miR-335-5p在來源于轉(zhuǎn)移性CRC細(xì)胞的外泌體中高表達(dá)
作者進(jìn)行miRNA測序以確定SW480-exo或SW620-exo中的miRNA表達(dá)譜。結(jié)果發(fā)現(xiàn)SW480-exo和SW620-exo具有顯著不同的miRNA表達(dá)譜，并確定了77個miRNA的倍數(shù)變化大于5。通過定量PCR，證實miR-335-5p在SW620-exo中的表達(dá)比在SW480-exo中更高。并使用來自TCGA數(shù)據(jù)庫的miRNA和mRNA表達(dá)數(shù)據(jù)，證實了CRC中的miR-335-5p相對于正常樣本顯著升高，以及miR-335-5p高表達(dá)的病例的總體存活率較低。為了探索miR-335-5p在CRC中的功能，作者對miR-335-5p高或低表達(dá)的CRC樣本中表達(dá)的基因進(jìn)行了基因集富集分析(GSEA)分析。確定了兩種生物學(xué)途徑的顯著富集：Ras蛋白信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和Ras蛋白信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的調(diào)節(jié)。這些結(jié)果表明SW620外泌體具有較高水平的miR-335-5p，miR-335-5p在CRC中的功能可能與Ras信號通路的***有關(guān)。 公共比較毒理基因組學(xué)數(shù)據(jù)庫。MCD誘導(dǎo)課題基礎(chǔ)實驗外包
為了證明ELNAT1與BCa分泌的EV的關(guān)系，作者從BCa細(xì)胞培養(yǎng)基中分離出EVs，采用透射電子顯微鏡(TEM)、納米粒子**分析(NTA)及對EVs的蛋白標(biāo)志物檢測，證明了作者準(zhǔn)確分離出BCa分泌的EV（Figure 2 J-L）。并且從BCa患者和健康志愿者尿液樣本中分離的EVs中檢測ELNAT1的表達(dá)，發(fā)現(xiàn)ELNAT1在BCa分泌的EV中過表達(dá)（Figure 2 I）。以上數(shù)據(jù)表明，EVs介導(dǎo)的ELNAT1過表達(dá)與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移相關(guān)。
3.EVs介導(dǎo)的ELNAT1促進(jìn)BCa體內(nèi)外淋巴管生成和淋巴轉(zhuǎn)移
為了確定EV介導(dǎo)的ELNAT1是否促進(jìn)體外淋巴管生成，作者用HLECs孵育BCa細(xì)胞分泌的EVs的檢測管形成和遷移。研究發(fā)現(xiàn)，干擾ELNAT1基因會破壞UM-UC-3和T24細(xì)胞分泌EVs誘導(dǎo)HLECs管形成和遷移的能力（Figure3A-C），這些結(jié)果表明EVs介導(dǎo)的ELNAT1誘導(dǎo)了體外淋巴管生成。為 pcr課題第三方實驗室英拜生物對實驗可行性分析。
2021年，美國華盛頓大學(xué)生物醫(yī)學(xué)信息學(xué)與醫(yī)學(xué)教育系和華盛頓大學(xué)兒科等團隊合作在Elife（IF=7.08） 雜志上發(fā)表了文章“Simultaneous trimodal single-cell measurement of transcripts, epitopes, and chromatin accessibility using TEA-seq.”。此報道開發(fā)了一種新的scATAC-seq工作流程，增加了信噪比，并允許對細(xì)胞表面標(biāo)記物和染色質(zhì)可及性進(jìn)行配對測量:染色質(zhì)環(huán)境和表位的整合細(xì)胞索引，稱為ICICLE-seq。用基于液滴的多組學(xué)平臺擴展了這種方法，開發(fā)了一種三峰分析方法，可以同時測量數(shù)千個單細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組學(xué)(scRNA-seq)、表位和染色質(zhì)可及性(scATAC-seq)，并稱之為TEA-seq。這些多模式單細(xì)胞檢測提供了一個新的工具箱來識別基于表型定義的細(xì)胞類型的類型特異性基因調(diào)控和表達(dá)。
2、HMH-exo增強低轉(zhuǎn)移性HCC細(xì)胞系的轉(zhuǎn)移潛力
為了探究HCC轉(zhuǎn)移時外泌體在細(xì)胞與細(xì)胞串?dāng)_中的可能作用，作者實驗HMH-exo預(yù)處理低轉(zhuǎn)移性的HCC細(xì)胞系。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，與LMH-exo或者PBS預(yù)處理組相比，HMH-exo***增強了低轉(zhuǎn)移性HCC細(xì)胞系的轉(zhuǎn)移能力；隨后作者使用低轉(zhuǎn)移性HCC細(xì)胞系構(gòu)建了體內(nèi)原位異種移植瘤模型，成瘤后使用外泌體***6周，***檢測肝臟**和肺轉(zhuǎn)移，結(jié)果顯示與其它組相比，HMH-exo組的肝臟**更大，肺轉(zhuǎn)移結(jié)節(jié)更多。（圖2）。這些結(jié)果表明HMH-exo可以在體內(nèi)外增強低轉(zhuǎn)移性HCC細(xì)胞的轉(zhuǎn)移能力。 提供***科研設(shè)計咨詢及輔助實驗。
固醇調(diào)控元件結(jié)合蛋白(SREBPs)是***高脂血癥特征性膽固醇、脂肪酸和甘油三酯生物合成的主要轉(zhuǎn)錄因子。本研究中發(fā)現(xiàn)了一種小分子，白樺素，它通過誘導(dǎo)SREBP裂解***蛋白(SCAP) 與Insig相互作用特異性地抑制SREBP的成熟，進(jìn)而降低膽固醇和脂肪酸的生物合成，改善飲食誘導(dǎo)的肥胖，降低血清和組織中的脂質(zhì)含量，提高胰島素敏感性，減小***斑塊的大小。樺樹皮中含有豐富的白樺素，有望成為開發(fā)***高脂血癥藥物的先導(dǎo)化合物。本研究于2021年1月發(fā)表在《Cell Metabolism》IF:21.567期刊上。英拜生物致力于分子生物行業(yè)十余年。武漢課題基礎(chǔ)實驗外包
完善的實驗平臺提供可視化的建模服務(wù)。MCD誘導(dǎo)課題基礎(chǔ)實驗外包
接下來研究RASA1是否參與了CRC細(xì)胞中外泌體miR-335-5p對遷移、侵襲和EMT的誘導(dǎo)。蛋白質(zhì)印跡分析顯示，miR-335-5p模擬物-exo增加了Ras和波形蛋白的蛋白水平，但降低了RASA1和E-鈣粘蛋白的蛋白水平；對于RASA1過表達(dá)，觀察到這些蛋白質(zhì)的反向表達(dá)趨勢。此外，RASA1過表達(dá)逆轉(zhuǎn)了miR-335-5p模擬物-exo誘導(dǎo)的SW480細(xì)胞遷移和侵襲。這些結(jié)果表明外泌體miR-335-5p可能通過靶向RASA1誘導(dǎo)遷移、侵襲和EMT。
該研究揭示了外泌體 miR-335-5p 在 CRC 轉(zhuǎn)移中的新功能，并闡明了外泌體包裹的 miR-335-5p 通過直接靶向 RASA1 促進(jìn) CRC 細(xì)胞侵襲、轉(zhuǎn)移和 EMT 轉(zhuǎn)化。 這些發(fā)現(xiàn)強烈表明外泌體 miR-335-5p 可能是一種預(yù)后生物標(biāo)志物，并為解決 CRC 轉(zhuǎn)移提供有價值的***策略。 MCD誘導(dǎo)課題基礎(chǔ)實驗外包
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實驗平臺，提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進(jìn)度，保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。
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5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實驗