommitted亞型中的分布(圖1C，補(bǔ)充討論中的亞型和突變部分和補(bǔ)充表6 17)。盡管亞型中富含某些突變(原始組的FLT3-ITD和承諾組的DNMT3A)，驅(qū)動(dòng)突變的遺傳改變對(duì)原始和committed亞型的預(yù)測(cè)較差(補(bǔ)充圖3 16和補(bǔ)充討論)，基因突變和亞型之間的Matthews相關(guān)系數(shù)(MCC)較低(FLT3-ITD的MCC = 0.32, DNMT3A的MCC = 0.16;在precision-recall曲線(AUPRC = 0.62)值下，突變與亞型之間的多變量分析得到一個(gè)薄弱區(qū)域(Supplementary Fig. 7)。FMT處理加速SCI小鼠的胃腸...