CRC中circPLCE1的特征及臨床意義
為了識別CRC中差異表達(dá)的circRNA，我們使用正常的人類腸道上皮細(xì)胞系和CRC細(xì)胞系進(jìn)行了總RNA測序。我們確定研究對象為circPLCE1(hsa_circ_0019223，命名為circPLCE1)。我們分析了85對CRC樣本中的circPLCE1表達(dá)，證實(shí)了88.2%(75/85)的CRC患者中circPLCE1表達(dá)下調(diào)。進(jìn)一步分析顯示，circPLCE1在晚期臨床期或T期患者中表達(dá)下調(diào)。使用qRT-PCR分析circPLCE1在正常人腸上皮細(xì)胞株和CRC細(xì)胞株中的表達(dá)水平差異，得到了相似的結(jié)果。circPLCE1由PLCE1外顯子2反向剪接而成。通過Sanger測序證實(shí)了circPLCE1的反向拼接連接。PLCE1的環(huán)狀轉(zhuǎn)錄本只能通過擴(kuò)增引物在cDNA中擴(kuò)增。circPLCE1還能抵抗RNaseR酶切。半衰期試驗(yàn)進(jìn)一步表明，circPLCE1比circPLCE1線性mRNA更穩(wěn)定。通過核質(zhì)量分離試驗(yàn)和熒光原位雜交(FISH)檢測了circPLCE1的定位，結(jié)果顯示circPLCE1在CRC細(xì)胞的細(xì)胞質(zhì)中富集。此外，circPLCE1在臨床晚期或T期患者中表達(dá)較低。KaplanMeier曲線結(jié)果顯示，CRC患者circPLCE1表達(dá)較低與較差的生存率相關(guān)。這些數(shù)據(jù)驗(yàn)證了circPLCE1的特征和臨床意義。 circRNAs在**的發(fā)展和進(jìn)展中發(fā)揮著重要的調(diào)控作用.焦亡生物相關(guān)標(biāo)書創(chuàng)新服務(wù)
為了探討UCP1與AKI之間的相關(guān)性，我們在體內(nèi)、體外檢測了UCP1在AKI模型中的表達(dá)。結(jié)果顯示，UCP1在AKI小鼠中***下調(diào)，更重要的是，隨著腎損傷的加重，其表達(dá)量逐漸降低(圖2E-F)。在體外，隨著順鉑刺激時間的延長，HK2細(xì)胞中UCP1的表達(dá)降低(圖2G)。這些結(jié)果表明UCP1與AKI的嚴(yán)重程度呈負(fù)相關(guān)。此外，隨著AKI腎細(xì)胞損傷程度的增加，脂質(zhì)的積累，UCP1的表達(dá)逐漸降低(圖2H)。這一結(jié)果表明，UCP1在AKI中的表達(dá)可能影響脂質(zhì)積累。
3）AKI中的脂質(zhì)積累與UCP1高度負(fù)相關(guān)在確定了UCP1與AKI中的脂質(zhì)積累負(fù)相關(guān)
后，我們試圖闡明其潛在的關(guān)系。首先，我們使用UCP1特異性過表達(dá)慢病毒載體和UCP1激動劑CL316243構(gòu)建UCP1上調(diào)的細(xì)胞模型(圖3A)。如圖3B所示，UCP1過表達(dá)***降低了順鉑暴露HK2的脂質(zhì)積累。 蛋白組學(xué)標(biāo)書免費(fèi)設(shè)計(jì)circNDUFB2敲低可降低細(xì)胞培養(yǎng)上清液中這些細(xì)胞因子的水平。
3）CircMAPK1在體內(nèi)抑制胃*的發(fā)生和轉(zhuǎn)移
為了進(jìn)一步證實(shí)體外研究結(jié)果，我們在體內(nèi)驗(yàn)證了circMAPK1在影響致瘤性方面的生物學(xué)作用。circMAPK1的沉默可***促進(jìn)**的生長。相比之下，過表達(dá)circMAPK1***抑制了皮下**的生長(圖3a)。接下來，我們通過對增殖細(xì)胞標(biāo)記物Ki67的染色來監(jiān)測異種移植瘤的增殖。穩(wěn)定敲除circMAPK1的**組織表現(xiàn)出更強(qiáng)的Ki67染色，而過表達(dá)circMAPK1的**組織表現(xiàn)出更弱的Ki67染色(圖3b和c)。為了研究circMAPK1在體內(nèi)的轉(zhuǎn)移潛能，我們用熒光素酶質(zhì)粒穩(wěn)定地轉(zhuǎn)染上述細(xì)胞系，然后注射到裸鼠的尾靜脈中。結(jié)果顯示，circMAPK1的敲低有效地增加了肺轉(zhuǎn)移病灶的數(shù)量和大小。相比之下，生物發(fā)光成像(圖3d和e)和H&E染色(圖3f和g)顯示，過表達(dá)circMAPK1減少了肺轉(zhuǎn)移病變。
為了進(jìn)一步確定過表達(dá)的Caspase-11是否足以加重MCD誘導(dǎo)的NASH，我們給小鼠使用了Caspase-1抑制劑belnacasan。belnacasan******降低MCD***對照組小鼠的脂肪變性評分(圖8H)。相比之下，belnacasan***不影響MCD處理的Caspase-11過表達(dá)小鼠的脂肪變性評分。同樣，belnacasan處理***降低了MCD處理對照組小鼠的腫脹評分(圖8I)、血清ALT(圖8J)、AST(圖8K)和肝臟甘油三酯(圖8L)，而MCD處理過表達(dá)Caspase-11小鼠的這些指標(biāo)沒有明顯影響。綜上所述，過表達(dá)Caspase-11足以促進(jìn)MCD誘導(dǎo)的小鼠脂肪性肝炎的嚴(yán)重程度。
結(jié)論MCD處理后Caspase-11缺陷小鼠的肝損傷、纖維化和炎癥明顯減輕。Caspase-11缺失可改善NASH患者的肝細(xì)胞焦亡。 我們進(jìn)行了熒光素酶報告基因檢測.
6）NOX4誘導(dǎo)的線粒體代謝損傷通過抑制人類星形膠質(zhì)細(xì)胞的細(xì)胞抗氧化過程而誘導(dǎo)氧化應(yīng)激
我們研究了NOX4誘導(dǎo)的線粒體代謝損傷是否可以通過抑制人體星形膠質(zhì)細(xì)胞的細(xì)胞抗氧化過程來誘導(dǎo)氧化應(yīng)激。與對照組相比，NOX4的升高***降低了谷胱甘肽(GSH)水平和谷胱甘肽/氧化谷胱甘肽(GSSG)的比值(圖6A和B)。NOX4的升高也增加了GSSG的水平(圖6C)。由于NOX4導(dǎo)致GSH減少以及GSH/GSSG比值降低，我們接下來研究NOX4是否可以影響人類星形膠質(zhì)細(xì)胞中NRF2信號通路，這是細(xì)胞抗氧化反應(yīng)的關(guān)鍵調(diào)控因子。與對照組相比，NOX4的升高抑制了NRF2在細(xì)胞質(zhì)中的核易位(圖6D)。此外，NRF2靶基因HO-1和GCL的水平和活性在人星形膠質(zhì)細(xì)胞中被NOX4過表達(dá)***抑制(圖6E和F)。這些結(jié)果表明，NOX4誘導(dǎo)的線粒體代謝損傷通過抑制人星形膠質(zhì)細(xì)胞的細(xì)胞抗氧化過程而誘導(dǎo)氧化應(yīng)激。 檢測circNDUFB2是否作為miRNA海綿調(diào)節(jié)NSCLC的靶標(biāo).單細(xì)胞相關(guān)課題標(biāo)書技術(shù)指導(dǎo)
circNDUFB2敲低促進(jìn)這些表型。焦亡生物相關(guān)標(biāo)書創(chuàng)新服務(wù)
4、白樺素能改善小鼠血液、肝臟和脂肪組織中的脂質(zhì)參數(shù)
測量了血液和其他組織中的脂質(zhì)水平，如圖5所示。洛伐他汀和白樺素處理的小鼠的血清總膽固醇（TC）和甘油三酸酯（TG）的水平顯著低于對照***的小鼠（圖5A和5B）。值得注意的是，與洛伐他汀相似，白樺素降低了LDL膽固醇（LDL-c）的含量并增加了HDL膽固醇（HDL-c）（圖5C和5D）。有趣的是，盡管白樺素和洛伐他汀均降低了肝臟的TC水平，但只有白樺素顯著降低了肝臟的TG含量（圖5E和5F）。組織學(xué)分析表明，白樺素可以減少白色脂肪細(xì)胞組織（WAT）和棕色脂肪細(xì)胞組織（BAT）的細(xì)胞大小，而洛伐他汀*可以減少棕色脂肪細(xì)胞的大?。▓D5G）。油紅色O切片染色表明，與用WD喂養(yǎng)的對照***小鼠的肝臟相比，洛伐他汀或白樺素處理的小鼠的肝臟具有較低的脂質(zhì)蓄積（圖5G）。這與洛伐他汀和白樺素降低肝脂質(zhì)含量的先前數(shù)據(jù)一致（圖5E和5F）。 焦亡生物相關(guān)標(biāo)書創(chuàng)新服務(wù)
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7.實(shí)時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)