深圳mTOR信號通路芯片科研

來源: 發(fā)布時間:2021-11-11

近日,美國圣路易斯華盛頓大學醫(yī)學院Yoshiharu Muto教授等在Nature communications發(fā)布了Single cell transcriptional and chromatin  accessibility profiling redefine cellular  heterogeneity in the adult human kidney的研究論文。文中,作者采用單細胞核轉(zhuǎn)錄組snRNA-seq和單細胞核染色質(zhì)可及性snATAC-seq技術,對5個健康成人(50歲到62歲,男性(n = 3)和女性(n = 2))腎臟樣本進行檢測。此文揭示腎臟內(nèi)獨特的細胞狀態(tài),并重新定義近端小管和粗升肢的細胞異質(zhì)性。英拜專注高通量測序行業(yè)的整體服務。深圳mTOR信號通路芯片科研

8)在AKI期間上調(diào)UCP1減少脂質(zhì)積累,可通過AMPK/ULK1途徑促進體內(nèi)自噬

我們發(fā)現(xiàn)UCP1在體外通過***自噬來影響AKI中的細胞功能,我們探討了這種情況在體內(nèi)是否也會發(fā)生。結(jié)果表明,在動物模型中上調(diào)UCP1也能******AMPK/ULK1/自噬通路(圖8A),免疫熒光和免疫組化分析進一步證實了這一點(圖8B-C)。***,CL316243上調(diào)UCP1后,AMPK/ULK1/自噬通路也被******(圖8D-F)。綜上所述,我們的研究構建了AKI中脂質(zhì)積累***的模型,且這種積累的脂質(zhì)與UCP1呈負相關。通過上調(diào)UCP1來***AKI中積累的脂質(zhì),可以***AMPK/ULK1/自噬通路來抑制疾病進展(圖9)。

結(jié)論:UCP1直接調(diào)控AKI中的脂質(zhì)積累,***細胞自噬,從而***抑制疾病進展。這為AKI的***提供了新的思路和靶點。 肺動脈高壓科研文章檢測了小鼠腸系膜淋巴結(jié)(MLN)中的Th17細胞(與結(jié)腸炎癥密切相關)。

3)DRD2重新編碼MφM1表型,下調(diào)IL-6和IL-10

據(jù)報道,DRD2可調(diào)節(jié)M1的極化。結(jié)果顯示,在DRD2表達水平較高的BrCa組織中,M1Mφ的浸潤增加,M2Mφ的浸潤減少(圖3A)。為進一步研究DRD2對TAMs的調(diào)控作用,構建了BrCa與Mφ共培養(yǎng)體系。當Mφ與表達DRD2的BrCa細胞共培養(yǎng)時,qRT-PCR顯示M1表型標記增加,M2Mφ標記下調(diào)(圖3B-C)。qRT-PCR也證實了載體轉(zhuǎn)染的BrCa細胞將Mφ調(diào)節(jié)為M2型(圖3C)[12]。WB結(jié)果顯示,表達DRD2的BrCa細胞上調(diào)M1標記iNOS,下調(diào)M2標記CD206(圖3D)。IF染色顯示,與表達DRD2的**細胞共培養(yǎng)后,Mφ表現(xiàn)為M1表型(圖3E)。上述結(jié)果表明,BrCa中的DRD2具有將Mφ重新編碼為M1表型的能力。為了探索使Mφ向M1表型分化的關鍵調(diào)控因子,我們進行了細胞因子陣列分析。結(jié)果表明,TNF-α和兩種誘導M1極化的經(jīng)典細胞因子IFNγ均未增加。而與Mφ共培養(yǎng)后,DRD2***下調(diào)IL-6和IL-10(圖3F)。分析熒光值,進一步證實IL-6和IL-10下調(diào)(圖3F)。因此,DRD2可以將Mφ重新編碼為M1表型,并在crosstalk過程中***下調(diào)IL-6和IL-10。

人類人臍帶來源的間充質(zhì)干細胞(hUC-MSCs)移植被證實是***系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SLE)的有效方法,但是詳細的潛在機制仍不明確。轉(zhuǎn)運miRNAs可能是MSCs交流其它細胞的方法。Sirt1是一種NAD依賴的去乙?;福ㄟ^去乙?;痯53來防止細胞衰老。本研究旨在探討在MRL/lpr狼瘡小鼠模型中,hUC-MSCs是否通過miRNA調(diào)節(jié)Sirt1/p53來影響脾CD4+ T細胞的衰老。本文于2021年1月發(fā)表在《Theranostics》IF:8.597期刊上。

1、hUC-MSCs減輕緩解MRL/lpr小鼠的疾病進展

為了評估對MRL/lpr小鼠狼瘡綜合征的***作用,從17周齡開始用5×105hUC-MSCs或PBS***MRL/lpr小鼠,并在21周齡時處死所有小鼠(圖1A)。與PBS處理的小鼠相比,hUC-MSC處理的小鼠的腎臟病變明顯減少(圖1B)。此外,與PBS處理的MRL/lpr小鼠相比,hUC-MSCs處理后小鼠的脾臟重量和蛋白尿明顯降低(圖1C-D)。hUC-MSCs***組的血清anti-dsDNA抗體水平較低,但未達到統(tǒng)計學水平(圖1E)。數(shù)據(jù)表明hUC-MSCs改善MRL/lpr小鼠的狼瘡疾病。 英拜在全國各省會城市均有自己的**客戶。

CircMYH9通過hnRNPA2B1調(diào)節(jié)p53前體mRNA的穩(wěn)定性

為了解釋circMYH9調(diào)節(jié)p53表達的機制,進行了qRT-PCR和FISH以確定circMYH9在HCT116和LoVo細胞中的亞細胞位置。結(jié)果表明,circMYH9主要定位于細胞核中。由于circMYH9敲低不影響p53啟動子活性。有趣的是,在用放線菌素D阻斷新的RNA合成后,發(fā)現(xiàn)沉默circMYH9并沒有在12小時內(nèi)改變p53mRNA的穩(wěn)定性,但在24小時內(nèi)顯著增強了p53mRNA的穩(wěn)定性,表明circMYH9可能間接抑制p53的mRNA降解。事實上,circMYH9siRNA處理后p53前體mRNA表達增加,circMYH9質(zhì)粒處理后p53前體mRNA表達降低。結(jié)果表明,circMYH9的缺失可能導致p53前體mRNA的增加,進而影響p53的mRNA表達。 METTL14的上調(diào)可以通過m6A修飾降低PERP水平。上海炎癥因子科研

乳酸菌是益生菌在嘌呤代謝中發(fā)揮關鍵作用。深圳mTOR信號通路芯片科研

系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SLE)患者大多數(shù)存在I型IFN刺激基因(ISGs)的高表達。線粒體異常也有報道,但I型IFN暴露對這些變化的貢獻尚不清楚。此外,I型IFN通過上調(diào)脂肪酸氧化(FAO)和氧化磷酸化(OXPHOS)促進漿細胞樣樹突狀細胞(pDCs)的線粒體功能。本文數(shù)據(jù)表明,I型IFN暴露通過代謝重編程促進CD8 + T細胞死亡,有助于SLE發(fā)病。本文于2021年3月發(fā)表在《Nature Communications》IF:12.121。

1、ISGs高表達患者OXPHOS基因下調(diào)為了確定是否T細胞的轉(zhuǎn)錄組特征可以幫助鑒定SLE患者的疾病活動,作者對來源于***和未***女性的CD8+T和CD4+T細胞的mRNA進行測序。對DEGs進行聚類熱圖分析,發(fā)現(xiàn)SLE患者根據(jù)ISG表達水平被分為***的兩類:SLE-1和SLE-2(Fig.1a,b)。在兩種T細胞中,SLE-2類群的患者具有更強烈的I型IFN特征。在CD4+T細胞中,這種特征伴隨著參與JAK-STAT信號和T細胞共刺激的基因,而在CD8+T細胞中,ISG基因的高表達與基因參與細胞周期,響應DNA損傷和凋亡有關(Fig.1a,b)。比較SLE-1和SLE-2組的轉(zhuǎn)錄表達譜,結(jié)果顯示,除ISGs外,mtDNA編碼的OXPHOS基因的表達差異比較大(Fig.1c,d)。 深圳mTOR信號通路芯片科研

公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。

1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎

2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。

3.提供熱點**文獻技術支持,探討科研前沿熱點研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關研究

4.二代測序:轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序

5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片

6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗

7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗