我們進一步發(fā)現(xiàn),MCD處理的Caspase-11缺陷小鼠顯示更低的血清谷丙轉(zhuǎn)氨酶(ALT)水平(圖2D)、血清天冬氨酸轉(zhuǎn)氨酶(AST)水平(圖2E)和肝臟甘油三酯水平(圖2F)??傊?,我們的結(jié)果表明Caspase-11缺陷減輕了MCD誘導(dǎo)的小鼠肝臟脂肪變性。
3.Caspase-11缺乏減弱NASH小鼠的肝纖維化
通過測量纖維化相關(guān)因子的表達我們評估Caspase-11缺失對MCD誘導(dǎo)的肝纖維化的影響。在正常條件下,野生型和Caspase-11缺陷小鼠的TGF-β(圖3A)、α-Sma(圖3B)和Col1a1(圖3C)表達相似。MCD處理的野生型小鼠中TGF-β、α-Sma和Col1a1的表達***上調(diào)。相比之下,MCD處理的Caspase-11缺陷小鼠TGF-β、α-Sma和Col1a1的mRNA水平***降低。這些結(jié)果表明,Caspase-11缺乏可減少MCD處理小鼠的肝纖維化。 英拜注重客戶的隱私。上海糞便微生物科研
TCGA泛*中的m6A概況
為了表征m6A模式和篩選潛在靶點,在TCGA中的9804個泛*樣本中開發(fā)了一個四步計算框架。經(jīng)過質(zhì)量控制后,共有23個m6A調(diào)節(jié)因子、56個m6A交互蛋白編碼基因、10個lncRNAs和17個miRNAs被納入本研究。106個基因有密切的共表達關(guān)系(Pearsonr>0.3)。在共表達調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中,大多數(shù)m6A調(diào)節(jié)因子和一些蛋白質(zhì)編碼基因是與其他基因相互作用的樞紐基因。在不同**類型*旁組織的差異表達比較中,許多基因在**組織中的表達水平較高,而一些蛋白質(zhì)編碼基因則表現(xiàn)出相反的關(guān)系。這些基因包括ASB2、P2RX6、AXL、ID2和SOCS2;miR-143、miR-29a、miR-125b-1和miR-145等4種miRNA在**組織中表達較低。所有l(wèi)ncRNAs在**組織中均有較高的表達。利用**和正常組織的前兩個主成分(PC),我們發(fā)現(xiàn)m6A模式具有良好的鑒別診斷價值。曲線下面積(AUC)在大多數(shù)**中超過90%。 丁酸科研地區(qū)科學(xué)基金大黃酸改變嘌呤代謝降低尿酸水平。
肝miRNA發(fā)現(xiàn)者miRNAPCR芯片用于研究肝組織豐富表達或特異性表達的84個miRNA。已注釋的miRNA的數(shù)量不斷擴大,重點關(guān)注那些特異表達某種細胞系或組織的miRNA變得尤為重要,并非所有的miRNA在每一個組織中都表達。因此,我們通過實驗在人類肝臟樣本池通過miRBaseV18分析已鑒定的miRNA的表達,并將結(jié)果與相關(guān)文獻進行比較。每一種miRNA可以調(diào)節(jié)一個或多個信使RNA轉(zhuǎn)錄,反之一個給定的信使RNA可以由-個或多個miRNA調(diào)節(jié)。因此,盡管他們很有特點,每個miRNA的復(fù)雜作用尚未完全定義。這個芯片比較大化發(fā)現(xiàn)與肝組織或肝細胞系生物學(xué)表型相關(guān)的miRNA。每張芯片含一個對照組使得分析數(shù)據(jù)時可以用相對定量00CT方法評估逆轉(zhuǎn)錄效率,基因組DNA污染和PCR效率。利用這張芯片,通過實時定量PCR,可以簡易且可靠地肝中miRNA的表達。
6.靶向遞送lnc-PMIFsiRNA接近骨形成表面的OPCs促進老年小鼠骨形成
接下來評價lnc-PMIF在骨形成表面周圍的老年OPCs中系統(tǒng)靶向沉默對衰老相關(guān)骨質(zhì)疏松的影響。為促進lnc-PMIFsiRNA(即si-PMIF)接近骨形成表面周圍的OPCs,si-PMIF或si-NC被包裹在骨形成表面靶向遞送系統(tǒng)(即,(DSS6)-脂質(zhì)體)。21月齡自然衰老的雄性和雌性小鼠靜脈注射(DSS6)-脂質(zhì)體-si-PMIF、(DSS6)-脂質(zhì)體-si-NC或(DSS6)-脂質(zhì)體單藥(溶劑)。si-PMIF處理組Gli1+細胞中l(wèi)nc-PMIF的表達***降低,si-PMIF處理組兩種性別小鼠的骨量更高,脛骨干骺端微結(jié)構(gòu)更好,BMD和BV/TV更高,MAR和BFR/BS較高。這些發(fā)現(xiàn)表明,靶向沉默骨形成表面周圍OPCs中的lnc-PMIF可以促進衰老相關(guān)骨質(zhì)疏松小鼠的骨形成。 這些數(shù)據(jù)表明大黃酸***可以改善DSS誘導(dǎo)的結(jié)腸炎。
以上數(shù)據(jù)提示,miR-934異常高表達與結(jié)直腸***進展及肝轉(zhuǎn)移***相關(guān)。生存分析顯示,與miR-934表達較低的患者相比,miR-934表達較高的患者總生存期(OS)和無病生存期(DFS)較低(Fig.1f,g)。因此,在CRLM患者中,miR-934高表達與CRLM進展和預(yù)后不良呈正相關(guān)。
2、miR-934存在于CRC細胞衍生的外泌體中
miR-934在HCT-8和LoVo的CM中的表達***高于其它細胞(Fig.2a)。隨后,研究發(fā)現(xiàn)HCT-8和LoVo的CM中miR-934的表達***高于細胞核和細胞質(zhì)(Fig.2b,c)。并且,miR-934在CM中的表達不隨RNaseA的處理而改變,而隨RNaseA+TritonX-100的處理***下降(Fig.2d),這表明細胞外的miR-934被膜包裹,而不是直接分泌。因此,推測miR-934可能是被外泌體傳輸。電鏡和納米顆粒追蹤分析表明,miR-934表達水平較高的CRC細胞分泌的外泌體比miR-934表達水平較低的CRC細胞分泌的外泌體更多(Fig.2e,f)。各組外泌體標志物CD9,ALIX,TSG101均被WB檢測到(Fig.2g)。 英拜生物提供生物科學(xué)內(nèi)的專業(yè)的技術(shù)咨詢,技術(shù)合作。多細胞亞型科研分子生物學(xué)實驗
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2)M1-BMDMs來源的外泌體加重了bEnd.3細胞的EndoMT
我們評估了M1-BMDMs對bEnd.3細胞的影響。結(jié)果表明,M1-BMDMs條件培養(yǎng)基(M1-CM)***降低了bEnd.3細胞TEER值(圖2A),并增加通透性(圖2B)。此外,TJs蛋白熒光染色顯示,M1-CM處理***降低了bEnd.3細胞膜ZO-1和Occludin的表達(圖2C和D)。為了進一步研究M1-BMDMs是否通過外泌體破壞血管內(nèi)皮細胞的TJs,我們使用外泌體分泌抑制劑GW4869預(yù)處理M1-BMDMs。我們發(fā)現(xiàn),加入GW4869部分逆轉(zhuǎn)了M1-CM誘導(dǎo)的TEER值的下降(圖2A),滲透率增加(圖2B);GW4869也逆轉(zhuǎn)了TJs蛋白熒光強度下降的趨勢(圖2C和D)。相應(yīng)的,TJs蛋白表達水平也出現(xiàn)了類似的結(jié)果(圖2E)。有趣的是,通過對脊髓切片中的α-SMA和CD31進行共染色,我們發(fā)現(xiàn)損傷部位的共定位比未損傷部位更多(圖2F和G)。M1-CM***改變bEnd.3細胞形態(tài),分枝減少,胞體拉長(圖2H)。此外,M1-CM暴露***降低了CD31的表達,并強烈增強了EndoMT標記物膠原I、III和α-SMA在bEnd.3細胞中的表達(圖2I)。然而,GW4869可以部分扭轉(zhuǎn)這些影響。綜上所述,外泌體可能介導(dǎo)巨噬細胞和血管內(nèi)皮細胞之間的相互作用,并可能是巨噬細胞誘導(dǎo)血管內(nèi)皮細胞EndoMT的原因。 上海糞便微生物科研
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標書申請:提供標書課題設(shè)計、撰寫,標書部分基礎(chǔ)實驗的開展,設(shè)計的標書均符合科研前沿?zé)狳c,中標率很高。
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4.二代測序:轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學(xué)實驗