CircRNF13通過SUMO2抑制NPC的增殖和轉(zhuǎn)移
***，作者進行了拯救實驗，如圖8A-D所示，抑制circRNF13會促進NPC的生物學(xué)功能，包括增殖，遷移和侵襲，但是過表達SUMO2會***挽救circRNF13敲除帶給NPC細胞的表型改變。免疫組化顯示，SUMO2在circRNF13過表達裸鼠**切片中低表達，而GLUT1則***高表達。以上證實circRNF13通過SUMO2抑制NPC的增殖和轉(zhuǎn)移。
總之，這些結(jié)果強調(diào)了circRNF13在鼻咽*增殖和轉(zhuǎn)移中的重要意義。CircRNF13作為抑*因子直接與SUMO2的3 -UTR結(jié)合，延長了SUMO2 mRNA的半衰期。上調(diào)SUMO2通過GLUT1的泛素化來促進GLUT1降解，這些通過抑制糖酵解調(diào)控AMPK-mTOR通路，**終導(dǎo)致鼻咽*的增殖和轉(zhuǎn)移。 尿酸升高直接引起腸道屏障損傷。重慶樹突和抗原呈遞細胞芯片科研
確定關(guān)鍵驅(qū)動突變在原始和committed亞型中的分布(圖1C，補充討論中的亞型和突變部分和補充表6 17)。盡管亞型中富含某些突變(原始組的FLT3-ITD和承諾組的DNMT3A)，驅(qū)動突變的遺傳改變對原始和committed亞型的預(yù)測較差(補充圖3 16和補充討論)，基因突變和亞型之間的Matthews相關(guān)系數(shù)(MCC)較低(FLT3-ITD的MCC = 0.32, DNMT3A的MCC = 0.16;在precision-recall曲線(AUPRC = 0.62)值下，突變與亞型之間的多變量分析得到一個薄弱區(qū)域(Supplementary Fig. 7)。線粒體科研服務(wù)兩年嘌呤在細胞中執(zhí)行許多重要的功能。
2）M1-BMDMs來源的外泌體加重了bEnd.3細胞的EndoMT
我們評估了M1-BMDMs對bEnd.3細胞的影響。結(jié)果表明，M1-BMDMs條件培養(yǎng)基(M1-CM)***降低了bEnd.3細胞TEER值(圖2A)，并增加通透性(圖2B)。此外，TJs蛋白熒光染色顯示，M1-CM處理***降低了bEnd.3細胞膜ZO-1和Occludin的表達(圖2C和D)。為了進一步研究M1-BMDMs是否通過外泌體破壞血管內(nèi)皮細胞的TJs，我們使用外泌體分泌抑制劑GW4869預(yù)處理M1-BMDMs。我們發(fā)現(xiàn)，加入GW4869部分逆轉(zhuǎn)了M1-CM誘導(dǎo)的TEER值的下降(圖2A)，滲透率增加(圖2B)；GW4869也逆轉(zhuǎn)了TJs蛋白熒光強度下降的趨勢(圖2C和D)。相應(yīng)的，TJs蛋白表達水平也出現(xiàn)了類似的結(jié)果(圖2E)。有趣的是，通過對脊髓切片中的α-SMA和CD31進行共染色，我們發(fā)現(xiàn)損傷部位的共定位比未損傷部位更多(圖2F和G)。M1-CM***改變bEnd.3細胞形態(tài)，分枝減少，胞體拉長(圖2H)。此外，M1-CM暴露***降低了CD31的表達，并強烈增強了EndoMT標記物膠原I、III和α-SMA在bEnd.3細胞中的表達(圖2I)。然而，GW4869可以部分扭轉(zhuǎn)這些影響。綜上所述，外泌體可能介導(dǎo)巨噬細胞和血管內(nèi)皮細胞之間的相互作用，并可能是巨噬細胞誘導(dǎo)血管內(nèi)皮細胞EndoMT的原因。
為了確定s-flow和d-flow在體內(nèi)單細胞分辨率下對ECs基因轉(zhuǎn)錄表達和染色質(zhì)可及性譜的全基因組影響，我們使用小鼠PCL模型進行了scRNA-seq和scATAC-seq。將C57BL/6小鼠部分結(jié)扎，以暴露于血流的對側(cè)RCA作為對照，在LCA中誘導(dǎo)d-血流。部分結(jié)扎后2天(2D)和2周(2W)， rca (2D- r和2W- r)和lca (2D- l和2W- l)用膠原酶酶解獲得單個細胞和單個核，分別用于scRNA-seq和scATAC-seq。
在標準化之后，一個基于無監(jiān)督圖的聚類將細胞劃分成組，通過統(tǒng)前列形近似和投影(UMAP)圖可視化(圖1A)。我們的UMAP分析確定了16個獨特的細胞簇以流和時間依賴的方式分布(圖1A和1B)。每個細胞簇都是用確定的標記基因進行鑒定(1C).發(fā)現(xiàn)8個EC簇(E1E8)、血管平滑肌細胞(SMCs)、成纖維細胞(Fibro)、4個單核/巨噬細胞(macrophages14)、樹突狀細胞(DCs)和T細胞。通過Pecam1、Icam2、Cdh5和Tie1的表達來鑒定EC簇。smc特異性標記為Cnn1、Myl9和Speg。同樣，Medag、Dpep1和Lum作為纖維的標記物;巨噬細胞C1qa,C1qb,C1qc,C5ar1;DCs的Ccr7和Mmp25;T細胞的Itk(圖1C)。
這些數(shù)據(jù)表明大黃酸***可以消除尿酸引起的腸道通透性增強。
5.ELNAT1與UBC9啟動子形成DNA-RNA三聯(lián)體，通過招募hnRNPA1增強H3K4me3修飾
為了探索ELNAT1誘導(dǎo)BCa淋巴轉(zhuǎn)移的分子機制，我們使用NGS檢測過表達ELNAT1的BCa細胞和對照細胞（Figure5A），由于SUMOylation已經(jīng)被證明可以調(diào)節(jié)特異性RNA的識別，并參與RNA分選進入EVs的過程，因此鑒定ELNAT1的SUMOylation相關(guān)靶基因。在受ELNAT1調(diào)控的925個基因中，作者發(fā)現(xiàn)UBC9是SUMOylation相關(guān)基因變化*****的（Figure5B-D）。接著通過RNA純化（ChIRP）檢驗ELNAT1與UBC9中P1（153~143bp）啟動子區(qū)域存在生理相互作用（Figure5E,F）。CD光譜證實ELNAT1/UBC9TTS1組在270~280nm處有一個***的正峰，在210nm處有一個負峰。在FENDRR/PITX2陽性對照組中也有類似的發(fā)現(xiàn)（Figure5G,H）。FRET技術(shù)分析顯示,與ELNAT1/UBC9TTS1組相比，熒光強度發(fā)生了巨大的變化：從520nm到570–580nm,熒光強度控制單鏈RNA/UBC9ssRNA/UBC9TTS1集團,這與FENDRR/PITX2陽性對照組類似（Figure5I,J）。 文章使用FMT(糞微生態(tài)移植)來確定大黃酸改變的腸道菌群是否對結(jié)腸炎有療效。廣州智力障礙拷貝數(shù)科研
上海英拜生物設(shè)有專業(yè)的武漢技術(shù)中心。重慶樹突和抗原呈遞細胞芯片科研
USP35敲除增加了脂質(zhì)活性氧的產(chǎn)生和丙二醛的產(chǎn)生(圖2D)。過量的活性氧導(dǎo)致多不飽和脂肪酸氧化損傷并分裂成各種產(chǎn)物，包括HETEs。我們觀察到，USP35沉默促進了H460和H1299細胞中5-HETE、11-HETE和15-HETE的釋放，而不影響12-HETE的釋放(圖2F)。GSH/GPX4為基礎(chǔ)的ROS***機制在防止鐵缺乏期間的脂質(zhì)過氧化中起著不可或缺的作用。研究表明在USP35缺乏的細胞中GSH水平降低并伴隨著對GPX4活性的抑制(圖2G，H)。此外，shUSP35***細胞中的鐵和Fe2+水平***高于對照組。相比之下，補充GSH或鐵螯合劑***減少了shUSP35***細胞的細胞死亡和集落形成(圖2K，L)。因此，我們得出結(jié)論，鐵死亡有助于USP35敲除誘導(dǎo)的肺*細胞死亡。
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