用戶界面SC2disease提供瀏覽器和搜索引擎，以查詢有關(guān)不同疾病中特定于細胞類型的基因的詳細信息，具體流程如圖。
“疾病”和“單元格類型”是SC2disease瀏覽器的根類別?！凹膊 备悇e中總共包括25種疾病，通過單擊疾病名稱可以顯示與所關(guān)注疾病相關(guān)的特定于細胞類型的基因的詳細信息。**初將所有細胞類型分為16組，以幫助想要瀏覽特定細胞類型中標記基因的研究人員。還可以使用“搜索”功能搜索他們感興趣的疾病，基因或細胞類型。每個基因的信息將在表格中以一行顯示，其中包括疾病名稱，實驗組織，細胞類型，基因名稱，用于描述基因表達的變量名稱（log 2 FC或均值），變量的值，DEG比較，源發(fā)布的標識符，排序平臺和詳細信息。 引起28種血清代謝物豐度的變化在tempol作用下部分減弱.基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)標書推薦咨詢
MAPK級聯(lián)是人類****重要的致*驅(qū)動因子之一，通過靶向抑制劑阻斷這一信號通路是一種重要的抗**策略。因此，我們用MAPK通路抑制劑PD0325901處理SGC7901和MGC803細胞。Western blot顯示，PD0325901的加入***降低了MAPK1通路下游因子的***。而添加PD0325901后，MAPK1-109aa的表達水平?jīng)]有明顯變化(圖8a)。集落形成(圖8b，c)、EdU(圖8d，e)和Transwell實驗(圖8f)結(jié)果表明PD0325901處理后細胞的增殖和遷移能力明顯受到抑制。此外，在抑制劑存在的情況下，將shcircRNA轉(zhuǎn)染到SGC7901和MGC803細胞中，目的是部分提高MAPK通路的活性。然而，當細胞與PD0325901共同處理時，抑制circMAPK1沒有明顯的促*作用(圖8b-f)。綜上所述，這些結(jié)果證實了MAPK1-109aa通過與MEK1競爭相互作用抑制MAPK1的磷酸化，通過抑制MAPK通路發(fā)揮**抑制作用。
結(jié)論我們在胃*中發(fā)現(xiàn)了一種來自MAPK1的下調(diào)circRNA。MAPK1-109aa由circMAPK1編碼，通過與MAPK1競爭與上游激酶MEK1結(jié)合發(fā)揮***作用，抑制MAPK1磷酸化和下游致*因子。我們的研究結(jié)果提示circMAPK1可能作為GC的***靶點，也為MAPK通路***引起的疾病提供了新的***思路。 醫(yī)學(xué)科研標書細胞實驗?zāi)c道緊密連接已被證明與腸道屏障完整性有關(guān)。
此外，低氧誘導(dǎo)乳腺*細胞中依賴ZNF217的NANOG 和KLF4 的mRNA m6A甲基化抑制，且ALKBH5敲除***降低免疫缺陷小鼠乳腺*的肺轉(zhuǎn)移[24]。在肺*中，METTL3能夠促進肺腺*細胞的生長、生存和侵襲，但還不清楚它是否作為 m6A 調(diào)節(jié)器或效應(yīng)器發(fā)揮作用[25]。在急性髓細胞白血?。ˋML）患者中，m (6) A 調(diào)控基因的突變或拷貝數(shù)變化與TP53 突變存在密切聯(lián)系，且m (6) A 調(diào)控基因的改變與AML不良預(yù)后相關(guān)[26]。此外，F(xiàn)TO在AML中高表達，它通過降低mRNA轉(zhuǎn)錄本中的m(6)水平，調(diào)節(jié)ASB2和RARA等靶點的表達，增強了白血病*基因介導(dǎo)的細胞轉(zhuǎn)化和白血病形成，并抑制全反式維甲酸(ATRA)誘導(dǎo)的AML細胞分化[27]。在脂肪形成過程中，F(xiàn)TO表達與m6A水平成負相關(guān)，促進脂肪形成[3]。在膠質(zhì)細胞瘤樣細胞中，ALKBH5通過lncRNA FOXM1介導(dǎo)FOXM1基因pre-mRNA上的m6A修飾維持膠質(zhì)瘤細胞的成瘤性[28]。此外，甲基轉(zhuǎn)移酶METTL3或METTL14的敲除，能夠改變m6A的富集和ADAM19的表達，極大地促進了膠質(zhì)瘤細胞的生長、自我更新和**形成[29]。
4.ELNAT1直接與hnRNPA1相互作用
由于lncRNA的分子功能與其亞細胞定位相關(guān)，通過FISH和亞細胞定位實驗發(fā)現(xiàn)ELNAT1在UM-UC-3和T24細胞的細胞質(zhì)和細胞核均有表達（SupplementalFigure7A,B）。并且通過RNA-pulldown實驗，發(fā)現(xiàn)在分子量35~40kDa上有明顯的條帶（Figure4A）。對此，通過質(zhì)譜（MS）和Westernblot分析顯示，hnRNPA1是**豐富的ELNAT1相互作用蛋白（Figure4B-D）。熒光染色和RNA免疫沉淀（RIP）證實了ELNAT1和hnRNPA1在UM-UC-3和T24細胞中的共定位，并且ELNAT1通過內(nèi)源性hnRNPA1富集（Figure4E,F），進一步驗證了ELNAT1和hnRNPA1之間的相互作用。 FMT處理加速SCI小鼠的胃腸道消化。
熒光原位雜交和核胞質(zhì)RNA分數(shù)實驗結(jié)果顯示，MIR210HG在Ishikawa細胞和HEC-1A細胞中均位于核和細胞質(zhì)內(nèi)(圖3D和3E)。我們假設(shè)MIR210HG對miRNAs起海綿作用。為了探究MIR210HG是否參與了一個新的MIR210HG- miRNA -HMGA2調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，我們使用TargetScan、miRanda、CLIP-Seq和miRDB生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫來預(yù)測與HMGA2結(jié)合的mirna(圖3F)。選擇3個軟件程序分析交叉處的miRNAs作為候選miRNAs。通過將野生型雙熒光素酶載體介導(dǎo)的HMGA2構(gòu)建物共轉(zhuǎn)染HEK293T細胞，共鑒定和篩選了110個miRNAs。轉(zhuǎn)染后，23個miRNA轉(zhuǎn)染細胞的熒光素酶活性***降低(圖3G)。在上述23種miRNAs中，轉(zhuǎn)染miR-3373p、miR-137、let-7c-5p和miR-98-5p時，熒光素酶活性***降低，其中轉(zhuǎn)染miR-337-3p和miR-137時，熒光素酶活性降低**多。利用生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫TargetScan預(yù)測miR-337-3p和miR-137中與HMGA2結(jié)合的位點。雙熒光素酶基因報告基因檢測結(jié)果顯示，miR-337-3p和miR-137在其預(yù)測的結(jié)合位點上結(jié)合HMGA2(圖3H)。第4周測定FITC標記的葡聚糖(4kd)和血液中FITC水平?；A(chǔ)醫(yī)學(xué)標書推薦咨詢
DHEA和tempol處理可影響腸道微生物的β-多樣性?；A(chǔ)醫(yī)學(xué)標書推薦咨詢
5.ELNAT1與UBC9啟動子形成DNA-RNA三聯(lián)體，通過招募hnRNPA1增強H3K4me3修飾
為了探索ELNAT1誘導(dǎo)BCa淋巴轉(zhuǎn)移的分子機制，我們使用NGS檢測過表達ELNAT1的BCa細胞和對照細胞（Figure5A），由于SUMOylation已經(jīng)被證明可以調(diào)節(jié)特異性RNA的識別，并參與RNA分選進入EVs的過程，因此鑒定ELNAT1的SUMOylation相關(guān)靶基因。在受ELNAT1調(diào)控的925個基因中，作者發(fā)現(xiàn)UBC9是SUMOylation相關(guān)基因變化*****的（Figure5B-D）。接著通過RNA純化（ChIRP）檢驗ELNAT1與UBC9中P1（153~143bp）啟動子區(qū)域存在生理相互作用（Figure5E,F）。CD光譜證實ELNAT1/UBC9TTS1組在270~280nm處有一個***的正峰，在210nm處有一個負峰。在FENDRR/PITX2陽性對照組中也有類似的發(fā)現(xiàn)（Figure5G,H）。FRET技術(shù)分析顯示,與ELNAT1/UBC9TTS1組相比，熒光強度發(fā)生了巨大的變化：從520nm到570–580nm,熒光強度控制單鏈RNA/UBC9ssRNA/UBC9TTS1集團,這與FENDRR/PITX2陽性對照組類似（Figure5I,J）。 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)標書推薦咨詢
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺，提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度，保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性，為您的標書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標書申請：提供標書課題設(shè)計、撰寫，標書部分基礎(chǔ)實驗的開展，設(shè)計的標書均符合科研前沿?zé)狳c，中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術(shù)支持，探討科研前沿?zé)狳c研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測序：轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學(xué)實驗