在確定了UCP1與AKI中的脂質積累負相關后,我們試圖闡明其潛在的關系。首先,我們使用UCP1特異性過表達慢病毒載體和UCP1激動劑CL316243構建UCP1上調的細胞模型(圖3A)。如圖3B所示,UCP1過表達***降低了順鉑暴露HK2的脂質積累。UCP1激動劑CL316243也得到了類似的結果。這些結果表明,UCP1參與了AKI中脂質積累的調節(jié)。為了進一步驗證這一調控關系,提高證據(jù)的可靠性,我們采用腎多點注射UCP1特異性過表達腺病毒的方法建立AKI過表達UCP1的動物模型(圖3C-D)。油紅O染色顯示,過表達UCP1可***緩解AKI動物模型中的脂質積累(圖3E)。***,使用UCP1激動劑CL316243在AKI動物模型中誘導UCP1過表達,也觀察到了相同的結果(圖3F-H)。因此,所有證據(jù)表明,隨著UCP1表達的增加,AKI模型中的脂質含量降低。DHEA處理的大鼠給予200 mg/kg水蘇糖12天.蛋白組學標書服務兩年
2021年6月,***一篇發(fā)表在Microbiome(IF=11.607)的文章(Microbiota long-term dynamics and prediction of acute graft-versus-host disease in pediatric allogeneic stem cell transplantation.)從共生功能體視點的角度對29名接受同種異體造血干細胞移植的兒童的腸道、口腔和鼻腔微生物群進行了綜合宿主微生物群分析。***揭示了口腔和鼻子中的細菌可能預測急性移植物抗宿主病(aGvHD)。監(jiān)測HSCT患者不同身體部位的微生物群,特別是通過移植前樣本的參與,可能具有預后價值,并有助于指導個性化***策略。識別具有預測移植后aGvHD潛力的獨特細菌,可能為改進預防性臨床管理提供機會,包括對微生物群的調節(jié)。焦亡生物相關標書細胞實驗水蘇糖可減少卵巢囊泡數(shù)量黃體形成.
snoRNAs的生物學功能
snoRNAs與核糖體RNA加工
在核糖體RNA的加工過程中,核糖體RNA的2′-O–甲基化由C/DboxsnoRNAs來負責。C/DboxsnoRNAs包含有兩個短的序列元件,即位于5"末端的boxC(RUGAUGAR**A或G)和3"末端的boxD(CUGA)。多數(shù)boxC/DsnoRNAs基因的5"和3"末端都有4-5nt的反向重復序列,可以形成較為穩(wěn)定的短莖結構,這一結構在snoRNAs的生物合成和核仁定位過程中起關鍵作用[7]。核糖體RNA的假尿嘧啶修飾主要是由H/ACAboxsnoRNAs來完成的。H/ACAboxsnoRNAs具有保守的“發(fā)夾-鉸鏈-發(fā)夾-尾”的二級結構。boxH(ANANNA,N**任一核苷酸)位于單鏈形式的鉸鏈區(qū),ACA則一般位于3"末端上游3個核苷酸處。H/ACAboxsnoRNAs的指導序列位于單個或者兩個發(fā)夾內(nèi)部的“假尿嘧啶化泡”內(nèi),它們可以與靶RNA上的被修飾位點兩翼序列各形成4-8nt的互補配對。
6)FPN蛋白在肺*細胞中的穩(wěn)定性需要USP35
USP35屬于DUBs家族,在控制各種蛋白質的Ub依賴性降解中起關鍵作用。此外,F(xiàn)PN泛素化和隨后的內(nèi)吞作用導致鐵超載和鐵死亡。因此,我們研究了USP35是否通過影響其蛋白質穩(wěn)定性來調節(jié)FPN表達。如圖8A所示,USP35敲除增加,而USP35過表達降低泛素化FPN水平。用MG132蛋白酶體抑制劑***后,shUSP35***細胞的全部或膜裂解物中FPN水平的降低被阻止(圖8B)。隨后,我們檢查了USP35是否是FPN的直接結合伙伴。IP分析的數(shù)據(jù)揭示了內(nèi)源性USP35和FPN之間的聯(lián)系(圖8C)??傊@些數(shù)據(jù)表明USP35可以直接與FPN相互作用,并作為deubiquitinase發(fā)揮作用,以保持其蛋白質穩(wěn)定性。 血清代謝產(chǎn)物的豐度也發(fā)生了***變化.
此外,circPDE4B不影響MID1水平(圖4E)。RPD和序列IP分析都顯示circPDE4B促進了RIC8A和MID1的結合(圖4F,G)。與這一發(fā)現(xiàn)相一致的是,體外結合試驗表明,circPDE4B增加了重組RIC8A和MID1蛋白之間的關聯(lián)(圖4H)。通過co-IP,MID1與RIC8A在N端調控域結合(圖4I)。此外,我們檢測了RIC8A的功能位點。在HCs中免疫沉淀RIC8A并進行MS分析,證實了RIC8A中氨基酸殘基的泛素化(圖4J)。在RIC8A、K143和K187中鑒定出10個泛素化位點,并且在人類和小鼠之間并不保守(圖4J)。因此,我們將保守的RIC8A位點從賴氨酸(K)突變?yōu)榫彼?R),以排除泛素化。IP結果表明,與WT相比,K415的取代**降低了RIC8A的泛素化位點(圖4K)。有趣的是,K415在哺乳動物中高度保守(圖4L,M)。此外,在K415突變后,circPDE4B過表達或抑制不再調節(jié)RIC8A的泛素化水平(圖4N)。這些結果表明circPDE4B可以作為促進RIC8A和MID1之間聯(lián)系的支架。異丁酸含量與BMS評分/ FITC -葡聚糖滲透性之間的相關性無統(tǒng)計學意義。糖尿病標書免費設計
FMT處理可恢復SCI小鼠中糞便短鏈脂肪酸(SCFAs)。蛋白組學標書服務兩年
4)SsD通過直接抑制FTOm6A去甲基化活性來誘導m6A修飾
為了檢測m6A在RNA上的變化,我們在SsD處理的白血病細胞中進行了m6A點印跡實驗。如圖4A所示,SsD***增加了m6A在轉錄組中的豐度。此外,HPLC-MS/MS定量證實了SsD處理的NB4和Kas-1細胞mRNA中細胞m6A的增加(圖4B)。接下來,我們檢測了FTO的兩個直接靶點MYC和RARA在SsD處理的細胞中的表達。SsD在mRNA和蛋白水平***下調了NB4和Kas-1細胞的MYC,而上調了RARA(圖4C-D)。有趣的是,SsD依賴的MYC和RARA的減少是由于FTO過表達細胞中mRNA和蛋白穩(wěn)定性的降低(圖4E-4H)。綜上所述,這些結果證明了FTO及其下游靶點(如MYC,RARA)是FTO過表達白血病細胞中SsD的主要效應因子。 蛋白組學標書服務兩年
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2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗