1）USP35敲除抑制肺*細胞生長、集落形成和**進展
我們首先檢測了肺*組織和細胞系中USP35豐度的變化。如圖1A所示，USP35在肺ADC和SCC**中都***上調。與正常的BEAS2B和HBE肺上皮細胞系相比，USP35mRNA水平在肺*細胞系(A549、H358、H460、H1299和H1650)中也高度表達(圖1B)。鑒于H460和H1299細胞中USP35mRNA的豐度較高，我們在下一項研究中使用了這兩種細胞系。與mRNA水平一致，在H460和H1299細胞中USP35蛋白也增加了(圖1C)。為了闡明USP35在肺*發(fā)病機制中的作用，我們在H460和H1299細胞中沉默了USP35(圖1D)。有趣的是，USP35敲除抑制了H460和H1299細胞在體外的生長能力和集落形成(圖1E、F)。來自**異種移植實驗的數(shù)據(jù)進一步表明，USP35沉默抑制了25天生長后的**體積和重量(圖1G，H)?？傊琔SP35在調節(jié)肺*細胞生長和**進展中起著關鍵作用。 總體生存率低與m6A水平增高***相關。神經(jīng)炎癥科研地區(qū)科學基金
在缺氧條件下持續(xù)刺激的T細胞出現(xiàn)衰竭
為了確定缺氧是否會導致細胞衰竭，在體外建立暴露于缺氧應激的模型。a，體外CD8+ T細胞d10的TNF和IFN-γ的產(chǎn)生，在缺氧或缺氧條件下，用抗cd3 /CD28珠急性或持續(xù)***d2- 5，然后在常氧或缺氧條件下額外培養(yǎng)5天。b，，圖2中使用的刺激方案生成的第3天CD8+ T細胞CTV稀釋液的代表性直方圖和division分析。c, CD8+ T細胞的擴增(左)和累積倍增(右)。d，第3天或第4天產(chǎn)生的CD8+ T細胞的染色稀釋(增殖)與細胞死亡(活/死)染色。e, PD-1在cd4 + T細胞中的平均熒光強度。.f–h。第3天CD8+ T細胞的流式圖。 深圳熱圖科研嘌呤在細胞中執(zhí)行許多重要的功能。
m6A 的研究方向
主要是通過研究 m6A修飾相關的甲基化、去甲基化酶和識別蛋白的功能，進而研究m6A修飾的生物學功能和作用機制：一般通過敲除m6A酶分子，研究下游功能基因分子的表達和m6A甲基化情況，通過介導相關基因異常（可變剪切、穩(wěn)定性、翻譯、miRNA 調控）影響細胞表型和功能特征。m6A修飾圖譜構建及作用機制：通過m6A甲基化測序（MeRIP-Seq, miCLIP）構建疾病細胞模型或者發(fā)病組織的 m6A 修飾譜，分析m6A的motif, peaks數(shù)量及分布，Peak 關聯(lián)基因的特征，聯(lián)合RNA-seq研究m6A甲基化與表達的關系。
circNDUFB2觸發(fā)NSCLC細胞的免疫防御反應
為了研究參與circNDUFB2的信號通路，使用RNA測序（RNA-seq）進行了轉錄組分析。結果表明circNDUFB2過表達影響934個基因的表達水平，其中743個基因上調，191個基因被下調?；虮倔w生物學過程（GO_BP）和KEGG途徑富集分析表明circNDUFB2觸發(fā)了免疫防御和I型干擾素（IFNs）信號傳導?；蚣患治觯℅SEA）也表明目標基因的信號傳導途徑參與了免疫反應。確認了在circNDUFB2過表達的NSCLC細胞中一組免疫基因表達被上調，而circNDUFB2敲低降低了NSCLC細胞中這些基因的水平。這些結果表明，過量表達circNDUFB2，而不是其具有相同序列的線性RN**段，導致免疫基因上調。 酶聯(lián)免疫吸附試驗（ELISA）證實circNDUFB2過表達顯著增加了細胞培養(yǎng)上清液中CXCL10，CXCL11，CCL5和IFNβ的水平，而circNDUFB2敲低降低了細胞培養(yǎng)上清液中這些細胞因子的水平。這些結果證明circNDUFB2在NSCLC細胞中引發(fā)免疫應答。 m6A表達水平較高的**患者淋巴轉移***增加。
如圖4所示，與LS相比，慢性OS降低了KLF2和KLF4的表達，同時誘導了EndMT標記物(SNAI1和TAGLN)。重要的是，慢性OS誘導了兩個巨噬細胞標記基因(C1QC和C5AR1)的表達，直接證明了OS可以在體外誘導EndICLT。此外，我們利用小鼠PCL模型進行了一項en - face共免疫染色研究，以確定體內CDH5+ ECs中是否表達巨噬細胞標記蛋白。如圖4A-4D所示，C1QA和LYZ在LCA ECs中明顯被誘導，而在rca中沒有，這為血流誘導的eniclt提供了更有力的證據(jù)。我們分析了由基因本體結果確定的d-flow條件***的致***通路(圖2E)。英拜是您身邊的科研小助手。壞死性小腸結腸炎小鼠模型科研實驗外包
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褪黑素不能挽救Fth 敲低HT-22細胞中機械性損傷引起的鐵死亡
為了進一步證實褪黑素對Tth小鼠在Fth- KO小鼠中的上述作用，將HT-22細胞系用siRNA轉染，然后在體外進行機械刮擦損傷。siRNA敲低Fth可以降低Fth的蛋白質水平。鑒于脂質過氧化是鐵死亡的標志，使用DCF和BODIRY 581/591 C11作為評估了溶質ROS。與對照組+刮擦損傷組相比，siFth +刮擦損傷組細胞的熒光強度顯著增加，表明siFth增強了HT-22細胞中機械刮擦損傷引起的ROS產(chǎn)生的上調。重要的是，與未經(jīng)***的siFth組相比，用褪黑素處理siFth轉染的HT-22細胞未能顯著減少刮擦損傷后ROS的上調。
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6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗