METTL3介導(dǎo)APCmRNA上的m6A上調(diào)
為了確定METTL3促進(jìn)**細(xì)胞增殖的機(jī)制,檢測(cè)了METTL3在ESCC細(xì)胞上轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)中的作用。METTL3缺失降低了KYSE180細(xì)胞中m6A的總豐度。甲基化RNA免疫沉淀(MeRIP)和m6A特異性抗體,然后進(jìn)行RNA測(cè)序(MeRIP-seq),發(fā)現(xiàn)KYSE180的mRNA中鑒定的m6A位點(diǎn)與RRACH序列一致。m6A信號(hào)在mRNAs的終止密碼子和3′-非翻譯區(qū)富集。
在MeRIP-seq中METTL3缺失減少了1101個(gè)基因的mRNAs中1199個(gè)m6A峰。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序發(fā)現(xiàn)METTL3缺失調(diào)節(jié)2973個(gè)基因的表達(dá)。二者取交集發(fā)現(xiàn)共有93個(gè)基因重疊。MeRIP-seq中細(xì)胞成分(CC)項(xiàng)的基因本體(GO)富集分析表明,在METTL3缺失的KYSE180細(xì)胞中,β-連環(huán)蛋白降解復(fù)合物(的基因組(包括APC)中m6A水平***降低。 高通量分子實(shí)驗(yàn)的后續(xù)標(biāo)書(shū)申請(qǐng)指導(dǎo)服務(wù)。焦亡課題實(shí)驗(yàn)檢測(cè)服務(wù)
4)USP35過(guò)表達(dá)減少erastin/RSL3觸發(fā)的鐵紊亂和鐵死亡
erastin和RLS3誘導(dǎo)的ROS和MDA生成因USP35過(guò)表達(dá)而減少(圖4A,B)。此外,在erastin和RLS3處理的*細(xì)胞中,HETEs水平升高,但在除12-HETE外的USP35過(guò)表達(dá)的*細(xì)胞中,HETEs水平降低(圖4C,F(xiàn))。然而,USP35過(guò)表達(dá)對(duì)GSH含量和GPX4活性沒(méi)有影響(圖4G,H)。如圖4I,J所示,USP35的過(guò)表達(dá)***減弱了用erastin或RSL3刺激H460和H1299細(xì)胞誘導(dǎo)LIP和Fe2+的作用。與表型改變一致,在基礎(chǔ)條件下,USP35過(guò)表達(dá)對(duì)鐵代謝和鐵死亡也沒(méi)有影響(圖4A,J)。 免疫熒光課題一站式我們接下來(lái)研究了Pex對(duì)HSCs生物學(xué)行為的影響。
7)NOX4通過(guò)氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的人體星形膠質(zhì)細(xì)胞的脂質(zhì)過(guò)氧化促進(jìn)鐵死亡
為了探討NOX4調(diào)控AD星形膠質(zhì)細(xì)胞氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡的分子機(jī)制,我們檢測(cè)NOX4的升高是否能通過(guò)氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的人星形膠質(zhì)細(xì)胞脂質(zhì)過(guò)氧化促進(jìn)鐵死亡。我們用免疫熒光染色法測(cè)定了4-HNE在人星形膠質(zhì)細(xì)胞中的蛋白水平。免疫熒光染色顯示,與對(duì)照組相比,NOX4的升高增加了4-HNE蛋白的水平,增加了質(zhì)膜中脂質(zhì)過(guò)氧化源性液滴的含量,細(xì)胞的形狀出現(xiàn)收縮(圖7A)。NOX4過(guò)表達(dá)使4-HNE陽(yáng)性細(xì)胞數(shù)量***增加(圖7B)。NOX4過(guò)表達(dá)增加了4-HNE水平和MDA水平(圖7C)。值得注意的是,與對(duì)照組相比,NOX4的升高增加了鐵的積累,這是鐵死亡的特異性標(biāo)志(圖7D)。
褪黑素可挽救TBI后皮層的鐵蓄積和神經(jīng)元損傷
為了進(jìn)一步研究褪黑素在TBI后鐵蓄積和神經(jīng)元損傷中的假定作用,在TBI后第3天,在受傷的皮層中觀察到了Fe2+,F(xiàn)e3+,總鐵含量顯著增加。而褪黑素或Lip-1抑制TBI誘導(dǎo)的血清和同側(cè)皮層中鐵含量的上調(diào)的。Perls的藍(lán)色染色表明,TBI后第7天鐵陽(yáng)性細(xì)胞的數(shù)量顯著增加,褪黑素或Lip-1***組的鐵陽(yáng)性細(xì)胞少于對(duì)照組。鑒于TBI誘導(dǎo)的鐵超載伴隨著Fth表達(dá)的上調(diào),使用免疫熒光染色觀察了TBI后神經(jīng)元中Fth的表達(dá)。發(fā)現(xiàn)與假手術(shù)組相比,模型組中Fth陽(yáng)性神經(jīng)元的***增加,而褪黑素和Lip-1處理顯著降低了Fth陽(yáng)性神經(jīng)元。與假手術(shù)組相比,受傷的神經(jīng)元的細(xì)胞體在TBI后7天出現(xiàn)胞質(zhì)萎縮或核固縮。褪黑素和Lip-1處理可減輕這些組織病理學(xué)變化。TBI后第7天,F(xiàn)JB染色測(cè)定腦部神經(jīng)元變性,發(fā)現(xiàn)TBI導(dǎo)致大腦皮層變性神經(jīng)元的數(shù)量增加,但是褪黑素和Lip-1給藥明顯減少了變性神經(jīng)元的數(shù)量。這些數(shù)據(jù)表明褪黑素可防止TBI誘導(dǎo)的鐵蓄積并防止同側(cè)皮質(zhì)的神經(jīng)元損傷。 soRNA測(cè)序的 整套服務(wù)。
CancerSCEM數(shù)據(jù)庫(kù)收集了涵蓋人類20種**類型、總計(jì)208個(gè)**樣本的單細(xì)胞RNA-seq數(shù)據(jù),使得我們可以比較不同**類型之間的細(xì)胞成分和許多功能分子的表達(dá),**終挖掘出一些新的優(yōu)越免疫檢查點(diǎn),可用于未來(lái)針對(duì)特定類型**的臨床免疫***。
單擊導(dǎo)航欄中的“Project Browse”后,將顯示所有收集的**單細(xì)胞 RNA-Seq 列表,信息包括項(xiàng)目 ID、**類型、項(xiàng)目所在國(guó)家、樣本 ID ,樣本詳細(xì)信息,細(xì)胞計(jì)數(shù),文庫(kù)構(gòu)建協(xié)議。
此外,表中的“SampleDetails”和“Analysis”列將分別提供指向每個(gè)數(shù)據(jù)集的**樣本的詳細(xì)信息及其一般分析結(jié)果的超鏈接。
主頁(yè)快速搜索:用戶可以在“Quick Search”欄輸入**類型/基因名/基因ID進(jìn)行快速搜索,將生成相應(yīng)的項(xiàng)目/樣本及其分析結(jié)果和目標(biāo)基因的整體表達(dá)模式;也可以在“Keyword Cloud”中點(diǎn)擊感興趣的關(guān)鍵詞進(jìn)行快速搜索。
在心分析分為基因分析模塊和樣本分析模塊?;蚰K主要針對(duì)樣本中基因表達(dá)、不同**類型中基因表達(dá)、特定樣本中基因表達(dá)相關(guān)性及不同來(lái)源的數(shù)據(jù)數(shù)據(jù)集間基因表達(dá)的差異。結(jié)果數(shù)據(jù)可以進(jìn)行下載。樣本分析模塊包塊細(xì)胞成分比較、細(xì)胞相互作用及生存分析。
Pex衍生的CD44v6/C1QBP復(fù)合物介導(dǎo)了Pex對(duì)肝纖維化和PDAC肝轉(zhuǎn)移的積極作用。星形膠質(zhì)細(xì)胞課題課題設(shè)計(jì)
***ATM對(duì)PTEN的磷酸化增加了DNA損傷后AKT和p27Kip1的***。焦亡課題實(shí)驗(yàn)檢測(cè)服務(wù)
為了確定s-flow和d-flow在體內(nèi)單細(xì)胞分辨率下對(duì)ECs基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)和染色質(zhì)可及性譜的全基因組影響,我們使用小鼠PCL模型進(jìn)行了scRNA-seq和scATAC-seq。將C57BL/6小鼠部分結(jié)扎,以暴露于血流的對(duì)側(cè)RCA作為對(duì)照,在LCA中誘導(dǎo)d-血流。部分結(jié)扎后2天(2D)和2周(2W), rca (2D- r和2W- r)和lca (2D- l和2W- l)用膠原酶酶解獲得單個(gè)細(xì)胞和單個(gè)核,分別用于scRNA-seq和scATAC-seq。
在標(biāo)準(zhǔn)化之后,一個(gè)基于無(wú)監(jiān)督圖的聚類將細(xì)胞劃分成組,通過(guò)統(tǒng)前列形近似和投影(UMAP)圖可視化(圖1A)。我們的UMAP分析確定了16個(gè)獨(dú)特的細(xì)胞簇以流和時(shí)間依賴的方式分布(圖1A和1B)。每個(gè)細(xì)胞簇都是用確定的標(biāo)記基因進(jìn)行鑒定(1C).發(fā)現(xiàn)8個(gè)EC簇(E1E8)、血管平滑肌細(xì)胞(SMCs)、成纖維細(xì)胞(Fibro)、4個(gè)單核/巨噬細(xì)胞(macrophages14)、樹(shù)突狀細(xì)胞(DCs)和T細(xì)胞。通過(guò)Pecam1、Icam2、Cdh5和Tie1的表達(dá)來(lái)鑒定EC簇。smc特異性標(biāo)記為Cnn1、Myl9和Speg。同樣,Medag、Dpep1和Lum作為纖維的標(biāo)記物;巨噬細(xì)胞C1qa,C1qb,C1qc,C5ar1;DCs的Ccr7和Mmp25;T細(xì)胞的Itk(圖1C)。 焦亡課題實(shí)驗(yàn)檢測(cè)服務(wù)
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過(guò)英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái),提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫(xiě)SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開(kāi)發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開(kāi)放參觀,客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度,保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性,為您的標(biāo)書(shū)奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書(shū)申請(qǐng):提供標(biāo)書(shū)課題設(shè)計(jì)、撰寫(xiě),標(biāo)書(shū)部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開(kāi)展,設(shè)計(jì)的標(biāo)書(shū)均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn),中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究
4.二代測(cè)序:轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片:信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn):DNA甲基化實(shí)驗(yàn)(BSP,MSP,焦磷酸測(cè)序),RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證,過(guò)表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測(cè),F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)