5、GPX4活性預(yù)防鐵死亡促進(jìn)轉(zhuǎn)移作者推測(cè)細(xì)胞對(duì)鐵死亡的抗性可能使細(xì)胞能夠抗住在轉(zhuǎn)移過(guò)程中面臨的代謝和環(huán)境壓力。注射Py230-27HCS細(xì)胞的小鼠發(fā)生micrometastasis，而注射Py230-27HCR細(xì)胞的小鼠發(fā)生macrometastasis；但是無(wú)論是從micrometastasis還是從macrometastasis處分離出的轉(zhuǎn)移病灶表現(xiàn)出相似的對(duì)鐵死亡誘導(dǎo)劑（RSL3和ML210）相同的抗性。因此，27HCR細(xì)胞轉(zhuǎn)移表型的增加可能是促進(jìn)27HC抗性的適應(yīng)性事件的結(jié)果，而不是與羥甾醇***相關(guān)的基因表達(dá)/生化活性的特定變化。此外，GPX4的敲除***降低了B16F10細(xì)胞27HCS和27HCR衍生物的轉(zhuǎn)移，盡管后者的轉(zhuǎn)移程度較低。同樣，通過(guò)直接計(jì)數(shù)轉(zhuǎn)移結(jié)節(jié)證明，在Py230細(xì)胞的27HCR衍生物中觀察到的轉(zhuǎn)移表型在GPX4敲低后完全消除。這些數(shù)據(jù)證實(shí)了GPX4在轉(zhuǎn)移過(guò)程中預(yù)防鐵死亡的重要作用。英拜的實(shí)驗(yàn)室坐落在上海漕河涇園區(qū)浦江園區(qū)。北京biomarker科研
隨后，我們研究了miR-337-3p和miR-137是否負(fù)調(diào)控MIR210HG的表達(dá)，發(fā)現(xiàn)過(guò)表達(dá)miR-337-3p/137會(huì)下調(diào)MIR210HG的表達(dá)，而敲除miR-337-3p/137會(huì)上調(diào)MIR210HG的表達(dá)(圖4G)。
過(guò)表達(dá)miR-337-3p和miR-137抑制子宮內(nèi)膜*細(xì)胞的惡性生物學(xué)行為
為了研究miR-337-3p和miR-137在子宮內(nèi)膜*生物學(xué)行為中的可能作用，我們分別用agomir-337-3p/137和antagomir-3373p/137轉(zhuǎn)染Ishikawa和HEC-1A細(xì)胞。使用CCK-8和EdU檢測(cè)細(xì)胞增殖(圖5A和5B)。傷口愈合和Transwell檢測(cè)分別用于評(píng)估細(xì)胞遷移和侵襲。過(guò)表達(dá)miR-33373p和miR-137降低了Ishikawa和HEC-1A細(xì)胞的遷移和侵襲能力(圖5C和5D)。流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)并分析細(xì)胞周期分布(圖5E)。以上實(shí)驗(yàn)結(jié)果證實(shí)，與miR-NC組相比，miR-337-3p和miR-137過(guò)表達(dá)***抑制了細(xì)胞的增殖、侵襲和遷移。 廣州生長(zhǎng)因子科研Caspase-11介導(dǎo)的肝細(xì)胞焦亡促進(jìn)非酒精性脂肪性肝炎的進(jìn)展。
表觀基因組學(xué)(ChIP-Seq)模塊
ChIP-seq模塊目前包含大量染色質(zhì)免疫沉淀測(cè)序(ChIP-seq)數(shù)據(jù)，反映了特定的衰老相關(guān)基因座是如何受組蛋白修飾和轉(zhuǎn)錄因子調(diào)節(jié)的。這些數(shù)據(jù)有助于闡明調(diào)控因素如何在全基因組范圍內(nèi)影響衰老過(guò)程中的基因表達(dá)。ChIP-seq數(shù)據(jù)來(lái)自已發(fā)表的與衰老相關(guān)的文章，并使用相同的分析方法處理原始數(shù)據(jù)以保持一致性。直觀地顯示了衰老過(guò)程中特定基因組位點(diǎn)不同轉(zhuǎn)錄因子的富集或組蛋白修飾的變化。
蛋白質(zhì)組學(xué)（蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用）模塊
衰老過(guò)程中蛋白質(zhì)穩(wěn)態(tài)受損是典型的，蛋白質(zhì)相互作用隨著年齡的增長(zhǎng)而發(fā)生顯著變化。蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用模塊（PPI）旨在允許查詢感興趣的蛋白質(zhì)及其與衰老相關(guān)的相互作用蛋白。結(jié)果以兩種方式呈現(xiàn)：交互式表格和網(wǎng)絡(luò)圖。前者提供了更詳細(xì)的信息，包括相互作用蛋白的數(shù)量、細(xì)胞/組織類(lèi)型和支持相互作用的出版物；后者允許蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的可視化，并提供使用在線工具對(duì)選定數(shù)據(jù)執(zhí)行基因本體或 KEGG 通路分析的選項(xiàng)。因此，PPI 將成為分析細(xì)胞衰老過(guò)程中關(guān)鍵蛋白質(zhì)相互作用的有用模塊，從而可以在蛋白質(zhì)水平上更好地了解人類(lèi)衰老。
p533'非翻譯區(qū)(UTR)介導(dǎo)的hnRNPA2B1對(duì)前mRNA穩(wěn)定性的調(diào)節(jié)
為了進(jìn)一步確定p53的哪個(gè)區(qū)域參與穩(wěn)定性調(diào)節(jié)，在HCT116細(xì)胞中進(jìn)行了MeRIP-seq，發(fā)現(xiàn)一個(gè)顯著的m6A峰分布在p53mRNA的3'UTR。構(gòu)建了一個(gè)帶有Flag標(biāo)簽的表達(dá)載體，包括帶有3'UTR(p53CDS-3'UTR)或單獨(dú)CDS(p53CDS)的p53編碼序列，以及用hnRNPA2B1siRNA共轉(zhuǎn)染的HCT116細(xì)胞。結(jié)果表明，hnRNPA2B1敲低顯著降低了p53CDS-3'UTR轉(zhuǎn)染的CRC細(xì)胞中p53的表達(dá)，而不是單獨(dú)的p53CDS。這表明3'UTR對(duì)于hnRNPA2B1介導(dǎo)的p53調(diào)節(jié)是必不可少的。 神經(jīng)元中FTH的敲除抵消了褪黑素對(duì)創(chuàng)傷性腦損傷鐵死亡的保護(hù)作用。
7）腎小管細(xì)胞來(lái)源的外泌體miR-21通過(guò)PTEN/Akt通路介導(dǎo)體外成纖維細(xì)胞***為了進(jìn)一步證實(shí)miR-21在PTEN中的作用，NRK-49F細(xì)胞在接受NRK-52E遞送的外泌體之前，先用PTENsiRNA處理，與si-NC組相比，PTENmRNA明顯受到抑制。CCK-8和PTEN的westernblot表達(dá))表明，不經(jīng)外泌體干預(yù)的siPTEN轉(zhuǎn)染***促進(jìn)了NRK-49F的增殖。在外泌體干預(yù)組中，單獨(dú)轉(zhuǎn)染miR-21inhibitor可抑制NRK-49F增殖，同時(shí)轉(zhuǎn)染siPTEN后明顯逆轉(zhuǎn)。免疫熒光染色顯示，轉(zhuǎn)染siPTEN后，NRK-49F細(xì)胞中Col-I、纖連蛋白和α-SMA表達(dá)明顯增加。在外泌體干預(yù)組中，單獨(dú)轉(zhuǎn)染miR-21inhibitor可抑制上述指標(biāo)，同時(shí)轉(zhuǎn)染siPTEN后則明顯逆轉(zhuǎn)。westernblot檢測(cè)通路相關(guān)蛋白PTEN和p-Akt。未經(jīng)外泌體干預(yù)的siPTEN轉(zhuǎn)染可***抑制PTEN，但加速p-Akt。在外泌體干預(yù)組中，單獨(dú)轉(zhuǎn)染miR-21inhibitor可加速PTEN并抑制p-Akt，但與siPTEN共轉(zhuǎn)染后這種作用被逆轉(zhuǎn)。上述結(jié)果表明，腎小管細(xì)胞來(lái)源的外泌體miR-21可以通過(guò)PTEN/Akt途徑介導(dǎo)成纖維細(xì)胞的***。這些數(shù)據(jù)表明大黃酸***可以消除尿酸引起的腸道通透性增強(qiáng)。江蘇SCI科研
英拜提供一年三節(jié)的購(gòu)物卡津貼。北京biomarker科研
在沒(méi)有RNA配體的情況下，RIG-I采用一種自動(dòng)抑制的構(gòu)象，CARDs發(fā)出信號(hào)。因此假設(shè)circNDUFB2可能通過(guò)促進(jìn)其CARDs釋放***RIG-I。用Co-IP檢測(cè)RIG-I的CARDs（FLAG-CARD）和螺旋酶結(jié)構(gòu)域（HA-ΔCARD）之間的相互作用。結(jié)果表明circNDUFB2抑制了RIG-I的CARDs和螺旋酶結(jié)構(gòu)域之間的相互作用。此外，circNDUFB2增強(qiáng)了CARDs與線粒體抗病毒信號(hào)蛋白（MAVS）的相互作用。這些結(jié)果表明circNDUFB2可能通過(guò)破壞CARDs與其解旋酶結(jié)構(gòu)域之間的分子內(nèi)相互作用來(lái)***RIG-I，并使RIG-I保持活性，從而***RIG-I-MAVS信號(hào)級(jí)聯(lián)。北京biomarker科研
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過(guò)英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫(xiě)SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開(kāi)發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開(kāi)放參觀，客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專(zhuān)題，外泌體研究專(zhuān)題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性，為您的標(biāo)書(shū)奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書(shū)申請(qǐng)：提供標(biāo)書(shū)課題設(shè)計(jì)、撰寫(xiě)，標(biāo)書(shū)部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開(kāi)展，設(shè)計(jì)的標(biāo)書(shū)均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn)，中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持，探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測(cè)序：轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片：信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過(guò)表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)