2、miR-208b由結(jié)腸*細胞以外泌體的方式分泌
隨后,作者探究了miR-208b的存在方式是否由外泌體介導(dǎo)。分離鑒定了3株CRC細胞系的外泌體,并檢測了其中miR-208b的表達。外泌體中miR-208b的表達模式和在細胞中的模式一致,在SW480-OXA***高于SW480***高于NCM460。這些結(jié)果表明CRC中miR-208b的是以外泌體的模式分泌,這可能和順鉑化療敏感性有關(guān)。
3、SW480細胞分泌的外泌體miR-208b促進Treg擴增
前人研究表明順鉑會影響**免疫微環(huán)境。MiRNA可能通過促進Treg擴增誘導(dǎo)免疫侵襲。因此,作者探究了CRC分泌外泌體miR-208b對T細胞分化的影響。使用siRNA去除miR-208b,然后收集外泌體,將含有不同水平miR-208b的外泌體與原代CD4+T細胞共培養(yǎng)(圖4A-B)。6h后,受體CD4+T細胞中miR-208b***增加,尤其是SW480-OXA組,而外泌體miR-208b缺失組則沒有***改變,表明CD4+T細胞中miR-208b是由外泌體傳輸(圖4C-D)。此外,SW480和SW480-OXA來源外泌體處理組的CD4+CD25highFoxp3+Tregs細胞數(shù)***增加,而外泌體miR-208b缺失對其陽性細胞數(shù)則沒有明顯影響。表明外泌體miR-208b促進Treg擴增。 代謝變化被認(rèn)為是腸病**重要的特征之一。北京生理節(jié)律芯片科研
我們進一步發(fā)現(xiàn),MCD處理的Caspase-11缺陷小鼠顯示更低的血清谷丙轉(zhuǎn)氨酶(ALT)水平(圖2D)、血清天冬氨酸轉(zhuǎn)氨酶(AST)水平(圖2E)和肝臟甘油三酯水平(圖2F)。總之,我們的結(jié)果表明Caspase-11缺陷減輕了MCD誘導(dǎo)的小鼠肝臟脂肪變性。
3.Caspase-11缺乏減弱NASH小鼠的肝纖維化
通過測量纖維化相關(guān)因子的表達我們評估Caspase-11缺失對MCD誘導(dǎo)的肝纖維化的影響。在正常條件下,野生型和Caspase-11缺陷小鼠的TGF-β(圖3A)、α-Sma(圖3B)和Col1a1(圖3C)表達相似。MCD處理的野生型小鼠中TGF-β、α-Sma和Col1a1的表達***上調(diào)。相比之下,MCD處理的Caspase-11缺陷小鼠TGF-β、α-Sma和Col1a1的mRNA水平***降低。這些結(jié)果表明,Caspase-11缺乏可減少MCD處理小鼠的肝纖維化。 野生型科研服務(wù)兩年總體生存率低與m6A水平增高***相關(guān)。
靶向**相關(guān)巨噬細胞(TAMs)是一種很有前途的策略,可以改變免疫抑制**微環(huán)境,改善**免疫***。單胺氧化酶A (MAO-A)是一種因其在大腦中的功能而***的酶,小分子MAO抑制劑(MAOIs)用于臨床***神經(jīng)系統(tǒng)疾病。這里作者發(fā)現(xiàn)MAO-A誘導(dǎo)人和小鼠的TAMs進而可用于**的免疫***。該文2021年6月發(fā)表于《nature communications》IF:14.919期刊上。
主要實驗結(jié)果:1、MAO-A缺陷小鼠顯示與TAM極化改變相關(guān)的**生長減少
將同基因B16-OVA黑色素瘤接種給C57BL/6J小鼠,分離出TAM并評估TAM基因表達譜。除了參與調(diào)節(jié)巨噬細胞免疫應(yīng)答的經(jīng)典基因的變化,還觀察到一個Maoa基因在TAMs中的上調(diào)表達(圖1a),這表明MAO-A可能參與了TAM活性的調(diào)節(jié)。
單細胞轉(zhuǎn)錄組學(xué) (scRNA-Seq) 模塊
scRNA-seq 模塊系統(tǒng)地組織了基因表達隨年齡增長的組織和細胞類型特異性異質(zhì)變化。該模塊提供不同細胞類型或亞型的高分辨率、綜合參考圖,以及它們的時空分布信息,以及在不同衰老相關(guān)或疾病條件下每種細胞類型或亞型的基因表達模式。該模塊目前包括來自大鼠、猴子和人類的 14 種衰老組織的單細胞 RNA 測序數(shù)據(jù)集。這些數(shù)據(jù)包括從單細胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)圖譜中的多個哺乳動物組織中提取的細胞類型注釋和細胞類型特異性 DEG,用于衰老和熱量限制 (CR)。該模塊還包含單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),涵蓋非人類靈長類動物的卵巢、胰島、主動脈、視網(wǎng)膜和心肺衰老,以及老年 COVID-19 患者中人類循環(huán)免疫細胞的單細胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)景觀。 英拜可解放您的雙手釋放您的時間。
6.靶向遞送lnc-PMIFsiRNA接近骨形成表面的OPCs促進老年小鼠骨形成
接下來評價lnc-PMIF在骨形成表面周圍的老年OPCs中系統(tǒng)靶向沉默對衰老相關(guān)骨質(zhì)疏松的影響。為促進lnc-PMIFsiRNA(即si-PMIF)接近骨形成表面周圍的OPCs,si-PMIF或si-NC被包裹在骨形成表面靶向遞送系統(tǒng)(即,(DSS6)-脂質(zhì)體)。21月齡自然衰老的雄性和雌性小鼠靜脈注射(DSS6)-脂質(zhì)體-si-PMIF、(DSS6)-脂質(zhì)體-si-NC或(DSS6)-脂質(zhì)體單藥(溶劑)。si-PMIF處理組Gli1+細胞中l(wèi)nc-PMIF的表達***降低,si-PMIF處理組兩種性別小鼠的骨量更高,脛骨干骺端微結(jié)構(gòu)更好,BMD和BV/TV更高,MAR和BFR/BS較高。這些發(fā)現(xiàn)表明,靶向沉默骨形成表面周圍OPCs中的lnc-PMIF可以促進衰老相關(guān)骨質(zhì)疏松小鼠的骨形成。 Caspase-11介導(dǎo)的肝細胞焦亡促進非酒精性脂肪性肝炎的進展。天津胃腸道消化科研
血清或尿液中尿酸濃度的升高與痛風(fēng)腎臟和血管疾病密切相關(guān)。北京生理節(jié)律芯片科研
2)SsD響應(yīng)相關(guān)基因和通路的鑒定
為了進一步確定可能與白血病細胞中SsD敏感性相關(guān)的潛在靶點,我們對SsD處理過的NB4細胞進行了RNA測序。我們共發(fā)現(xiàn)3732個上調(diào)基因和3442個下調(diào)基因(圖2A)。為了揭示SsD的潛在機制,我們進行了富集分析并研究了差異基因相關(guān)的通路。我們篩選了上調(diào)和下調(diào)基因富集的**個通路(圖2B)。此外,我們使用GSEA研究SsD處理影響的信號通路(圖2C)。我們的數(shù)據(jù)顯示,SsD處理導(dǎo)致MYC靶點、E2F靶點和G2M檢查點信號級聯(lián)受到抑制。有趣的是,這些發(fā)現(xiàn)與FTO抑制劑和內(nèi)源性FTO的下調(diào)抑制的信號通路相一致。因此,SsD的抑制作用可能有助于FTO抑制細胞周期和增殖(圖2D-E)。此外,絕大多數(shù)通過FTO敲低而上調(diào)的信號通路對SsD富集,同樣,絕大多數(shù)被SsD抑制的信號通路也被FTO敲低而抑制(圖2F)。更重要的是,SsD介導(dǎo)的m6A相關(guān)基因的變化具有***的一致性(圖2G)。綜上所述,SsD可能參與了FTO介導(dǎo)的m6ARNA甲基化途徑。 北京生理節(jié)律芯片科研
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請:提供標(biāo)書課題設(shè)計、撰寫,標(biāo)書部分基礎(chǔ)實驗的開展,設(shè)計的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c,中標(biāo)率很高。
3.提供熱點**文獻技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究
4.二代測序:轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學(xué)實驗