在MAD1與未連接的動(dòng)點(diǎn)結(jié)合后，MAD2從開放的構(gòu)象狀態(tài)(O-MAD2)轉(zhuǎn)化為封閉的構(gòu)象狀態(tài)(C-MAD2)，SAC信號(hào)被緊密調(diào)控和放大。MAD2的構(gòu)象變化啟動(dòng)了它與CDC20的結(jié)合。為了直接測(cè)試RIT1是否抑制了MAD2與CDC20或MAD1的關(guān)聯(lián)，進(jìn)行了競(jìng)爭(zhēng)性pull-down實(shí)驗(yàn)來測(cè)試RIT1-MAD2和MAD2-CDC20/MAD1結(jié)合之間的互斥性(圖4A和4B)。MAD2結(jié)合肽1(MBP1)是一種模擬CDC20和MAD1相互作用基序(MIM)的高親和合成肽，它取消了MAD2-rit1的結(jié)合。評(píng)估了RIT1與O-或c-狀態(tài)穩(wěn)定的MAD2突變體的結(jié)合(圖4C)。用過量的RIT1c端尾肽孵育MAD2蛋白，并用凝膠過濾分離(圖4D)。RIT1M90I***降低了MAD2-CDC20和BubR1-CDC20的相互作用(圖4E和4F)；表明致病RIT1蛋白水平阻礙MCC的完整性，符合RIT1從CDC20中隔離MAD2并促進(jìn)MCC拆卸的模型。用重組RIT1補(bǔ)充這些提取物增加了CyclinB1和Securin的泛素化和降解，表明APC/C活性增加，可能是由于MCC抑制緩解(圖4G)。RIT1缺失細(xì)胞顯示CyclinB1降解延遲(圖4H)。此外，RIT1M90I的表達(dá)加速了正常細(xì)胞生長(zhǎng)下CyclinB1的降解(圖4I);然而，其對(duì)CyclinB1降解的影響在藥理學(xué)誘導(dǎo)的有絲分裂阻滯下被消除(圖S4M)，這表明致病性水平的RIT1不能抑制過度活躍的SAC反應(yīng)。探討SCI腸道微生物失調(diào)與神經(jīng)炎癥之間的分子相互作用。cancer標(biāo)書分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)
一、scRNA-Seq和scATAC-Seq的整合
共嵌入的UMAP圖顯示，scRNA-seq和scATAC-seq數(shù)據(jù)集中分析的大部分細(xì)胞相互重疊，這表明在大多數(shù)細(xì)胞簇中，染色質(zhì)可及性和相應(yīng)的基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)的變化是一致的(圖2A)。整合結(jié)果顯示，兩個(gè)數(shù)據(jù)集中所有巨噬細(xì)胞簇幾乎完全重疊，表明我們的研究中確定的所有巨噬細(xì)胞簇沒有明確區(qū)分。scATAC-seq和scRNA-seq數(shù)據(jù)的單個(gè)UMAP圖顯示了各自的小區(qū)集群標(biāo)識(shí)(圖2B和2C)。然后使用每個(gè)細(xì)胞簇中**個(gè)上調(diào)的基因生成熱圖(圖2D)。如圖2E所示，暴露于慢性d-流中的ec表現(xiàn)出許多與致***途徑相關(guān)的已知生物學(xué)過程的誘導(dǎo)。 服務(wù)標(biāo)書服務(wù)價(jià)格circNDUFB2作為一個(gè)支架增強(qiáng)IGF2BP蛋白與TRIM25的結(jié)合。
METTL3促進(jìn)小鼠ESCC細(xì)胞增殖和**生長(zhǎng)為了確定METTL3在細(xì)胞增殖中的作用，通過轉(zhuǎn)染METTL3 shRNAs來去除ESCC細(xì)胞中的METTL3。發(fā)現(xiàn)METTL3缺失減少了這些細(xì)胞的增殖和集落數(shù)。通過在KYSE180和KYSE450中重組表達(dá)METTL3，這些抑制作用被消除。
接下來在KYSE450細(xì)胞中建立四環(huán)素誘導(dǎo)的METTL3表達(dá)。四環(huán)素***以劑量依賴的方式增加METTL3的表達(dá)，相應(yīng)地引起細(xì)胞增殖水平的增加和集落形成水平的增加。與野生型（WT）METTL3的過表達(dá)相比，在ESCC細(xì)胞中METTL3非活性突變體的過表達(dá)未能促進(jìn)細(xì)胞生長(zhǎng)和增殖。這些結(jié)果有力地表明，METTL3促進(jìn)**細(xì)胞增殖依賴于其表達(dá)水平和完整的活性。為了確定METTL3在小鼠**生長(zhǎng)中的作用，將KYSE180或KYSE450細(xì)胞皮下注射到裸鼠體內(nèi)，發(fā)現(xiàn)METTL3缺失降低了**大小、體積和重量。與表達(dá)METTL3非活性突變體引起的有限效應(yīng)相比，WTMETTL3過表達(dá)極大地促進(jìn)了**生長(zhǎng)。這些結(jié)果表明METTL3的表達(dá)有助于小鼠**的生長(zhǎng)。METTL3介導(dǎo)APCmRNA上的m6A上調(diào)
HoxBlinc基因表達(dá)增強(qiáng)HSC自我更新，擴(kuò)大骨髓形成
NPM1c+促進(jìn)HSC自我更新和髓細(xì)胞擴(kuò)張的能力已被明確。為了進(jìn)一步了解HoxBlinc在AML發(fā)病機(jī)制中的作用，研究了HoxBlinc過表達(dá)對(duì)HSPC功能的影響。HoxBlincTgBM細(xì)胞中Lin-scale-1+c-Kit+(LSK)細(xì)胞的比例明顯高于野生型小鼠，而Lin-scale-1-c-Kit+(LK)細(xì)胞群與野生型小鼠相似（圖3a）。計(jì)算ST-HSCsLT-HSCs總數(shù)時(shí)，股骨和多能祖細(xì)胞(MMP)計(jì)算基于比例LSK內(nèi)細(xì)胞群和BM多孔性，LT-和ST-HSCs池，但不是MPP明顯擴(kuò)大，盡管只有ST-HSCsLSK內(nèi)細(xì)胞的比例增加（圖3b）。當(dāng)對(duì)LK細(xì)胞內(nèi)的每個(gè)髓系祖細(xì)胞群進(jìn)行分析時(shí)，HoxBlincTg小鼠中GMP的百分比***高于WT小鼠，但MEP/CMP細(xì)胞群的百分比低于WT小鼠（圖3c）。因此，HoxBlinc過表達(dá)導(dǎo)致HSPC池失調(diào)，導(dǎo)致體內(nèi)造血系統(tǒng)向髓系傾斜。 circNDUFB2觸發(fā)NSCLC細(xì)胞的免疫防御反應(yīng)。
5、外泌體miR-934通過下調(diào)PTEN表達(dá)和***PI3K/AKT信號(hào)通路誘導(dǎo)巨噬細(xì)胞M2極化
進(jìn)一步探索**來源的外泌體miR-934誘導(dǎo)M2巨噬細(xì)胞極化的機(jī)制。miR-934序列與PTEN的3'-UTR序列存在比對(duì)，提示miR-934可能靶向PTEN誘導(dǎo)M2巨噬細(xì)胞極化（Fig.5a）。如Fig.5b所示，將miR-934mimics或anti-miR-934及其控制載體轉(zhuǎn)染到PMA處理的THP-1細(xì)胞中，發(fā)現(xiàn)分別轉(zhuǎn)染miR-934mimics或anti-miR-934和PTEN野生型結(jié)合位點(diǎn)組中PTEN的3’-UTR熒光素酶活性***降低或升高（Fig.5b）。有趣的是，當(dāng)細(xì)胞與轉(zhuǎn)染了anti-miR-934、miR-934mimics或其對(duì)照載體的HCT-8或HT29細(xì)胞的外泌體共培養(yǎng)時(shí)，熒光素酶活性模式顯示出與上述趨勢(shì)相同（Fig.5c）。此外，PMA處理的THP-1細(xì)胞轉(zhuǎn)染miR-934mimics或anti-miR-934，與各自的對(duì)照細(xì)胞相比，分別在mRNA和蛋白水平下調(diào)或上調(diào)了PTEN的表達(dá)（Fig.5d）。類似的，分別用轉(zhuǎn)染anti-miR-934或miR-934mimics的CRC細(xì)胞的外泌體孵育PMA處理的THP-1細(xì)胞，結(jié)果發(fā)現(xiàn)PTEN，PI3K/AKT的表達(dá)明顯高于或低于各自的對(duì)照組（Fig.5e,f）。這些表明在PMA處理的THP-1細(xì)胞中，外泌體來源的miR-934可以通過靶向其3'-UTR和***PI3K/AKT通路來下調(diào)PTEN的表達(dá)。 血清代謝產(chǎn)物的豐度也發(fā)生了***變化.基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)標(biāo)書地區(qū)科學(xué)基金
我們進(jìn)行了熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè).cancer標(biāo)書分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)
另外，相對(duì)于對(duì)照組，在生理?xiàng)l件下，單獨(dú)使用siFth不能顯著增加ROS的產(chǎn)生。對(duì)鐵死亡的抗性與抑制BODIRY-C11氧化有關(guān)。與上述ROS結(jié)果一致。測(cè)量了鐵死亡的幾種推定生物標(biāo)志物，包括xCT，Cox2和4HNE表達(dá)。如預(yù)期的那樣，與對(duì)照組+刮擦損傷組相比，在siFth轉(zhuǎn)染的HT-22細(xì)胞中，刮擦損傷的xCT表達(dá)顯著下降，而Cox-2和4HNE的表達(dá)顯著增加。重要的是，與未經(jīng)***的siFth組相比，用褪黑素處理siFth轉(zhuǎn)染的HT-22細(xì)胞在刮傷后未能顯著改變xCT，Cox2和4HNE的表達(dá)。另外，在生理?xiàng)l件下，單獨(dú)的siFth與對(duì)照組之間上述蛋白質(zhì)的表達(dá)沒有顯著差異。這些結(jié)果表明，用siFth轉(zhuǎn)染的HT-22細(xì)胞易受機(jī)械性刮擦損傷誘導(dǎo)的脂質(zhì)過氧化和鐵死亡的影響，而褪黑素在統(tǒng)計(jì)學(xué)上并未減輕損傷后的鐵死亡，并且siFth不會(huì)影響褪黑素受體的表達(dá)。cancer標(biāo)書分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)
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4.二代測(cè)序：轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片：信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)