前，PROTAC-DB包括1662個PROTAC，202個彈頭（靶向目標蛋白質的小分子），65個E3配體（能夠募集E3連接酶的小分子）和806個接頭，以及它們的化學結構，生物學活性和理化性質。除了彈頭和E3配體的生物活性外，PROTAC-DB還提供PROTAC的降解能力，結合親和力和細胞活性。
數(shù)據(jù)庫的查詢和瀏覽為了方便對PROTAC-DB中的數(shù)據(jù)進行檢索，作者提供了檢索和瀏覽工具。在檢索工具上，PROTAC-DB可以進行基于文本的檢索和基于結構的檢索?；谖谋镜乃阉魇窃谡麄€PROTAC-DB中進行搜索的一種簡單方式，只需輸入單個術語，如目標名稱、化合物名稱或ID。對于基于結構的搜索，用戶可以在ChemDoodle編輯器中輸入SMILES字符串、上傳MO***F文件或繪制分子草圖。導入自編輯的分子后，可以從三個搜索選項(similarity、substructure或exact)中選擇一個。在相似性搜索中，利用類FCFP指紋中的位向量Morgan指紋來計算兩個分子之間的Tanimoto相似度?？梢赃x擇數(shù)據(jù)集(PROTAC、彈頭、E3配體或Linker)進行搜索。 我們證明circSDHC作為miRNA-127-3p的海綿.重慶焦亡活化標書
結果顯示，敲低Mettl3降低了HCT116細胞中p53前體mRNA水平，而Mettl3過表達增加了p53前體mRNA水平而不影響hnRNPA2B1的蛋白質水平。使用針對p533'UTR和CDS區(qū)域的特異性引物進行MeRIP-qPCR以檢測m6A水平，結果顯示沉默Mettl3導致3'UTR峰m6A甲基化水平降低，而過表達Mettl3具有相反的效果。接下來，RIP分析證實了hnRNPA2B1和p53前體mRNA之間的相互作用通過消耗Mettl3被抑制或通過過度表達Mettl3增強。
p533'UTR熒光素酶報告基因檢測發(fā)現(xiàn)hnRNPA2B1敲低降低了含有p533'UTR的熒光素酶構建體的活性，而Mettl3過表達增加了由hnRNPA2B1敲低誘導的熒光素酶活性降低。建立了p533'UTRmut熒光素酶測定。發(fā)現(xiàn)p533'UTRmut的螢光素酶活性對hnRNPA2B1敲低或Mettl3過表達沒有反應。數(shù)據(jù)表明，p53前體mRNA的表達受hnRNPA2B1與p533'UTR上m6A位點的結合控制。 大連壞死標書肺*是**常診斷的**之一也是大多數(shù)國家**死亡的主要原因。
一、NPM1突變的AML聚集成兩個不同的組
為了在391個npm1突變的AML樣本中定義一致的分子亞型，我們使用CoINcIDE12框架應用元聚類方法。我們的元聚類分析顯示在我們的數(shù)據(jù)概要中有兩個穩(wěn)健的亞型(圖1A和補充圖1和2)。接下來，我們使用PERT算法13來闡明每個聚類中AML樣本的細胞組成。我們發(fā)現(xiàn)有一簇干細胞***富集，因此被標記為原始。與此相反，另一簇與髓系和造血分化相關的基因表達豐富，因此我們將其標記為committed亞型(圖1B)。兩個組在年齡、核型和白細胞計數(shù)等臨床病理參數(shù)方面沒有差異(卡方檢驗假發(fā)現(xiàn)率[FDR] >5%;補充表2 5)。
與基因表達改變一致，白樺素處理以濃度依賴性的方式***減少了膽固醇和脂肪酸的從頭合成（圖3D-E）。此外，白樺素降低了細胞膽固醇（圖3F）和中性脂質（主要是膽固醇酯和甘油三酸酯）的穩(wěn)態(tài)水平（圖3G）。 兩者合計，我們的數(shù)據(jù)表明白樺素抑制SREBP加工并下調膽固醇和脂肪酸的生物合成，從而降低細胞脂質水平。 有趣的是，洛伐他汀顯著降低了膽固醇的合成（圖3D），但也適度地增加了脂肪酸的生物合成（圖3E），這可能是因為洛伐他汀是HMGCR的抑制劑，它可以阻斷膽固醇的合成，進而刺激SREBP的活化，從而增加脂肪酸合成。 circRNAs在腎細胞*(RCC)中的表達模式和生物學功能.
4、hnRNPA2B1在外泌體miR-934向巨噬細胞轉移中發(fā)揮作用
據(jù)報道，外泌體RNA的分泌需要一種特定的RNA結合蛋白來轉運。通過RNApull-down分析和質譜分析，鑒定了三種可能參與miR-934轉運的RNA結合蛋白，并發(fā)現(xiàn)敲除hnRNPA2B1可以降低外泌體miR-934的表達（Fig.4a,b）。hnRNPA2B1是一種RNA結合蛋白，通過與特定基序GGAG/CCCU結合，參與miRNAs的運輸和轉錄后調控。特別是，由于miR-934序列中有兩個GGAG基序，我們推測hnRNPA2B1可能通過與GGAG序列結合，介導miR-934包裝成外泌體的過程。此外，miRNApull-down分析顯示，在細胞質和外泌體中，miR-934和hnRNPA2B1之間存在***的結合關系，然而，突變miR-934的結合序列(GGAG)可削弱這種結合（Fig.4c）。RNA免疫沉淀分析進一步證明，無論是在CRC細胞及其外泌體裂解物中，miR-934在anti-hnrnpa2b1抗體組中比在anti-IgG抗體組中更***富集（Fig.4d）。此外，敲除hnRNPA2B1可以抑制外泌體miR-934從HCT8和LoVo細胞轉移到巨噬細胞的過程（Fig.4e）。因此，這些結果證實hnRNPA2B1可以通過與miR-934的GGAG序列結合，介導miR-934包裝到CRC細胞外泌體中，并將外泌體miR-934轉移到巨噬細胞中。 E2F1是一種有效的轉錄調控因子.大連壞死標書
水蘇糖減輕DHEA誘導的多囊卵巢綜合征大鼠卵巢功能障礙.重慶焦亡活化標書
5.Caspase-11缺乏抑制小鼠肝細胞焦亡
我們評估了Caspase-11缺乏對MCD處理后小鼠焦亡活化的影響。我們檢測了Gsdmd和IL-1β的***，這是焦亡的兩個關鍵因素。我們在未處理的野生型和Caspase-11缺陷小鼠肝臟中檢測到類似的Gsdmd(圖5A和B)、Gsdmd-N(圖5A和C)和pro-IL-1β(圖5A和D)蛋白水平。此外，我們在野生型和Caspase-11缺陷小鼠的肝臟中均未檢測到成熟的IL-1β蛋白(圖5A和E)。MCD處理誘導了野生型小鼠肝臟中pro-Gsdmd(圖5A和B)、Gsdmd-N(圖5A和C)、pro-IL-1β(圖5A和D)和成熟IL-β(圖5A和E)的表達，表明MCD誘導了Gsdmd和IL-1β的***。相比之下，與MCD處理的野生型相比，MCD處理的Caspase-11缺陷小鼠肝臟中pro-Gsdmd(圖5A和B)、Gsdmd-N(圖5A和C)、pro-IL-1β(圖5A和D)和成熟IL-β(圖5A和E)的蛋白水平***降低。野生型小鼠和Caspase11缺陷小鼠肝臟中pro-caspase-1(圖5A和F)和cleavedcaspase-1(圖5A和G)的蛋白水平相似。
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