為了探討UCP1與AKI之間的相關(guān)性，我們?cè)隗w內(nèi)、體外檢測(cè)了UCP1在AKI模型中的表達(dá)。結(jié)果顯示，UCP1在AKI小鼠中***下調(diào)，更重要的是，隨著腎損傷的加重，其表達(dá)量逐漸降低(圖2E-F)。在體外，隨著順鉑刺激時(shí)間的延長(zhǎng)，HK2細(xì)胞中UCP1的表達(dá)降低(圖2G)。這些結(jié)果表明UCP1與AKI的嚴(yán)重程度呈負(fù)相關(guān)。此外，隨著AKI腎細(xì)胞損傷程度的增加，脂質(zhì)的積累，UCP1的表達(dá)逐漸降低(圖2H)。這一結(jié)果表明，UCP1在AKI中的表達(dá)可能影響脂質(zhì)積累。
3）AKI中的脂質(zhì)積累與UCP1高度負(fù)相關(guān)在確定了UCP1與AKI中的脂質(zhì)積累負(fù)相關(guān)
后，我們?cè)噲D闡明其潛在的關(guān)系。首先，我們使用UCP1特異性過(guò)表達(dá)慢病毒載體和UCP1激動(dòng)劑CL316243構(gòu)建UCP1上調(diào)的細(xì)胞模型(圖3A)。如圖3B所示，UCP1過(guò)表達(dá)***降低了順鉑暴露HK2的脂質(zhì)積累。 阻斷atm依賴的磷酸化會(huì)損害DNA損傷后PTEN的亞細(xì)胞再分配。MMP
qRT-PCR結(jié)果表明，暴露于miR-144模擬物處理的鼻咽*細(xì)胞的HUVECs中miR-144上調(diào)，而暴露于miR-144inhibitor處理的鼻咽*細(xì)胞的HUVECs中miR-144下調(diào)(圖3C)。Transwell實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明，miR-144過(guò)表達(dá)EVs足以增強(qiáng)HUVECs的遷移和侵襲，而miR-144抑制EVs則表現(xiàn)出相反的趨勢(shì)(圖3D和3E)。此外，我們還通過(guò)傷口愈合實(shí)驗(yàn)檢測(cè)HUVECs的增殖和遷移能力(圖3F)。結(jié)果顯示，與NC模擬EV組相比，miR-144模擬EV組細(xì)胞的創(chuàng)面愈合率升高，說(shuō)明C666-1-和SUNE1細(xì)胞來(lái)源的EVmiR-144均促進(jìn)HUVECs的增殖和遷移。與NC抑制EV組相比，miR-144抑制EV組的細(xì)胞創(chuàng)面愈合率降低，提示C666-1-和SUNE1EV細(xì)胞EVmiR-144抑制后，HUVECs的增殖和遷移受到抑制。轉(zhuǎn)錄組Pex衍生的CD44v6/C1QBP復(fù)合物介導(dǎo)了Pex對(duì)肝纖維化和PDAC肝轉(zhuǎn)移的積極作用。
為了了解白樺素和他汀類藥物的抗DIO作用，進(jìn)一步分析了脂質(zhì)吸收，體力活動(dòng)和能量消耗。在洛伐他汀***的小鼠中，盡管呼吸商（RQ）增強(qiáng)，表明從體內(nèi)利用葡萄糖和蛋白質(zhì)進(jìn)行能量生產(chǎn)已超過(guò)脂質(zhì)氧化，但耗氧量和總能量消耗仍與WD喂養(yǎng)的小鼠相似（圖4F-4H）。另一方面，用洛伐他汀喂養(yǎng)的小鼠的糞便膽固醇和甘油三酸酯（TG）顯著增加（圖4C和4D），表明洛伐他汀降低脂質(zhì)吸收或增加脂質(zhì)排泄，從而拮抗DIO。這一觀察結(jié)果與以前的報(bào)告是一致的。另一方面，白樺素對(duì)脂質(zhì)吸收/排泄沒(méi)有影響（圖4C和4D）。
數(shù)據(jù)庫(kù)還可以分析現(xiàn)有的化學(xué)品和基因相關(guān)數(shù)據(jù)，根據(jù)自身需要檢索相關(guān)基因或者化學(xué)品。
該數(shù)據(jù)庫(kù)還將解剖學(xué)及其相關(guān)表型與環(huán)境化學(xué)物質(zhì)聯(lián)系起來(lái)，使它們可計(jì)算用于薈萃分析，并使 CTD 中化學(xué)和表型景觀的解剖學(xué)視角成為可能。2020 年， CTD 利用醫(yī)學(xué)主題詞中“解剖學(xué)”分支的修改子集作為其受控詞匯源，其中包括 1799 個(gè)用于解剖結(jié)構(gòu)和區(qū)域、生理系統(tǒng)、流體和組織、細(xì)胞和亞細(xì)胞成分的術(shù)語(yǔ)。 目前，CTD中超過(guò)247000種化學(xué)-表型相互作用使用了870個(gè)解剖學(xué)術(shù)語(yǔ)。 用戶可以通過(guò)選擇門(mén)戶圖標(biāo)向下鉆取可導(dǎo)航層次結(jié)構(gòu)或使用 CTD 關(guān)鍵字搜索框中的“解剖”選擇列表選項(xiàng)，從主頁(yè)訪問(wèn) CTD Anatomy。CTD Anatomy 頁(yè)面組織和合并數(shù)據(jù)，允許用戶從解剖學(xué)角度探索交互；這可用于識(shí)別不同生理系統(tǒng)（例如腎臟、肝臟、大腦和心血管系統(tǒng)）獨(dú)有或共享的化學(xué)物質(zhì)和表型，或發(fā)現(xiàn)例如影響影響的 1158 種化學(xué)物質(zhì) 心臟中有 600 種表型。同樣，已經(jīng)開(kāi)始將 CTD 暴露與 CTD 解剖學(xué)相結(jié)合，使環(huán)境健康科學(xué)家能夠調(diào)查暴露研究和組織和系統(tǒng)暴露化學(xué)應(yīng)激誘導(dǎo)表型的細(xì)節(jié)。***，為了幫助提高數(shù)據(jù)庫(kù)的互操作性。 上海英拜提供課題外包服務(wù)。
1、在響應(yīng)CDK4/6抑制中瘤內(nèi)記憶類CD8+T細(xì)胞的表現(xiàn)
為了***評(píng)價(jià)CDK4/6抑制對(duì)抗**T細(xì)胞免疫的影響，使用多模式單細(xì)胞測(cè)序(CITE-seq)分析了CDK4/6抑制劑palbociclib或?qū)φ仗幚淼腗C38-OVA**小鼠的瘤內(nèi)T細(xì)胞群體(Fig.1A)。維度分析顯示MC38-OVA**中有10個(gè)不同的T細(xì)胞群(Fig.1B)。用CDK4/6i處理的**有較低頻率的CD4+調(diào)節(jié)性T細(xì)胞(Foxp3+Tregs)，而CD8+記憶類T細(xì)胞頻率更高，以Tcf7、Sell、Bcl2和Cd7高表達(dá)為特征(Fig.1B-D)。CD8+T細(xì)胞池的基因動(dòng)態(tài)表達(dá)揭示來(lái)源于CDK4/6i處理的小鼠的CD8+**免疫浸潤(rùn)（TILs）向更早、更像干細(xì)胞的分化狀態(tài)傾斜(Fig.1E-F)。與此一致，較早出現(xiàn)假時(shí)間軌跡的細(xì)胞表達(dá)更高水平的記憶相關(guān)基因(Tcf7,Sell,Il7r)，和更低水平的效應(yīng)相關(guān)基因(Prf1,Gzmb)和耗損標(biāo)志物(PD-1,TIM3)(Fig.1G)。 ATM對(duì)PTEN的磷酸化導(dǎo)致PTEN在質(zhì)膜上重新分布。MMP
外泌體CD44v6和C1QBP可能是預(yù)測(cè)PDAC患者預(yù)后的有前途的生物標(biāo)志物。MMP
JAK-Stat6信號(hào)通路在介導(dǎo)IL-4/IL-13誘導(dǎo)TME中TAMs免疫抑制極化過(guò)程中起關(guān)鍵作用。IL-4/IL-13刺激后，JAK磷酸化，隨后Stat6磷酸化，磷酸化后的Stat6二聚并遷移至細(xì)胞核，然后與IL-4/IL-13相應(yīng)基因，包括那些參與巨噬細(xì)胞免疫響應(yīng)功能的基因的啟動(dòng)子結(jié)合。據(jù)報(bào)道ROS可以促進(jìn)JAK和Stat6磷酸化。因此，推測(cè)MAO-A可能通過(guò)上調(diào)ROS水平影響巨噬細(xì)胞極化，從而使JAK-Stat6信號(hào)通路敏感。事實(shí)上，直接分析從B16-OVA荷瘤Maoa WT和Maoa KO小鼠中分離的TAMs證實(shí)，與野生型TAMs相比，MAO - A缺陷的TAMs顯示Stat6***降低（圖4k-l）。進(jìn)一步分析IL-4/ IL-13誘導(dǎo)的JAK-Stat6信號(hào)通路，與在Maoa WT BMDMs中相比，在Maoa KO BMDMs中JAK-Stat6信號(hào)***下降，補(bǔ)充H2O2可使其JAK-Stat6信號(hào)達(dá)到與WT類似水平（圖4m）。這些數(shù)據(jù)表明MAO-A通過(guò)ROS致敏的JAK-Stat6通路***促進(jìn)巨噬細(xì)胞免疫抑制極化。
總之，這些體內(nèi)外數(shù)據(jù)支持MAO-A促進(jìn)TME中免疫抑制極化，通過(guò)上調(diào)TAM細(xì)胞內(nèi)ROS水平，從而提高IL-4/ IL -13誘導(dǎo)的JAK-Stat6信號(hào)通路。 MMP
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過(guò)英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫(xiě)SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開(kāi)發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開(kāi)放參觀，客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
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4.二代測(cè)序：轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片：信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過(guò)表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)