3、外泌體S100A4是HCC細胞轉移潛力的關鍵增強子
為了探究通過HMH-exo增強HCC轉移能力的關鍵，作者對LMH-exo和HMH-exo進行了iTRAQ質譜篩選。結果從HMH-exo中鑒定到116個***上調和43***下調的蛋白質；結果發(fā)現了4個蛋白家族的聚類：Apo、PSM、EEF/EIF和S100鈣結合蛋白家族（圖3a-b）。經過文獻分析，作者主要關注了S100鈣結合蛋白家族，并以其中*****差異表達的4個蛋白為主：依次是S100A4，S100A6，S100A10，和S100A11。作者檢測了這4個蛋白在5個HCC細胞系外泌體中的表達豐度，結果發(fā)現依然是S100A4的表達水平比較高（圖3c）。因此，初步選擇S100A4進行下一步分析。 生物素標記的miR-127-3p比陰性對照探針捕獲的circSDHC.大連circRNA標書
HoxBlinc基因表達增強HSC自我更新，擴大骨髓形成
NPM1c+促進HSC自我更新和髓細胞擴張的能力已被明確。為了進一步了解HoxBlinc在AML發(fā)病機制中的作用，研究了HoxBlinc過表達對HSPC功能的影響。HoxBlincTgBM細胞中Lin-scale-1+c-Kit+(LSK)細胞的比例明顯高于野生型小鼠，而Lin-scale-1-c-Kit+(LK)細胞群與野生型小鼠相似（圖3a）。計算ST-HSCsLT-HSCs總數時，股骨和多能祖細胞(MMP)計算基于比例LSK內細胞群和BM多孔性，LT-和ST-HSCs池，但不是MPP明顯擴大，盡管只有ST-HSCsLSK內細胞的比例增加（圖3b）。當對LK細胞內的每個髓系祖細胞群進行分析時，HoxBlincTg小鼠中GMP的百分比***高于WT小鼠，但MEP/CMP細胞群的百分比低于WT小鼠（圖3c）。因此，HoxBlinc過表達導致HSPC池失調，導致體內造血系統(tǒng)向髓系傾斜。 浙江細胞增殖標書FMT處理可能導致SCI后胃腸道消化活力變快。
三、原始表型和染色質可及性
雖然基因表達反映了細胞身份的活躍狀態(tài)，但順式調節(jié)元件(cre)，包括啟動子和增強子，是決定細胞命運的潛在因素。因此，我們研究了npm1突變的AML樣本是否也會根據其順式調控景觀分層為原始和committed的集群。使用轉座酶可達染色質測序(ATAC-seq)可達染色質區(qū)域，以CREAM方法鑒定的**為重點，根據表達譜對AML樣本進行聚類，但有一個例外(圖3A)。我們的研究結果表明，啟動子區(qū)形成了**(啟動子:FDR = 11%，基因間:FDR = 2%;圖3B、C及補充圖19)。RUNX和GATA家族成員HOXC9和CTCF的dna結合位點基模只富集在原始亞型的COREs中，提示可能存在調控原始亞型基因的因素(圖3D，補充數據3).對承諾亞型中***可獲得的**進行基序富集分析，確定了CEBP、ATF家族成員、OCT2、IRF2、NFkB-p65、ESRRB和EGR2識別的共識序列，提示它們在committed亞型中可能發(fā)揮的作用(圖3D)補充數據。
5）M1-Exos通過傳遞miR-155加重了EndoMT
為了研究外泌體miR-155在SCI后M1-Exos介導的BSCB破壞惡化中的作用，構建miR-155過表達(miR-155OE)和敲低(miR-155KD)BMDMs，然后分離外泌體并處理bEnd.3細胞。如圖5A和B所示，miR-155OE-Exos組TEER值***降低，通透性***增加，而miR-155KD-Exos組則相反。加入miR-155OE-Exos后，ZO-1和Occludin的熒光強度明顯降低，而miR-155KD-Exos處理后，ZO-1和Occludin的表達***增強(圖5C和D)。此外，westernblot檢測TJs蛋白的表達，結果與上述討論的結果相似(圖5E)。miR-155OE-Exos可促進細胞形態(tài)轉化，其分支更少，體細胞更長。miR-155KD-Exos處理后的結果則相反(圖5F)。miR-155OE-Exos暴露后，I型膠原蛋白、III型膠原蛋白和α-SMA蛋白水平上調，CD31蛋白水平下調，而miR-155KD-Exos作用相反(圖5G)。以上結果表明，外泌體miR-155在促進bEnd.3細胞的EndoMT中起著至關重要的作用。 神經絲(NF-200)是神經元軸突中富含的細胞特異性蛋白。
我們研究了FOXO3A是否通過LINC00926調節(jié)這些效應。細胞增殖和集落形成分析顯示FOXO3A過表達***了乳腺*細胞的生長，而LINC00926敲低則促進了細胞的生長(圖6A和6B)。重要的是，下調LINC00926***減弱了FOXO3A調控細胞增殖的能力，表明FOXO3A主要通過表達LINC00926來降低乳腺*細胞的增殖。接下來，我們通過LINC00926檢測FOXO3A是否***細胞遷移、侵襲和糖酵解。如預期，FOXO3A減少了乳腺*細胞的遷移和侵襲(圖6C和6D)。敲除LINC00926**削弱了FOXO3A***細胞遷移和侵襲的能力。FOXO3A過表達***葡萄糖攝取、乳酸生成和ATP生成，降低ECAR和增加OCR。然而，敲除LINC00926極大地減弱了FOXO3A調節(jié)細胞遷移、侵襲和糖酵解的能力(圖6C-6G)。綜上所述，FOXO3A***乳腺*細胞的遷移和侵襲，以及糖酵解主要依賴于LINC00926。circSDHC在ccRCC中過表達且其過表達與低存活率相關.武漢rip標書
我們使用miR-127-3p抑制劑和模擬物在circSDHC缺失或過表達后進行拯救實驗.大連circRNA標書
circRNA是一種新型的非編碼RNA，已被報道通過多種機制參與疾病的發(fā)生和發(fā)展。MAPK通路是一種常見的信號轉導通路，參與細胞增殖、炎癥和凋亡，在**中起著特別重要的作用。然而，與MAPK通路相關的circRNA在胃*中的作用尚未被探索。因此，小編為大家?guī)硪黄?021年4月發(fā)表于影響因子為15.302的雜志Molecular Cancer上的文章“A novel protein encoded by circMAPK1 inhibits progression of gastric cancer by suppressing activation of MAPK signaling”。在本研究中，我們發(fā)現circMAPK1在胃*組織中較鄰近正常組織表達下調。重要的是，較低的circMAPK1表達預示著GC患者較差的生存。CircMAPK1在體內外均能抑制胃*細胞的增殖和侵襲。接下來，我們發(fā)現circMAPK1編碼了一個長度為109個氨基酸的新蛋白。通過一系列功能實驗，我們證實了circMAPK1通過編碼的蛋白MAPK1-109aa發(fā)揮了抑制**的作用。在機制上，**抑制因子MAPK1-109aa通過競爭性結合MEK1來抑制MAPK1的磷酸化，從而抑制MAPK1及其下游因子在MAPK通路中的***。大連circRNA標書
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5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，FISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗