使用SmartSeq2協(xié)議對15個胎兒的單個細(xì)胞進(jìn)行scRNA-seq處理（圖1 a）。 基于差異表達(dá)(DE)分析和按標(biāo)準(zhǔn)化表達(dá)***性排序的前20個標(biāo)記基因。紅細(xì)胞(表達(dá)HBG1、HBA1、GYPA和ALAS2)、mk(表達(dá)FLI1、ITGA2B和GP9)、單核細(xì)胞祖細(xì)胞和單核細(xì)胞(表達(dá)CD14、MPEG1和CD33)、CD4+單核細(xì)胞、肥大細(xì)胞(表達(dá)CD63、GATA2和HDC)、漿細(xì)胞樣樹突狀細(xì)胞(pDCs;表達(dá)IL3RA,IRF8,MPEG1和JCHAIN)和另一簇高循環(huán)pDCs(表達(dá)pDC和增殖標(biāo)記物;例如，MKI67)和粒細(xì)胞1、2和3(表達(dá)AZU1、MPO和PRTN3)...

2、miR-208b由結(jié)腸*細(xì)胞以外泌體的方式分泌 隨后，作者探究了miR-208b的存在方式是否由外泌體介導(dǎo)。分離鑒定了3株CRC細(xì)胞系的外泌體，并檢測了其中miR-208b的表達(dá)。外泌體中miR-208b的表達(dá)模式和在細(xì)胞中的模式一致，在SW480-OXA***高于SW480***高于NCM460。這些結(jié)果表明CRC中miR-208b的是以外泌體的模式分泌，這可能和順鉑化療敏感性有關(guān)。 3、SW480細(xì)胞分泌的外泌體miR-208b促進(jìn)Treg擴(kuò)增 前人研究表明順鉑會影響**免疫微環(huán)境。MiRNA可能通過促進(jìn)Treg擴(kuò)增誘導(dǎo)免疫侵襲。因此，作者探究了CRC分泌外泌體m...

snoRNA與mRNA3’末端加工 在一項新的研究中，研究人員通過生化分析和大規(guī)模測序，發(fā)現(xiàn)mRNA3'末端加工復(fù)合體和部分snoRNA相互作用。在對其中的一種snoRNA富含U/A的SNORD50A進(jìn)一步開展體外實(shí)驗和體外實(shí)驗，結(jié)果表明SNORD50A在mRNA3'末端加工中主要發(fā)揮著一種競爭性抑制的用，并**終影響mRNA水平的表達(dá)[8] snoRNAs與應(yīng)激 反應(yīng)snoRNAs有助于細(xì)胞應(yīng)對應(yīng)急反應(yīng)。棕櫚酸酯處理能夠?qū)е录?xì)胞中SNORDs32A,33以及35A的表達(dá)水平也***提高。細(xì)胞對棕櫚酸酯產(chǎn)生抗性是由于抑制了SNORDs32A,33和35A的表達(dá)，它們介導(dǎo)了...

CircRNF13通過SUMO2抑制NPC的增殖和轉(zhuǎn)移 ***，作者進(jìn)行了拯救實(shí)驗，如圖8A-D所示，抑制circRNF13會促進(jìn)NPC的生物學(xué)功能，包括增殖，遷移和侵襲，但是過表達(dá)SUMO2會***挽救circRNF13敲除帶給NPC細(xì)胞的表型改變。免疫組化顯示，SUMO2在circRNF13過表達(dá)裸鼠**切片中低表達(dá)，而GLUT1則***高表達(dá)。以上證實(shí)circRNF13通過SUMO2抑制NPC的增殖和轉(zhuǎn)移。 總之，這些結(jié)果強(qiáng)調(diào)了circRNF13在鼻咽*增殖和轉(zhuǎn)移中的重要意義。CircRNF13作為抑*因子直接與SUMO2的3 -UTR結(jié)合，延長了SUMO2 mRNA的半...

三、染色質(zhì)可及性與細(xì)胞類型特異性轉(zhuǎn)錄因子活性和染色質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)有關(guān) HNF4A編碼驅(qū)動近端小管分化的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子。chromVAR檢測到近端小管DAR中HNF4A結(jié)合基序的富集(圖3b，基序活性)，這是HNF4A中染色質(zhì)可及性增強(qiáng)(圖3b，基因活性)和snRNA-seq數(shù)據(jù)集中HNF4A轉(zhuǎn)錄增強(qiáng)(圖3b，基因表達(dá))所支持的。我們通過染色質(zhì)免疫沉淀，然后定量PCR (ChIP-qPCR)驗證了HNF4A與腎近端小管上皮細(xì)胞(RPTEC，補(bǔ)充圖8a)中選定的靶基因位點(diǎn)(SLC34A1, SLC5A2, HNF4A) DAR中預(yù)測的HNF4A結(jié)合位點(diǎn)的結(jié)合。 然而，在RPTEC中可檢測到...

2、miR-208b由結(jié)腸*細(xì)胞以外泌體的方式分泌 隨后，作者探究了miR-208b的存在方式是否由外泌體介導(dǎo)。分離鑒定了3株CRC細(xì)胞系的外泌體，并檢測了其中miR-208b的表達(dá)。外泌體中miR-208b的表達(dá)模式和在細(xì)胞中的模式一致，在SW480-OXA***高于SW480***高于NCM460。這些結(jié)果表明CRC中miR-208b的是以外泌體的模式分泌，這可能和順鉑化療敏感性有關(guān)。 3、SW480細(xì)胞分泌的外泌體miR-208b促進(jìn)Treg擴(kuò)增 前人研究表明順鉑會影響**免疫微環(huán)境。MiRNA可能通過促進(jìn)Treg擴(kuò)增誘導(dǎo)免疫侵襲。因此，作者探究了CRC分泌外泌體m...

一、異種HSCT前后監(jiān)測腸道、口腔和鼻腔微生物群和宿主免疫系統(tǒng)。 在1年的時間里，從29名兒童的10個時間點(diǎn)收集糞便樣本、口腔拭子和前鼻孔拭子:在HSCT前2次，HSCT當(dāng)天，HSCT后1個月每周，以及HSCT后12個月的3個隨訪時間點(diǎn)(圖1)。通過16SrRNA基因譜測定這些樣本中的微生物群落動態(tài)。共對709份患者樣本(212份糞便樣本、248份口腔拭子和249份鼻拭子來自10個時間點(diǎn))進(jìn)行了鑒定。發(fā)現(xiàn)移植前患者的微生物群落組成與健康對照不同；三個身體部位性在HSCT后微生物α多樣性下降；在一年中，微生物群落動態(tài)呈現(xiàn)出三個階段：第一階段(在檢查前和適應(yīng)開始時的樣本)，第二階段(HS...

1.下載GEO數(shù)據(jù)（./geo/）并進(jìn)行預(yù)處理下載數(shù)據(jù)集GSE28829，GSE41571和GSE43292，使用Perl腳本和R軟件的sva軟件包進(jìn)行原始數(shù)據(jù)的合并和預(yù)處理。然后，使用Perl腳本將每個基因的探針I(yè)D轉(zhuǎn)換為基因名。，這些數(shù)據(jù)可從CIBERSORT網(wǎng)站（CIBERSORT./）進(jìn)行下載。使用CIBERSORT對表達(dá)文件的P值和均方根誤差進(jìn)行計數(shù)，獲得免疫細(xì)胞收據(jù)，使用R包，corplot，vioplot和ggplot2進(jìn)行結(jié)果的可視化。 3.免疫浸潤細(xì)胞分析對斑塊中浸潤的免疫細(xì)胞進(jìn)行了相關(guān)分析，結(jié)果表明活化的肥大細(xì)胞和TFH細(xì)胞顯示出協(xié)同的作用。 METTL1...

三、ICICLE-seq聯(lián)合測量可及性和表位 A.在標(biāo)準(zhǔn)的scATAC-seq協(xié)議下，細(xì)胞膜的去除切斷了細(xì)胞表面和細(xì)胞染色質(zhì)狀態(tài)之間的連接。為了測試我們在通透性細(xì)胞上同時測量細(xì)胞表面蛋白和染色質(zhì)狀態(tài)的能力，我們修改了我們優(yōu)化的通透性細(xì)胞scATAC-seq方法，將其納入使用商用條形碼抗體試劑的測量，我們將這種新方法稱為ICICLE-seq.ICICLE-seq協(xié)議利用定制的Tn5轉(zhuǎn)座復(fù)合體，其捕獲序列與基因組公司的10xscRNA-seq凝膠珠捕獲反應(yīng)兼容，可同時捕獲ATAC片段和多聚腺苷化抗體條形碼序列. B.UMAP投影和ATAC標(biāo)記轉(zhuǎn)移在ICICLE-seq數(shù)據(jù)上的分辨率...

2021年4月，加拿大University Ave和中國香港大學(xué)團(tuán)隊與**研究所表觀遺傳學(xué)和基因組穩(wěn)定性小組在Cell Death & Differentiation 雜志上發(fā)表了文章“The PTEN and ATM axis controls the G1/S cell cycle checkpoint and tumorigenesis in HER2-positive breast cancer”。此報道發(fā)現(xiàn)ATM磷酸化PTEN的398位(人類蘇氨酸;在小鼠絲氨酸)的***，為了理解ATM磷酸化PTEN的生物學(xué)意義，建立了一個小鼠模型，構(gòu)建了一個不能被ATM磷酸化的PTEN突變形式，...

2）UCP1在AKI中***下調(diào)，且與腎損傷嚴(yán)重程度呈高度負(fù)相關(guān) UCPs超家族與能量代謝密切相關(guān)，并在多種疾病中介導(dǎo)脂質(zhì)消耗?；赨CPs的功能，我們通過westernblot和免疫組化方法對正常C57小鼠腎組織中UCP1、UCP2和UCP3的表達(dá)進(jìn)行了表征。結(jié)果顯示，UCP1和UCP2表達(dá)較好，而UCP3幾乎未檢測到(圖2A-B)。在UCPs中，UCP1被認(rèn)為是脂質(zhì)降解**關(guān)鍵的基因，而UCP2與之沒有直接關(guān)系。因此，我們選擇UCP1進(jìn)行進(jìn)一步分析，證實(shí)其在皮質(zhì)小管中高表達(dá)，在髓質(zhì)中部分表達(dá)，C57小鼠、Sprague-Dawley大鼠、Wistar大鼠腎小球、**幾乎無表達(dá)(圖...

近日，美國圣路易斯華盛頓大學(xué)醫(yī)學(xué)院Yoshiharu Muto教授等在Nature communications發(fā)布了Single cell transcriptional and chromatin accessibility profiling redefine cellular heterogeneity in the adult human kidney的研究論文。文中，作者采用單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組snRNA-seq和單細(xì)胞核染色質(zhì)可及性snATAC-seq技術(shù)，對5個健康成人（50歲到62歲，男性(n = 3)和女性(n = 2)）腎臟樣本進(jìn)行檢測。此文揭示腎臟內(nèi)獨(dú)特的細(xì)胞狀態(tài)，并重新...

4、RBM17促進(jìn)PTC細(xì)胞的增殖和遷移，并在PTC**組織中升高 接下來探究RBM17在PTC細(xì)胞中的功能，RBM17的mRNA和蛋白表達(dá)在K1細(xì)胞系中遠(yuǎn)低于TPC-1和BCPAP細(xì)胞，其表達(dá)趨勢類似于tiRNA-Gly（圖4A-B）。于是構(gòu)建了RBM17過表達(dá)的K1細(xì)胞系，發(fā)現(xiàn)其增殖和遷移曾麗***增加（圖4C-F）。RBM17敲低則效果相反（圖4G-J）。此外，RBM蛋白表達(dá)在PTC**組織中***高于*旁組織（圖4K）。以上結(jié)果表明RBM17的作用和tiRNA-Gly相似，在PTC中促進(jìn)**進(jìn)展。 5、RBM17的衰減抑制了tiRNA-Gly對PTC細(xì)胞的影響，RBM1...

一、實(shí)驗流程：1.樣品提取總DNA。2.基因組片段化、加測序接頭。3.瓊脂糖凝膠電泳回收合適大小的片段。4.完成測序文庫的制備,用lluminaHiseq2500進(jìn)行測序。二、數(shù)據(jù)分析1、測序質(zhì)量評估2、宿主基因組比對與覆蓋度read統(tǒng)計3、Denovo基因組組裝拼接4、Denovo組裝拼接性能評估5、Unigene預(yù)測6、Unigene功能注釋7.微生物種群鑒別分析8、微生物種群進(jìn)化分析9、微生物種群差異分析10、微生物種群結(jié)構(gòu)分析。英拜專業(yè)專注于國內(nèi)外醫(yī)學(xué)研究熱點(diǎn)。上海英拜生物設(shè)有專業(yè)的武漢技術(shù)中心?；|(zhì)蛋白酶科研省自然科學(xué)基金 4）Pex來源的CD44v6對于HSCs的***是必要的，...

2021年6月，***一篇發(fā)表在Nat Immunol.（IF=25.600）的文章（Mitochondrial stress induced by continuous stimulation under hypoxia rapidly drives T cell exhaustion.）當(dāng)**內(nèi)衰竭T細(xì)胞經(jīng)歷嚴(yán)重缺氧時，他們假設(shè)代謝應(yīng)激會改變其對其他信號的反應(yīng)，特別是持續(xù)的抗原刺激。在體外，盡管單獨(dú)經(jīng)歷連續(xù)刺激或缺氧的CD8 + T細(xì)胞分化為功能性效應(yīng)物，但這種組合迅速驅(qū)動了與衰竭一致的T細(xì)胞功能障礙。連續(xù)刺激促進(jìn)了Blimp-1介導(dǎo)的PGC-1α依賴性線粒體重編程阻遏作用，使細(xì)胞對缺氧的...

***是一種系統(tǒng)性疾病，與炎癥細(xì)胞浸潤和免疫相關(guān)途徑的***有關(guān)。本文旨在揭示與免疫相關(guān)的變化，并探索頸***斑塊形成過程中的新型免疫學(xué)特征。首先，我們應(yīng)用了集成的生物信息學(xué)方法，包括CIBERSORT和基因集富集分析（GSEA）。基因表達(dá)矩陣GSE28829，GSE41571和GSE43292是從基因表達(dá)綜合（GEO）數(shù)據(jù)集獲得的。經(jīng)過一系列數(shù)據(jù)預(yù)處理步驟后，使用CIBERSORT，GSEA和ClusterProfiler軟件包對所得的組合表達(dá)矩陣進(jìn)行了分析。在對早期和晚期頸***斑塊進(jìn)行比較和分析后，我們發(fā)現(xiàn)，在晚期斑塊中活化記憶CD4T細(xì)胞的百分比較高，而靜息記憶CD4細(xì)胞的百分比較低。...

VD以VDR依賴的方式調(diào)控AMPK 由于維生素D通過VDR發(fā)揮其比較大的生物學(xué)作用，我們使用HK-2VDRKO細(xì)胞研究VD是否通過VDR***AMPK。結(jié)果表明l，paricalcitol增加了PRKAA1和ULK1的磷酸化，而在高糖條件下則降低了PRKAA1和ULK1的磷酸化。而在HK-2VDRKO細(xì)胞中，這種作用完全消失。此外， 二甲雙胍在高糖條件下***了HK-2WT細(xì)胞中的PRKAA1和ULK1，但二甲雙胍的這種作用在HK-2VDRKO細(xì)胞中仍然可以觀察到。這些結(jié)果表明VD以VDR依賴的方式***AMPK。 英拜的員工福利待遇很好。北京上皮細(xì)胞科研 6、外泌體miR-138...

有趣的是，研究報道S100A4可以增強(qiáng)STAT3的磷酸化，而STAT3的磷酸化與OPN的表達(dá)是相關(guān)的，并且STAT3被預(yù)測是OPN的潛在轉(zhuǎn)錄因子。因此，檢測了S100A4敲除和過表達(dá)后OPN表達(dá)，STAT3表達(dá)和STAT3磷酸化，結(jié)果顯示OPN表達(dá)和STAT3磷酸化水平與S100A4的變化趨勢一致；并且敲除STAT3后HCC細(xì)胞系中OPN表達(dá)和STAT3磷酸化被***抑制（圖5a-c）。這些結(jié)果表明S100A4可以***STAT3磷酸化并增加OPN表達(dá)。 為了進(jìn)一步探究S100A4過表達(dá)外泌體對STAT3磷酸化和OPN表達(dá)的影響，使用該外泌體預(yù)處理HCC細(xì)胞，結(jié)果顯示它可以***促進(jìn)...

我們進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)，MCD處理的Caspase-11缺陷小鼠顯示更低的血清谷丙轉(zhuǎn)氨酶(ALT)水平(圖2D)、血清天冬氨酸轉(zhuǎn)氨酶(AST)水平(圖2E)和肝臟甘油三酯水平(圖2F)。總之，我們的結(jié)果表明Caspase-11缺陷減輕了MCD誘導(dǎo)的小鼠肝臟脂肪變性。 3.Caspase-11缺乏減弱NASH小鼠的肝纖維化 通過測量纖維化相關(guān)因子的表達(dá)我們評估Caspase-11缺失對MCD誘導(dǎo)的肝纖維化的影響。在正常條件下，野生型和Caspase-11缺陷小鼠的TGF-β(圖3A)、α-Sma(圖3B)和Col1a1(圖3C)表達(dá)相似。MCD處理的野生型小鼠中TGF-β、α-Sma和C...

在TYRO3-OE 4T1**細(xì)胞中，阻斷鐵死亡的基因上調(diào)（Slc40a1、Slc7a11、Slc3a2、Gpx4、Fth1和Blvrb），而增強(qiáng)鐵死亡的基因下調(diào)（Slc5a1、Tfrc）。在接受抗PD-1***的黑色素瘤患者中，阻止脂質(zhì)過氧化和鐵死亡的分子SLC3A2與TYRO3***共表達(dá)。抗PD-1***后，Tyro3-OE CD45-**細(xì)胞的脂質(zhì)ROS水平低于4T1-P CD45-**細(xì)胞，而加入抗PD-1***增加4T1-P**細(xì)胞的脂質(zhì)ROS，但不增加Tyro3-OE**細(xì)胞的脂質(zhì)ROS，表明Tyro3抑制抗PD-1誘導(dǎo)的**細(xì)胞鐵死亡。在體外用鐵死亡誘導(dǎo)劑erastin和鐵死亡...

N6-甲基腺苷（m6A）是一種真核mRNA修飾，通過改變mRNA穩(wěn)定性、剪接、運(yùn)輸、定位、翻譯、微RNA（miRNA）處理和RNA-蛋白質(zhì)相互作用來調(diào)節(jié)基因表達(dá)，并改變修飾RNA分子的命運(yùn)。新的證據(jù)表明m6A修飾與**增殖、分化、**發(fā)生、侵襲和轉(zhuǎn)移相關(guān)，并在**發(fā)展中發(fā)揮重要作用。此外，m6A修飾還受許多蛋白質(zhì)編碼基因調(diào)控，非編碼RNA（如miRNAs、lncRNAs）通過相互作用控制切割、定位、運(yùn)輸、穩(wěn)定性和降解以及影響**細(xì)胞的增殖、浸潤和轉(zhuǎn)移等生物過程。***我們來講一篇關(guān)于泛*m6A相互作用的RNA的文章，文章題名為：Comprehensiveanalysesofm6Aregulat...

放線菌素D處理后的 qRT-PCR 和 RT-PCR 分析表明，circACTN4 在指定的時間點(diǎn)具有抗性。隨后，生物信息學(xué)預(yù)測上游轉(zhuǎn)錄因子2(USF2)可能與ACTN4的啟動子結(jié)合。因此，構(gòu)建了攜帶全長野生型和突變型ACTN4啟動子的熒光素酶報告基因載體，結(jié)果表明USF2增強(qiáng)了熒光素酶野生型熒光素酶報告基因的活性。Chip-qPCR檢測進(jìn)一步證明USF2可以與ACTN4基因啟動子結(jié)合并增強(qiáng)其轉(zhuǎn)錄活性。設(shè)計并構(gòu)建了USF2過表達(dá)和敲低質(zhì)粒，通過qRT-PCR檢測到轉(zhuǎn)染相應(yīng)質(zhì)粒的BC細(xì)胞中ACTN4的表達(dá)。結(jié)果表明，上調(diào)的 USF2 顯著增加了線性ACTN4和circACTN4的表達(dá)，而下調(diào)...

非酒精性脂肪性肝炎(NASH)是一種結(jié)果嚴(yán)重的炎癥性疾病。肝細(xì)胞死亡，包括凋亡、壞死和焦亡，在NASH的病理生理學(xué)中已被證實(shí)。到目前為止，Caspase-11在NASH中的確切作用仍不清楚。本文詳細(xì)介紹了2021年4月發(fā)表于“Cell Mol Gastroenterol Hepatol”（IF=7.706）的文章“Caspase-11–Mediated Hepatocytic Pyroptosis Promotes the Progression of Nonalcoholic Steatohepatitis”。本研究探討了Caspase-11在NASH中的潛在作用。NASH小鼠肝臟中Cas...

二、npm1突變AML患者聚集的分子基礎(chǔ) DH2是鈣粘蛋白家族的一員，被認(rèn)為是決定干細(xì)胞命運(yùn)的調(diào)節(jié)因子15。類似地，G蛋白偶聯(lián)受體12(GPR12)在原始亞型中上調(diào)，已知在干細(xì)胞維持和**干細(xì)胞的體細(xì)胞重編程中發(fā)揮作用。MyoD家族抑制劑(MDFI)在原始亞型中表達(dá)增加，據(jù)報道它是WNT信號通路的調(diào)節(jié)因子，只在造血干細(xì)胞祖細(xì)胞中表達(dá)。鋅指蛋白521(ZNF521)是一種轉(zhuǎn)錄因子，其在人類白血病細(xì)胞系中被敲低可以減少增殖但在原始亞型中卻有***的高表達(dá)。CD163是一種免疫調(diào)節(jié)劑，是巨噬細(xì)胞清清體受體家族的成員，已知在單核細(xì)胞系的AML細(xì)胞中表達(dá)。在committedcluster中其...

急性髓系白血病(AML)是一種基因和生物學(xué)上的異質(zhì)性疾病，其特征是克隆擴(kuò)增和突變的造血干細(xì)胞和祖細(xì)胞分化受損。在AML**常見的驅(qū)動突變中，NPM1基因第12外顯子的4堿基對插入是穩(wěn)定的，在20%-30%的病例中發(fā)生。由于其生物學(xué)意義和預(yù)后影響，NPM1突變在世界衛(wèi)生組織(WHO)的髓性白血病分類中**了一個獨(dú)特的白血病實(shí)體，并在預(yù)后和***決策中發(fā)揮重要作用。NPM1突變通常與誘導(dǎo)和鞏固化療后患者生存的良好影響相關(guān)。在NPM1突變的AML中，F(xiàn)LT3-ITD突變經(jīng)常與DNMT3A突變同時發(fā)生，這本身與接受標(biāo)準(zhǔn)誘導(dǎo)***的患者預(yù)后更差有關(guān)。大多數(shù)關(guān)于NPM1突變的AML的研究都集中在其他突變的...

野生型小鼠和Caspase11缺陷小鼠肝臟中pro-caspase-1(圖5A和F)和cleavedcaspase-1(圖5A和G)的蛋白水平相似。在野生型小鼠和Caspase-11缺陷小鼠中，MCD處理***降低了pro-caspase1的蛋白水平(圖5A和F)，而增加了活性Caspase-1的蛋白水平(圖5A和G)。此外，Caspase-11缺陷小鼠的活性caspase-1水平明顯低于野生型小鼠，說明MCD處理Caspase-11缺陷小鼠肝臟中Caspase-1的***較少。同樣，我們在MCD處理的Caspase-11缺陷小鼠的肝細(xì)胞中檢測到較少的Gsdmd-N表達(dá)(圖5H和I)。這些...

NPC-EVs通過轉(zhuǎn)染miR-144增強(qiáng)體外和體內(nèi)HUVECs的血管樣管形成 我們評估NPC-EVs來源的miR-144對HUVECs血管樣管結(jié)構(gòu)的影響，以闡明**分泌的miR-144在血管生成中的作用?；诨|(zhì)膠的體外血管生成實(shí)驗(圖4A)表明，miR-144模擬物處理的鼻咽*細(xì)胞EVs***促進(jìn)了體外HUVECs的血管樣管形成，這與miR-144抑制劑處理的鼻咽*細(xì)胞EVs的結(jié)果形成了鮮明對比。接下來，為了進(jìn)一步證明NPC-EVs來源的miR-144的促血管生成活性，我們在裸鼠中進(jìn)行了體內(nèi)Matrigel實(shí)驗，以鑒定移植凝膠栓中新形成的血管(圖4B和4C)。我們發(fā)現(xiàn)，來自miR-...

3、CDK4/6抑制劑促進(jìn)記憶形成通過RB介導(dǎo)的G1停滯 為了確定驅(qū)動CDK4/6i誘導(dǎo)的記憶，對調(diào)節(jié)記憶標(biāo)記的基因CD62L(SELL)，進(jìn)行了全基因組CRISPR/Cas9篩選，用基因組范圍的sgRNA文庫轉(zhuǎn)導(dǎo)表達(dá)Cas9的JurkatT細(xì)胞（CDK4/6抑制后上調(diào)CD62L），然后用CDK4/6i處理，并對未能上調(diào)CD62L的細(xì)胞進(jìn)行熒光***細(xì)胞分選(Fig.3A)。對分選群體進(jìn)行測序發(fā)現(xiàn)，靶向RB轉(zhuǎn)錄共抑制因子1(RB1)的sgRNA*在處理條件下***富集(Fig.3B)，暗示RB是CDK4/6i誘導(dǎo)CD62L上調(diào)所必須的。隨后對急性(2h)暴露于CDK4/6i后的Jur...

3.TYRO3通過抑制鐵死亡和**TME，誘導(dǎo)抗PD-1/PD-L1耐藥性。 為探究TYRO3在TME中的功能，首先評估了TYRO3-OE4T1和4T1-P**之間免疫學(xué)特征的整體變化。免疫細(xì)胞譜分析發(fā)現(xiàn)在CD45-**細(xì)胞中，Tyro3過表達(dá)與PD-L1或caspase-3無關(guān)，Tyro3-OE**中M1樣巨噬細(xì)胞水平降低，M1/M2比值下降，提示**表達(dá)的Tyro3促進(jìn)M1～M2巨噬細(xì)胞極化。用TYRO3-OEBT549細(xì)胞或TYRO3-OE和TYRO3–/–4T1**細(xì)胞的條件培養(yǎng)基孵育THP1單核細(xì)胞或骨髓源性巨噬細(xì)胞，進(jìn)一步驗證TYRO3的體外***功能。RNA-Seq發(fā)現(xiàn)...

4）USP35過表達(dá)減少erastin/RSL3觸發(fā)的鐵紊亂和鐵死亡 erastin和RLS3誘導(dǎo)的ROS和MDA生成因USP35過表達(dá)而減少(圖4A，B)。此外，在erastin和RLS3處理的*細(xì)胞中，HETEs水平升高，但在除12-HETE外的USP35過表達(dá)的*細(xì)胞中，HETEs水平降低(圖4C，F(xiàn))。然而，USP35過表達(dá)對GSH含量和GPX4活性沒有影響(圖4G，H)。如圖4I，J所示，USP35的過表達(dá)***減弱了用erastin或RSL3刺激H460和H1299細(xì)胞誘導(dǎo)LIP和Fe2+的作用。與表型改變一致，在基礎(chǔ)條件下，USP35過表達(dá)對鐵代謝和鐵死亡也沒有影響(圖...