轉(zhuǎn)錄組學(xué) (RNA-Seq) 模塊 RNA-seq 模塊對(duì)與衰老相關(guān)的全基因組轉(zhuǎn)錄組變化進(jìn)行編目。RNA-seq 模塊中收集的數(shù)據(jù)集來自與衰老研究相關(guān)的已發(fā)表文章。該模塊收集在特定基因干預(yù)（過表達(dá)、敲除等）時(shí)觀察到的轉(zhuǎn)錄組變化，該模塊還收集特定組織和...

六、改進(jìn)分選策略以分離胚胎HSCs/MPPs 研究者基于細(xì)胞表面標(biāo)記設(shè)計(jì)了一種針對(duì)HSCs / MPP的新的熒光***細(xì)胞分選策略（簡(jiǎn)稱CD-REF），使用CD-REF分選板對(duì)股骨BM細(xì)胞進(jìn)行分選，結(jié)果顯示標(biāo)記為HSCs / MPP和HSCs / M...

胰腺*(PC)是**棘手的**之一，被認(rèn)為是預(yù)后**差的消化系統(tǒng)**。外泌體是微環(huán)境中**細(xì)胞和基質(zhì)細(xì)胞之間相互交流的重要介質(zhì)。**的發(fā)展不僅由*細(xì)胞決定，還受**微環(huán)境(Tumor microenvironment, TME)中缺氧、脂質(zhì)和間質(zhì)細(xì)胞這三個(gè)重要...

5、GPX4活性預(yù)防鐵死亡促進(jìn)轉(zhuǎn)移作者推測(cè)細(xì)胞對(duì)鐵死亡的抗性可能使細(xì)胞能夠抗住在轉(zhuǎn)移過程中面臨的代謝和環(huán)境壓力。注射Py230-27HCS細(xì)胞的小鼠發(fā)生micrometastasis，而注射Py230-27HCR細(xì)胞的小鼠發(fā)生macrometastasis；但...

為了檢測(cè)補(bǔ)充NAD + 是否可以糾正IFNα刺激的下游效應(yīng)，用1 mM β-煙酰胺單核苷酸(NMN)培養(yǎng)CD8 + T細(xì)胞以恢復(fù)NAD +/NADH比值（圖6e）。然后，評(píng)估了用抗CD3/CD28再刺激后的氧化反應(yīng)和細(xì)胞活力。補(bǔ)充NMN的NAD + 增加了OC...

為了確定CRC細(xì)胞來源的外泌體miR-934是否誘導(dǎo)巨噬細(xì)胞的M2極化，首先生成了miR-934 mimics和anti-miR-934來過表達(dá)或抑制miR-934的表達(dá)。與對(duì)照組相比，轉(zhuǎn)染miR-934 mimics的巨噬細(xì)胞M2標(biāo)記物(CD163、CD20...

總的來說，在處理與脂質(zhì)代謝失調(diào)相關(guān)的壓力時(shí)，細(xì)胞如何上調(diào)GPX4軸的活性和/或減少對(duì)GPX4的依賴以適應(yīng)這種壓力，這有增加細(xì)胞轉(zhuǎn)移能力的附帶責(zé)任。急性27HC 處理通過干擾SREBPs和LXR信號(hào)傳導(dǎo)擾亂脂質(zhì)代謝，從而導(dǎo)致了細(xì)胞生長和遷移的抑制。*細(xì)胞可以適應(yīng)...

本文鑒定了一種名為LncHrt的新型心肌細(xì)胞富集的lncRNA，它作為心臟代謝的重要調(diào)節(jié)因子發(fā)揮作用。LncHrt是MI反應(yīng)中下調(diào)**多的lncRNA，對(duì)心臟穩(wěn)態(tài)至關(guān)重要，因?yàn)長ncHrt的耗竭會(huì)損害心臟形態(tài)、代謝和功能。重要的是，心臟特異性過表達(dá)LncHrt...

為了表征RIT1相互作用組，我們進(jìn)行了親和純化-質(zhì)譜篩選(圖1A)，確定MAD2(MAD2L1)和p31conmet(也稱為MAD2L1結(jié)合蛋白)作為新的和選擇性的RIT1結(jié)合伙伴，不與其他RasGTPases相互作用(圖S1A和S1B)。MAD2參與了在未附...

SIM2是否也影響AR與染色質(zhì)的結(jié)合，我們?cè)赟IM2沉默后進(jìn)行AR ChIP-seq。如圖7所示，受體與大多數(shù)arb的結(jié)合沒有改變。然而,SIM2沉默影響2265 ARBs藥物通過降低和增加染色質(zhì)占用大約相同數(shù)量的地點(diǎn)(圖7 a、b)。當(dāng)反映這些siSIM2-...

6）NOX4誘導(dǎo)的線粒體代謝損傷通過抑制人類星形膠質(zhì)細(xì)胞的細(xì)胞抗氧化過程而誘導(dǎo)氧化應(yīng)激 我們研究了NOX4誘導(dǎo)的線粒體代謝損傷是否可以通過抑制人體星形膠質(zhì)細(xì)胞的細(xì)胞抗氧化過程來誘導(dǎo)氧化應(yīng)激。與對(duì)照組相比，NOX4的升高***降低了谷胱甘肽(GSH)水...

外泌體circ_0072083的分泌依賴于TMZ抗性神經(jīng)膠質(zhì)瘤細(xì)胞中的Warburg效應(yīng) 為了探索circ_0072083是否通過外泌體攜帶，從TMZ抗性和敏感細(xì)胞的培養(yǎng)基中分離外泌體。外泌體通過TEM 確認(rèn)。大小主要在 100-200 nm，抗性細(xì)...

3、白樺素可以改善小鼠飲食導(dǎo)致的肥胖并增加能量消耗 接下來，研究了白樺素在體內(nèi)的作用。洛伐他汀是一種HMGCR抑制劑，具有良好的有益作用，將其與白樺素進(jìn)行比較。用對(duì)照（鹽水），洛伐他?。?0mg/kg/day）或白樺素（15或30mg/kg/day）...

紡錘體裝配檢查點(diǎn)(SAC)作為一個(gè)傳感器的**的著絲點(diǎn)延遲有絲分裂進(jìn)入后期，直到適當(dāng)?shù)娜旧w分離得到保證。這一安全機(jī)制的破壞導(dǎo)致基因組不穩(wěn)定和非整倍體，這是胚胎死亡、先天性出生缺陷、智力殘疾和**的遺傳原因。然而，盡管了解了控制SAC的基本機(jī)制，但信號(hào)通路如何...

自噬“貨物”是有選擇性裝載的，其中主要依靠LIR基序與LC3互作，形成自噬體。隨后，自噬體進(jìn)行運(yùn)輸、溶解。研究表明，自噬異常會(huì)影響疾病進(jìn)程。**中的自噬具有雙重作用：一方面自噬的發(fā)生會(huì)增強(qiáng)*細(xì)胞的生存能力；另一方面，抑制自噬會(huì)造成“廢物”的積累、基因突變等...

點(diǎn)擊該基因的名稱，將彈出該基因在NCBI中的鏈接。也可以單擊“paper ID”來瀏覽原始文獻(xiàn)中的更多詳細(xì)信息。***，在“詳細(xì)信息”部分中總結(jié)了有關(guān)疾病，細(xì)胞類型和基因的詳細(xì)信息。SC2disease還提供了從基于單細(xì)胞的結(jié)果和基于GWAS的結(jié)果得出的疾病的...

IGF2BP結(jié)合區(qū)域包含“GGAC”N6-甲基腺苷（m6A）**基序。IGF2BPs是m6A結(jié)合蛋白。為了探索circRNA和IGF2BP之間的相互作用是否通過m6A依賴性的方式進(jìn)行調(diào)節(jié)，對(duì)circNDUFB2進(jìn)行了MeRIP，并觀察到circNDUFB2中m...

結(jié)果1）circPDE4B在OA組織中表達(dá)較低 我們之前對(duì)3個(gè)臨床OA和3個(gè)對(duì)照樣本的軟骨細(xì)胞核糖體RNA缺失的總RNA進(jìn)行了RNA-seq分析。在數(shù)量**多的50個(gè)***調(diào)控異常的circRNA中，circPDE4B的表達(dá)水平排名***。我們?cè)u(píng)估了...

1）USP35敲除抑制肺*細(xì)胞生長、集落形成和**進(jìn)展 我們首先檢測(cè)了肺*組織和細(xì)胞系中USP35豐度的變化。如圖1A所示，USP35在肺ADC和SCC**中都***上調(diào)。與正常的BEAS2B和HBE肺上皮細(xì)胞系相比，USP35mRNA水平在肺*細(xì)胞...

CD163是一種免疫調(diào)節(jié)劑，是巨噬細(xì)胞清清體受體家族的成員，已知在單核細(xì)胞系的AML細(xì)胞中表達(dá)。在 committed cluster 中其他基因的高表達(dá)包括免疫相關(guān)基因，如C1QA, CD14和MARCO。msl1基因，一種已知的白血病干細(xì)胞增殖抑制因子，也...

2、miR-208b由結(jié)腸*細(xì)胞以外泌體的方式分泌 隨后，作者探究了miR-208b的存在方式是否由外泌體介導(dǎo)。分離鑒定了3株CRC細(xì)胞系的外泌體，并檢測(cè)了其中miR-208b的表達(dá)。外泌體中miR-208b的表達(dá)模式和在細(xì)胞中的模式一致，在SW48...

CircACTN4 直接與 FUBP1 相互作用并*** MYC 的轉(zhuǎn)錄 為了探索circACTN4的分子機(jī)制，首先進(jìn)行了pull down和質(zhì)譜分析circACTN4結(jié)合蛋白，發(fā)現(xiàn)FUBP1在circACTN4上顯著富集。RIP 檢測(cè)進(jìn)一步證實(shí) F...

3）STK39與SNAI1相互作用，并使T203上的SNAI1磷酸化為了描述STK39與SNAI1的相互作用，我們?cè)贖EK293T細(xì)胞***表達(dá)Myc-STK39和HA-SNAI1，并進(jìn)行了共同免疫沉淀(IP)實(shí)驗(yàn)。在SNAI1的IP之后，我們檢測(cè)到一個(gè)相關(guān)的...

在CRC和HC鑒定的628個(gè)和745個(gè)tDR中，每組分別有85個(gè)和202個(gè)tDR。此外，CRC患者血漿中81個(gè)tDR較HC患者明顯增加。為了驗(yàn)證小RNA測(cè)序結(jié)果，對(duì)上述3例CRC和3例HC受試者血漿樣本中5例上調(diào)的候選tDR進(jìn)行了qRT-PCR檢測(cè)。CRC...

胰腺*(PC)是**棘手的**之一，被認(rèn)為是預(yù)后**差的消化系統(tǒng)**。外泌體是微環(huán)境中**細(xì)胞和基質(zhì)細(xì)胞之間相互交流的重要介質(zhì)。**的發(fā)展不僅由*細(xì)胞決定，還受**微環(huán)境(Tumor microenvironment, TME)中缺氧、脂質(zhì)和間質(zhì)細(xì)胞這三個(gè)重要...

PTEN是一種**抑制因子，調(diào)節(jié)多種細(xì)胞功能，包括***，PI3K/AKT信號(hào)通路是PTEN通過其磷酸酶活性靶向的**重要通路之一。因此，推測(cè)PI3K/AKT信號(hào)通路可能參與CRC細(xì)胞來源的外泌體miR-934誘導(dǎo)M2巨噬細(xì)胞極化。WB結(jié)果顯示過表達(dá)PTEN可...

三、染色質(zhì)可及性與細(xì)胞類型特異性轉(zhuǎn)錄因子活性和染色質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)有關(guān) HNF4A編碼驅(qū)動(dòng)近端小管分化的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子。chromVAR檢測(cè)到近端小管DAR中HNF4A結(jié)合基序的富集(圖3b，基序活性)，這是HNF4A中染色質(zhì)可及性增強(qiáng)(圖3b，基因活性...

CircCwc27能直接與Pur-α蛋白結(jié)合，并影響Pur-α蛋白分布為進(jìn)一步探索CircCwc27引起AD的分子機(jī)制，作者假設(shè)CircCwc27具有翻譯功能，但通過RegrRNA2.0分析，并未發(fā)現(xiàn)CircCwc27序列中包含開放的閱讀框架(ORF)，表明C...

利用METABRIC數(shù)據(jù)集，我們?cè)u(píng)估了1459例ER+乳腺*中17個(gè)常見Wnt/β-catenin通路基因的表達(dá)，包括幾個(gè)Wnt靶基因(圖7a)。為了確定INPP4B是否促進(jìn)PI3K和Wnt/β-catenin通路之間的對(duì)話，我們用增加劑量的PI3K抑制劑BK...

ReducedRepresentationBisulfiteSequencing(RRBS)是-種準(zhǔn)確、高效、經(jīng)濟(jì)的DNA甲基化研究方法,通過酶切富集啟動(dòng)子及CpG島區(qū)域,并進(jìn)行Bisulfite測(cè)序,同時(shí)實(shí)現(xiàn)DNA甲基化狀態(tài)檢測(cè)的高分辨率和測(cè)序數(shù)據(jù)的高利用率...